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<주간 소년 점프>에 연재되면서 폭발적인 인기를 모았던 '나루토'를 애니메이션으로 만들었다. 한국에서도 단행본이 나와 많은 인기를 얻고 있다. 나루토와 동료들이 닌자가 되기 위한 모험을 떠나는 흥미진진한 작품. 닌자 마을 중 하나인 나뭇잎 마을. 매일같이 장난만 치며 공부도 뒤쳐져서 졸업조차 불안하기만 한 문제아 나루토. 그런 그이지만 마을에서 제일 가는 닌자, '호카게'가 되고 싶다는 커다란 꿈을 지니고 있다. 하지만, 자신의 출생의 비밀을 안 나루토는 결의를 새롭게 다지고 같은 학교 학생인 사스케, 사쿠라와 함께 닌자로서의 첫 발을 내딛게 된다.
여기는 닌자의 나라 나뭇잎 마을. 닌자 학교의 낙제생 소년 나루토는 오늘도 장난이 한창이다. 그리고, 또다시 졸업시험에 낙제해 버린다. 그러던 어느날, 마을의 영웅인 초대 호카게가 남긴 봉인의 서를 도둑맞는 사건이 발생했다!! 범인은 나루토였지만…
나뭇잎 마을의 대표는 대대로「호카게」라는 이름으로 불리고 있다. 현재 호카게는 3대. 그리고 이 3대 호카게 에게는 코노하마루 라고하는 손자가 있다. 우여곡절끝에 닌자 학교를 졸업할 수 있던 나루토가 닌자 등록서를 제출하러 갔을 때, 코노하마루와 마주치게 된다. 코노하마루는 곧바로 나루토를 「두목」이라고 부르더니, 마음대로 뒤를 따라 다니기 시작한다. 그것은, 나루토만이 코노하마루를 「호카게의 손자」로서 특별 취급 하지 않았기 때문이다. 그리고 코노하마루는, 어서 빨리 호카게가 되어 모두에게 인정할 수 있는 닌자가 되고 싶다고 생각하고 있었지만…
드디어 닌자가 된 나루토는, 새로운 수업을 위해 3인 1조가 되었다. 나루토와 같은 조가 된 것은, 「하루노 사쿠라」와「우치하 사스케」. 나루토는 귀여운 사쿠라를 좋아하고 있지만, 그 중요한 사쿠라는 사스케에게만 열중한다. 게다가 사스케는 나루토와 다르게, 쿨하고 멋질 뿐만이 아니라 실력도 뛰어난 엘리트. 이에 심술이 난 나루토는, 사스케를 골탕먹이려고 뭔가를 준비하는데.......
3인 1조로 팀을 짜게 된 나루토, 사스케, 사쿠라. 이들을 지도하기위해 새로운 선생님, 「하다케 카카시」가 왔다!! 어딘가 수상한 카카시는, 첫날부터 지각을 한다. 게다가 나루토가 설치해 놓은 장난에 간단하게 걸려 버릴 정도로 수상한 냄새가 풀풀~ 그런데 그 카카시가 갑자기 어려운 수련을 나루토들에게 내놓는다. 그것은, 셋 중 한명 밖에 합격할 수 없다고 하는 「서바이벌 연습」이었다!? 게다가 이 시험에 떨어지면 다시 학교로 되돌아가게 된다니!!?
카카시가 내놓은 수련은 굉장한 것이었다. 그리고, 나루토들을 상대하는 카카시는 지금까지와는 완전히 다른사람!? 온 힘을 다해 달려드는 나루토를 가볍게 다루고, 학교 제일의 엘리트인 사스케조차도 당해 낼 도리가 없다. 사쿠라는 이미 말 다했다! 상급닌자인 카카시의 진정한 실력 앞에, 하늘과 땅 정도의 차이를 느껴 어찌할 방법이 없는 셋. 이대로는 셋다 전원 학교로 돌아가게 되어 버린다! 서두르기 시작하는 나루토들이었지만, 실은 카카시는 이 수련 안에 숨겨져있는 중요한 일을 모두에게 깨닫게 하려는 것이었는데…
드디어 첫번째 임무를 맡게 된 나루토들. 그러나 그 임무 라는 것은, 잃어버린 고양이를 찾아주는 등등 따분한 일들 뿐이었다. 차츰 불만이 쌓이는 나루토는, 마침내 3대 호카게 앞에서 때를쓰기 시작한다. 토라진 나루토에게 조금 당황한 호카게 였지만, 나루토의 의지를 느끼고는 보다 중요한 임무를 내리기로 한다. 새로운 임무는, 타즈나 라고 하는 인물을 조국의 「파도의 나라」까지 호위 하는 것. 첫 본격적인 호위 임무에 의욕이 넘치는 나루토였는데......
파도의 나라에 가까스로 도착한 나루토들은, 이 나라가 가토라고 하는 악덕 상인에게 지배되고 있는 것을 알게된다. 방금전의 추격자도, 타즈나의 생명을 노린 가토가 보낸 자객이었던 것이다. 게다가, 다음에 나타난 적은「무음살인술의 달인」이라고 불리는 안개마을의 탈주닌자 모모치 자부자. 생각치 못한 강적 출현에 흥분하는 나루토! 하지만 그런 나루토에게 카카시는 아까와는 비교도 안될만큼 강한 상대라며 물러서게 한다. 평상시와는 다른 모습의 카카시에게 보통이 아닌 살기를 느끼는 나루토들···!
자부자의 뒤를 노린 카카시! 마침내 자부자의 목에 쿠나이를 들이댄다. 배후로부터 자부자을 막은 카카시의 승리는 틀림없는 것으로 생각되었다. 그러나, 이 자부자의 육체는 또 「물 분신술」에 의해서 만들어진 가짜였다! 한순간에 형세는 역전, 이번에는 카카시가 자부자에게 몰려 「물감옥」에 갇혀 버린다. 이미 타즈나를 지키는 것은 나루토들 3인뿐, 게다가 나루토와 사스케의 공격도 전혀 통하지 않는다. 압도적인 힘의 차이에 당하기만 하는 나루토들은 패닉이 되어 도망치려고 한다. 그러나 왼손의 맹세, 두 번 다시 도망치지 않겠다고 한 일을 생각해 내어 용기를 내는 나루토였다.
나루토의 작전에 의해 물감옥이 깨져 자유롭게 된 카카시가 다시 자부자를 공격한다. 마침내 사륜안의 진정한 힘이 발휘될 때가 온 것이다! 카카시는 자부자의 기술을 한순간에 카피해, 자부자를 쓰러트린다. 자신의 행동의 모든 것을 읽어낸 자신의 기술로, 그것도 수배의 파괴력을 가지는 카카시의 공격에 의해 중상을 입은 자부자. 마지막으로 끝을 내려는 그 순간. 어디선가 갑자기 날아 온 철침이 자부자의 목을 관통하고...!!
간신히 타즈나의 집에 도착한 나루토들. 사륜안을 사용했기 때문에 힘을 소진한 카카시는 당분간은 꼼짝 못하게 되었지만, 자부자을 쓰러뜨렸다는 사실이 나루토들에게는 안도감과 여유를 주었다. 그러나, 냉정한 카카시에게는 하나의 의문이 있었다. 본래의 헌터닌자 라면, 죽인 상대를 그 자리에서 흔적도 없이 처리 할텐데, 왜 그 소년은 자부자의 사체를 가지고 돌아갔지...? 라고...
타즈나와 함께 파도의 나라의 거리에 나간 사쿠라는, 가토에 의해서 사람들의 생활이 몹시 괴롭힘 당하고 있는 것을 알게된다. 그러한 이유로 타즈나는, 바다를 건너는 다리를 건설하려고 목숨을 걸어 노력하고 있는것이었다. 이 다리가 생기면 해운 교통을 지배하는 가토로부터 사람들을 구해낼 수 있다고 굳게 믿으면서.... 한편 나루토와 사스케는 카카시가 낸 과제, 차크라를 이용한 나무 타기 수업에 여념이 없었다. 그날의 수련을 마치고 타즈나의 집에 돌아온 두 사람은 너덜너덜. 그런 두 사람을 차갑게 바라보는 아이 이나리는, 나루토에게 「가토에게 이길 수 있는 날은 오지 않는다」라고 해 버리는데...
차크라를 컨트롤하기 위한 수업에 돌진하는 나루토의 앞에, 수수께끼의 인물이 모습을 나타냈다. 「소중한 것을 지키기 위해서는 어디까지나 강하게 될 수 있다」라고, 말하는 인물. 그것은, 나루토가 가슴속에 품고있던 것과 완전히 같은 기분이었다. 서로 어딘가 공감하는 두 사람. 하지만 그 이상은 말하지 않고, 어딘가로 사라져 갔다. 그 인물은 누구인가? 그리고, 무엇 때문에 나루토에게 나타난 것 일까!?
마침내 자부자와의 재결전의 날이 찾아 왔다. 게다가 요전날의 「가면의 소년」도 자부자과 함께 나타났다. 자부자들은 사스케를 보고 한눈에 그 실력을 깨닫고 사스케 또한 가면의 소년이 보통 사람은 아닌 것을 실감하게 된다. 그리고, 마치 서로의 힘에 이끌리는 것 처럼 사스케와 소년이 전투를 개시한다. 그 시각, 가토의 부하가 츠나미를 인질로 하려고 타즈나의 집으로 찾아오고 있었다. 악당들이 엄마를 데려갈 것 같지만 공포에 질려 무서워만 하는 이나리. 그러나 나루토의 말을 떠올려, 이나리는 용기를 내어 악당들에게 향한다.
하쿠의 비술 마경빙정에 의해, 핀치에 빠진 사스케. 거기에 돌연 나루토가 뛰어들어 왔다! 그러나, 마경빙정을 안과 밖에서 동시에 공격하려고 했던 사스케의 작전은, 나루토의 생각치 못한 행동으로 엉망이 되어 버리고...!!
카카시는 알고 있었다. 「닌자」에게 가장 필요한 「실전」의 경험이 없는 지금의 나루토들에게는, 자부자과 함께 몇번이나 죽음의 선을 넘어 온 하쿠를 쓰러뜨릴 힘이 없다는 것을… 시간이 얼마 남지 않은 것을 깨달은 카카시는, 자부자를 쓰러뜨리기 위해서 다시한번 사륜안을 사용할 결심을 한다. 그러나, 자부자는「사륜안은 이제 통하지 않는다」라고 말한다! 자부자 또한 수많은 아수라장을 빠져 나온 닌자! 한 번 본 사륜안에 대항하는 방법을 벌써 마련해 놓았던 것인데.....!?
하쿠의 마경빙정에 의한 공격을 계속 받는 나루토와 사스케! 나루토는 벌써 일어서는 것도 할 수 없게 되었다. 그러나 사스케는 이 싸움 중에 자신이 가지고 있는 「사륜안」의 능력에 눈을 떠, 조금씩이지만 확실히 하쿠를 공격하고, 방어도 할수 있게 되었다. 그것을 눈치챈 하쿠는, 사스케가 싸우면서 자신의 능력에 눈떠 가는 것에 놀란다. 그리고 이대로 장기전이 되면 사스케에게 유리하다고 판단해, 단번에 승부할것을 결심하는데…
마침내 나루토가 각성 했다! 적에게 공격당해 사스케가 쓰러졌다는 것에대한 분노가 봉인되어 있던 구미호의 능력을 깨워버린 것이다. 나루토의 굉장한 차크라는 밖에서 싸우던 카카시와 자부자에게도 느껴질만큼 강력한 것이었다. 나루토의 압도적인 힘 앞에 꼼짝없이 쓰러지는 하쿠. 패배를 깨닫은 하쿠는 나루토에게 자신을 죽여달라고 부탁한다. 이기는 것만이 자부자의 기대에 부응하는 것이고 하는 하쿠는 나루토에게 진 지금, 자신의 가치가 없어진 것을 알고 있었던 것이다...
하쿠는 망설이고 있는 나루토에게 계속 자신을 죽여줄것을 강요한다. 하지만, 싸우는 것, 이기는 것만이 자신의 존재 이유라고 하는 하쿠 생각에 나루토는 격렬한 의문을 가진다. 그것이 닌자의 길이라고 하는 것을 알고 있지만… 그 무렵, 자부자과 카카시의 싸움도 마지막을 맞으려 하고 있었다.
하쿠를 생각하며 치미는 분노를 이기지 못해 자부자를 추궁하는 나루토. 그런데 아무것도 느끼고 있지 않는 것처럼 보이는 자부자 였지만, 실은 눈물을 흘리고 있었다. 말과는 반대로 자부자는 하쿠를 누구보다 소중히 생각했다. 마음을 기댈수 있는 단 한명의 존재였던 하쿠를 잃은 자부자의 분노와 슬픔은 매우 큰 것이었다. 그리고, 이 비정함 이야말로 닌자의 숙명인 것을 나루토는 알게된다.
파도의 나라로부터 돌아온 나루토들. 주어진 임무를 해내고 있는 그들이었지만, 나루토는 그런 날에 불만 투성이. 처음으로 마을을 벗어나, 자부자 · 하쿠와의 사투를 격음으로 성장한 나루토들은, 지금부터 스스로가 부딪혀 가지 않으면 안 되는 세계가 매우 넓고, 또 강적이 얼마나 많이 있을까를 피부로 느꼈던 것이다. 「이런 임무만 해서는 전혀 강하게 될 수 없어―…」라고, 초조해하는 나루토. 하지만 그 때, 나뭇잎 마을에 속속 다른 마을의 닌자들이 모이고 있었는데...
나뭇잎 마을에서도「중급닌자시험」에 나갈 닌자들을 뽑게되었다. 그리고 그 중에는 나루토, 사쿠라, 사스케들도 포함되었다. 하지만, 나루토들의 참가에 이루카가 강하게 반대한다. 아직 나루토들은 너무 어린데다가 경험·실력 모두 너무 미숙하다는 것이다. 똑같이 신인이면서 참가하는 팀에는 지난회 시험도 넘겨버리고, 그 사이에 충분한 실력을 단련해 온 팀도 있을 정도다. 간단하게는 합격할 수 없다… 그것을 이루카는 잘 알고 있었던 것이다. 「나루토들의 가능성을 부수어 버릴 생각인가!?」라고, 이루카는 카카시에 묻는다. 그러나 카카시는 「그들은 충분히 성장했다」라고 단언하는데…
중급닌자시험에 임하려고 하는 나루토·사스케·사쿠라의 3인의 앞에, 바가지 머리의 송충이 눈썹「록·리」가 나타났다! 리는 사스케에게 돌연「승부하지 않겠습니까?」라고 대련을 요청. 우치하 일족의 능력을 가진 사스케에게 전의를 불 태우는 리! 그리고 사스케는 리의 도전을 받아 들인다!
중급닌자 시험장으로 향하는 나루토, 사스케, 사쿠라 3인. 사실 이 시험은 3인이 1조가 기본으로, 누군가 하나라도 빠진다는 것은 시험을 볼 기회도 없다는것. 동료와의 팀워크가 지금보다 중요하게 된다. 교실에 들어서자 벌써 많은 수험생들이 있었다. 분위기에 압도되는 나루토들. 그들 역시 자신만의 꿈을 가지고 이 장소에 와있는 것인데....
제1시험의 필기시험에 임하는 나루토들! 제1시험의 시험관 모리노 이비키는, 고문과 심문의 프로라는 명칭 답게 얼굴에는 그의 과거를 짐작하게 하는 많은 상처를 지닌 특별상급닌자였다. 금새 긴장하는 수험생들. 그리고 이비키로부터 이 시험의 방식이 설명되었다. 문제는 10문제. 모든 문제가 정답이라면 10점으로, 하나가 틀릴 때 마다 1점씩 감점된다. 합격인지 불합격인지는 팀 3인의 합계로 결정되지만, 컨닝에 적발된 사람이 있으면 팀 전원이 불합격이 된다고 하는데.....
제1시험은 수험생들의 「정보 수집 능력」을 조사하기 위해서 행해지고 있었다. 시험관들에게 들키지 않게 컨닝을 하여 시험을 보는 것이었던 것! 그리고 드디어, 제1시험 최대의 난문인 제10번 문제. 만약 이 문제를 틀리게 되면, 제1시험에 불합격이 될 뿐더러 지금부터 평생 중급닌자 시험의 수험 자격까지 잃는다고 하는데...!!
나뭇잎의 마을 3대 호카게 의 손자인 코노하마루가, 중급 닌자 선발 시험의 회장에 나타났다. 닌자 아카데미의 학급 신문에서 중급 닌자 시험의 특집 기사를 맡아, 친구들과 함께 취재하러 왔던 것이다. 나루토들에게의 인터뷰를 하는 형식으로 지금까지의 그들의 활약을 정리하는 장!!
중급닌자 선발 시험, 제2시험의 시험장 「죽음의 숲」에 온 나루토들과 수험자 일동. 시험관인 앙코가 시험 내용을 설명하지만, 무려 그 내용은 서바이벌게임이었는데.....
「죽음의 숲」에서 제2시험이 시작되었다! 소변을 보고 숲에서 나온 나루토를 난데없이 쓰러뜨리는 사스케. 사스케는 적이 나루토로 변신한 것을 알고 있었던 것! 상대를 몰아넣는데 성공했지만 놓쳐 버린다. 그리고 3인은, 뿔뿔이 흩어지게 되었을 때를 위해서 암호를 정한다. 그 때, 나루토들은 또 다시 습격 당해 또 나루토만 멀리 떨어지는데…
사스케와 사쿠라의 위기에 순간 나타난 나루토!! 하지만 사스케는 그런 나루토가 도움이 되지 않을거라고 판단해, 두루마기를 상대방에게 주려고한다. 이에 나루토는 불같이 화를 내며 두루마기를 낚아채고 말한다. "지금의 사스케는 가짜야! 내가 아는 우치하 사스케라는 녀석은 이렇게 멍청한 겁쟁이가 아니야!!"
쓰러진 나루토 앞에서 다시한번 마음을 다잡는 사스케. 비슷한 시각 제 2의 시험관 앙코는 "그"가 돌아왔음을 알아채고 서두르고 있었다. '오로치마루'란 자는 사스케의 혼연의 일격에도 불구하고 상처하나 없는 모습으로, 사스케의 몸에 표식을 남기고 사라진다. 극심한 고통으로 정신을 잃은 사스케와 나루토. 그리고 홀로남은 사쿠라는.....
밤을 지새며 나루토와 사스케를 지키고 간호하는 사쿠라. 그런 그들을 노리는 세개의 그림자가 있었으니... 같은 시각 송충이 눈썹 록리의 팀도 움직임을 개시하고! 점점 지쳐가는 사쿠라에게 소리마을의 세 닌자가 나타난다! 만들어둔 함정들도 간파당하고 위험에 빠진 사쿠라앞에 나타난 그사람은!?
사쿠라를 지키기위해 힘을 다했지만, 꼼짝없이 당해버린 리… 항상 나루토와 사스케의 뒷모습만을 보며 그들에게 지킴받고, 지금은 리 마저도 목숨을 걸고 자신을 지키다가 쓰러졌다. 모두를 지키겠다는 일념으로 다시 일어선 사쿠라! "나도 너희들처럼 강해지고 싶어, 모두들 이번에는 나의 뒷모습을 잘 봐줘!!"
홀로 소리마을의 닌자들과 싸우는 사쿠라 앞에 라이벌 이노의 팀이 나타났다! 록리는 물론, 사쿠라가 싸우는 모습을 지켜보다못한 나머지 사쿠라를 도우러 왔던 것이다. 포메이션「이노시카쵸」로 소리마을의 닌자들을 막아내려고 하는 이노의 팀이었지만…
굉장한 힘을 가진 사스케를 당해내지 못하고 소리마을 닌자들은 도망쳤다. 그리고, 몸과 마음이 지친 나루토 일행에게 잠시동안의 휴식이 주어졌다. 한편, 탑에 도착한 키바조는 수시간전에 이미 탑에 도착해 조금전에 만났던 모래 마을의 가아라를 생각하고 있었다…
소리마을 닌자들과의 싸움이 끝난뒤, 나루토들은 상처 치료하기위해 잠시동안의 휴식을 취하고 있었다. 그러나, 시험이 시작된지 벌써 4일째. 남은 시간은 앞으로 하루정도가 남아있다. 그런 중에, 나루토가 제안을 하는데...바로 자신이 가지고 있는 두루마리로, 필요한 「하늘의 서」를 만들어 버리자고 한다. 게다가 내용까지 똑같이 해야한다며 열어서는 안 되는「땅의 서」를 열어 보려고 하는데!!
