탐정은 이미 죽었다

상공 1만 미터 위를 나는 비행기가 하이재킹을 당했다. 키미즈카 키미히코는 자신이 탐정이라고 하는 수수께끼의 소녀 시에스타에게 조수로 임명되어 조종석 쪽으로 향했다. 그곳에는 박쥐라는 코드네임의 남자가 기장을 인질로 잡고 있었다. 박쥐는 인질을 해방시키기 위한 조건으로 시에스타에게 '비행기를 공중 납치한 이유'를 추리해보라고 요구했는데.

시에스타와 사별한 지 1년. 키미즈카는 일상이란 이름의 미지근한 물에 머리부터 발끝까지 푹 잠겨있었다. 그런 키미즈카에게 동급생 소녀인 나츠나기 나기사가 찾아왔다. 나츠나기는 정체불명의 인물 X를 찾기 위해 키미즈카에게 의뢰를 했고, 키미즈카는 나츠나기의 의뢰를 해결하기 위해 경찰인 카세 후우비에게서 협력을 구했다. 후우비가 안내한 곳은 교도소. 키미즈카는 거기서 한때 사투를 벌였던 박쥐와 재회했는데.

키미즈카와 나츠나기의 앞에 갑자기 나타난 사람은 중학생 아이돌인 사이카와 유이였다. 그녀에게는 '돔 공연 당일에 시가 30억 엔의 사파이어를 받아 가겠다'라고 쓰여 있는 편지가 와있는 상태였다. 키미즈카와 나츠나기는 시에스타의 유지를 잇기 위해 의뢰를 받아들였다. 그런데, 라이브 전날 리허설 때 스테이지 위에 있는 사이카와에게 수수께끼의 남자가 다가왔는데.

'사이카와 유이는 거짓말을 하고 있다.' 범인의 목적이 보물고에 있는 사파이어가 아닌 사이카와 자신이라는 걸 간파한 키미즈카는 라이브 당일, 나츠나기와 함께 라이브 회장으로 향했다. 둘은 분위기가 달아오른 라이브 회장에서 몸을 숨기고 있는 범인을 찾았지만, 좀처럼 위치를 알 수가 없었다. 초조함만이 더해지는 가운데 그 순간은 점점 다가오고 있었는데.

배경은 1년 전. 무언가가 인간의 심장을 먹어치우는 기괴한 사건이 잇따라 발생하고 있었다. 시에스타와 키미즈카는 그 사건이 비밀조직 SPES의 일원인 케르베로스의 소행인 것을 눈치채고 함정 수사를 계획했다. 미끼가 된 키미즈카는 어두컴컴한 방에 침입해 온 정체불명의 사람을 제압했지만, 그 사람의 정체는 시에스타를 사모하는 소녀 샤르였는데.

갑자기 나타난 SPES의 최고 간부 헬과의 싸움에서 승리한 시에스타와 키미즈카. 그 대가로 시에스타는 다리에 전치 2주에 달하는 부상을 입었다. 심부름을 나오게 된 키미즈카는 뒷골목에서 골판지 박스 안에 자고 있는 소녀 알리시아와 만나게 된다. 키미즈카는 그녀에게 그녀의 신원에 관련된 질문을 던졌지만 알리시아는 지금까지의 기억을 잃은 상태였는데.

시에스타가 요양하는 동안 탐정 대행이 된 알리시아와 함께 '사파이어의 눈'을 찾게 된 키미즈카. 그런 나날도 순식간에 지나갔고, 시에스타의 완쾌를 축하하기 위해 다이닝 바에 세 사람이 모였다. 애플파이 때의 일을 보상받고자 하는 시에스타는 키미즈카에게 잔을 내밀었고, 눈치채보니 밤도 한창 깊어가고 있었다. 숙소로 돌아온 시에스타는 침대 위에 앉자 '이쪽으로 와'라고 키미즈카를 불렀는데.

전에 만났던 후우비가 가짜였다는 것을 깨달은 키미즈카와 시에스타. 동요하고 있는 사이에 다섯 번째 희생자가 나와버리고 말았다. 헬을 쓰러뜨리기 위해서라면 수단을 가리지 않는 시에스타와 유족의 마음을 중시하고자 하는 키미즈카는 서로 어긋나기 시작했다. 그로부터 사흘 뒤, 알리시아가 사건에 휘말리게 되고 키미즈카는 일단은 알리시아가 무사한 것에 안도했으나, 받아들이기 어려운 현실을 깨닫기 시작했는데.

