포켓몬스터

지우와 친구들은 한 호수에 도착했지만 호수는 말라있는 상태. 그러던 중 야도킹 전설을 연구하는 부녀를 만나 야돈들이 괴로워할 때 야도킹이 나타나서 야돈들을 구한다는 전설을 듣게 되는데…

지우와 친구들은 우연히 에레키드를 만났지만 로켓단이 에레키드와 애버라스를 잡아가고 만다. 그때 에레키드를 찾는 야구 소녀 나진을 만나게 되는데…

은빛산 기슭에 있는 포켓몬센터에서 지우는 성도리그 출전을 위해 포켓몬들의 특훈을 시작한다. 그런데 그때 로켓단이 기습을 해와, 지우는 애버라스 대신 로켓단에 잡힌다.

은빛산 입구에 도착한 지우와 친구들. 갑자기 하늘에서 떨어진 안농을 주워 간호하게 된다. 다음날 안농의 숨겨진 힘이 발동하면서 지우와 친구들은 애버라스의 마음속 세계로 빨려 들어가게 되는데...

애버라스의 고향인 은빛산에 도착한 지우와 친구들. 그런데 갑자기 나타난 마기라스가 지우와 친구들을 밀렵단으로 착각하고 공격한다. 그 마기라스는 애버라스가 찾고있던 엄마였지만, 마기라스는 애버라스를 알아채지 못하고 있는데...

성도리그 은빛대회에 출전하기 위해 은빛마을 근처에 있는 칠색조사원에 도착한 지우와 친구들. 그곳에서 야생 포푸니의 방해로 성화가 출발할 수 없다는 이야기를 듣게 된다.

은빛대회에서 라이벌 바람과 재회한 지우. 선발전에서 승리를 거머쥐며 예선리그에 진출하지만, 로켓단에게 속아 개막식에서 피카츄를 빼앗기고 감금당하게 되는데…

지우의 예선리그 첫 번째 상대인 모에. 불꽃타입을 주로 사용하여, 상대의 물타입에 대한 대책으로 에레브를 내보낸다. 그런 에레브에게 맞서던 지우의 코코리가 당하면서 지우에게는 꼬부기밖에 남지 않았는데…

지우의 이상해씨와 꼬부기는 순호의 마릴리, 메가니움과 대회장 밖에서 싸움을 하게 되지만, 한웅의 밀탱크 덕분에 싸움을 멈추고 진정하게 된다. 그리고 예선 리그에서 지우와 순호는 맞붙게 되는데…

결승 토너먼트에 진출한 지우. 첫 시합 상대가 라이벌인 바람이라는 걸 알게 되고, 의욕을 불태운다. 지우는 대책을 강구한 뒤 비장의 카드인 리자몽까지 데리고 경기장으로 향한다.

은빛대회 결승 토너먼트에서 바람과 맞붙게 된 지우. 바람의 포켓몬이 너무 강력해서 지우는 계속 밀리고 있는 가운데, 마지막 남은 한 마리가 거북왕과 상성이 좋지 않은 리자몽이다. 과연 이 승부의 향방은...?!

호연지방에서 온 트레이너인 한웅과 대결하게 된 지우. 한웅은 성도지방에서는 좀처럼 보기 힘든 포켓몬으로 배틀에 임하고, 마침내 비장의 카드인 번치코를 꺼낸다.

대회가 끝난 후 지우는 한웅으로부터 호연지방에 대한 이야기를 듣고 관심을 두게 된다. 그리고 갑자기 나무 밑에 깔린 무우마의 비명을 듣고 구해주게 되는데…

해외여행을 가는 언니들 대신 블루체육관을 지켜야 하는 이슬. 한편, 웅도 집으로 돌아가야 할 사정이 생겨서 지우, 이슬, 웅 세 사람에게는 이별의 순간이 찾아오게 된다.