카부토와 탑까지 함께 하기로 한 나루토들. 하지만 그 도중에 비 마을 닌자의 술법 함정에 빠져 버린다. 계속 같은 곳을 빙빙 돌아 체력이 떨어진 가운데, 술법으로 만들어진 분신에 둘러싸인 나루토들은 고전을 면치 못하고... 나루토는 상대의 분신을 차례차례로 쓰러뜨리려고 하지만 아무리 쓰러뜨려져도 사라지지 않는다. 한편 사스케도 사륜안으로 적의 본체를 찾아내려고 하나, 오로치마루에게 받은 주인이 반응해 힘을 잘 사용할 수 없다! 초조해진 나루토는, 그림자 분신으로 적의 환영을 한번에 쓰러뜨리려고 하는데…!
간신히 탑에 도착한 나루토들이 두개의 두루마리를 열자, 이루카가 나타났다! 이루카는 나루토들에게 제 2 시험의 합격을 알린다. 그것을 듣자 뛸듯이 기뻐하는 나루토! 그러나, 이루카에게는 시험 합격 외에 또 하나 전하지 않으면 안 되는 것이 있었다. 그것은,「중급닌자」로서의 마음가짐 이었다.
합격자들 앞에 3대 호카게가 나타나 말한 중급닌자 시험의 진짜 목적. 그것은,「동맹국간 전쟁의 축소판」이었다. 사쿠라의 눈물어린 만류에도 불구하고 시합을 하려는 사스케, 한편 앙코는 오로치마루에게 당한 사스케가 시험보는것을 강제로라도 막으려하고…
1 대1의 개인전이 된 제3 시험 예선의 최초 대전은, 사스케와 오로치마루의 부하 요로이. 금년의 NO.1위 루키인 사스케에게 모두 주목한다. 그러나, 시합을 개시하자마자 요로이에게 당하는 사스케! 사스케는 챠크라에 반응하는 주인 때문에, 특기인 사륜안을 쓰지도 못하고 요로이에게 챠크라를 흡수당해가고…
사스케의 주인을 봉인한 카카시의 뒤에, 오로치마루가 나타났다! 오로치마루는 스스로의 야망을 위해서, 사륜안을 가진「우치하」의 힘을 가지고 싶다고 하는데… 한편, 제3시험 예선에서는 사스케에게 공격당해 한쪽 팔밖에 사용할 수 없는 소리마을의 자쿠 아부미와 나뭇잎 마을의 아부라메 시노가 싸우고 있었다. 두 사람의 싸움은, 챠크라를 먹는 대량의 기괴충을 생각하는 대로 조종하는 시노가 유리하게 보였는데!
예선은 순조롭게 이어져, 다음 대전은 모래마을의 칸쿠로 와, 오로치마루의 부하 미스미로 결정되었다. 시합이 개시되자마자 모든 관절을 마치 뱀처럼 움직일수 있는 미스미가 칸쿠로 를 포박했다. 그런데 사실 그가 잡은 것은, 인형이었던 것이다! 칸쿠로는 인형을 조종하는 괴뢰사였고, 형세는 단숨에 역전되 칸쿠로 의 승리로 끝이난다. 그리고 발표된 다음 대전, 사쿠라VS이노. 소꿉친구이자 라이벌인 두 사람의 대전이 시작되었다.
제4회전은, 소꿉친구이며 사스케를 사이둔 연애의 라이벌이기도 한 사쿠라와 이노의 시합. 사쿠라는 어릴 때 이노에게 동경과도 같은 감정을 품고 있었지만, 지금은 마음을 다해서 진심으로 대결!! 이노는 사쿠라의 도발에 빠진척 연극하고, 이혼술로 사쿠라의 몸속에 들어가려고 한다. 이는 본인의 입으로 시합을 기권한다는 말을 하게하려는 작전이었다…
제5회전은 텐텐 VS 테마리. 무기의 달인 텐텐은 다양한 닌자도구로 테마리에게 도전하지만, 거대부채를 사용하는 테마리는 바람으로 모조리 뒤엎어버린다. 텐텐의 무기공격을 완전히 막은 테마리는 승자가 되고, 모래마을의 무서움을 과시했다. 제6회전은 시카마루 VS 킨! 소리마을의 킨이 언듯 유리하게 되는것 같았지만, 시카마루가 특기인 그림자흉내술을 사용한 것에 의해…
제7회전은 나루토 vs 키바. 아카마루를 데리고 있는 키바는, 짐승둔갑술로 나루토를 공격! 위기인가! 라고 생각되는 나루토 였지만, 여기서 끝날 나루토가 아니야!! 연막을 편친 나루토는 그림자분신술에 새로운 기술을 응용해서 키바에게 반격하고 자신의 강함을 주변에 과시했다. 그러나, 아카마루와 키바 도 만만치 않은데…
환을 먹고 차크라를 증가시킨 키바와 아카마루는, 단숨에 나루토에게 반격한다. 한편 나루토는 의외성닌자 랭킹1위 답게 뛰어난 후각을 가진 키바를 혼란시키고, 새로운 필살기로 쓰러뜨린다고 큰소리 치는데! 거기에서 내놓은 나루토 최후의 수단은…?!
제8회전은 히나타 vs 네지. 그들은 같은 일족인 휴우가의 종가와 분가, 즉 친척끼리의 싸움이 되었다. 마음이 약한 히나타는 네지의 박력에 압도 되지만, 나루토의 격려하는 목소리를 듣고, 싸울것을 결심한다. 휴우가가 계승하는「백안」이라고 하는 기술을 가진 2명은, 어떠한 싸움을 하게될것인가…?
네지와의 싸움을 정면에서 도전한 히나타 이지만, 월등한 네지의 실력앞에서 무너진다. 그러나 히나타는 무슨일에도 포기하지 않고 자신의 닌자의 길을 향해 나가는 나루토의 모습을 생각하며, 용기를 쥐어짜 일어선다. 이전의 히나타 와는 다르게, 한계를 넘어서려는 그 모습에 모두가 놀라지만…
제9회전은 드디어 모래마을의 가아라가 등장. 대전 상대는 체술의 스페셜리스트, 리! 표주박 속의 모래를 생각한대로 조종하는 가아라에게, 리는 초인적인 체술을 사용해서 몰아넣는다. 그리고, 드디어 가아라의 절대방어「모래갑옷」이 풀리는듯 하였으나…!?
리 가 금단의 기술인 연화로 가아라를 공격. 승부가 결정된 걸로 보였지만, 그것은 가아라의 빈 모래껍질이었다. 이에 가아라는, 연화에 의해 몸을 움직일 수 없는 리 를 가지고 놀기 시작한다. 궁지에 몰린 리 이지만, 선생님 가이의 격려에 힘입어 다시 일어서고… 연화이상의 금단의 기술로 여겨지는 두번째 연화로 승부를 가리려고 결의하지만… !
목숨을 걸고 금단의 기술 두번째 연화로 공격을 시작하는 리. 이것은, 차크라혈이 밀집한 팔문을 3개 이상 여는 것을 가리킨다. 팔문 모두를 연 상태는, 사용한 닌자의 죽음을 의미한다고 할정도로 이것은 상당히 위험한 금단의 기술이다. 제5의 문까지 연 리 는, 초인적인 고속연속체술을 사용하여 있는힘을 다해 목숨을 걸고 가아라를 공격하지만, 가아라는 모래관으로 맹 반격. 기절해버린 리 는, 자신의 닌자의 길을 증명하기 위해서 또 일어서서려고 하지만…
예선 최종전의 쵸지와 오로치마루의 부하 도스 키누타의 대전은, 쵸지의 육탄전차가 소리공격에 어이없이 무너지면서 도스의 승리로 끝났다. 예선은 모두 무사히 끝나고, 드디어 본선의 내용이 호카게로부터 발표되었다. 그리고 그시각, 오로치마루는 다른계획을 짜고있었는데…
나루토의 선생님이었던 카카시는 1개월 후의 본선에 대비해 나루토의 새로운 선생님으로 에비스를 선택했다. 에비스로 부터 챠크라의 컨트롤이 원활하지 못하다는 것을 지적받은 나루토는 물위를 걷는 수행에 몰두한다. 의외로 빨리 요령을 파악하는 나루토에게 감탄하는 에비스. 바로 그 때, 돌연 두사람의 앞에 어떤 인물이 등장하는데…!
에비스와 나루토 앞에 나타난 것은 전설의 세 닌자중 한사람인 지라이야 였다. 여탕을 몰래 엿보고 있던 그를 [에로선인] 이라고 놀리는 나루토. 그러나 나루토는 에비스 대신 그가 수행의 선생님이 되주었으면 하는 마음을 가지고 있었다. 우여곡절 끝에 나루토의 수행을 돕기로 한 지라이야는 나루토의 배에 있는 구미호의 봉인식을 보다가 수상한 점을 발견 하는데…
만월의 밤, 지붕 위에 있었던 가아라 앞에, 소리마을의 도스가 나타난다. 예선전에서 살아남은 도스는 여기에서 가아라를 쓰러뜨리고, 본선에서 바로 사스케와 싸울 생각인 것이다. 그러나, 가아라는 간단하게 이를 해치워버리고... 그 모습을 몰래 보고 있었던 것은, 모래마을의 바키와 소리마을의 첩자 가부토. 나뭇잎 마을과 동맹국인 모래 마을은, 소리마을과 함께 나뭇잎 마을을 무너뜨리는 계획을 세우고 있었던 것이었다. 두명의 밀회를 엿듣고 있던 하야테는 깜짝 놀란다. 그리고, 어떻게 해서든 먼저 호카게에게 전하고자 하는 하야테 였지만...
나루토는 지라이야 에게서 생물을 불러내 도움을 받을수 있는 소환술 수업을 계속 받고 있었지만, 자신 안에 잠들어있는 구미호의 챠크라를 완전히 소화해내지 못해, 개구리는 커녕 올챙이만 불러댄다. 한편, 사쿠라는 입원해 있는 사스케가 걱정이 되어 병원으로 향한다. 도중에 들른 이노네 꽃집에서 이노를 만나 함께 병문안을 가지만, 병실에 사스케의 모습은 보이지 않고…
나루토가 지라이야에게 수업을 배운지 3주나 지난 어느날, 소환술의 요령을 질문 받은 지라이야는 왜인지 모르게 나루토가 아주 좋아하는 라면을 배터지도록 먹게 하거나, 좋아하는 여자아이를 안아보고 오라는 둥 이해 안되는 행동을 하기 시작한다. 그러나 그 후, 지라이야는 한번 죽어보고 오라며 절벽에서 나루토를 떨어뜨리는데...!! 사실 이런 지라이야의 목적은 죽음의 공포 속에서 나루토안에 잠들어있는 구미호의 챠크라를 끌어내기 위함이었지만..
우여곡절 끝에 결국 구미호의 챠크라를 끌어내어 소환술을 성공한 나루토!! 소환 된 것은 두꺼비들의 두목 [가마분타] 였다! 그러나 기쁜것도 잠시, 가마분타는 '너같은 꼬맹이가 나를 소환했을리가 없다' 며 나루토가 소환한것을 믿지 않는다. 이에 분한 나루토는 가마분타의 등에서 하룻동안 떨어지지 않는 것으로 자신을 주인으로 인정시키려고 필사적으로 매달린다.
본선 전날, 모래마을 일행이 머무는 숙소에서 빠져나온 가아라가 향한 곳은 나루토나 리 들이 입원해 있는 병원. 가아라는 리의 병실에 잠입하여 침대에 잠들어 있는 리를 어쩐지 기분나쁘게 내려다본다. 그리고 곧, 가아라가 조종하는 모래는 리를 습격하기 시작하는데… 바로 그때! 시카마루가 그림자 흉내술로 가아라의 움직임을 멈추고 리를 위기에서 구한다. 그러자 가아라는, '단지 죽이고 싶기때문에 없앤다. 나를 방해하면 너희도 죽인다.' 라고 단언하는데…
드디어 본선 당일!! 나루토의 첫 상대는 휴우가 네지. 처음부터 강한 상대인 네지와 겨루다니... 긴장한 나루토는 예전, 자신이 하급닌자 합격을 받았던 연습장을 찾았다. 그곳에는 나루토를 마음에 두고있는 히나타의 모습이... 그리고 히나타에게서 따뜻한 격려의 말을 들은 나루토는 더욱 힘을 내는 것이었다. 그 후, 서둘러 본선 회장으로 향하는 나루토 였지만 코노하마루가 나타나 대회장의 지름길까지 안내해 준다고 하는데…
드디어 나뭇잎 마을 주최 중급 닌자 선발시험의 예선통과자 8명에 의한 본선이 시작되었다. 그러나, 아직 사스케의 모습은 보이지 않고… 나루토와 사쿠라는 사스케의 신변에 무슨 일이 생긴건 아닌가 걱정한다. 일회전은 우즈마키 나루토VS휴우가 네지. 나루토를 향해서 한번 낙제생은 영원한 낙제생 이라고 단언하는 네지의 앞에 나투토는 반드시 이긴다고 선언한다! 그리고 싸움이 시작되었다!!
제 1 회전으로 휴우가 네지와 대전하게 된 나루토, 인간의 점혈을 간파하는 백안을 사용하는 네지 앞에서 그림자분신술도 통하지 않고 일방적으로 당하기만 한다. 더욱이 네지는 팔괘장 회천 이라고 하는 절대방어의 기술을 가지고 있었다. 이것은 360도의 시야를 가지는 동시에, 공격을 받을때 몸 전체로부터 챠크라를 대량방출하고 그 방출력 만으로 물리적 공격을 막는다고 하는 기술이다. 나루토의 공격을 막은 네지는, 팔괘장 회천으로 나루토의 전신 64개의 점혈을 찔렀다. 결국 설 수도 없게 되버린 나루토 였지만...
나루토와 네지의 대전은, 네지의 압도적인 우세로 계속되고 있었다. 네지가 나루토에게 결정타를 먹인걸로 보였지만, 나루토는 너덜너덜해지면서도 일어서고 승부를 포기하지 않는다. 그러나, 네지의 공격에 의해 점혈이 모두 막혀있기 때문에 나루토는 챠크라를 짜낼수가 없다. 바로 그때! 나루토의 머리속에 지라이야의 말이 떠오른다. 그것은, 나루토안에 잠들어있는 강력한 힘을 지닌 구미호의 챠크라! 그리고 나루토는 결심하는데…
결국 나루토에게 져서 병원으로 운반된 네지의 앞에 휴우가 가의 당주이자 네지의 큰아버지 [휴우가 히아시]가 나타난다. 히아시는, 네지의 아버지 [휴우가 히자시]가 죽었을때의 진실을 전하러 왔다고 하는데... 그동안 네지는 큰아버지인 히아시를 위해서 자신의 아버지인 히자시가 죽임을 당한 것을 원망하고 있었다. 그러나 히아시는 그 때 자신이 죽을 생각이었던 것, 그리고 히자시가 자기 스스로 운명을 택해 죽은 것이라는 것을 전한다. 이 이야기를 들은 네지는 '운명' 이라는 것이 자신이 지금까지 생각하고 있었던대로 처음부터 결정되 있는 것인가, 아니면 나루토가 말한대로 자신이 선택하는 것인가를 생각하는 것이었다. 다음의 시합은 사스케VS가아라. 그러나 사스케의 모습은 아직도 보이지 않고 있다. 나루토는, 사스케는 절대로 올거라고 믿고있는데...
사스케와 가아라의 대전이 뒤로 밀려, 갑작스럽게 시합에 나가게 된 것은 시카마루. 원래 처음부터 의욕이 없었던 시카마루 였지만, 어차피 시간때우기 역할의 시합일 뿐이다 라고 생각해버린다. 더욱이 상대가 여자인 테마리 라는 것을 알고 점점 더 의욕을 잃어간다. 시합중에도 구름이나 보고 부러워 하며, 닌자가 된 것도 인생을 즐겁게 살 수 있을 것 같아서였는데...라고 생각하는 시카마루. 그 모양을 관객석에서 보고있던 쿠레나이는 아스마 에게서 시카마루에 관한 의외의 사실을 듣게 되는데...
시카마루VS테마리의 시합은, 우위로 진행시키고 있었던 시카마루가 돌연 포기선언! 테마리의 승리로 끝났다. 다음은 드디어 사스케VS가아라의 시합이었지만, 사스케는 아직도 회장에 나타나지 않았다. 타임리미트는 10분. 오지않으면 기권이 될 수 밖에 없는데… '사스케는 시합전 수행으로 큰 부상을 당했다'라는 둥 소문이 돌고 나루토는 안달복달, 사쿠라는 기원하는데.....
모두가 가장 주목하는 시합, 사스케와 가아라의 대전이 시작 되었다. 가아라는 「어머니…」라며 누군가와 대화를 하는듯한 어쩐지 기분나쁜 혼잣말을 중얼거린다. 그것은, 가아라 자신에 있어서 사스케가 진심으로 대전할 가치가 있는지 어떤지 분간하는 것 이었다. 제정신이 든 가아라는 모래를 변화시켜 공격을 시작한다. 그러나 사스케는 이전과는 비교도 안될 정도의 스피드로 움직여, 보는 사람들을 놀라게 한다. 그것은 움직임도 기술도 리의 체술과 똑같았다. 자신이 몇년씩이나 걸쳐서 습득한 것을 단 1개월 만에 쓸수 있게 된 사스케를 본 리는 그의 천재성에 놀라움과 부러움에 휩싸이고...
자신의 빠른 공격이 통하지 않자, 새로운 기술을 발동시키는 사스케. 그 기술은 [치도리] 라고 하며, 카피닌자 카카시의 유일한 오리지널 기술이라는데… 사스케가 자신과 같은 타입임을 안 카카시는 그에게 자신의 기술인 치도리를 가르쳤던 것이다. 그 기술로 사스케는 가아라의 모래방어를 뚫고 상처를 입히는데에 성공한다. 자신이 상처를 입었다는 걸 자각한 가아라는 폭주하기 시작하고…
사스케와 가아라의 시합도 한창 열기를 띄어가고 있을 즈음, 누군가 환술을 사용하여 회장전체의 관객들을 재워버린다. 그것은 나뭇잎 마을에 원한을 품고 떠났던 오로치마루를 중심으로, 모래에 의한 나뭇잎 마을을 쓰러뜨리자는 작전의 시작 신호였다. 그러나 모래의 닌자들은 가아라의 상처가 깊은것을 우려하여 일단 후퇴, 가아라를 데리고 시합회장에서 떠나는 것이었다. 사스케와 가아라의 시합은 중지가 되고, 사스케는 시합의 심판인 겐마의 명으로 가아라의 뒤를 쫓는다. 그리고, 카제카게로 변장해 있던 오로치마루가 모습을 드러내어...
나뭇잎 마을을 쓰러뜨리기로 한 소리마을과 모래마을, 그리고 오로치마루가 움직이기 시작했다. 전투의 장소가 된 회장 안에서, 카카시는 사쿠라에게 파도의 나라 이래로 A랭크 임무를 명한다. 그리고 사쿠라에 의해 환술이 풀린 나루토와 환술에 걸린척 하던 시카마루는 이유도 모른체 사쿠라에게 끌려가 사스케를 뒤쫓는다. 한편 망루 위에서는 호카게와 오로치마루가 마주보고 싸우려 하고있는데…
닌자 개 파쿤 과 함께 사스케의 뒤를 쫓고있던 나루토, 사쿠라, 시카마루. 그러나 그 도중 파쿤은 오로치마루의 부하가 9명이나 쫓아오고 있는것을 알아차린다. 그 9명의 수준은 높다고 판단되어, 만약 따라잡힌다면 나루토들은 전멸당할 가능성이 충분하다. 거기에서, 시카마루는 매복작전을 제안. 그 내용인 즉슨 혼자남아 함정이 되어 적의 발을 묶고 있는 사이에 남은 세명이 도망친다고 하는 것이다. 함정 역이 된 자는 죽임을 당할 가능성이 높다! 그리고 함정 역으로 입후보 한것은 언제나 요리조리 피하기만 하던 줄행랑 NO.1 시카마루 였는데...