알리시아를 되찾기 위해 시에스타, 키미즈카, 샤르는 드디어 SPES의 거점에 도달했다. 시에스타와 잠시 떨어져 샤르와 함께 움직이게 된 키미즈카는 SPES의 우두머리인 '시드'와 대치하고, SPES의 정체를 알게 되었다. 한편 시에스타는 헬과의 조우를 이루고 알리시아 탈환을 시도하고 있었는데.

'같이 바다에 가자'라는 약속을 이행하는 데에 있어, 사이카와의 스케일이 너무나도 큰 탓에 호화로운 여객선을 타는 크루즈 여행에 초대받은 키미즈카와 나츠나기. 세 사람은 배를 타고 즐기는 여행을 만끽했지만, 옛날에 키미즈카와 동료였던 샤르가 나타났다. 샤르는 여객선 안에 잠들어있는 '시에스타의 유산'을 조사하고 있었다. 다음 날 아침, 선내에 불길한 안내 방송이 울려 퍼지기 시작했는데.

카멜레온과 대치하는 키미즈카. 어떻게든 나츠나기를 구해냈지만, 여전히 적의 맹공은 끊이질 않았다. 샤르가 가세해서 잠시나마 적을 궁지에 몰아넣었나 생각했지만, 카멜레온의 일격에 갑판이 부서지고 키미즈카는 아래층으로 추락하고 말았다. 그렇게 의식이 몽롱한 와중에 시에스타와 사별했을 때의 기억이 되살아났는데.

키미즈카의 주먹과 카멜레온이 맞붙으려던 순간에, 천장에서 발사된 총탄이 카멜레온을 꿰뚫었다. 그곳에 있는 건 틀림없는 '명탐정'이었다. '너, 내 조수가 돼라'. 4년 만에 듣는 말에 키미즈카는 상공 1만 미터에서의 그리운 기억을 떠올렸다. 그렇게 명탐정과 그 조수는 옛날 이야기꽃을 피우면서 카멜레온에게 총을 겨눴는데.

시에스타의 무덤에 인사를 하러 가던 중에 키미즈카 키미히코, 나츠나기 나기사, 사이카와 유이, 샬롯 아리사카 앤더슨은 누군가에 의해 납치되었다. 그들이 감금된 곳에서 본 것은, 자신의 죽음에 관련된 진상을 기록한 시에스타의 영상이었다. 어리둥절한 채 상황을 지켜보는 가운데 나츠나기는 어떤 사실을 깨달았다. 그리고 키미즈카 일행 앞에, 죽었을 터인 시에스타가 메이드복 차림으로 나타났는데.

시에스타가 남긴 '실수'에 대해 알아보기 위해, 키미즈카 일행은 나츠나기의 안에 봉인되어 있는 헬과 대면했다. 헬의 독촉을 받은 나츠나기가 도달한 건, 임상시험을 하는 연구 시설에서 지냈던 6년 전의 기억. 그곳에는 시에스타, 알리시아 또한 있었다. 괴로운 임상시험을 받으면서도 두 사람과 깊은 우정을 쌓아갔던 나츠나기. 하지만 그 연구 시설에는 숨겨진 비밀이 있었는데.

'저의 프로듀서가 되어주세요!' 돌아가신 부모님의 회계 부정 의혹이 부상해 몸을 숨길 필요성이 생긴 사이카와. 동시에 박쥐가 탈옥한 소식을 들은 키미즈카는 안전 확보를 위해 노체스의 은신처에서 사이카와와 함께 지내기로 했다. 어째서인지 나츠나기와 샤르도 여기에 끼게 되어 활기찬 동거 생활이 시작된 가운데, 사이카와는 키미즈카를 '어떤 장소'로 데리고 가고자 했는데.

시드가 사이카와를 새로운 그릇으로 삼기 위해 그녀를 노리고 있다는 걸 알게 된 키미즈카 일행. 박쥐는 시드의 목적과 실험의 진상에 대해 이야기했고, 거기에다 사이카와의 사파이어빛 왼쪽 눈과 부모님에게 숨겨진 비밀을 밝혔다. 한편 스칼렛은 사이카와가 함께 싸우는 대가로 그녀의 부모님을 되살리는 걸 제안. 죽었을 터인 '그 남자'가 부활했지만, 그 광경을 본 사이카와는 어떤 결단을 내렸는데.

SPES에게 대항하기 위해 사이카와 말살을 획책하는 후우비와 샤르. 키미즈카는 노체스와 함께 두 사람을 쫓아가 그들의 발을 묶는 데에 성공했다. 그들과 대치하던 샤르는 시에스타에게 구원받았던 과거를 생각하고 있었다. 그럼에도 노체스를 끝장내기 위해 총구를 겨눈 그 순간, 키미즈카는 노체스에게 숨겨진 비밀을 밝혔는데.