지우와 피카츄는 함께 호연지방으로 향하던 중, 로켓단이 갑자기 나타나 몰래 피카츄만 잡아서 도망친다. 그런데 피카츄와 나옹만 따로 떨어지게 되고, 그 둘은 항구의 창고 거리에 도착하게 되는데…

아직 본적 없는 포켓몬들... 아직 가본 적 없는 마을... 미지의 세계와 만나기 위해, 새로운 모험의 땅 하나지방에 도착한 지우와 피카츄! 새로운 지방에서의 모험에 가슴이 벅차오른다. 그 앞에 나타난 하나지방 포켓몬 연구의 권위자, 주박사! 곧바로 주박사의 연구소로 향하려는 그때, 갑자기 하늘에서 번개구름이 나타나고 천둥소리가 울려 퍼진다! 그 중심에는 검고 거대한 포켓몬 같은 그림자가... 그리고 그 순간, 그림자로부터 한 줄기의 번개가 지우의 피카츄에게 직격! 뺨에서 전기가 찌릿찌릿하며 괴로워하는 피카츄. 서둘러 주박사의 연구소로 가서 자세한 검사를 한다. 하지만, 생각지도 못한 결과가 나오는데... 바로 피카츄가 전기타입 기술을 사용할 수 없게 되어버린 것이다! 파란의 막을 열게 된 지우와 피카츄의 여행! 과연 어떻게 될 것인가!?

피카츄 몸에 일어난 이변에 당황하면서도, 하나지방 여행을 결정한 지우. 우선 이 지방의 포켓몬을 잡기 위해 숲으로 들어간다. 그러자 눈앞에 있는 풀숲이 부스럭부스럭 흔들리고 있는 것을 발견! 서둘러 포켓몬 도감으로 확인하니, 거기에는 “이빨포켓몬” 터검니가 있다는 표시가! 재빨리 잡으려 몬스터볼을 던지는 지우! 그러나 볼을 던진 풀 속에서 들려온 것은 사람의 목소리!? 그리고 힘차게 튀어나온 것은 터검니가 아닌 한 여자아이다! 그 소녀의 이름은 아이리스. 그리고 잡으려 했던 터검니는 아이리스의 머리카락 속에...! 과연 이 수수께끼 소녀의 정체는...!?

′우선 첫 번째 체육관이 있는 성신시티로 향하는 지우. 그리고 왠지 모르게 지우를 따라오는 아이리스. 두 사람은 성신시티로 가는 도중 단이라는 소년과 만난다. 그 소년의 집은 근처에 있는 모래찜질로 유명한 온천 리조트라고 한다. 재빨리 모래찜질을 하러 들어가는데, 모래의 이쪽저쪽에 “사막악어포켓몬” 깜눈크의 모습이! 단이가 말하기를 평소에는 매우 얌전하고 트레이너와 함께 모래찜질을 즐긴다고 한다. 그런데 깜눈크들이 갑자기 무서운 기세로 땅을 파기 시작한다! 휘몰아치는 모래연기 앞에 나타난 것은 선글라스를 쓴 깜눈크! 놀란 지우와 친구들을 아랑곳하지 않고 큰 입으로 피카츄와 터검니, 그리고 몰래 뒤를 따라왔던 수댕이를 데리고 가버린다! 이 깜눈크의 목적은 대체 무엇일까?′

성신시티를 향해 여행을 계속하는 지우와 친구들. 도중에 들른 마을에서 재미있는 시설을 발견한다. 그것은 ′포켓몬 배틀 클럽′이란 곳으로, 트레이너가 자유롭게 시합할 수 있는 장소다. 의욕이 넘치는 지우는 서둘러 배틀 클럽 안으로~! 클럽의 지배인인 ′돈 조지′는 지우와 친구들을 맞이하며, 하나지방에서는 보기 힘든 피카츄를 데리고 있는 지우에게 말을 건넨다. 드디어 시합개시! 그러나 선제공격을 하려는 순간 경비경보가 울린다! 창고에 누군가가 침입한 것. CCTV를 확인하니 거기에 있던 것은 바로...!!