호카게를 잡아 망루위에 올라간 오로치마루는, 결계를 치고 싸움을 하려하고 있었다. 그리고 오로치마루는, 죽은자를 이 세상에 되살아나게하는 금지된 술법인 예토전생을 이용하여 초대와 2대 호카게를 불러내어 3대와 싸우게 한다. 그리하여, 초대와 2대 호카게 VS 3대 호카게의 슬픈 싸움이 시작되었는데…
가아라, 테마리, 칸쿠로의 뒤를 쫓고있었던 사스케는 드디어 그들을 따라잡았다. 칸쿠로는 가아라를 데리고 도망치고, 사스케의 앞을 테마리가 가로막지만 막강한 실력앞에 실패하고... 한편 망루위에서는 호카게와 오로치마루의 싸움이 계속되고있었다. 오로치마루의 얼굴밑에 숨겨져있던 젊은 얼굴을 보고 놀라는 호카게. 오로치마루는 타인의 육체를 빼앗고, 그 육체에 자신의 정신을 넣어 사용하는 불로불사의 술법을 완성한 것이다. 그리고, 다음 차례로 오로치마루가 노리고 있는 육체는 바로 사스케 였다!! 일찍이 오로치
호카게와 오로치마루의 싸움도 대단원에 다다르고 있었다. 결국 호카게는, 오로치마루도 모르는 소중한 기술인 봉인술 「시귀봉진」을 발동하여 사신을 불러내어 초대와 2대째 호카게를 봉인한다. 호카게의 배로부터 뻗어져나온 사신의 팔은, 오로치마루의 배에 박히어 그 혼을 빼내려고 하는 것이었다. 이 술법에 의해 봉인된 자는, 영원히 성불하지 못하고 사신의 뱃속에서 영원히 괴로워 해야한다. 그러나, 이 술법은 그것과 교환해 술사의 혼을 사신에게 넘겨준다고 하는 것으로...
사스케와 칸쿠로가 싸우려는 중에 나타난 것은 아부라메 시노 였다. 사스케는 칸쿠로를 시노에게 맡기고, 다시 가아라를 쫓기 시작한다. 한편, 숲속으로 도망치고있는 테마리의 등에 업혀있던 가아라가 눈을 떠, 사스케와 대면한다. 바로 그 때, 돌연 가아라가 괴로워 하기 시작, 얼굴의 반쪽에 금이 간다. 가아라의 몸 속에서 무엇인가가 눈을 뜨기 시작한 것이다!
반쪽 몸만 괴물로 변해버린 가아라와 마주한 사스케. 가아라가 사스케와의 싸움에 집착하는 이유. 그것은 자신과 똑같이, 힘을 추구하며, 미움과 살의에 찬 눈을 하고 있기 때문이라고 한다. 가아라에게 있어서 싸우는것은, 다른사람을 죽이는 것으로 자신의 존재가치를 실감할 수 있다는 의미를 가지고 있었다. 사스케에게 너도 같다며 싸움을 걸어오는 가아라. 그때 사스케는, 자신의 일족인 우치하 속에서 자신만이 살아 남은 이유를 되새기고 있었다....
나루토와 사쿠라가 사스케를 쫓아 급히 왔을때, 가아라와 목숨을 걸고 싸우던 사스케는 힘이 다해 쓰러져 있었다. 나루토는 반만 괴물로 변한 가아라의 모습에 놀라고, 사스케를 데리고 도망치기로 한다. 그러나, 가아라가 다시 사스케를 공격! 사스케를 감싸던 사쿠라는 기절해 버린채 가아라의 모래 손아귀에 붙잡히고 만다. 사스케도, 사쿠라도 쓰러져버려 어떻게 해야할지 궁지에 몰린 나루토. 바로 그 때, 가아라는 사쿠라가 사스케를 감싸는 모습에서 자신의 과거를 떠올리며 괴로워하기 시작한다. 가아라는 어릴때부터 괴물이라고 불리며, 누구에게도 사랑을 받지 못하고 자라왔던것이다....
가아라의 압도적인 힘 앞에서, 어떻게 해 볼 도리가 없는 나루토. 동료를 위해서 싸운다는 나루토에 대하여, 가아라 자신은 스스로를 위해 싸운다고 한다. 그런 가아라의 굉장한 과거가 밝혀진다! 괴물 이라고 불리는 두려움의 대상이 되어, 아무에게도 인정받지 못했던 자신의 과거와 가아라의 과거가 겹쳐지는 나루토는 가아라에게 동정한다. 그러나 마음속으로부터 끓어 오르는 「지고 싶지 않다」라고 하는 감정이 폭발해…
가아라의 힘에 당할 재간이 없는 나루토. 그러나, 움직일수 없는 몸으로 사쿠라나 나루토를 구하려고 하는 사스케의 행동을 본 나루토는, 「사람은 소중한 무엇인가를 지키고 싶어질때, 정말로 강해진다」라고 하던 하쿠와 이루카의 말을 떠올린다. 믿을 수 없는 양의 챠크라로 가아라를 압도하기 시작하여 형세를 역전시키는 나루토. 그러나 나루토가 결정타를 날리려는 그때, 엄청난 소리와 함께 결국 가아라는 진짜모습, 수학의 완전체가 되었다!!
가아라의 거짓수면술로 그 본래의 힘을 쓰기 시작한 수학. 콤비변화로 거대한 구미호가 된 나루토와 가마분타는, 거짓수면술로 자고있는 가아라를 깨우는 것으로 수학의 힘을 빼앗자고 한다. 겨우 가아라를 깨우는데에 성공했으나, 여전히 수학의 힘은 강했다. 드디어 가마분타도 조금씩 밀리기 시작하여 가아라의 공격앞에 무너지기 시작하는데… 한편, 나뭇잎 마을에서는 오로치마루와 3대 호카게의 싸움이 계속되고 있었다!
온 힘을 다해 싸운 나루토와 가아라. 이미 두 사람모두 싸우는 것은 물론, 일어설 힘도 남아있지 않다. 그러나, 그래도 소중한 사람을 지키기 위해서 가아라에게 기어가는 나루토. 가아라는 어째서 나루토가 이렇게 강한 것인가 의문에 잠긴다. 마을사람들에게 미움을 받으며, 자신이 누구에게도 필요치 않는 존재라고 생각하며 자라온 나루토와, 가아라. 그러나 두 사람의 결정적인 다른 점은, 그런 자신의 존재를 인정해 준 소중한 사람을 지키고 싶은 마음이었다.
오로치 마루에 의한 나뭇잎 부수기를 겨우 막아낸 나뭇잎 마을. 그러나 상처는 마음속 깊숙히 묻고, 다시 일어서기 위한 작업을 서두르고 있었다. 바로 그 때, 마을에 낮선 두 사람의 모습이 나타난다... 그것은 바로 사스케의 형 우치하 이타치와 수배 S랭크의 중죄인 키사메 였다. 그것을 본 아스마와 쿠레나이는 두 사람의 뒤를 좇는다. 그리고 그 정체를 알아차려, 싸움을 벌이는 것이었다!!
아스마와 쿠레나이의 위기를 가까스로 구한 카카시. 그리고 , 지금까지는 전혀 손을 대지 않던 이타치가 싸움에 합류해, 드디어 사륜안을 지닌 자들의 싸움이 시작되었다. 처음에는 대등한 전개로 시작된 이타치와 카카시의 승부. 그러나, 사륜안의 진정한 계승자인 이타치가, 「최강」이라 불리우며 두려워하는 우치하 일족의 참된 힘을 발동시킨다! 과연 카카시는 그 막강한 힘에 맞서 승리 할 수 있을 것인가!?
현재 행방불명인 전설의 세 닌자 중 한사람인 츠나데의 소식을 알아내기 위해서, 나루토와 여행을 떠난 지라이야. 그는 이번 여행으로 수수께끼의 조직「아카츠키」의 일원이 되어 있는 우치하 이타치로부터 나루토를 지키면서, 자신의 제자로써 수업을 받게 하려고 생각하고 있었다. 지라이야로부터 새로운 기술을 가르쳐준다는 말에 신나하는 나루토. 그런 나루토에게 지라이야는 일찍이 자신의 제자였던 4대 호카게, 그리고 자신의 어렸을적을 연상시키는 것이었다. 한편, 이타치의 환술에 당해 혼수상태가 되어있던 카카시를 병문안 온 사스케는 그곳에서 중대한 사실을 알게된다. 일족을 죽음으로 몰아넣은 자신의 형 이타치가 나뭇잎마을에 나타났다는 것, 그리고 그 이타치가 나루토를 노리고 있다는것... 사스케는 나루토와 지라이야가 향했다는 여관마을로 향하지만...
이타치와 싸우기 위해서 나루토가 향했다는 여관마을로 급히 향하는 사스케. 그는 어렸을 적의 꺼림칙한 과거를 회상하고 있었다. 일찍이 사스케의 동경의 대상이며 자랑이었던 이타치는. 7세에 닌자 아카데미를 톱의 성적으로 졸업하고, 불과 13세의 나이로 나뭇잎 최강의 부대, 암부의 분대장까지 맡고있었다. 그러나, 어느날 밤 홀로 나뭇잎의 최강 가문인 자신의 우치하 일족을 몰살하고 동생인 사스케만을 남겨놓는다. 나루토를 데리고 가려는 이타치. 한편, 사스케는 여관마을에 도착하지만...
키사메에게 당할 찰나에 나타난 지라이야에게 구조된 나루토. 이타치들은, 역시 나루토의 안에 봉인되어있는 구미호의 힘을 노리고 있었던 것이다. 「나루토는 건네 주지 않는다」라고 이타치와 키사메의 앞에서 단언하는 지라이야. 그러자 이타치에게 당해 쓰러져있던 사스케가 일어나 이타치는 자신이 죽일거라고 말하는데....
몸과 마음 모두 중상을 입은 사스케는 가이에 의해 나뭇잎 마을로 돌려보내지게 되었다. 전설의 세 닌자중 한사람, 그리고 의료술의 스페셜 리스트인 「츠나데」가 있으면, 사스케를, 그리고 마을에서 이타치에게 깊은 상처를 입은 카카시를 구할 수 있다… 지라이야와 나루토는 츠나데의 단서를 찾기위해 환락가로 향한다.
드디어 지라이야에 의한 나루토의 수행이 시작되었다. 습득하려고 하는 기술은, 그 4대 호카게가 남긴 술법으로 천재닌자라고 불리는 4대도 습득하는데에만 3년이 걸렸다고 하는 기술이었다. 수행의 제1단계는, 손바닥에서 내보내는 챠크라의 흐름으로 물풍선을 터뜨리는 것. 간단할 것 같이 보이는 수행이었지만… 과연 나루토는 이 제1단계를 클리어할 수 있는 것인지!?
수행의 제 1단계를 겨우 클리어 하는 나루토. 그러나, 다음 단계인 고무공을 챠크라의 힘으로만 터뜨리는 수행은 상상이상으로 어려운 것이었다. 또 다시 겨우겨우 공에 구멍을 뚫는 정도까지는 가지만, 아직 터뜨리는 수준까지는 한참 멀었다. 그런 나루토에게 지라이야는 「손바닥에 먹으로 점을 찍고 그곳에 정신을 집중하면, 힘을 끌어 낼 수 있다」는 힌트를 준다. 다시 수행을 시작하는 나루토. 그러나 바라는대로 성과가 오르지 않고... 그 때, 나루토는 옛날 그리운 닌자 아카데미에서의 일들을 생각해내는데...
탄자쿠성을 둘러보던 시즈네 앞에 돌연 나타난 오로치마루와 가부토. 3대 호카게의 봉인술에 의해 입은 오로치마루의 부상을, 츠나데의 힘으로 치료하고자 함이었다. 그러나, 나뭇잎 마을을 배신하고 3대 호카게를 망자로 만든 오로치마루를 츠나데가 치료해줄리 없다. 하지만 거기에는 츠나데의 슬픈 과거를 이용한 비겁한 거래 조건이 기다리고 있었는데....
자신의 상처를 치료받기위해 오로치마루가 내건 조건은, 츠나데가 가장 사랑하던 남동생 나와키와 연인이었던 단 을 예토전생을 이용해서 소생시킨다는 것이었다. 게다가 팔의 상처가 나았을 경우, 오로치마루는 즉시 나뭇잎 부수기를 재개하겠다고 한다. 대답의 기한은 일주일. 츠나데는 나뭇잎 마을을 생각하며, 이제는 만날수 없는 가장 사랑하던 남동생 나와키와 연인이었던 단 을 만날수 있다는 유혹 사이에서 흔들리는 것이었다. 그런 중에 드디어 츠나데를 만나게된 지라이야는, 5대째 호카게로 취임해달라는 요청을 하지만...
역대의 호카게들은 무시하는 것 같은 츠나데의 말에 화가나 싸움을 건 나루토. 츠나데의 순간의 빈틈을 찔러 수행중인 4대 호카게의 「나선환」을 사용하지만, 어이없게 튕겨나가 버린다. 그러자 츠나데는, 그 다음에는 지라이야를 향해 비난을 시작한다. 그것을 듣고 화가 난 나루토는 3일 내에 「나선환」을 마스터 하겠다고 선언해버린다. 그런 나루토에게 츠나데는 일주일 내에 「나선환」을 마스터 할 수 있게되면, 초대 호카게가 했던 목걸이를 건네준다고 말한다. 그 목걸이는, 츠나데의 소중한, 그리고 괴로운 추억이 들어있는 것이었다. 게다가, 츠나데의 슬픈 과거가.......
츠나데로부터 목걸이를 받아내기 위해, 일주일만에 기술을 마스터 하리라고 필사적으로 덤비는 나루토. 한편 츠나데는 일찍이 사랑했던 남자와 남동생을 되살려준다고 하는 오로치마루의 유혹에, 아직 망설이고 있었다. 빨리 대답을 하지 않는 츠나데에게 가부토는 의심을 하지만 「반드시 조건을 받아들인다」라고 오로치마루는 자신있어한다. 그 시각, 술집에서 술을 마시고 있던 지라이야는......
나와키와 단을 한번이라도 좋으니 다시 만나고 싶은 츠나데는, 오로치마루의 유혹에 앞에서 망설이지만 두 사람과 같은 꿈을 가진 나루토와 모습이 겹쳐져, 겨우 단념한다. 무슨 일이 있어도 츠나데의 힘으로 자신의 팔을 치료하고 싶은 오로치마루는, 츠나데의 최고「약점」을 가지고 공격하기 시작한다. 그리고 그것에 의해 츠나데는 재기 불능상태에 빠져버린다. 한편 나루토는, 「너에게 닌자의 재능은 없다」라는 말을 가부토에게 듣고 충격에 휩싸이고.....
소환술로 커다란 뱀을 불러낸 오로치마루와 가부토. 그리고 그 앞에 약 때문에 아직 챠크라를 잘 사용할 수 없는 지라이야는, 가마분타의 아들 가마키치를 소환해버렸다. 오로치마루에게 당하는 지라이야를 보고 화가 난 나루토도 소환술을 하지만, 등장한 것은 가마키치의 동생 가마타즈! 오로치마루에게 밀리는 지라이야.「나루토에게는 재능이 없다」라고 말하는 오로치마루에게, 지라이야는「닌자에게 중요한 것은 재능이 아니라, 포기하지 않는 끈질긴 근성이다」라고 되받아친다. 한편, 시즈네와 나루토를 쓰러뜨린 가부토는, 떨고있는 츠나데에게 다가가 공격하기 시작했다. 그것을 보고 분노로 가득찬 나루토는 어떻게 해서든 몸을 일으켜, 반격을 하려고 하지만....
「자신이 내뱉은 말은 굽히지 않는다」그것이 자신의 닌자의 길이라고 하는 나루토. 가부토에게서 받은 상처로 인해 비틀거리면서도 나와키와 단이 쫓았던 것과 같은 꿈을 가진 나루토를 보고, 츠나데는 최후의 희망을 건다. 그녀는「혈액공포증」이 있었지만, 나루토를 지키려는 마음이 그것을 극복시킨다. 그러나, 그 때문에 봉인을 풀어버려......
모두 소환술을 사용하는 지라이야, 츠나데, 오로치마루의 사투가 시작되었다. 지라이야와 츠나데는 두사람의 힘으로 오로치마루를 공격하지만, 역시 그렇게 간단히 쓰러뜨릴수는 없다. 상처입은 몸을 질질 끌면서, 필사적으로 오로치마루에게 달려드는 츠나데 였지만, 어떤 위화감이 느껴지고 있었다. 그 위화감이 의미하는 것은....?
5대째 호카게가 되는 것을 정식으로 임명받기 위해서 나뭇잎 마을로 향하는 나루토들. 그러나 츠나데의 발언에 의해 도중에 온천가에 들르게 된다. 그곳에서 나루토들을 기다리고 있었던 것은, 츠나데가 빌린돈을 받으려고 하는 아카기 일당이었다. 나루토들이 온천을 즐기는 사이에 목걸이를 훔쳐 달아난 아카기 일당. 뒤늦게 알아챈 나루토가 쫓아가지만, 그들의 이야기를 듣는동안 동정심에 이끌려버린다. 그리고 나루토는, 아카기 일당과 손을 잡기로 하고.......
호카게 취임 전에 사스케와 리 의 부상 치료를 츠나데에게 부탁하는 나루토. 리를 진찰한 츠나데는 그에게「닌자 이외의 길을 찾아라」라고 심한 통고를 한다. 중급 닌자 시험때 사막의 가아라와 싸운 리의 몸은, 이미 망가질대로 망가졌던 것이다. 「체술만으로도 훌륭한 닌자가 될수 있다는 것을 증명한다」 그것이 리의 목표였다. 그러나, 그 희망이 끊어진 리는 이제부터 어떻게 해야 하는 것인가....
츠나데로 부터, 닌자를 그만 둘 것인가, 또는 살지 죽을지 성공률 50%의 수술을 받을 것인가 라는 말을 듣고 주저하는 리. 한편, 3대 호카게와 충격적인 이별을 한 코노하마루는 5대의 취임을 준비하느라 3대의 물건들을 정리하는 모양을 보고 화를내며 호카게의 방에 들어가 틀어박혀 버린다. 아직 그 상처가 아물지 않은 것인가… 이에 나루토가 찾아가 코노하마루를 나오게 하기위해 설득을 해보지만…
츠나데로 부터「닌자를 그만둬라」라는 선고를 받은 리는, 자신의 스승 가이 를 만났을 때를 회상하고 있었다. 둔갑술도, 환술도 할 수 없어 언제나 주변에서 좋지 않은 눈으로 보여졌던 리. 그러나 가이 만은「열혈만 있으면 된다」라고 힘차게 말해 주었다. 그런 가이의 말로 인해, 리는「체술만으로도 훌륭한 닌자가 될수 있다는 것을 증명한다!」라는 꿈을 가지고, 그 어려운 수업들을 극복했던 것이다. 한편, 리에게 죽음과도 다름없는 선고를 한 츠나데는, 그의 마음을 아플만큼 느끼고 있었다. 그리고 츠나데는 성공률 50%인, 실패하면 목숨을 잃고 마는 어려운 수술을 실행하려는 결의를 확고히 하지만........
나루토들 세명에게 있어서, 눈아래를 마스크로 가리고있는 카카시의 맨 얼굴은 항상 수수께끼. 그 맨 얼굴을 보기위해서 세명은 계획을 세우는데.... 우선은 카카시에게 라면을 대접하고, 마스크를 때고 먹는 순간을 보기로 한 세명. 평소와는 다른 세명의 행동을 수상하게 여기면서도, 카카시는 라면을 먹지만 금새 작전은 실패. 어떻게 하더라도 진짜 모습을 보고싶은 나루토들은, 계속 다른 작전을 실행하지만......
