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세상에서 가장 똑똑한 여자 안토니아 스콧은 비밀경찰 프로젝트에서 레드퀸이 된다. 징계로 경찰을 그만둔 존 구티에레스는 강인한 바스크 출신 게이로, 자신의 인생과 방식을 통해 납치 및 살인이라는 흥미로운 이중 사건에 대변혁을 일으킨다.
안토니아 스콧은 세상에서 가장 똑똑한 사람으로, 이는 행운인 동시에 저주나 다름없다. 그녀는 명석함 덕분에 비밀 실험 경찰 프로젝트인 '레드퀸'이 되었지만, 개인적인 비극을 겪으면서 자리에서 물러난다. 이제 곤경에 처한 경찰 존 구티에레스는 그녀를 세상으로 다시 데리고 나와 그녀의 능력과 과거를 시험대에 올리는 사건을 해결해야 한다.
에세키엘은 스페인에서 가장 큰 권력을 쥔 두 가문의 맏이인 알바로 트루에바를 암살하고 카를라 오르티스를 납치했다. 존은 안토니아의 종자가 되기로 한다. 두 사람의 시작은 좋지 않았지만, 모두가 손에 땀을 쥘 만한 급속도의 추격전 이후 에세키엘을 붙잡기 직전까지 간다. 카를라는 그녀의 독방에서 에세키엘에게 붙잡혀 있는 사람이 자신만이 아니라는 사실을 알게 된다.
이제 겨우 업무를 함께 시작한 안토니아와 존은 이미 납치 전담반, 라몬 오르티스, 라우라 트루에바, 그리고 레드퀸의 그림자 지도자인 멘토와 척을 진 상태다. 수사 과정에서 모두가 거짓말을 한다. 안토니아와 존은 에세키엘이 오르티스와 트루에바에게 요구한 것이 사실은 개인적인 죄를 인정하는 것임을 알게 된다. 하지만 에세키엘은 늘 한 발짝 앞서나가고, 이제는 안토니아를 위협하는 상황이 된다.
안토니아는 벽화를 마주 보며 홀로 잠에서 깨어난다. 에세키엘은 어째서 안토니아를 죽이지 않은 걸까? 암살자의 목적은 안토니아와 존을 택시로 이끌어 에세키엘 뒤에 숨은 진짜 정체를 밝히는 메시지를 전달하는 것이었다. 납치 전담반 역시 에세키엘의 주소와 택시를 발견했지만, 안토니아는 생각만큼 조각이 정확히 맞아떨어지지 않음을 눈치채는데...
안토니아와 존은 에세키엘이 단독범이 아니라 딸의 도움을 받고 있음을 알게 된다. 하지만 너무나 많은 실수를 저지른 것을 보면 앞뒤가 맞지 않는다. 납치 전담반이 함정에 빠진 뒤, 그 모든 것이 의도된 것임이 드러난다. 카를라 오르티스는 다른 독방에 갇혀 있던 납치된 여자에 대한 끔찍한 진실을 알게 된다. 존이 저지른 용서 못 할 실수로 멘토는 사건을 종결하고 안토니아를 보직 해제한다. 그녀는 이제 스페인의 레드퀸이 아니다.
안토니아의 아버지는 안토니아가 안토니아 자신의 아들을 납치했다며 그녀를 체포시키려 하지만, 존이 안토니아의 탈출을 돕는다. 혼자가 된 채 도시 전역의 경찰들에게 쫓기는 신세가 된 안토니아는 자식을 구출할 계획을 세우고자 몸을 숨기려 한다. 기억과 그녀의 정신, 오랜 친구들, 그리고 의상의 도움을 받은 안토니아는 일생일대의 임무를 위해 나선다.
존과 안토니아는 다시 한 팀이 된다. 시간에 쫓기는 퀸과 종자는 함정과 폭탄으로 가득한 지하철 터널을 뒤져야 한다. 산드라와 에세키엘이 두 사람을 기다리고 있고, 호르헤와 카를라의 목숨이 위험한 상황이다. 하지만 안토니아는 여기서 끝이 아님을 알고 있다. 산드라는 훨씬 더 강력한 존재의 예언자라는 본인의 정체를 숨겼다. 안토니아가 가장 아끼는 것을 이미 파괴한 그 사람 말이다.
파하르도 사건 몇 달 후, 안토니아는 여전히 화이트와 산드라에게 사로잡혀 있고 존은 사랑을 갈구한다. 마르베야에서 오를로프의 자금책인 유리의 아내 롤라가 살해 위기에 처하자, 멘토는 두 사람에게 오를로프보다 먼저 롤라를 찾으라고 지시한다. 하지만 유리는 이미 살해됐고, 로메로와 벨그라노 형사가 제시한 단서도 석연치 않다. 한편, 독일에서 한 여성이 스스로 목숨을 끊는다.
오를로프는 롤라의 습격 소식을 접하고 블랙 울프에게 그녀를 추적하라고 지시한다. 안토니아와 존은 롤라의 어머니가 운영하는 위장 사업체를 조사하고 유리의 장례식에 참석한다. 존은 안토니아가 숨겨온 감시 소프트웨어 헤임달을 알게 되고, 롤라는 은신처와 인슐린을 찾아 헤맨다. 불법 자금을 추적하던 안토니아와 존은 한 컨테이너에서 끔찍한 광경을 목격한다.
안토니아와 존은 컨테이너에서 소녀 아홉 명의 시신과 생존자 한 명을 발견한다. 롤라는 뉴스를 보고 자신의 개를 데려오기로 결심해 가사 도우미에게 도움을 청한다. 오를로프는 유리와 함께 일했던 앞잡이를 제거하지만, 그의 행동대원들과 안토니아, 존은 블랙 울프와 맞닥뜨린다. 안토니아는 블랙 울프가 독자적으로 움직이고 있다고 의심한다.
가사 도우미에게 줄 돈을 구하려던 롤라는 사채업자를 죽이고, 총격전 끝에 블랙 울프의 도움으로 경찰을 따돌린다. 유리의 배신을 알게 된 오를로프는 롤라를 산 채로 잡으려 한다. 유럽 곳곳에서 레드퀸들이 잇따라 죽는 가운데, 멘토는 안토니아와 존에게 마드리드로 복귀를 명령하지만 두 사람은 불복한다. 이 모든 일의 배후가 롤라임을 알아낸 안토니아는 존에게 수수께끼 같은 메시지만 남긴 채 자취를 감춘다.
안토니아는 오를로프에게 돈을 빼돌린 사람이 롤라라고 밝히지만 고문당한다. 블랙 울프의 은밀한 도움으로 존이 그녀를 구한다. 개를 찾으려던 롤라는 가사 도우미의 배신으로 오를로프 부하에게 붙잡히고, 경찰이 롤라와 오를로프의 부하를 체포하지만, 로메로는 롤라를 제거하기 위해 사고를 일으킨다. 가사 도우미가 개를 한 집으로 데려가자 롤라와 오를로프의 부하도 그곳으로 향한다. 안토니아는 로메로에 관한 결정적인 사실을 깨닫는다.
산속 집에서 안토니아는 오를로프의 돈이 담긴 칩이 개한테 있다는 걸 알아낸다. 안토니아와 존, 블랙 울프는 오를로프, 로메로, 벨그라노의 공격을 막아내지만, 롤라가 잃어버린 칩은 블랙 울프의 손에 들어간다. 마드리드로 돌아온 안토니아는 남편의 연명 치료를 중단하고 미스터 화이트가 블랙 울프의 배후임을 깨닫는다. 존에게 경고하러 간 그녀는 산드라가 존을 납치하는 모습을 목격한다.