드디어 도착한 성신시티! 하나지방의 첫 체육관 시합을 앞두고 흥분을 감추지 못하는 지우 앞에 덴트라는 청년이 나타나는데... 덴트는 아이리스와 터검니의 사이 좋은 모습을 보고, 둘의 상성이 완벽하다고 한다. 그는 “포켓몬소믈리에”라는 자격을 가지고 있어서, 트레이너와 포켓몬의 상성 등을 보는 것이 가능하다고 한다. 덴트가 지우와 아이리스를 성신체육관까지 안내해준다. 그리고 눈앞에 나타난 것은 기다리고 기다리던 성신체육관! 지우는 시합모드가 되어 힘차게 체육관으로 뛰어 들어간다! 그러나 건물 안에는 눈을 의심케 하는 광경이...

체육관 시합을 마치고, 포켓몬센터에서 포켓몬들을 회복시키고 있는 지우. 그때, 아이리스가 터검니를 품에 안고 당황하며 뛰어들어 온다! 품 안의 터검니는 희미한 핑크색 빛에 감싸여 새근새근 자고 있다. 이야기를 들으니 잠들어 버린 터검니가 깨어나지 않는 것 같다! 이러한 상황에 모두 혼란스러워 하는 그때, “꿈먹기포켓몬” 몽나를 데리고 한 여성이 나타난다! 그녀의 이름은 주리박사. 그녀는 터검니가 잠들어버린 원인을 알고 있는 듯하다. 그것을 해결하기 위해 밖으로 나서는 지우와 친구들. 그러나 눈앞에는 놀라운 광경이! 하늘에서 춤추는 핑크색의 빛, 긴급사태를 알리는 여경. 마을은 공황에 빠지는데...

지우, 아이리스, 덴트. 함께 여행하게 된 세 사람이 숲에서 쉬고 있는데, 거기에 “풀뱀포켓몬” 주리비얀이 나타나 덴트가 만들어 준 케이크를 먹기 시작한다! 황급히 그만두게 하려는 피카츄지만, 갑자기 눈이 하트로...! 주리비얀의 “헤롱헤롱” 공격을 받은 것 같다. 휘청거리는 피카츄를 비웃는 듯한 눈으로 바라보는 주리비얀은 빠른 몸놀림으로 달아나 버린다. 그러나 그 모습에 투지가 활활 타오르는 지우! 반드시 잡고야 말겠다는 의지를 보이며, 쫓아가기 시작하는데... 과연 지우는 멋지게 주리비얀을 잡을 수 있을 것인가!?

다음 목적지를 향해가던 도중, 포켓몬들과 함께 강가에서 점심을 먹고 있는 지우와 친구들. 평화로운 시간을 보내고 있는 그때, 피카츄와 터검니의 포켓몬 음식이 없어진다! 누구의 짓인지 주위를 살펴보니 거기에 나타난 것은 “달마포켓몬”인 달막화 2마리! 쫓아가는 지우와 친구들을 화염방사로 뿌리치고 순식간에 도망간다. 잡고 싶긴 하지만, 상처 입은 포켓몬들의 치료가 우선이다. 서둘러 포켓몬센터로 향한다. 하지만 거기에도 달막화 2마리가! 게다가 음식을 훔쳐 도망가고 있다! 달막화들의 목적은 과연 무엇일까...!?

아이리스와 터검니, 덴트와 야나프. 상대를 마주 보며 둘은 시합 연습 중! 그러나 아직 파워가 모자란 터검니에게 야나프도 약한 파워로 기술을 쓴다. 조금씩 강해지면 된다고 터검니를 격려하는 아이리스. 항상 상냥한 아이리스를 좋아하는 터검니는 나무열매를 선물하려고 숲 속으로 나무열매를 찾으러 들어간다. 높은 나무 위에 맛있어 보이는 나무열매를 발견! 서둘러 터검니를 따라간 피카츄의 제지도 뿌리치고 가느다란 나뭇가지 위에서 손을 뻗는 터검니. 나무열매까지 얼마 남지 않은 순간! 발밑의 나뭇가지가 부러져 거꾸로 떨어진다. 떨어진 곳은 “메가지네포켓몬” 펜드라의 머리 위! 놀란 펜드라는 터검니를 태운 채로 날뛰기 시작하는데...!