나루토, 사스케, 사쿠라에게 B랭크 임무가 떨어졌다. 츠나데의 말에 의하면, 이웃나라 차의 나라에서 4년에 한번 펼쳐지는 토도로키 신사에서 열리는 레이스에 참가하는 사람들을 호위해주었으면 싶다고 하는듯. 그리고 세명은 의뢰를 한 와사비 일가의 두목 지로쵸 에게 보내진다. 지로쵸에게 향하는 도중, 나루토들은 닌자가 아주 싫다는 수수께끼의 소년 이다테를 만나게 된다. 이다테는 나루토들에게 트집을 잡고 달려가 버리지만, 그 발의 속도는 엄청난 것이었다. 그리고 지로쵸에게 도착한 나루토들은, 이번 임무의 내용을 듣고 놀라는데....
도망치듯이 달려나간 이다테를 따라잡은 나루토들은, 비의 닌자들에게서 이다테를 지키기위해 필사적으로 설득을 시작한다. 그러나 닌자를 싫어하는 이다테는 귀를 귀울이려고 하지도 않고… 그러는 동안에도 비의 닌자들이 바로 근처까지 접근하고 있었는데…
비의 닌자들과의 수중전에 고전하는 나루토 들이었지만, 어떻게든 도망치는 데에 성공, 이다테를 따라잡았다. 그러나 그곳에 있는 것은, 상처입어 의식을 잃은 이다테와 여유있는 미소를 띄운 아오이의 모습이었다. 같은 시각, 와가라시 일가의 주자인 후쿠스케는 자신의 승리를 확신하고 잠시 휴식에 들어가 있었다. 이다테가 왜 닌자를 미워하는 것인가, 어째서 지로쵸 두목에게 목숨을 걸고 충성을 다하는 것인가....
아오이의 방해에도 굴하지 않고, 필사적으로 골을 향하는 이다테. 나루토들에게 도움을 받으면서도 결코 아무도 믿지 않으려하는 이다테의 슬픈 과거가 밝혀진다. 일찍이 닌자를 목표로 하고있었던 이다테는 중급 닌자시험때에 시험관이었던 형 이비키가 낸, 열번째의 문제에서 탈락하고 말았던 것이다. 결국 아오이의 꾀임에 넘어가 마을에서 달아나다 이비키와 마주치게 되고, 이비키는 자신의 목숨을 걸고 이다테를 구해주지만, 이다테는…
와사비 일가와 와가라시 일가의 불꽃 튀기는 토도로키 신사의 봉납의식. 그 레이스도 드디어 종반에 이른다. 이다테를 믿고 골에서 기다리는 와사비 일가의 두목 지로쵸. 그러나 이다테 앞에는 와가라시 일가가 고용한 닌자, 아오이가 가로막고있다. 골을 눈 앞에 두고 아오이에게 당하는 사스케. 그 사스케를 도우려고하던 사쿠라도 함께 벼랑 아래로 떨어져버린다. 한편, 상처입은 나루토는 남은 힘을 쥐어짜 일어선다. 이다테를 지키고, 사스케와 사쿠라를 돕기위해... 그리고 드리어 나루토와 아오이의 마지막 대결이 시작되었다!!
중급 닌자를 목표로 뜨겁게 펼쳐졌던 선발시험. 그러나 최종 시험이 중단된 탓에 합격자가 없는 것인가.. 하고 생각되었지만, 시카마루가 추천되어 중급닌자로 승격이 결정. 즐거운 듯한 시카마루 들에 아랑곳 않고, 리는 다시 닌자로써 움직일 수 있는 몸을 되찾기 위해 위험한 수술을 받을 결심을 더욱 확고히 하고 있었다. 그 시기 사스케는 병실에서 생각에 몰두하고 있었다. 나루토는 새로운 기술을 익히고 나날히 강해져 간다...사스케는 그런 나루토에게 심한 질투를 느끼고 있었던 것이다. 거기에 또 다시 오로치마루의 그림자가 드리우는데...
드디어 시작된 나루토와 사스케의 진지한 승부. 두 사람은 서로 심하게 흥분한 나머지, 결국 나루토는 나선환을, 사스케는 치도리를 발동한다. 이미 기술을 멈출 수 없을 그때, 두 사람 사이에 사쿠라가 뛰어들어온다!! 그리고 간발의 차로 카카시가 나타나 위기는 넘어가지만, 이미 나루토와 사스케의 사이에는 균열이 생겨버린 뒤... 나루토의 성장 속도를 느끼고 열등감을 품는 사스케, 형인 이타치의 복수에 불타 올라 나루토의 실력을 인정할 수 없다. 그러던 중 돌연 그 앞에 소리의 닌자 4명이 나타나는데....
이타치에게 복수를 하는 것에 불타오르고 있었던 사스케는, 그 분노를 소리의 닌자들에게 표출하고만다. 그러나, 소리의 닌자들은 압도적인 힘으로 사스케에게 맞서온다. 한편, 사쿠라와 나루토는 라면집에 있었다. 사스케의 몸에 새겨져있는 오로치마루의 주인에 대해 걱정하는 사쿠라에게 괜찮다고 밝게 당언하는 나루토. '사스케는 그런 녀석의 권유는 받아들이지 않을 것이다' 라고 하는 나루토의 말에, 사쿠라는 마치 구제된 양 함께 미소짓는 것이었다…
필사적으로 만류하는 사쿠라의 말에 귀를 귀울이지 않고, 소리의 닌자 들의 유혹에 결국 나뭇잎 마을을 떠나고 마는 사스케. 그것을 안 츠나데는 사스케를 마을로 데리고 오기 위해 시카마루를 불러들인다. 그러나, 시카마루의 중급닌자로서의 첫 임무는 배후에 오로치마루가 있어 꽤나 성가신것. 게다가, 대부분의 상급 닌자들은 임무로 인해 마을 밖에 있다... 그리하여 시카마루는 나루토, 쵸지, 네지, 키바와 아카마루 인 '5명+1마리'를 모아 사스케를 쫓기로 한다. 시카마루의 재빠른 판단으로 철벽의 포메이션을 만든 나루토들은, '반드시 사스케를 데리고 돌아온다' 고 사쿠라에게 약속하고 출발하는 것이었다...
소리의 닌자 4명과 함께 소리 마을로 향하는 도중, 사스케는 주인의 힘을 증폭시키기 위해 성심환을 먹고 가사상태가 된다. 소리의 닌자들은 사스케를 통안에 넣어 봉인하고, 오로치마루에게로 향한다. 그때 임무를 마치고 돌아오던 라이도와 겐마가 이들을 막아서지만 당하고 만다. 상급 닌자와의 싸움에 지쳐 쉬고 있는 소리의 닌자들을 따라잡는 나루토들. 그러나 기색을 눈치챈 상대에 의해 선제공격을 받아버리는데!
상황을 염탐하러 간 시카마루와 네지, 그러나 기색을 눈치채버린 상대에 의해 선제공격을 받고 만다. 결국 모두 들켜 꼼짝달싹 못하는 상태!? 인줄 알았지만 시카마루의 그림자 흉내술을 쓰기위한 작전이었다. 그러나 성공한줄 알았던 작전이 역으로 뒤바껴 지로보의 술법으로 흙벽의 결계 안에 갇혀버리는데… 게다가 그 갇힌 상태에서 차크라도 흡수 당하고 있다..!
시카마루의 판단과 쵸지의 파워로 다섯명은 결계로부터 탈출하는 것에 성공한다. 지로보의 우롱에 화가 나, 반격을 시작하는 나루토와 키바였지만 간단히 당해버리고... 이대로는 사스케가 국경을 넘어버려 자신들의 손이 닿지 않는 곳으로 가버린다고 판단한 시카마루는, 사스케를 쫓는 팀과 지로보의 발을 묶는 팀으로 나눠야 한다고 판단. 그리고 쵸지가 혼자 남는다고 자진 하는데…
먹으면 폭발적인 힘을 발휘할 수 있는 파랑, 노랑, 빨강 삼색의 비약을 가지고 이번 임무에 임하던 쵸지. 그 비약에는, 약의 효과가 없어지면 온몸이 아프다는 부작용이 있었다. 우선 파란 시금치 환, 이어 노란 카레 환 을 먹으며 공격하지만 지로보는 지금까지의 10배 이상의 힘으로 반격해온다. 비약의 부작용으로 움직일 수 없게 된 쵸지에게 지로보는 사정없이 덤벼들어 차크라를 흡수한다. 멀어지는 의식 속에서, 쵸지는 어린날의 시카마루와의 만남을 떠올리고 있었다.....
사스케를 넣은 관을 가지고 서두르는 소리의 닌자들은, 나루토들이 지로보를 쓰러뜨리고 쫓아올거라고는 생각지도 못한채 함정도 설치하지 않고 서두른다. 그 헛점을 찔러서 공격하기로 하고 둔갑술로 지로보로 변신한 시카마루가 소리의 닌자들과 합류한다. 그러나 곧 간파되어 거미줄을 토하는 키도마루의 거미줄 술법에 잡혀 버리고 마는데…
나루토의 재치로 겨우 거미줄에서 빠져 나오지만 여전히 키도마루의 공격에는 밀린다. 키도마루의 공격패턴을 파악한 네지는 여기는 자신에게 맡기고 떠나라며 아이들을 먼저 보낸다. 서로의 기술이 먹히지 않는 양자의 공방. 서로 한 발짝도 불러서지 않는 상태가 계속되는데…
백안의 비밀도 들켜버리고, 몸의 한계를 느끼는 네지. 키도마루의 화살이 백안의 사각지대로 인해 보이지 않는 네지는 온 몸의 챠크라를 방출해 겨우겨우 이를 막아내고 있는데… 백안의 사각을 막아낼 방법도 없고 약점을 들긴 네지는 이대로 키도마루에게 당해버리는 것인가...!
사스케를 내일중으로 오로치마루의 수중에 넘기지 않으면 안되는 소리의 닌자들과, 그 뒤를 쫓는 나루토, 시카마루, 키바&아카마루 세명과 한마리. 계속 소리의 닌자들을 따라잡지 못하자 조바심내는 나루토와 키바는, 밤 사이에 기습공격을 하자고 제안한다. 그러나 시카마루는 밤의 공격은 위험하여 불리한 점이 많다고 판단, 아침까지 기다려서 기습공격을 하자는 작전을 세운다. 그 때, 나뭇잎 마을의 3대 호카게에 의해 깊은 상처를 입은 오로치마루는 죽음의 문턱을 넘나드는 고통으로 괴로워 하고 있었는데...
결국 사스케를 되찾는 것에 성공한 나루토들, 그러나 그 뒤에 사스케를 빼앗겨 투지에 타오르는 사콘과 타유야가 다가온다. 아카마루는 퇴각 하면서도 나무에 기폭찰을 붙혀 사콘을 함정에 빠트린다. 그러나, 분노에 정신이 나간 사콘에게 붙잡히고 나무에 묶여 버린다. 간발의 차로 키바가 아카마루를 구출해 내지만, 그 순간 기폭찰이 폭발! 키바와 아카마루는 사콘과 함께 골짜기 아래쪽으로 추락하는 것이었다.
숲 속에서 타유야의 발을 묶으려는 시카마루는, 타유야의 술법이 불러낸 세명의 거인들로 인해 맥을 못 추고 있었다. 거인들의 공격을 겨우 막아내는 것이 한계인 시카마루… 한편, 초원에서는 키미마로와 나루토의 싸움이 시작되려 하고있었다. 나루토의 그림자 분신들에게 둘러싸인 상황에서도 대담한 미소를 짓는 키미마로. 그리고 그 때, 골짜기의 아래쪽에서 싸우는 키바와 아카마루 앞에는 새로운 적이 모습을 나타내고 있었는데…
다른 사람의 몸에 침입할 수 있는 우콘은, 키바의 몸에 들어가 그 세포를 파괴하려 하고 있었다. 이에, 키바는 우콘을 자신의 몸에 잡아놓은뒤 자결을 결심하고 수리검으로 복부를 찌른다. 아픔에 괴로워하는 키바와 우콘. 그리고 키바가 숨통을 끊으려 한 순간, 우콘은 키바의 몸으로부터 나온다. 같은 상처에서 피를 흘리며 괴로워하는 우콘에게, 키바를 남은 힘을 쥐어짜내서 수리검과 연기구슬을 던지고 몸을 숨긴다. 그 때, 나루토는 키미마로의 혈계한계를 눈으로 확인하고 두려움에 놀라고 있었는데...
우콘과 사콘에게 상처를 입히고 아카마루를 안고 탈출한 키바. 같은 시기 나루토는 키미마로의 힘 앞에 고전을 면치 못하고 있었다. 한 편 시카마루는 타유야가 조종하는 세명의 거인에게 애를 먹고 있었다. 타유야가 부는 피리의 곡조가 바뀌자마자, 거인들의 입으로부터 물질화 영혼이 토해져 나오기 시작한다. 물질화 영혼들은 시카마루의 팔에서 신체 에너지를 뜯어 먹으며 공격에 박차를 가하는데...!
결국 타유야를 그림자 속박술로 붙잡는 것에 성공한 시카마루. 그러나 '상태2' 가 된 타유야는 막강한 파워로 다시한번 역공을 펼친다. 한번 더 공격당하면 이번에야 말로 당한다고 확신한 시카마루는 최후의 수단으로 결판을 낼 것을 다짐한다. 그 때, 키바는 아카마루의 상처를 치료하고 자신의 상처에도 약을 바르고 있었다. 그러나 그 뒤로 다가오는 그림자가...! 한 편 나루토는 수 많은 그림자 분신술로 맞서보지만 키미마로에게 한방 먹이는 것도 힘든 상태... 키미마로의 막강한 힘에 놀라는 나루토! 그 순간 봉인 되어있던 통 안에서 연기와 함께 사스케가 나왔다!! 그러나 사스케는 숲 안쪽으로 떠나버리고...
돌연 모습을 나타낸 리 에게 키미마로를 맡기고, 눈을 뜬 사스케의 뒤를 쫓는 나루토. 그러나, 사스케는 그런 나루토를 비웃기라도 하는듯한 미소를 띄우며, 이를 무시하고 숲 안쪽으로 들어가 버린다. 키미마로의 발을 묶고 있던 리는 약이라고 생각해서 잘못 가져온 츠나데의 술을 바셔버린다. 사실 리는 굉장한 주정쟁이로 술을 마시면 취권을 쓰는 사람으로 돌변한다. 취하면 취한만큼 강해지는 취권. 리는 휘청거리면서도 강렬한 공격을 퍼붓는데…
소리 닌자의 압도적인 강함에 절체절명의 시카마루, 키바, 리 앞에 나타난것은 모래의 닌자, 가아라, 테마리, 칸쿠로 였다!! 리에게 덤벼드는 키미마로를 모래의 벽으로 막아낸 가아라. 그런 가아라의 태도를 의심하는 리 였지만, 사실은 나뭇잎의 5대 호카게 츠나데가 모래마을에 도움을 요청했던 것이다. 같은 시각, 타유야의 힘에 밀리고 있었던 시카마루는 테마리의 술법에 놀라고 있었다. 그리고, 이미 세명의 낌새를 눈치 채고 있었던 키바는, 칸쿠로의 등장에 그다지 놀라지 않는 모습인데...
가아라의 철벽의 모래 가드를 부수는 것이 곤란한데다가, 컨트롤 할 수 있는 모래의 양이 한정되어 있다고 생각한 키미마로는 접근전을 포기하고 원거리에서 공격을 가한다. 그러나, 자신의 뼈를 손가락 끝으로 연달아 날리는 키미마로의 공격에도 가아라는 물러서지 않고 방어와 공격을 동시에 펼쳤다. 모래로 흙 속의 암석이나 광물을 부수어 모래로 만들어, 대량의 모래를 구사해 마침내 키미마로를 모래 안에 감금하는데 성공한다. 기뻐하는 리였지만 가아라는 '키미마로는 사스케와 같은 눈을 하고 있다' 라고 하는 것이었다...
그 시각 키미마로의 카구야 일족에 대해 떠올리는 오로치마루와 카부토... 한 편 가아라를 지키는 절대방어인 모래의 벽을 뚫고 훌륭하게 공격을 성공시킨 키미마로는, 자신의 등뼈를 채찍으로 만들어 가아라에게 덤벼들어왔다. 하지만 아직 가아라의 모래 공격에 맞서기에는 역부족... 다시한번 더 깊은 땅속으로 키미마로를 뭍어버리지만 키미마로는 고사리의 춤을 구사하며 역공을 펼친다. 땅속에 모래와 함께 뭍혀버린 키미마로는 오로치마루를 따랐던 지난날을 되새기는 것이었다. 모두와 함께 나뭇잎 부수기에 동참했었지만 몸이 약했던 탓에 중도 하차할수 밖에 없었던 그날... 처음으로 오로치마루를 만났던 그날을...
그 때 나루토는 오로치마루에게 향하는 것을 서두르는 사스케를 겨우 따라잡았다. 그러나 사스케는 이미 예전의 사스케가 아니라 반신은 주인표식으로 뒤덮히고, 어쩐지 기분나쁘게 변한 왼쪽 눈은 이상한 빛을 발하고 있었다. 울면서 '사스케를 데리고 돌아와 줘'라고 부탁한 사쿠라. 목숨까지 걸고 여기까지 온 시카마루, 그리고 쵸지, 네지, 키바, 록 리… 그런 동료들의 마음을 짓밟는 사스케에게 분노를 느끼는 나루토 였는데…
오로치마루에게 향하는 사스케를 막기위해 애써보는 나루토. 그러나 사스케는 사륜안을 사용하지도 않고 나루토의 공격을 매우 간단히 막아내어, 반대로 공격을 걸어왔다. 그리고 사스케는 형인 이타치를 따라잡기 위해서는, 더욱더 강한 힘과 미움이 필요하다고 하는 것이었다. 어린 날의 사스케의 기억에는. 동생을 생각하는 상냥한 이타치의 모습이 있었다. 사스케는 그런 이타치를 동경하면서도, 아버지의 기대를 한몸에 받는 이타치가 부럽기도하고, 또 얄밉기도 했던 것이다. 우수한 닌자인 이타치를 따라잡기 위해서 어린 사스케는 한결같이 그 등만을 바라보며 계속 쫓고 있었지만...
사스케를 나뭇잎마을로 데리고 돌아가기 위해 필사적인 나루토. 그러나 나루토의 그림자 분신술도 사스케의 사륜안에 간파되어 반대로 호화구술에 당해버린다. 사스케에게는, 이 호화구술에 깊은 추억이 깃들어있었다. 그 술법은 우치하 일족 대대로 전해지는 것으로, 이 것을 쓸 수 있어야 일족의 한 사람으로 인정 받을 수 있게 되는 것이다. 어린 시절, 사스케가 처음으로 아버지에게 가르침 받은 술법도 이것으로, 그때까지 형인 이타치에게만 관심을 가져준 아버지가 처음으로 자신을 바라봐 준것이 사스케는 기뻤다. 그러나, 사스케는 아버지의 눈 앞에서 술법에 실패해 버린다. 그 날 이후로, 너덜너덜해지면서도 필사적으로 수행하여 술법을 습득한 사스케는 드디어 아버지에게 칭찬받게 되지만...
나루토를 폭포아래로 떨어뜨린 사스케. 물 밑으로 가라앉아 가는 나루토를, 사스케는 '그 어떤 것이 있더라도, 힘을 손에 넣는다' 라고 조용히 내려다본다. 그리고 그 날의 일들을 떠올리는 것이었다. 친했던 마을 사람들, 그리고 양친마저도 쓰러뜨린 것은 어떠한 방법으로 만화경 사륜안을 쓸 수 있게 된 이타치였다. 충격을 받은 사스케는 이타치에게 캐묻지만, 그는 '자신의 그릇을 알아보기 위해 모두 죽였다'라고 차갑에 답하는데…
나뭇잎 마을 밖으로 나가버린 사스케와 나루토가 걱정된 사쿠라는 카카시에게 이를 상의 한다. 두명이 정말 서로를 죽일지도 모른다고 생각한 카카시는 그들의 동향을 살피기 위해 닌자견을 파견한다. 어떻게 해서든 힘을 손에 넣고싶은 사스케는 나루토를 진심으로 쓰러뜨리려 하고 있었다. 가장 친한 친구를 쓰러뜨리면 만화경 사륜안을 가질 수 있다는 형 이타치의 말이 있었기 때문이다. 나루토는 '너는 나에게 있어서 가장 친한 친구가 되었다...'라는 사스케의 말에 감동을 받으면서도 그를 마을로 데리고 돌아가기 위해 응전한다. 치도리를 발동시키는 사스케, 나루토는 그림자분신으로 나선환을 만들어 반격, 두 사람은 서로 격렬하게 맞서지만....