칠보체육관을 향해 여행을 계속하는 지우와 친구들. 도중에 들른 마을에서 포켓몬 배틀 클럽을 발견! 재빨리 대전상대를 찾던 지우는 슈티의 모습을 확인하고, 곧장 시합신청을 한다. 그리고 돈 조지 아저씨에게 부탁하여 슈티의 라이브캐스터로 연락을 한다. 생각지도 못했던 재시합으로 불타오르는 지우를 아랑곳하지 않고, 언제나 그랬듯 쿨하게 등장하는 슈티. 두 사람의 5대5 포켓몬 시합이 시작된다! 지우의 첫 번째 포켓몬은 수댕이, 슈티는 “들비둘기포켓몬”인 유토브를 내보낸다. 가리비칼을 사용하여 독창적인 공격을 시도하는 지우와 수댕이! 그러나 슈티의 유토브도 이에 질세라 기술을 선보인다! 이 승부에서 승리하는 것은 과연 누구!?

여행을 계속하는 지우와 친구들은, 칠보시티를 향하는 길에서 바위를 깎아 집을 만드는 “돌집포켓몬”인 돌살이를 만난다. 신기한 광경을 바라보고 있는데, 거기에 새로운 3마리의 돌살이가 나타난다! 그 중 한 마리는 한층 큰 바위를 짊어지고 있어 마치 3마리 중 보스인 듯하다. 그 보스가 응시한 것은 돌살이가 열심히 만든 돌집! 다음 순간, 3마리는 동시에 돌살이를 덮쳐 돌집을 빼앗아 사라진다! 그 비겁한 수법을 지켜본 지우와 친구들은 돌살이의 집을 되찾는데 협력하기로 한다. 처음에는 지우와 친구들을 경계하는 돌살이였지만, 점점 지우와 친구들에게 마음을 열게 되고, 드디어 작전개시! 과연 돌살이는 집을 되찾을 수 있을 것인가...!?

여행 도중 어느 길에서, 눈앞에 세발자전거를 탄 어린이들이 갑자기 진흙 폭탄을 던진다! 정통으로 맞은 지우와 친구들의 옆을 시끄럽게 떠들며 지나가는 아이들. 더구나 그 군단 속에 있던 “쓰레기봉투포켓몬”인 깨봉이가 떨어져 있던 지우의 소중한 모자를 주워서 가져가 버린다! 서둘러 쫓아가려 하는 지우와 친구들 앞에 유라라고 하는 한 여성이 나타나 말을 걸어온다. 유라는 조금 전의 아이들이 다니는 유치원의 선생으로, 현재 상황에 매우 곤란해하고 있다고 한다. 자세한 이야기를 듣기 위해 유치원으로 가보니, 눈앞에 벌어진 광경에 모두 깜짝 놀란다! 유치원에는 쓰레기 더미에 둘러싸인 비밀기지가 만들어져 있고, 그곳에 아이들이 틀어박혀 나오지 않는 것이다!

칠보체육관을 향해 여행을 계속하는 지우와 친구들은 갑자기 나타난 한 소녀와 부딪치게 된다! 그녀의 이름은 벨. 주박사에게 부탁을 받아, 지우에게 어떤 물건을 전하러 왔다고 한다. 그것은 바로 배지케이스! 그러나 벨의 가방 깊숙이 있던 케이스는 먼지투성이로 지저분해져 있었다. 그렇다곤 해도 소중한 배지케이스를 얻은 지우는 기분이 좋아져서 배지케이스를 높이 들어 올린다. 그런데 어느샌가 손에 있던 배지케이스가 사라져 버렸다?! 그 순간 후다닥 도망치는 “친칠라포켓몬” 치라미를 발견! 지우의 배지케이스를 소중히 입에 물고 뛰어가고 있다! 황급히 쫓아가는 지우와 친구들. 좌충우돌 치라미 잡기 소동은 어떻게 될 것인가!?