나루토와 사스케의 싸움은 그 강도를 더해가고 있었다. 굉장한 구미호의 기운으로 사스케를 날려버리는 나루토. 쓰러진 사스케의 멱살을 잡아 일으키며, 팔다리를 부러뜨려서라도 억지로 끌고 가겠다는 나루토에게 부모도 형제도 없는 네가 나의 무엇을 아느냐고 질문한다. 그러나 사스케를 특별한 친구라고 생각하고 있는 나루토는, 마치 형제와도 같이 보내온 지난 날들을 떠올리는 것이었다. 자세를 고쳐잡은 사스케는 나루토와의 관계를 끓으려는 결심을 하지만....
나루토가 가진 구미호의 차크라는 마치 의지를 가진것처럼 멋대로 움직여, 사스케에게 강렬한 공격을 퍼붓고 있었다. 그리고 드디어 사스케의 몸에도 변화가 나타난다. 솟아오른 등에서 마치 손과 같은 날개가 뻗어 나온 생긴 것이다. 아픔에 전신을 떨면서 더이상 시간이 없다는 것을 직감한 사스케. 한편, 나루토는 왼손의 감각이 없어지고 있었다. 힘을 얻은 대가로 데미지를 입었던 것이다. 폭포를 사이에 둔「종말의 골짜기」에서 과연 두 사람의 결판은…!?
사스케와의 격투끝에 쓰러져버린 나루토에게 카카시가 급히 달려왔다. 한편 의료반에서는 호송된 부상자들의 치료가 계속 되고 있었다. 시카마루는 경상. 키바는 상처가 깊지만 생명에 별 지장이 없지만 쵸지와 네지 두명이 중태... 임무에 희생은 부속물처럼 따라오는 것이라고 알고는 있었지만 시카마루는 심하게 흔들리고 있었다. 소대장으로서의 힘의 부족함을 실감하며 '자신은 닌자에 어울리지 않다'고 테마리에게 말하는 시카마루. 거기에 나루토가 돌아왔다는 소식이 들려오지만...
빨리 수행을 시작하고 싶어서 병실을 빠져 나가는 나루토. 그러나, 의료반에게 발각되어 잡혀와 침대에 꽁꽁 묶이는 신세가 되어버린다. 몰래 마을을 빠져나가려는 사쿠라. 그녀의 결심을 알아차린 나루토는 줄을 잡아뜯고 사쿠라를 쫓아간다. '말려도 소용없어'라는 사쿠라에게 자신도 함께 간다고 하는 나루토. 바로 그때 나무그늘에서 지라이야가 나타났다! 지라이야는 '사스케가 가버린 소리마을이 있는 밭의 나라를 조사하고, 보고하라' 는 호카게로부터의 임무가 내려졌다고 하는데...
수상한 가게에서 즐기고 있는 것 같은 지라이야를 버려두고, 나루토와 사쿠라는 변두리로 향한다. 그곳에서 두 사람은 부상을 당한채로 누군가에게 쫓기는 사사메를 만난다. 눈 깜짝할 사이에 사사메를 구하는 나루토. 한편 지라이야는 호스티스에게서 소리마을의 소문을 잘 아는 인물이 있다는 말을 듣고, 골목길로 향한다. 그곳에 돌연 도둑으로 전략한 닌자 한자키 일행이 습격하기 시작한다. 그러나, 상대가 나뭇잎마을의 전설의 세 닌자인 지라이야 라는 것을 안 한자키는 급히 항복한다. 그리고 지라이야는 한자키로 부터 소리마을의 닌자 일족들의 이야기를 듣게 되는데...
거미줄을 이용해 찾아온 후우마 일족의 카미키리, 지쿠모, 카게로에게 공격당하는 나루토, 사쿠라, 사사메. 그 순간 지라이야가 찾아와 싸움에 박차를 가하고, 자신들이 열세하다고 판단된 카미키리 들은 순식간에 멀리 도망가는 것이었다. 사사메의 안내로 나루토 일행은 오로치마루의 아지트가 있는 소리마을의 입구에 다다른다. 의욕이 넘쳐서 어서 빨리 가자고 재촉하는 나루토 들이었지만, 지라이야에 의해 단번에 제지. 본격적이기에 앞서 우선은 배를 채우자고 하는 지라이야의 말에 할수없이 순순히 따르는 나루토 들이었는데....
우여곡절 끝에 사사메의 안내로 인해 나루토, 사쿠라, 지라이야는 오로치마루의 아지트의 도착했다. 지라이야는 정찰을 위해 소환술을 이용, 가마키치를 불러내 앞세워 보낸다. 모두들 가마키치의 뒤를 따라 구불구불한 계단이나 긴 통로들을 지나가지만 갈림길을 만나 나루토와 사쿠라, 그리고 지라이야 두 패로 나뉘어 버렸다. 나루토들은 위험한 함정들을 통과하며 지나간다, 그러나 함정에 빠지는 사쿠라를 감싸고 나루토는 그만 대신 빠져버리는데…
오로치마루에게 압박 당하는 사쿠라. 그리고 카부토가 사쿠라를 향해 수리검을 던졌을때 나루토가 나타난다. 나루토는 그림자 분신술로 카부토를 농락하며 쿠나이를 다 써버리게 만든다. 한편 카부토는 화둔 안개 연무술을 이용해 반격, 나루토의 분신들은 연기가 되어 사라져 버린다. 그러나 나루토의 나선환이 카부토의 가슴에 직격, 승부가 결정 되는듯하는데…
카미키리, 지쿠모와 한 몸이 되버린 끔찍한 모습의 아라시. 공격당하는 사쿠라를 감싸는 나루토의 등에 카미키리의 가위가 꽂혀버린다. 자신이 아무 도움도 못되고 나루토에게 상처를 입히자 괴로워 하는 사쿠라. 하지만, 그런 사쿠라를 위로하고 다시 아라시를 공격하는 나루토! 그러나 부상을 당한 나루토는 그림자 분신으로 대항하지만 점차 밀려가는데…
의료닌자를 목표로 하는 사쿠라는 차크라의 미묘한 컨트롤을 수련하고 있었다. 한편 부상을 회복하고 기운이 넘치는 나루토는, 갑작스러운 임무로 외출하게 된 지라이야 때문에 심기가 불편하다. 지라이야는 그런 나루토에게 자신이 부재중에 있을때 할 특별 트레이닝 이라며 두루마기를 건네 주는 것이었다. 그 때, 호카게 집무실에서 서류 처리에 임하던 츠나데는 나뭇잎마을의 엄중경계시설 자료를 보게된다. 그곳은 중죄를 저지른 닌자들을 수용하는 시설로, 죄수들에게 굴을 파는 노동을 시키고 있는 것이었는데...
톤톤의 후각을 이용하여 탈옥한 미즈키를 쫓아가는 시즈네 일행. 그러나 후진과 라이진에 의해 시즈네가 당해버린다. 나뭇잎 마을에서는 미즈키 사건에 오로치마루가 얽혀있는 것을 알아차린 나루토가 츠나데에게 따진다. 바로 그때 톤톤이 돌아와 필사적으로 무언가를 전하려고 하는데… 나루토는 시즈네의 위기를 직감하고 츠나데의 제지도 듣지 않고 '시즈네를 구하고 오로치마루를 쓰러뜨려 사스케를 데리고 돌아온다' 라고 뛰쳐 나가버리는 것이었다.
미련하면서도 괴력의 소유자인 후진, 라이진 에게는 나루토의 공격이 통하지 않는다. 그림자 분신을 이용한 미끼작전으로 시간벌기를 하고있는 나루토의 앞에 최강 트리오가 등장하는데..!? 한편 이루카는 미즈키에게 공격을 받고있었다. 미즈키의 수리검을 막아내면서 '같이 불의 의지를 계승할 나뭇잎마을의 가족' 이라고 설득을 계속하는 이루카. 그러나 미즈키에게는 먹히지 않고 진심으로 이루카를 쓰러뜨리려 하는데…
후진, 라이진에게 고전을 면치 못하는 나루토의 앞에 시카마루, 이노, 쵸지가 등장! 츠나데의 명령을 받고 온 세명에게 뒤를 맡기고, 나루토와 파쿤은 미즈키를 쫓는다. 후진, 라이진의 움직임을 시카마루가 그림자 흉내술로 잡아두고 있는 사이 이노가 이혼술로 후진의 몸에 들어가고, 쵸지가 라이진과 맞붙는다. 이리하여 그들은 '포메이션, 이노시카쵸'를 완성하는 것이었다! 그 때 이루카는 피가 묻은 대나무 잎으로 키즈키를 쫓고 있었는데....
츠바키가 미즈키의 약혼녀 라는 것을 알게된 나루토. 미즈키를 말리고 싶은 츠바키는 함께 데려가 달라고 나루토들에게 부탁한다. 미즈키가 갈 장소로 짐작가는 곳이 있다고 하는 츠바키. 이전에 봉인의 서를 훔치기로 한 미즈키는 '오로치마루의 힘을 손에 넣어 그에게로 간다' 라고 이야기 한적이 있었다는 것이다. 미즈키의 진짜 목적을 알고 놀라는 나루토들. 그 때, 나라 일족의 사슴 목장에 있는 연구시설에 미즈키가 나타나 연구원 들을 습격하고, 약제를 훔져 멀리 달아나는데...
미즈키가 펼치는 차크라의 질과 파워에 나루토와 이루카는 압도된다. 나루토는 그림자 분신술로 맞서지만, 미즈키에게 당할뿐이다. 나루토를 지키기 위해 결국 이루카는 수리검을 꺼내드는데… 한창의 싸움 중에 미즈키의 몸에 변화가 일어나 호랑이 인간과 같은 모습으로 변신, 파워업한 미즈키였지만 파쿤과 이루카는 그 스피드가 미묘하게 약해진것을 민감하게 알아채고 있었다.
어느날 호카게에게 미향충을 이용해서 사스케를 찾는다는 아이디어를 전하기 위해 키바, 시노, 히나타가 찾아온다. 미향충은 닌자견의 몇천배의 후각을 지닌 벌레로, 냄새의 끝을 어디까지라도 쫓아간다. 일찍이 아부라메 일족이 사용하던 모양이었지만, 지금은 멸종위기로 인해 지극히 극 소수로 서식하는 환상의 벌레인 것이다. 산란은 몇 년에 한번으로, 올해가 산란의 해, 지금이 정확히 부화 시기에 해당한다고 한다. 키바, 시노, 히나타 세명. 그리고 그 이야기를 엿들은 나루토까지! 호카게는 미향충 찾기를 명하는데...
닌자견의 몇천배의 후각을 지닌 미향충을 찾는 임무로 키바, 시노, 히나타와 함께 나루토는 벌레들이 사는 바위 마을로 향한다. 사진을 단서로 미향충을 찾아다니는 일행이지만, 나루토는 벌레의 차이를 모른채 장수풍뎅이 같은 엉뚱한 벌레를 찾아내서는 시노들에게 핀잔만 듣는다. 그런 나루토들의 모습을, 뒤어서 몰래 지켜보는 닌자들이 있었는데…
카미즈루일족의 말벌들에게 히나타가 끌려가 버린다. 카미즈루일족은 땅의 나라 바위마을에서 주로 벌을 조종하는 일족. 지금은 불과 몇 명밖에 없다고 한다. 그들은 다양한 비술을 기록한 초대의 비전서를 찾아내기 위해서 미향충을 손에 넣으려 하는 것이었다.카미즈루일족은 나루토들이 잡은 미향충과 인질인 히나타와의 교환을 요구한다. 고민하던 나루토들... 결론은 히나타를 되찾고 미향충도 지키기 위해 스즈메바치들과 대결을 벌이는 것! 그리고 나루토들은 미향충이라고 속이고 변신한 장수풍뎅이를 건네는 것이었는데....
카미즈루일족의 말벌들에 의해 나루토, 키바, 시노는 여왕벌의 벌집에 갇힌다. 화가 난 여왕벌이 토해내는 밀납에 갇혀 나루토 일행은 꼼짝도 못하게 된다. 그러나 시노는 인질이 된 히나타와의 교환이 아니면 미향충을 건네지 않겠다고 선언한다. 부화의 시간이 다가오자, 스즈메바치는 시노의 요구를 받아들이기로 한다. 히나타가 잡혀있는 장소로 향하는 일동. 그러나 그곳에 히나타의 모습은 없었다....
나뭇잎마을에서 수행 중이던 나루토는 급류에서 로쿠스케, 하치다이, 산고로를 구조하게 된다. 세명은 강의 나라 카타바미 광산에서 나뭇잎 마을에 임무를 의뢰하러 왔다고 한다. 유수의 광산촌인 카타바미 광산에는 마을의 경호를 핑계삼아 '쿠로스키 패밀리'라 자칭하는 사악한 자들이 쳐들어와 마을을 지배하고, 이유도없이 사람들을 죽인다고 한다. 츠나데는 나루토, 리, 네지, 텐텐에게 '로쿠스케 일행을 카타바미 광산으로 바래다 주고, 쿠로스키 패밀리를 제거하라'는 임무를 명하는데....
카타바미 광산의 묘지에 생매장 된 동료를 기도하는 마음으로 파내는 로쿠스케. 그러나 쿠로스키 무리에 둘러싸여 잡히고 만다. '너의 장례식을 치뤄주마' 라고 로쿠스케에게 선언하는 라이가. 그동안 '장례식'을 목적으로 마을사람들을 죽여 왔던 것이다. 한편 나루토는 광산에서 활개 치는 쿠로스키 무리들을 보고 분노를 억누를 수 없는데....
네지는 백안으로 적의 위치를 파악하지만 이는 란마루가 만들어낸 허상일뿐, 나루도들의 공격도 허사로 돌아간다. 하지만 네지의 백안으로 적의 모습을 발견, 공격하지만 그것들의 정체는 말라죽은 나무나 바위였을 뿐… 사물에도 경락계가 보인다는 사실에 네지는 놀라는데.... 곧이어 이어지는 라이가의 공격에 아이들은 기절해버린다.
쿠로스키 패밀리가 도망가고 카타바미 광산에도 평화가 온 듯 보였다. 그러나 카라시는 무언가를 계획하고 있는 듯 한데… 이윽고 낭떠러지 위에 숨어 있던 쿠로스키 무리가 커다란 바위를 떨어뜨리며 나루토 일행에게 기습을 걸어 왔다! 쿠로스키 무리는 연달아 공격을 퍼붓는데...!
되살아난 라이가가 본 것은 죽은 듯이 누워있는 란마루. 절망한 라이가는 숨길 수 없는 분노를 내뿜고, 격렬한 번개를 부른다. 라이가를 막기위해 필사적으로 응전하는 텐텐. 그러나 라이가의 분노와 슬픔은 좀처럼 가라앉지 않는다. '나뭇잎마을에서 나루토 일행 놈들만 오지 않았더라면 나와 란마루는 영원히 함께 할 수 있었는데' 라고 생각한 라이가는…
라이가와 맞서 싸우던 리는 라이가의 공격에 절벽에서 떨어진다. 카라시 일행은 카레를 가지고 라이가에게 향하고 란마루와 할머니는 리에게 카레를 먹이고 텐텐은 나루토를 찾아나서고 카라시는 네지를 찾아나선다. 리는 카레를 먹고 정신을 차리지만 실수로 와인이 들어간 카레로 인해 만취하고 나루토는 정신을 차리지만 네지는 술 때문에 기절하고 만다. 란마루는 죄값을 치르기 위해서 라이가와 죽으려고 하지만 만취한 리가 나타나 수포로 돌아간다. 란마루는 라이가에게 생명의 카레를 먹고 사람을 해치는 일은 그만두자고 하지만 배신감에 불탄 라이가는 란마루를 공격한다. 나루토는 라이가에게서 란마루를 구하고 란마루를 보내주기 위해 연기까지 한 라이가는 스스로 죽음을 맞는다. 란마루는 생명의 카레집에서 일하게 되고 아이들은 나뭇잎마을을 향해 떠난다
닌자학교학생들과 조를 이뤄서 서바이벌 훈련을 가게 된 나루토, 처음에는 싫다고 성질을 부리지만 츠나데의 말솜씨에 넘어가 코노하마루 모에기 우돈과 함께 연습에 참가한다. 서바이벌 내용은 다쿠라미산 정상의 바위에 있는 기밀문서를 가지고 1등으로 도착할 것. 승부욕에 불타는 나루토는 지도를 못 읽고 길을 잃자 1등을 할 욕심에 아이들을 이끌고 비가 쏟아지는데도 지정된 루트외의 위험한 길로 향한다. 폭우 소식에 이루카와 교관들은 연습을 중지결정을 내리지만 나루토의 조가 루트를 벗어난 것을 알고 찾아나선다. 동굴에서 비를 피하던 코노하마루와 아이들은 닌자에게 중요한 건 팀욱이란 나루토의 말에 감명을 받고 다시 목적지로 향하지만 나루토가 바위에 깔려 위험에 처한다. 힘을 합쳐 나루토를 구한 아이들와 나루토는 마을로 돌아오지만 나루토는 사고 때문에 츠나데에게 혼줄이 난다.
츠나데는 한 영주의 다기를 훔쳐간 도둑 고슨쿠기를 잡아오라는 임무를 내리고 나루토는 좀도둑 잡는 시시한 임무라며 툴툴거린다. 마침내 고슨쿠기가 숨어있다는 돌의 나라에 도착한 나루토와 키바, 히나타는 곳곳에 붙어있는 고슨쿠기의 현상수배포스터를 본다. 그리고 술집에 들어간 아이들은 술집에 있던 불량배와 시비가 붙고 한 남자가 아이들을 구해준다. 자신을 현상금 사냥꾼이라고 소개한 남자는 고슨쿠기를 잡기 위해 나뭇잎마을에서 온 닌자라는 아이들의 말에 아이들을 마을 밖으로 유인해서 정신을 잃게 만든다. 정신을 차린 아이들은 고슨쿠기를 찾아 뒤를 쫓고 남자는 고슨쿠기를 만나 공격하지만 고슨쿠기에 당하고 아이들은 남자를 구하지만 그가 일가족을 살해해 수배중이라는 포스터를 보고 깜짝 놀란다.
깨어난 사자나미는 자신의 과거사를 털어놓는다. 작은 마을의 대장장이로 살다가 축제날 주문받은 칼을 전해주러 갔다가 고슨쿠기와 마주친 일, 고슨쿠기가 저지른 죄를 뒤집어쓰고 마을 떠난 고슨쿠기를 잡아 누명을 벗기 위해 현상금사냥꾼이 되었다는 얘기를 털어놓는다. 그리고 고슨쿠기를 양보해주겠냐고 하지만 아이들은 거절하고 고슨쿠기를 뒤쫓는다. 분신에게 유인당한 아이들은 고슨쿠기가 오케이절의 황금종을 훔쳐 달아나는 것을 보고 뒤쫓는다. 아이들을 따돌린 고슨쿠기는 사자나미에게 잡히지만 사자나미는 자신을 뒤쫓던 가츠라는 현상금사냥꾼에게 잡히고 만다. 하지만 가츠의 도움으로 사자나미는 누명을 벗고 무죄를 입증한다.
가이와 리가 원정임무를 떠나는 날, 나뭇잎마을의 기밀문서를 빼내 마을의 영웅이 되어서 되겠다는 꿈을 가진 어설픈 두 닌자 몬다이와 폿챠가 가이와 리로 변장해서 마을로 잠입한다. 어설픈 변장 탓에 모두 가이와 리가 아니란 걸 알아보지만 둘은 그 사실을 꿈에도 모른 채 마을을 돌아다니고 결국 이 사실은 츠나데의 귀에까지 들어간다. 한편 나루토는 둘을 가이와 리로 착각해서 같이 체술수행을 하자고 졸라대고 결국 둘은 허락하고 만다. 그러던 중 텐텐이 나타나 세 사람을 농가로 보내고 둘은 거머리에 피를 빨리며 모내기를 하고 거름까지 뒤집어쓴다. 그 후 사쿠라가 나타나 바람에 날아간 빨래를 찾아달라는 통에 고생을 한다. 마지막으로 츠나데까지 나타나 감기에 걸린 카츠유를 돌봐달라고 하고 카츠유의 콧물에 혼줄이 난다. 결국 모든 것을 포기하고 마을을 빠져나가려 하지만 가이와 리를 만나 공격 한방에 날려가고 만다.
새의 나라라는 가난한 먼 나라에서 유령을 퇴치해달라며 찾아온 치시마, 츠나데는 자기 돈까지 털털 털어 부탁하는 치시마 탓에 할 수 없이 의뢰를 받아들인다. 나루토는 돈이 없어 라면가게 근처를 어슬렁거리던 치시마를 만나 라면을 사주고 친구인 영주를 걱정하는 모습에 임무를 맡겠다고 나서지만 유령 얘기에 겁을 먹는다. 텐텐 네지와 함께 길을 나선 나루토는, 현 영주인 치시마의 친구 사기는 아버지의 의문의 죽음 이후 책사 코메이의 방해로 힘들게 영주에 취임했고 그 후 여동생마저 죽은 뒤 실의에 빠졌으면 저주받은 무사라는 유령은 선대 영주라는 소문이 돈다는 얘기를 듣고 저주받은 무사의 뒤에 코메이가 있다고 확신한다. 마을에 도착한 아이들은 저주받은 무사와 마주치고 쓰러진 갑옷 안이 텅 빈 것을 보고 깜짝 놀란다.
아이들은 모소의 집으로 찾아가고 모소는 반드시 무사의 정체를 밝혀달라며 정중히 부탁한다. 아이들은 무사의 출현에 대해 얘기하며 모든 것이 코메이의 짓이라 결론내리고 사기를 만나기 위해 사기의 추억의 장소로 향한다. 호수에서 여동생과의 추억을 되새기는 사기, 하지만 자객이 나타나 사기를 해치려 하고 사기는 아이들의 도움으로 목숨을 구한다. 그러나 사기는 아이들과 치시마에게 차갑게 대하고 치시마는 아버지와 여동생의 죽음으로 사기가 변했다고 말한다. 자객들이 던진 수리검이 코메이가 이끄는 근위병이 쓰는 것임을 알고 아이들은 코메이가 범인이라 확신하고 코메이의 집으로 가 어디론가 향하는 코메이를 뒤쫓는다. 코메이가 무사와 마주치는 순간, 무사에게서 이전과는 달리 인간의 기척이 느껴지지만 쓰러트린 후 열어본 갑옷 안은 다시 비어있다. 코메이는 체포당하고 네지는 무사는 둘이라는 결론을 내린다.
모소는 코메이가 자백했으니 사건이 다 해결되었다며 모두 돌아가라고 하지만 납즉할 수 없다며 나루토는 의문을 제기한다. 만류하던 네지도 나루토의 말에 일리가 있다며 재조사에 응하고 나루토는 무사가 나왔던 낡은 사당으로 간다. 소환술로 불러낸 가마키치, 가마타츠와 함께 사당을 둘러보던 나루토는 검은 연을 발견해 하늘을 나는 무사의 비밀을 푼다. 또 비밀통로를 발견해 그 통로를 따라가자 영주의 집으로 나온다. 영주의 집에서 들킨 나루토는 지하감옥에 갇히고 그 곳에서 저주받은 무사의 정체가 사기라는 사실을 알게 된다. 사기는 복수를 하기 위해서 죽어도 좋다며 비밀을 아는 나루토를 죽이겠다고 한다. 한편 영주의 묘에 간 네지와 텐텐은 선대 영주가 독살됐음을 눈치채고 영주의 병사에게 쫓기다 카카시와 마주친다. 하지만 카카시는 나루토를 구하러 가자는 말에 냉정하게 임무 이외의 일은 하지 말라고 한다.
카카시는 아이들에게 마을로 돌아갈 것을 명하고 이를 몰래 지켜보던 닌자는 이들을 뒤쫓는다. 하지만 카카시는 바꿔치기술로 이를 따돌린다. 모소는 코메이를 반역자로 칭하며 처형하려 하지만 저주받은 무사가 나타나 코메이를 데려가고 병사로 변장했던 카카시와 아이들도 이를 뒤쫓는다. 카카시는 추적자를 눈치채고 아이들을 보내고 혼자 남고 아이들은 무사를 쫓아 사당으로 간다. 카카시는 특이한 술법을 가진 닌자 나가레와 맞붙고 아이들은 사당의 지하통로를 들어간다. 아이들과 코메이를 데려온 무사는 나루토로 부상을 입고 쫓아온 치사마의 말에 모든 사실을 알게 된 나루토가 코메이를 구하러 갔던 것. 사기는 코메이에게 사과의 말을 전하고 자기 손으로 원한을 갚겠다며 다짐한다.
복수를 다짐하는 사기를 본 나루토는 사스케를 떠올리고 말리려하지만 사기는 나루토일행을 가두고 떠나고 나가레는 결국 카카시의 손에 쓰러진다. 한편 사기의 죽음 후 복수를 위해 사기행세를 했던 토키는 저주받은 무사로 변장해서 모소를 치러 가지만 잡히고 정체까지 발각된다. 뒤이어 쫓아온 나루토일행이 위기에서 토키를 구해내지만 덕망높은 모소로 가장했던 떠돌이닌자의 우두머리 호키는 떠돌이닌자로 떠돌며 훔쳐낸 술법과 속임수로 눈을 돌리게 한 후 토키를 데려간다. 뒤이어 쫓아간 나루토는 병풍에서 나온 배를 타고 병풍속의 세계로 들어간다.
모소의 환술에 홀려 위험에 빠졌던 나루토는 치시마덕에 정신을 차리고 토키를 인질로 잡고 있던 모소는 떠돌이닌자의 우두머리인 자신, 호키의 본모습을 드러내고 나루토를 공격한다. 하지만 치시마가 대신 공격을 받고 쓰러지며 토키를 지켜달라고 한다. 나루토는 호키를 공격하다 물에 빠지고 그 곳에서 사기의 영혼을 만난다. 사기는 토키가 복수가 아니라 새의 나라를 맡아주길 원했다며 멈춰버린 시간을 다시 움직여달라고 부탁한다. 물밖으로 나온 나루토는 그림자분신으로 호키를 쓰러트리고 토키에게 사기의 얘기를 전해준다. 그 후 토키는 다시 영주의 자리에 올라 새의 나라를 잘 다스릴 것을 다짐한다.
쵸지와 라면을 먹으러 간 나루토는 가게문을 닫고 라면을 끓이는 라면집 주인 테우치와 마주친다. 새 라면을 맛본 두 사람은 수프는 훌륭하지만 면이 별로라고 평하고 테우치는 핫카쿠라는 요리닌자가 환상의 요리법을 요구하며 딸인 아야메를 데려가서 새 메뉴를 개발중이었다고 한다. 아이들은 아야메를 되찾기 위해 테우치로부터 면 뽑기를 배운다. 다음날 대결이 시작되고 첫 번째 반죽을 망친 나루토는 번째 반죽을 닌자스타일로 해서 쫄깃한 면을 뽑아내는데 성공하고 결국 요리닌자들은 항복한다. 그리고 요리닌자가 살아남기 위해 테우치가 가지고 있다는 환상의 요리법이 필요했다고 하지만 그 요리법이 그저 국물의 쓴맛 없애는 요리법일 뿐이란 것을 알고 절망한다. 한편 요리닌자의 맛있는 요리를 먹고 살이 찐 아야메는 테우치가 개발한 다이어트라면 덕에 다시 날씬해지지만 테우치는 뼈만 남은 꼴이 되고 만다.
나루토는 앙코를 따라 시노 이노와 함께 해마를 퇴치하고 현금수송선을 경호하라는 임무를 맡도 바다의 나라로 떠난다. 한편 오로치마루를 따랐던 앙코는 어린 시절 오로치마루가 지워버린 기억 때문에 괴로워한다. 바다의 나라로 가기 위해 바닷마을로 온 아이들은 그 곳에서 바다의 나라의 중심인 엄마섬에 산다는 소녀 이사리비를 만난다. 이사리비는 많은 사람들과 실종됐다가 혼자 나타나는 바람에 마을 사람들에 섞이지 못 하고 혼자 살아가는 소녀다. 해마 때문에 배를 태워줄 수 없다는 말에 아이들은 배를 빌리고 밤바다를 배로 건넌다. 하지만 미스미와 요로이의 공격을 받아 배는 침몰하고 나루토는 혼자 바다에 빠지고 만다. 그리고 어디선가 헤엄쳐온 이사리비가 나루토를 구해낸다.
나루토를 찾지 못 한 앙코와 시노는 일단 숙소로 가고 오로치마루는 자신을 위해 실험중이라는 아마치라는 사내를 만난다. 한편 바다의 나라측은 현금수송선의 출발이 내일로 앞당겨졌다고 얘기한다. 나루토는 이사리비가 구해준 것을 알고 살갑게 대하지만 이사리비는 냉담하고 동네 아이들의 장난에서 구해줘도 차갑기만 하다. 한편 나루토를 찾아 다니던 이노와 시노는 마을 주민들로부터 귀계섬과 귀신놀음이 상관있다는 얘기를 듣고 이사리비의 집으로 향한다. 어디론가 향하는 이사리비의 뒤를 쫓던 앙코와 이노 시노는 이상한 몸으로 변한 이사리비를 해마로 간주하고 생포한다. 앙코는 이사리비를 보고 10년 전 오로치마루가 지워버린 자신의 기억 속에서 오로치마루의 실험을 기억해낸다. 한편 달려온 나루토는 이노가 잡은 해마가 이사리비란 것을 눈치채지만 요로이가 나타나 이사리비를 데리고 사라진다.
나루토는 이사리비가 자신을 구해줬다며 역성을 들지만 아이들은 귀 기울이려 하지 않는다. 한편 기절했다가 눈을 뜬 앙코는 사건의 범인은 해마가 아니고 오로치마루의 실험시설에서 생체실험을 통해 몸을 변형시킨 것이라고 인간이라 말하고 함께 귀계섬으로 향한다. 귀계섬에 도착한 앙코와 아이들은 기다리고 있던 닌자와 괴생물체의 습격을 받는다. 나루토는 아마치로부터 수중닌자부대를 만들기 위해 생체시험을 했다는 말에 아마치를 해치우려 하지만 이사리비는 다시 인간으로 돌아가고 싶다며 나루토를 막고 아마치는 이사리비와 함께 떠난다. 무너지는 건물에 갇힌 나루토와 아이들은 출구를 찾아 달린다.
겨우 빠져나온 아이들은 현금수송선에 타기 위해 항구로 향하지만 현금수송선은 해마를 퇴치했다는 거짓전갈을 받고 출발하지만 결국 이사리비와 아마치를 만나 위기에 처한다. 뒤늦게 나루토 일행이 나타나고 나루토는 이사리비를 말리지만 이사리비는 다시 인간이 될 수만 있다면 누가 죽든 말든 상관없다고 한다. 이상한 약품으로 앙코는 정신을 잃고 아마치는 자신도 이상한 모습으로 변신한다. 이사리비에게 해부자료로 쓰려고 했다는 아마치의 말에 나루토는 분노하지만 아마치의 공격에 번번히 당하고 아마치가 불러낸 괴물에 잡힌다. 이사리비는 아마치의 말에 나루토를 공격하려 하고 앙코는 이사리비에게 구미호에 얽힌 나루토의 비밀을 알려주고 나루토 안의 구미호의 본성이 깨어난다.
이노와 시노는 힘을 합쳐서 요로이를 해치운다. 도망가려던 아마치는 붙잡히지만 바다괴물이 다시 살아나 공격하고 나루토는 가마분타를 불러내지만 바닷물에 몸이 가려운 가마분타는 화를 낸다. 그러나 자신을 무시하는 아마치의 말에 화가 난 가마분타는 나루토와 힘을 합쳐 바다괴물을 처치한다. 이사리비는 나루토를 해치라는 아마치의 말을 거절하고 앙코는 아마치에게 오로치마루가 어디 갔는지를 묻지만 모른다고 대답한다. 앙코는 잃어버린 기억을 되찾기 위해 둘째섬으로 향하고 그 곳에서 주인을 남긴 열명의 아이 중 자신만이 살아남았고 자신은 오로치마루에게 버려진 것이 아니라 같이 가자는 오로치마루를 스스로 거절했다는 것을 기억해내고 기뻐한다. 나루토는 앙코와 아이들 그리고 이사리비와 함께 나뭇잎마을로 향한다.
나루토는 요인이라는 말에 신나서 임무를 맡겠다고 하지만 그 임무가 자신이 생각하던 요인경호가 아니라 닌자를 동경하는 버릇없는 부잣집 꼬마의 1일 닌자체험놀이를 봐주는 일이란 것에 치를 떤다. 여느 때처럼 D등급 임무를 수행하는 나루토곁에서 버릇없는 꼬마는 돈으로 경호원들을 마구 부리고 친구도 돈으로 사면 된다고 한다. 나루토는 꼬마에게 돈 쓰지 않고 자기 힘으로 원하는 것을 손에 얻는 법을 가르쳐주려고 하고 잘 따르던 아이는 그만 돈을 노리는 악당들에게 잡히고 경호원들은 돈을 쫓아 꼬마를 배신한다. 나루토와 도망친 꼬마는 나루토가 위험한 순간에 용기를 내서 나루토를 구하고 돈이 다가 아니라는 사실을 깨닫는다.
임무 없는 생활에 지루해하던 나루토와 키바는 츠나데가 부른다는 말에 신나게 달려간다. 츠나데는 자신의 지인이라는 아가리가 의뢰한 보물 찾기를 하라면서 세사람의 임무성공률이 낮다며 실패하는 경우 닌자학교로 돌려보내겠다고 한다. 나루토와 키바는 서로 상대 탓이라며 싸우고 나루토는 자기가 선택한 길을 맞다며 키바와 따로 다니다 고생만 한다. 그러다 종유동굴을 발견하고 키바의 만류에도 불구 동굴에 들어갔다가 동굴 붕괴를 겪는다. 이 일로 히나타는 다리를 다치고 키바는 아카마루와 둘이 보물을 찾아오겠다고 떠나고 남아있던 나루토는 불시의 공격으로 정신을 잃는다. 정신을 차려보니 히나타가 둘이고 당황한 나루토 앞에 아가리와 자신의 가짜까지 나타난다. 가짜 히나타와 가짜 나루토는 키바에게 가고 키바까지 잡아온다. 그리고 키바얼굴까지 베낀 세 명의 가짜는 나뭇잎마을로 가서 엉망으로 만들 것이라과 경고한다.
아가리와 가짜일행은 동굴에 기폭찰을 설치한채로 동굴을 떠난다. 나루토와 키바는 또 빠져나갈 방법에 대해 얘기하며 싸움을 벌이고 히나타가 수호팔괘로 폭발로부터 아이들을 지켜낸다. 억지로 부상을 티내지 않고 따라가려던 히나타를 본 나루토와 키바는 지나치게 둘을 의식하는 히나타와 너무 솔직한 말로 싸움을 벌이는 자신들의 문제를 깨닫고 히나타를 두고 먼저 출발한다. 하지만 이미 가짜들은 감쪽같이 마을로 들어간 상황, 이 소식은 급히 츠나데에게 보고된다. 나루토와 키바는 가짜들을 찾아내지만 생각외로 약한 그들에게 놀라고 가짜 나루토가 깔아놓은 외상값 때문에 나루토는 혼쭐이 난다. 결국 가짜를 잡는데 성공하지만 그것이 팀웍을 알아보기 위한 시험이었다는 얘기에 모두 깜짝 놀란다. 그리고 나루토가 가져온 가방을 열어본 츠나데는 시험을 함께 한 일족이 발급한 청구서를 보고 절규한다.
임무를 수행하고 돌아가던 나루토는 우연히 파발닌자를 만나게 된다. 그리고 잠시 들린 온천마을에서 지라이야를 만나는데 원고를 쓰기 위해 체류중이던 지라이야는 아카츠키 멤버가 모레 오기로 했다며 수행을 하자는 말에 시간이 없다고 거절한다. 결국 나루토는 멋대로 원고를 쓰고 파발닌자에게 출판사로 보내달라고 전하는데 이 과정에서 그만 다른 파발닌자와 내용물이 바뀌고 만다. 원고를 멋대로 써서 보냈다는 말에 화가 난 지라이야는 나루토와 파발닌자를 쫓아 우편물을 뺏지만 거기에 전운이 감도는 두 나라에 전쟁을 막을 화친의 밀서가 있음을 알고 다시 우편물을 바꾸기 위해 어금니의 나라로 가는 닌자를 다시 찾아나선다. 가까스로 따라잡지만 파발닌자와 동료들은 우편물을 전하기 위해 안간힘을 쓰고 결국 우편물이 전달되고 만다. 하지만 러브러브 시리즈 원고를 본 영주는 기분이 좋아져서 전쟁을 그만두고 화해를 결정하고 두 사람은 넋이 나간다.
100년 전 별이 떨어진 별마을에서 의뢰가 들어온다. 차크라에 영향을 주는 별을 노리는 자가 있기 때문. 나루토는 사스케에 대한 정보를 얻을까 하는 마음에 네지 리 텐텐으로 결정된 팀에 츠나데에게 뇌물로 양갱을 주고 따라나선다. 독가스에 당하지 않도록 별마을에서 마중나온 소년 스마루는 마을 수장에게 아이들을 안내하고 호시카게의 대리라는 아카호시와의 대화 중 스마루는 외부사람에 대한 적의와 마을을 일으킬 강한 열망을 드러낸다. 스마루는 나루토와 별이 있는 수행장으로 향하고 별을 훔쳐나오는 사람을 발견한다. 나루토가 쫓아가지만 스마루와 똑같은 인법을 쓴 사람은 별을 가지고 달아나고 스마루는 그 인법은 별의 수행을 한 사람만 쓸 수 있는 인법이라고 말한다.
스마루와 아이들은 별의 도난사실을 아카호시에게 알린다. 별을 가져간 자가 공작묘법을 썼다는 말에 반응을 보이는 아카호시를 본 네지는 뭔가 내막이 있음을 직감하고 리와 텐텐에게 아카호시를 감시하라고 한다. 나루토는 별마을 아이들을 찾아가지만 모두 스마루와 별을 찾아 나갔다는 얘기와 10년 전 스마루의 부모가 별을 지키다 죽음을 맞았다는 얘기를 듣게 된다. 한편 리와 텐텐은 아카호시를 감시하다 아카호시가 만나는 사람들을 뒤쫓지만 들키고 별은 자신들이 찾을테니 방해나 하지 말라는 말을 듣는다. 스마루와 친구들은 차크라를 뒤쫓아 죽음의 계곡으로 가서 정체불명의 닌자를 만나지만 오히려 당하고 그 자는 스마루를 데려간다.
스마루를 납치해간 아카호시는 나루토와 아이들에게 스마루를 납치해간 것이 별을 훔쳐간 것과 동일한 사람으로 생각하게 만들어서 적도 해치우고 별도 되찾을 계략을 꾸민다. 정신을 잃은 스마루는 부모를 잃고 슬퍼하던 자신에게 별마을 닌자로서의 태도를 가르쳐준 3대 호시카게를 떠올린다. 한편 호쿠토로부터 별의 수행을 하다 몸이 상해서 죽는 사람까지 있다는 말에 아이들은 놀란다. 네지는 마스크를 쓴 닌자가 둘이라 결론을 내리고 리와 텐텐에게는 아카호시를 감시하라고 한다. 왜 아이들에게 별의 수행을 시키냐는 나츠히의 질문에 아카호시는 자신의 야심을 드러내고 나츠히는 아카호시를 공격하려다 스마루 때문에 망설인다. 이 때 나루토와 네지가 나타나고 나루토가 허점을 노려 나츠히의 정신을 잃게 하자 아카호시는 일부러 둘을 같이 계곡으로 떨어트린다.
아카호시는 네지에게 임무는 끝났으니 돌아가라고 말한다. 정신을 차린 나루토는 나츠히와 얘기를 나누다 나츠히가 스마루의 엄마란 말을 듣고 깜짝 놀란다. 스마루가 없어진 사실을 알게 된 아카호시 일행은 당황하지만 아이들까지 모두 없앨 계략을 꾸민다. 리, 텐텐과 함께 온 스마루는 아카호시에 대한 의문을 표하고 네지는 아카호시의 야욕을 폭로한다. 나츠히는 10년 전 별의 수행으로 인해 사람들이 쓰러지는 것을 보고 남편과 별을 없애려 했고 이를 안 3대 호시카게가 별의 수행을 금지할테니 수행이 다시 시작되지 않도록 감시해달라고 하여 죽은 것으로 하고 마을 밖에서 생활해왔다고 말한다. 나츠히의 차크라를 뒤쫓아온 아카호시는 별의 수행을 하기 위해 3대 호시카게를 암살했음을 말하고 나츠히와 결전을 시작한다.
아카호시는 마을을 위해서라며 스마루를 조종하고 나츠히는 스마루를 위해 별을 포기하고 내어준다. 아카호시의 공격에 나츠히는 쓰러지고 아카호시는 스마루를 버리고 아이들을 데리고 떠나고 호쿠토만이 스마루 곁에 남는다. 네지는 수행의 부작용에 아카호시의 공격으로 치명상을 입었다며 다시 한번 술법을 쓰면 나츠히의 목숨이 위험할 거라고 경고한다. 나츠히는 스마루와의 오해를 풀고 별을 없애기 위해 다시 마을로 향한다. 아이들이 급히 뒤쫓아오지만 결국 나츠히는 별의 수행으로 인한 부작용으로 쓰러지고 아카호시는 호시카게의 자리에 오르고 스마루와 호쿠토를 탈주닌자로 선포하고 없애라고 명령을 내린다.
아이들은 스마루를 쫓아 별마을로 향한다. 스마루는 쓰러진 나츠히를 보고 오열하고 아카호시는 수행장을 통째로 폭파시킨다. 분노한 호쿠토는 사람들에게 별의 수행을 하면 모두 죽게 될 거라고 하지만 아카호시는 마을에 대한 사랑이 부족한 경우에만 그렇게 된다고 반박한다. 그러나 미즈라가 나타나 자신의 상처를 보여주고 마을 사람들은 아카호시에게 등을 돌린다. 화가 난 아카호시는 3대 호카게를 죽인 사실까지 스스로 말하고 별을 이용해 엄청난 차크라로 사람들을 압도한다. 하지만 나츠히가 남긴 차크라가 스마루를 구하고 나루토에게 힘을 주어 나루토는 아카호시를 쓰러트린다. 마을로 돌아온 아이들은 별을 부셔버린 일로 혼나지만 별마을 아이들이 치료를 받고 건강해져서 즐거워한다.
츠나데는 나루토에게 아카마루의 감시를 맡긴다. 아카마루가 침입자로 인해서 세균병기에 감염되었을 거라는 것. 아카마루의 상태는 점점 이상해지고 키바는 걱정이 늘어간다. 그러다 아카마루가 야간훈련중이던 닌자를 습격하고 결국 츠나데는 아카마루를 격리시킨다. 하지만 키바는 아카마루를 데리고 달아나고 나루토는 둘을 찾아나서지만 키바는 나루토의 도움도 거부한다. 특수추적대로 발탁된 키바의 누나가 의료반에서 만든 주사약을 가져오지만 치료가능성이 반반이란 말에 키바는 아카마루를 설득하다 큰 상처를 입지만 아카마루는 제정신을 차린다. 키바는 아카마루가 자신을 애써 지키려한 거라며 흐뭇해한다.
숲에서 수행하던 나루토의 등에 옴바의 새끼가 붙어온다. 전설의 동물 옴바는 태어나서 처음 본 것을 어미라 생각하고 그 등에 붙어서 다 클 때까지 자란다는 것. 하지만 다 크면 3미터나 되는 무시무시한 괴물이 된다는 말에 모두 나루토와 옴바를 슬슬 피한다. 그러나 나루토는 자신을 엄마처럼 따르는 새끼옴바에게 정이 든다. 츠나데는 옴바가 크는 것을 보고 내보내기 위해 산적 퇴치라는 임무를 내세워 나루토를 마을밖으로 내보내고 산적을 퇴치한 나루토는 옴바의 엄마와 마주친다. 새끼옴바는 엄마와 마주쳐 잔인한 본성을 깨우치고 나루토를 공격하려 하지만 나루토와의 기억을 떠올리고 나루토를 무사히 마을까지 데려다준다.
나루토는 시노와 임무차 장례식에 간다. 당주인 아버지가 남긴 유언 때문에 장남이 임무를 의뢰한 것. 유언장의 내용은 모든 재산을 장남에게 남기지만 장례식에서 소리 높여 웃으면 유산을 다른 유족에게 뺏긴다는 것으로 웃지 않는 시노가 뽑혀서 온 것이다. 하지만 시노는 음식에 든 이상한 약 때문에 미친 듯이 웃어대고 결국 나루토가 장례식 대리로 나선다. 하지만 머리털이 3개밖에 없는 스님에 유산을 위해서 이상한 짓을 하는 친척들 때문에 나루토는 미칠 지경이다. 겨우 끝났나 했던 참에 사위가 이상한 짓을 하고 그러자 죽은 줄 알았던 아버지가 나와서 우스운 짓으로 웃음을 이끌어낸다. 하지만 그 아버지는 시노의 변신으로 웃는 친척들 앞에 나타난 진짜 당주가 돈 때문에 웃음을 잃어버린 가족들 때문에 이런 일을 꾸몄다고 말하고 모두 그 진심을 깨닫고 행복한 마음으로 한바탕 웃는다.
츠나데는 예전에 자신이 신세를 진 유채의 나라에서 임무의뢰가 들어오자 나루토와 히나타 쵸지를 보낸다. 행상인들을 호위하라는 것. 그런데 행상인들의 무리 중 한 명인 슌은 유채의 나라는 평화롭다는 말에 평화로우니까 넘보는 거라며 날카롭게 반응한다. 사실 슌은 유채의 나라 영주의 딸 하루나로 유채의 나라가 무시무시한 3인조 닌자 렌가 지가 루이가의 손에 넘어가자 신분을 속이고 호위무사들과 함께 도망을 나온 것. 렌가 지가 루이가는 하루나를 찾기 위해 닌자를 보내고 나루토가 이들과 마주치지만 그들의 목표가 자신들이란 것을 눈치채지 못 하고 다른 길로 간다. 적들이 추적해오는 것을 알게 된 하루나의 호위무사 중 하나인 기쿠노죠는 먼저 자리를 떠서 루이가와 일전을 벌인다.
하루나는 젊은 람들과 늙은 사람들로 두 그룹으로 나뉘어서 도망가자고 한다. 그에 따라 히나타는 젊은 사람들과 함께 가고 나루토와 쵸지는 노인과 아이들과 함께 길을 나선다. 하지만 나루토는 히나타가 설치한 함정을 보러 갔다가 기쿠노죠의 시체를 발견하고 다시 돌아가 위기에 처한 쵸지를 구한다. 추적자들이 그냥 스쳐가자 목표가 젊은 그룹에 있다는 것을 눈치챈 둘은 젊은 그룹을 따라나서고 하루나와 유리노죠로부터 그들의 정체와 속사정을 알게 된다. 그리고 하루나가 노인과 어린이들을 이용해 도망가려 했다는 것을 알고 크게 분노한다. 유리노죠는 나루토에게 어려서부터 볼모로 잡혀가 살았던 탓에 사람을 믿지 못 하게 된 하루나를 이해해달라고 한다. 밤이 되자 루이가가 공격해오고 나루토는 루이가가 만들어낸 이상한 물방울에 갇히고 만다.
물을 사용하는 루이가의 공격에 속수무책으로 당하던 나루토 일행은 곤봉을 다우징 처럼 들고 있던 루이가의 모습을 떠올리고, 루이가를 물이 없는 바위산 위로 유인하여 루이가의 쓰러트린다. 히나타와 같이 도망간 하루나는 반드시 살아남아야 한다는 강박관념에 휩싸여 히나타를 기절시키고 혼자 도망가고, 나루토는 히나타와 만나 부상당한 유리노조를 부탁한다. 지가는 나라를 많이 차지하고 싶은 욕심에 쓰러져있는 동생 루이가를 처단해버리고, 나루토를 만나 자석인법으로 공격을 시작하는데..
시즈네에게 쿠데타 사실을 전해들은 츠나데는 아이들의 임무에 대해 의구심을 품게 된다. 한편 나루토는 지가의 술법에 속수무책으로 당해 쓰러진다. 히나타가 땅속에 파묻힌 나루토를 겨우 구해내지만 나루토는 도망가라고 말한다. 지가는 하루나의 소재를 묻지만 히나타는 대답하지 않고 달아난다. 달아나던 중 지가의 약점을 깨달은 히나타는 지가를 사철이 많은 지대로 유인하여 차크라를 폭주시키는 혈을 찌르고 온몸이 자석이 된 지가는 사철에 묻히고 히나타도 함께 묻히려 한다. 그 때 쫓아온 나루토가 히나타를 구하고 히나타는 쵸지에게 맡기고 하루나를 쫓아간다. 하루나는 나루토에게 볼모 시절의 서러움을 토해내고 나루토는 하루나를 데리고 달아나지만 뒤이어 쫓아온 렌가에게 잡히고 만다.
렌가는 나루토에게 하루나를 넘겨주면 자기에게 잡힌 동료를 풀어주겠다고 루이가와 지가를 없애준 것을 감사한다며 자신은 부모든 형제든 이용할 것이라고 한다. 나루토가 제안을 거절하자 렌가는 마지막까지 자신에게 백성들을 부탁하고 하루나를 볼모로 보낸 것을 후회한 영주의 얘기를 꺼내며 비웃는다. 나루토는 훌륭한 영주라며 반박하며 렌가를 공격하지만 공기중의 수증기로 렌즈를 만들어 태양빛을 받아 공격하는 렌가에게 속수무책으로 당한다. 결국 하루나가 나와 자신을 죽이라며 절규하고 나루토는 회심의 일격으로 렌가를 쓰러트린다. 그리고 곧 시즈네 일행이 나타나고 주변국가와의 문제도 잘 해결됐음을 알린다. 하루나는 떠나는 나루토에게 남아서 유채의 나라의 재건을 도와달라고 하지만 나루토는 동료를 위해서 돌아가야한다고 말하고 떠난다.
이노는 자신과 똑 닮은 영주의 딸의 대역을 맡으라는 임무를 맡고 나루토와 함께 떠난다. 하지만 정작 만나본 영주의 딸 후쿠는 뚱뚱하고 이노와 전혀 닮지 않았는데, 후쿠는 맞선상대의 사진을 보고 첫눈에 반해 마음이 들뜨고 스트레스를 받아 갑자기 살이 쪘다며 이노에게 자신을 대신해 맞선을 성공시키라고 한다. 맞선은 시작되고 나타난 주인공 치카라는 뚱뚱하고 느끼해서 이노는 진저리를 친다. 나루토는 후쿠로 변신해 야하게 유혹하고 이노는 치카라의 느끼함에 이를 가는 등 맞선은 엉망이 된다. 거기다 자신의 모습을 하고 노상방뇨를 하는 모습에 화가 난 후쿠가 뒤쫓다 모든 것을 치카라에게 들키지만 치카라는 뚱뚱한 후쿠가 자신의 이상형이라며 둘은 결혼을 약속한다.
리는 수행을 위해 도장격파 도전자를 만날 생각으로 도장을 열고 기다리지만 아무도 오지 않자 우연히 들른 나루토에게 자신과 대결을 벌이자고 조른다. 겨우 빠져나온 나루토는 가이를 만나고 가이는 자신이 리의 도장격파 도전자가 되어주겠다며 이상한 꼴로 변장한다. 하지만 츠나데의 호출을 받고 시카마루 팀을 지원하기 위해 급하게 마을을 나간다. 마침 마을을 염탐하기 위해 왔던 닌자 나나후시는 가이가 변장한 모습으로 변신해서 마을로 들어가고 나루토를 만나 도장으로 끌려간다. 나나후시는 리에게 공격당해 엉망이 되고 나루토에게 조금만 자기 대신 상대해달라고 하고 빠져나가 리로 변신한다. 하지만 시카마루 팀의 문제가 별 거 아니라 돌아온 가이와 만나 공격당해 쓰러진다. 리는 마침내 모든 사실을 알게 되고 츠나데에게 기절한 나나후시를 데려가고 첩자를 찾던 츠나데와 시즈네는 깜짝 놀란다.
꿀의 나라 영주의 부인이 친정에 가던 길에 쿠비사키 고개에서 사라지고 츠나데는 나루토 키바 히나타에게 찾아오라고 한다. 나루토는 미리부터 겁을 잔뜩 먹는다. 고개로 향하던 아이들 앞에 성이 나타나고 아이들은 성으로 들어가는데 어딘지 으스스한 분위기가 돈다. 쿠비사키고개는 50년 전 쿠비사키 일족이 침공을 받아 몰락한 곳으로 히나타는 성주였던 쿠비사키 코자의 기록을 통해 함락 직전 어떤 동물을 소환해 성을 찾는 자들을 다 삼키겠다며 저주를 남긴 것을 안다. 성은 아이들을 집어삼키고 위험에 처한 아이들이 소환 계약을 쓴 두루마리를 찾으려할 때 키바사키 코자의 영혼이 나타나 아이들을 안내해주고 소환동물이 원래 살던 세계로 돌아감에 따라 아이들과 영주의 부인 일행은 성에서 벗어난다.
리가 정기검진에 빠지자 츠나데는 나루토에게 리를 데려오라고 한다. 츠나데는 리에게 경락계에 손상이 있다며 임무도 빠지고 연화투는 다시 쓰지 말라고 한다. 리는 상심하고 이를 본 나루토와 텐텐은 결과가 심각한 거라며 걱정한다. 상심한 리 앞에 가이가 나타나 용기를 복돋워주고 리는 가이와 닌자학교 도장에서 수행을 하다 야구라라는 소년을 만난다. 야구라는 리에게 대련을 부탁하고 엄청난 기술로 리를 공격해 부상을 입힌다. 츠나데가 임무를 내리자 가이는 야구라를 데려가게 해달라 말하고 다리를 다친 리 앞에 나타난 야구라는 이를 이용해 리를 좌절시키려 한다. 마을에 온 야구라가 가짜라는 것을 안 츠나데는 네지 텐텐 나루토에게 가이를 뒤쫓게 하지만 길을 잘못 잡은 아이들은 한참 헤맨다. 한편 가이는 쿵푸 연습용 나무인형이 있는 곳으로 접어들어 나무인형과 결투를 벌이게 된다.
야구라는 옛날 가이에게 패배한 적이 있었던 닌자의 삼형제 중 첫째 겐쇼로 동생들과 함께 가이를 노린다. 한편 리는 사쿠라가 뭔가 숨기고 있다는 걸 눈치채고 추궁해서 쫓아온다. 나루토 네지 텐텐은 처음에는 단순하게 움직이는 나무인형을 쉽게 보지만 다양한 움직임의 나무인형이 가세하자 고전하고 때마침 나타난 리가 아이들을 구한다. 나무인형은 큰 성으로 변하고 리는 아이들의 엄호에 힘입어 그 안으로 들어가지만 나무인형 하나가 기다리고 있다. 한편 가이도 나무인형과 대면하는데 이는 겐쇼의 술법으로 리와 가이는 서로의 움직임을 그대로 따라하는 나무인형과 대적한다. 가이는 상대가 리라는 것을 눈치채고 둘은 나무인형이 따라할 수 없는 화려한 체술로 술법을 깬다. 가이는 겐쇼에게 아버지와의 정정당당한 승부를 전하고 3형제는 가이와 싸우라는 유언이 원한이 아니란 것을 깨닫는다.
나뭇잎마을에 불어닥친 건축붐으로 타국 목수들이 와서 일하고 나루토는 겐노라는 목수노인과 라면을 먹으며 친해진다. 그날 밤 한 자객이 목수의 집에서 중요시설의 도면을 훔쳐달아나고 암부가 뒤쫓지만 자폭하고 훔쳐간 도면은 발견되지 않는다. 츠나데는 시즈네에게 보고를 받고 이전 유명한 트랩술사였던 겐노라고 말한다. 츠나데는 급히 닌자들을 불러 슈퍼 에스급 비상경계 태세를 발동하고 국경 경비를 설 것을 지시한다. 그리고 시카마루를 불러 나루토 네지 텐텐 등을 데리고 겐노가 훔친 도면을 숨겨놓았을 것을 대비해서 겐노에 대해 조사하고 도면을 찾으라고 한다. 겐노의 행적을 뒤쫓던 나루토는 평소 겐노에 친하게 지낸 소년에 대한 얘기를 듣고 그것이 자신인줄도 모르고 좋아한다. 그리고 암부가 나루토를 찾아오는데...
겐노와 한 얘기를 얘기하라는 말에 기억이 나지 않는다고 하자 암부는 나루토에게 최면을 걸어 겐노가 나루토에게 아들과 보물찾기하는 걸 좋아한다는 말을 한 사실을 알게 된다, 각자 팀을 짜서 마을을 둘러보지만 별다른 소득을 얻지 못 한 가운데 시카마루는 츠나데에게 불려간다. 츠나데는 폭포마을이 훈련을 핑계로 침입하려는 거 같다며 시카마루에게 국경으로 가라고 하지만 시카마루는 뭔가 심상치 않다며 마을에 남아있겠다고 한다. 조사를 계속하던 아이들은 폭발 지점에서 폭발이 한번이 아니라 미리 준비해둔 상태에서 두 번 일어난 것이며 발견된 시체가 겐노가 아니라는 사실을 알게 된다. 시카마루는 30년 전의 소개서가 없어진 것과 닌자학교 도면이 없어진 것에 집중한다. 그러던 중 커다란 새가 날아와 없어진 도면을 하늘에서 떨어트린다.
겐노가 가져갔던 도면이 하늘에서 뿌려지고 폭포마을의 동태가 침략이 아니라 단지 훈련일뿐이란 사실이 밝혀진다. 그리고 아이들은 겐노가 달아난 굴을 발견하고 시체가 본인이 아니란 걸 알아내 겐노가 죽지 않고 살아있다는 것을 알아낸다. 시카마루는 닌자학교 도면만 없어졌다는 사실에 주목해 겐노가 닌자학교에 뭔가를 설치했음을 직감한다. 아이들은 네지와 히나타의 백안을 내세워 학교 구석구석을 뒤진다. 그러던 중 나루토는 도장에서 못 보던 표적이 그려진 통나무를 보고 이에 의심을 갖는다. 한편 학교 벽에 파묻힌 기폭찰을 찾아낸 네지는 그 기폭찰이 도장의 통나무에 연결됐으며 그 통나무가 기폭장치란 것을 알고 나루토와 도장으로 향한다. 하지만 네지와 히나타는 백안을 통해 그 기폭장치가 마을 곳곳으로 연결되어 있음을 알고 놀란다.
아이들은 마을을 돌아다니며 하나하나 기폭찰을 제거하지만 수가 너무 많아 쉽지 않다. 시루는 츠나데에게 지원을 요청하고 마을의 고문 호무라 코하루가 도와준다. 두 사람이 변두리에서 발견한 기폭찰을 보고 옛날 방식이며 그 곳이 30년전 번화가로 계획되었던 곳이란 사실에서 기폭찰은 30년 전의 것이라는 사실을 알게 된다. 시카마루는 이 말을 듣고 칸나의 집으로 가서 30년 전 소개장을 들고 온 자도 겐노란 사실을 밝혀낸다. 아지랑이마을과 나뭇잎마을이 전쟁중이던 30년 전 휴전협정이 맺어지고 겐노는 건축붐이 일어난 나뭇잎마을에서 목수로 일하며 곳곳에 기폭찰을 설치했던 것. 한편 나루토는 겐노를 처음 만났던 때를 떠올리다 역대 호카게들의 조각바위로 달려가고 그 곳에서 겐노와 마주친다. 마을에 설치된 기폭찰은 눈돌리기용일뿐, 진짜는 그 곳에 있었던 것.
바위얼굴 안에서 겐노와 마주친 나루토는 겐노를 설득하려 하지만 바위얼굴에 기폭찰을 설치한 겐노는 층이 진 바위얼굴을 이용해 마을을 토사에 파묻히게 할 것이라 말한다. 시카마루는 마침내 겐노의 뜻을 눈치채고 없어진 나루토를 찾아나선다. 나루토는 친구들이 폭발을 막을 거라 장담하고 위기의 순간 키바와 시노가 나타나 구해준다. 겐노는 바위얼굴 밖으로 나오지만 시카마루의 그림자목조르기술에 걸린다. 하지만 빠져나가 새를 소환하여 바위얼굴을 폭파시키려 한다. 나루토는 히나타의 힘을 빌어 나선환으로 이를 막고 겐노는 쓰러진다. 몸이 약해져있던 겐노는 재밌었다는 말과 사진을 남기고 숨을 거둔다. 사진의 주인공이 겐노의 친아들이었다는 말을 들은 시카마루는 나뭇잎마을과의 전투에서 숨진 아들의 원수를 갚기 위해 마을에 잠입한 겐노가 나루토를 만나 뜻을 바꾸고 아들과의 추억이 담긴 보물찾기를 했으리라 짐작한다. 나루토와 아이들은 모두 힘을 합쳐 마을을 지킬 것을 다짐한다.
이번 시간은 나루토와 사쿠라의 사회로 그동안 나루토에 등장했던 수많은 대결중 최고의 명승부 5개를 가려보는 시간을 갖는다. 5위는 나뭇잎병원 옥상에서의 나루토와 사스케의 대결, 4위는 쵸지와 지로보의 대결, 3위는 키바 아카마루와 사콘 우콘의 대결, 2위는 네지와 키도마루의 대결, 그리고 대망의 1위는 죽음의 계곡에서의 나루토와 사스케의 대결이 뽑힌다. 순위에 오른 주인공이 나와 소감도 들려주고 나루토는 자신의 특집영상을 틀어주지만 사쿠라에게 당하는 민망한 장면만 나와 속이 탄다. 마지막으로 현장에 나가있는 지라이야를 연결하자 오로치마루가 나타나고 얼핏 사스케의 모습의 비치지만 금방 사라져 나루토와 사쿠라를 가슴 아프게 한다.
혼자 수행을 하던 나루토는 한 소녀와 마주치고 소녀가 그리는 일이 그대로 일어나는 것을 보고 놀란다. 소녀는 의료닌자와 암부에게 억지로 끌려가고 나루토는 소녀의 정체를 궁금해한다. 한편 키바는 8조 담당을 그만두겠다는 쿠레나이의 말을 받아들일 수 없다며 분노해 시노와 갈등을 빚는다. 나루토는 쿠레나이에게 그만두지 말라고 하지만 받아들여지지 않자 츠나데를 만나러 가던 중 사쿠라를 만나 그 일에 아침에 만난 소녀 야쿠모가 관여되어 있음을 알게 된다. 한편 쿠레나이는 3대 호카게의 부탁으로 야쿠모를 맡았지만 포기했을 때를 떠올리고 가이의 말에서 자신이 잘못했음을 깨닫는다. 한편 나루토는 쿠레나이의 모습으로 변신해 야쿠모가 감금된 산장으로 가지만 쿠레나이의 가슴에 칼이 꽂힌 그림을 보고 큰 통증을 느낀다.
쓰러진 나루토는 기이한 꿈을 꾼다. 꿈에서 쿠레나이는 닌자를 포기하지 않으면 봉인술로 야쿠모의 능력을 봉인하겠다고 말한다. 깨어난 나루토는 사토미산장으로 향하는 쿠레나이에게 꿈 얘기를 하고 쿠레나이는 꿈이 아니라 사실이며 제자의 능력을 없앤 자신은 8조 아이들을 가르칠 자격이 없다고 말한다. 한편 야쿠모가 있는 사토미산장을 쿠라마 일족의 닌자들이 습격한다. 연락을 받은 츠나데는 사쿠라 가이와 8조 아이들을 불러서 산장으로 보낸다. 그리고 야쿠모가 가진 환술의 잠재능력은 엄청나고 위험할 정도며 야쿠모의 부모가 갑자기 목숨을 잃으며 명문이던 쿠라마일족이 몰락했음이 밝혀진다. 한편 쿠레나이는 쿠라마 일족이 쳐놓은 환술을 헤치고 무사히 야쿠모를 만난다.
쿠라마일족의 닌자들은 쿠레나이에게 야쿠모를 넘기라고 하지만 쿠레나이는 그들보다 한수 높은 환술로 쓰러트리고 야쿠모를 데리고 떠난다. 뒤따르던 나루토 일행은 쿠라마일족의 방해에도 무사히 산장으로 돌아가지만 이미 쿠레나이는 떠난 뒤다. 야쿠모를 데리고 떠나던 쿠레나이는 운카이와 마주치고 운카이의 환술에 걸리자 자기 몸에 상처를 내서 위기를 모면하고 나루토 일행의 도움으로 운카이를 따돌린다. 잠에서 깨어난 야쿠모는 3대 호카게가 자신의 능력을 봉인하라 지시했으며 자기 부모까지 살해했다고 주장한다. 한편 쿠레나이는 야쿠모가 가진 환술의 잠재능력에 질투를 느껴 능력을 봉인했다고 거짓말을 한다.
야쿠모와 쿠레나이를 데리고 마을로 돌아온 아이들은 전쟁이 휩쓸고 지나간 듯 폐허가 되고 아무도 없는 마을을 보고 경악한다. 사쿠라와 약을 찾던 나루토는 운카이를 마주치고 운카이는 지금 모두 야쿠모의 환술에 빠져있는 거라고 한다. 한편 마을을 조사하던 시노 키바 히나타 일행도 시노의 벌레를 통해 모든 것이 환술이라는 것을 깨닫는다. 운카이는 나루토에게 3대 호카게와 쿠레나이는 너무나 엄청난 힘 때문에 야쿠모 안에 생겨난 괴물을 없애려 했던 거라고 말한다. 그리고 자신의 몸을 던져 나루토를 환술에서 풀려나게 한다. 야쿠모는 쿠레나이에게 모든 것이 3대 호카게의 명령이 맞냐며 그림을 통해 쿠레나이의 몸을 지워나간다. 환술에서 빠져나온 나루토는 아이들과 함께 쿠레나이와 야쿠모가 있는 사토미산장으로 향한다.
나루토는 분신의 도움을 받아 야쿠모가 있는 세계로 들어간다. 그리고 운카이는 숨겨진 진실을 밝힌다. 어려서부터 부담감에 시달리던 야쿠모의 심층의식에서는 이드라는 괴물이 자라나고 이드가 집에 불을 내어 야쿠모의 부모를 살해한 것. 3대 호카게는 야쿠모를 처리하자는 운카이의 제안을 거절하며 이드를 제어할 방법을 찾거나 그것이 안 되면 능력을 봉인해야할 것이라며 쿠레나이를 시킨다. 쿠레나이는 야쿠모의 원망을 감내하며 그 비밀을 지켜온 것이다. 기억을 되살린 야쿠모는 자결하려 하지만 이드가 나타나 이를 막는다. 쿠레나이는 사람은 누구나 마음 속에 짐승을 키우고 살지만 그것을 조절할 수 있다면 꿈을 이룰 수 있다며 이드를 막을 수 있는 것은 너뿐이라며 야쿠모를 격려한다. 야쿠모는 용기를 내어 이드를 처치하고 평화를 찾고 8조도 다시 돌아올 거라는 쿠레나이의 말에 기뻐한다.
츠나데는 나루토에게 엄청난 가치의 국보급 다기 화조풍월을 전시회장까지 수송하라는 임무를 내린다. 추적요원으로 따라온 키바와 경호를 맡은 나루토는 골치 아픈 의뢰인 신에몬 때문에 골치가 아프다. 다기는 목숨보다 귀한 거라며 나루토와 키바를 온갖 위기로 내모는 신에몬. 나루토와 키바는 화가 나지만 꾹 참고 수송임무에 임한다. 그러던 중 다기를 노리는 도적단이 출현해 화조풀월을 도둑맞는다. 동굴로 쫓아가 도둑들을 찾아내는 데는 성공하지만 도적단의 두목이 동굴을 무너트리고 신에몬은 화조풍월을 구하려다 위기를 맞는다. 화조풍월은 깨어지지만 나루토의 구조로 살아난 신에몬은 목숨이 소중한 것임을 깨닫는다. 그리고 자신이 화조풍월을 만든 작가임을 밝히며 새로운 작품을 만들 꿈에 부푼다.
나뭇잎마을에 반닌자단의 멤버 간테츠를 호송해달라는 의뢰가 들어온다. 반닌자단이란 탈주닌자들로 이루어진 잔인하고 흉악한 강도단이다. 나루토 사쿠라 리는 숲의 나라 경호부대와 함께 경호임무를 맡지만 경호부대 대장 토도로키는 도움이 필요없다며 아이들을 무시한다. 나루토는 갇혀있는 간테츠를 감시하러 내려갔다가 토도로키가 간테츠를 해치려는 것을 보고 말린다. 토도로키는 옛날 간테츠를 만났을 때를 떠올리며 반닌자단은 죄없는 어린애들까지 해치는 나쁜 놈들이라며 분노한다. 그리고 그러던 중 반닌자단의 습격으로 나루토 토도로키 간테츠는 다른 일행과 헤어지게 된다.
사쿠라와 리는 배가 절단된 탓에 나루토 일행과 헤어지고 만다. 한편 반닌자단 일행은 나루토 일행을 공격하지만 배가 폭포 아래로 떨어져 나루토 일행을 놓치고 만다. 나루토 간테츠 토도로키는 반닌자단을 피해 이상한 숲으로 들어가고 숲을 가로질러 수도로 가기로 한다. 하지만 그 숲은 반닌자단의 아지트가 있는 미로의 숲으로 절대로 빠져나갈 수 없는 숲. 간테츠는 자신이 숲을 안내하겠다고 나서고 믿지 않는 토도로키에게 자신이 반닌자단의 돈을 훔쳤고 그래서 쫓기고 있는 것이라고 고백한다. 함께 길을 가던 나루토 일행 앞에 반닌자단 토키가 나타나고 나루토는 간테츠의 도움으로 위기를 모면한다. 한편 사쿠라와 리 앞에 정체를 알 수 없는 자들이 나타나고 토도로키는 간테츠가 자신의 가족과 동생을 죽였다고 절규하며 간테츠를 해치려 한다.
토도로키는 예전에 반닌자단에게 습격당한 일가의 생존자로 분노를 참지 못 하고 간테츠를 죽이려 하다 결국 나루토와 싸움을 벌인다. 이때 나타난 반닌자단 몬쥬는 두 사람을 묶어놓고 간테츠를 데리고 사라진다. 사쿠라와 리 앞에 나타난 소년들은 자신은 반닌자단이 습격했던 집의 아이들로 간테츠가 자신들을 몰래 살려주고 키워줬다며 반닌자단을 없애기 위해 간테츠가 보물을 없애고 스스로 경무청에 잡힌 거라고 말한다. 간테츠를 데려가던 몬쥬와 사쿠라 일행이 만나고 간테츠는 아키오를 이용한 협박에 모든 것을 털어놓는다. 그리고 위기의 순간 몬쥬의 줄을 푼 나루토가 나타나고 뒤따라온 토도로키는 아키오를 보고 놀란다.
나루토는 몬쥬를 궁지에 몰아넣지만 마침 나타난 슈라가 아키오를 데려가고 만다. 토도로키는 슈라가 데려간 것이 아키오란 사실을 알고 절망한다. 간테츠는 나루토 리 토도로키를 반닌자단의 아지트로 안내한다. 아키오는 보물이 있는 곳을 대라며 슈라로부터 고문을 당한다. 마침내 슈라의 저택에 도착한 나루토 일행, 하지만 슈라가 준비한 함정에 걸리고 만다. 나루토는 달아나는 슈라를 쫓아가 해치우고 토도로키는 불길 앞에서 5년전의 악몽을 떠올리고 용기를 잃지만 간테츠가 아키오를 지킨 것을 깨닫고 간테츠와 아키오를 구해서 데리고 나온다. 간테츠가 키워온 아이들과 만난 나루토 일행, 토도로키는 반닌자단은 괴멸됐으며 간테츠도 그 와중에 사망한 것이라며 아키오를 두고 떠난다.
나루토는 라면집 주인으로부터 마죽으로 만든 환상의 멘마에 대한 얘기를 듣고 임무를 마치고 오는 길에 멘마의 원료 마죽 죽순을 따러 갔다가 정신을 잃고 쓰러진 소년을 발견해서 마을로 데려온다. 사실 소년은 강도짓과 살인을 일삼는 무리의 일원, 하지만 습격한 마을에서 어린 소녀를 구하려다 동료를 해치고 벼랑에서 떨어진 것. 소년은 기억을 잃고 나뭇잎병원에 입원하지만 병원 화재시 아기를 구하고 츠나데의 허락을 받아 나루토의 책임 하에 마을에 머물게 된다. 나루토와 함께 살게 되고 멘마라는 이름까지 얻은 소년은 착한 마음씨로 마을 사람들을 도와준다. 하지만 마을에 이상한 자가 잠입하고 나루토는 멘마의 피리소리를 듣고 힘이 솟아나자 이를 의아하게 여긴다.
츠나데는 멘마의 술법과 비슷한 술법을 떠올리고 멘마가 소리마을과 관계있는 것이 아닐까 생각한다. 그리고 나루토는 멘마 네지 텐텐과 함께 멘마의 기억을 찾으러 밭의 나라로 향하지만 텐텐 네지가 멘마를 의심하자 불쾌해한다. 그러던 중 나루토 일행은 도적떼의 습격을 받은 마을에 도착한다. 마을 사람들이 금광을 노리는 도적떼의 공격을 받았다는 걸 알고 나루토는 도와주자고 하지만 네지와 텐텐은 반대한다. 멘마는 마을 사람들을 돕겠다며 마을에 남아 나루토와 방어벽을 만든다. 하지만 밤에 습격한 도적으로부터 후키를 구하려다 다치고 치료를 하려던 마을 청년 난은 멘마의 문신을 보고 마을을 습격한 자들과 한패라며 치료를 거부한다.
나루토는 멘마가 마을을 습격한 도적 패거리라는 사실이 믿어지지 않는다. 한편 마을 사람들은 멘마를 의심해서 배척한다. 마을 사람들이 멘마를 공격하는 순간 도적떼가 마을을 다시 습격한다. 나루토 일행은 그들과 싸움을 벌이고 어려운 순간 멘마의 도움을 받는다. 멘마는 시운이 강 상류의 둑을 폭파시켜 마을을 수장시키려 한다며 광산을 터트려 물길을 막자고 한다. 그리고 자신은 시운 일행의 손에 자랐고 마을을 습격한 일을 후회하며 시운을 막고 싶다고 고백한다. 시운은 나루토에게 시운을 맡기고 광산에 기폭찰을 설치해서 자폭하여 마을을 구한다. 마을 사람들은 멘마의 죽음앞에 숙연해지고 나루토는 친구를 잃은 쓸쓸한 마음으로 나뭇잎마을에 돌아온다.
닌자도구를 만드는 장인마을 사람들이 사라지고 마을 창시자의 관이 마을에 나타난다. 한편 가아라 칸쿠로 테마리는 나뭇잎마을의 교육과정을 본따서 아이들을 교육하고 눈앞에서 부모가 수많은 무기에 맞아 쓰러진 것을 본 교육생 마츠리는 가아라를 따른다. 그러던 중 사천상이란 자들이 나타나 마츠리를 납치하고 가아라에게도전장을 던지며 도전에 응하지 않으면 가까운 사람들을 매일 하나씩 제물로 바치겠다고 한다. 가아라 칸쿠로 테마리는 그들을 쫓아 나뭇잎마을로 향하고 나뭇잎마을에서는 사스케 사건 때 도와줬던 일의 은혜를 갚는다며 시카마루의 지휘아래 하급닌자들이 이들을 도우러 간다.
마츠리를 납치한 사천상은 가아라를 혼자서 고립시켜서 잡을 작전을 세운다. 그리고 작전에 따라 처음으로 공작이 남아 공격하자 같은 풍술사라는 것을 안 테마리가 남는다. 두 번째는 용안이 남자 같은 꼭두각시술을 쓰는 칸쿠로가 남는다. 그리고 마지막으로 수호가 남아 가아라를 맞는다. 한편 나루토 일행은 네지와 시노 히나타가 보내온 정보에 따라서 전투가 세군데에서 벌어지고 있는 것을 알고 세팀으로 나뉘어서 구하러 간다. 테마리와 칸쿠로는 처음 예상과는 달리 상대를 맞아 크게 고전하고 위기에 처하고 말지만 위기의 순간에 나뭇잎마을의 아이들이 나타나 위기에서 구해낸다.
나뭇잎마을의 아이들이 모래마을의 아이들을 돕기 위해서 나타나지만 사천상에 밀려 힘을 쓰지 못 한다. 키바 쵸지 칸쿠로는 서로 호흡이 맞지 않아서 힘들어하고 시카마루 이노는 기술을 쓸만큼 공작에게 접근하지 못 하고 번번히 실패한다. 한편 수호는 갑옷을 이용해 차크라를 빨아들여 가아라는 고전한다. 그리고 수호 공작 용안은 삼각형진을 이용해 수맥을 뚫어 가아라의 모래를 물로 적시고 물을 먹어 무거워진 모래로 가아라는 위험에 빠진다. 하지만 시카마루가 폭포의 그림자를 이용한 그림자흉내술로 공작을 해치우고 가아라도 모래갑옷으로 수호를 처치하고 쵸지 키바 칸쿠로도 용안을 쓰러트린다. 수호를 쓰러트린 가아라는 열심히 보구를 뒤쫓아간다.
보구는 막다른 길에 다다르자 기다렸다는 듯이 닌자도구를 이용해 가아라를 공격하고 가아라는 고전한다. 나루토가 오지만 나루토도 보구를 당해내지 못 하고 보구는 가아라를 우리에 가둔다. 보구는 그동안 닌자5대국에 당했던 장인마을의 기구한 역사를 애기하며 가아라의 차크라를 이용해 궁극의 병기 장인마을의 시조 세이메이를 자신의 몸안에 불러내어 부활시킨다. 한편 츠나데는 이 일을 알고 카카시에게 누군가와 함께 다녀올 것을 명한다. 나루토는 여전히 고전하지만 마츠리는 가아라가 자신에게 무기는 사람을 죽이기도 하지만 소중한 사람을 지킬 수도 있는 것이란 얘기를 해주려 했다는 걸 알고 용기를 내어 무기를 이용해 보구에 맞선다.
수학으로 변하고 있는 가아라는 엄청난 차크라를 내뿜고 세이메이는 그 차크라를 빨아들인다. 가아라는 예전에 나루토와 했던 말을 떠올리며 애써 자신안의 수학을 억누르고 원래 모습으로 돌아온다. 세이메이는 이런 가아라를 비웃지만 가아라는 바위를 모래로 만들어 세이메이를 물리친다. 가아라 일행은 고마움의 인사를 전하고 나뭇잎마을을 떠나고 임무를 통해 뒤처진 자신을 느낀 이노는 사쿠라에게 의료닌자가 되고 싶다고 말한다. 그리고 나루토는 돌아온 지라이야와 함께 사스케를 되찾기 위해 자신을 단련하기 위한 수행여행을 떠나게 된다.