드디어 칠보시티에 도착한 지우와 친구들. 당연히 목적은 칠보체육관에서 승리하여, 2번째 배지를 획득하는 것! 기합을 넣은 지우와 함께 칠보체육관으로! 그러나 박물관을 겸한 칠보체육관의 문은 굳게 닫혀 있고, 게다가 왠지 상황이 이상하다... 안을 확인하기 위해 문을 열고, 엿보려 하는 순간! 긴 복도의 반대편에서 비명과 함께 한 남성이 달려온다! 당황하여 허둥거리는 그 남성의 이름은 아보레. 이 박물관의 부관장으로 괴이한 현상에 휘말려 있다고 한다. 그런 아보레의 이야기를 자세히 들어보니, 박물관 안에는 귀신의 소행 같은 기묘한 현상이 계속되고 있다는데...

박물관의 기묘한 수수께끼를 해결한 지우와 친구들. 체육관 관장인 알로에와 만나, 드디어 기다리고 기다리던 체육관시합! 그러나 시합을 하기 위해서는 알로에가 내는 미션에 대답하지 않으면 안 된다. 생각지도 못한 미션에 당황하면서도 무사히 미션 클리어! 마침내 시합장으로! 노말타입의 포켓몬을 사용하는 알로에는 보르그와 요테리를 내보낸다고 자신 있게 선언. 자신의 포켓몬을 상대에게 보이고, 그 반응을 보는 것이 칠보체육관의 스타일인 것 같다. 지우도 마음속으로 정한 2개의 몬스터볼을 쥐고, 드디어 시합 시작! 알로에가 처음 내보낸 것은 “강아지포켓몬” 요테리! 대응하여, 지우는 뚜꾸리를 내보낸다. 하지만 시합은 예상하지 못한 전개로 흘러가는데...!

2번째 배지를 건 알로에와의 체육관시합. 그러나 지우는 “울부짖기”와 “검은눈빛”의 콤비네이션 앞에서 패배하고 말았다. 재도전을 다짐하는 지우는 뚜꾸리, 수댕이와 함께 배틀 클럽에서 돈 조지의 특별훈련을 받기로 한다. 우선 뚜꾸리는 알로에의 요테리가 사용하는 강력한 섀도볼에 대비하여 공을 피하는 특별훈련을 하고, 이어서 수댕이는 수영장의 물살을 거슬러서 수영을 하는 특별훈련을 한다. 지우는 새로운 기술을 몸에 익힌 뚜꾸리, 수댕이와 함께 다시 한번 칠보체육관으로 향한다! 그러나 상대는 백전연마의 체육관 관장. 시합은 생각지도 못한 전개를 맞이하는데…

유치원 선생 유라를 도왔을 때 받았던 알에서 이변이! 달각달각 흔들리면서 빛나는 그 모습에 모두 흥미진진. 특히 터검니는 새로운 친구가 늘어나는 것이 기쁜지 더욱 열심히 그 모습을 지켜보고 있다. 반짝임이 빨라지고 드디어 알이 부화하려는 순간! 기쁜 나머지 들떠 있던 터검니가 알과 부딪힌다! 내리막길을 빠른 속도로 굴러가는 알! 황급히 쫓아가는 지우와 친구들. 그러나 점점 더 빠르게 굴러가는 알은 바위에 튕겨 공중으로 날아가 버린다! 그대로 떨어지면 알은 깨져 버린다! 갑자기 찾아온 대위기! 알의 운명은 어떻게 될 것인가!?

다음 체육관이 있는 구름시티를 향해 여행을 계속하는 지우와 친구들은 바람개비숲에서 “재봉포켓몬” 두르보와 만난다. 오기가 강한 두르보를 잡으려고 애쓰던 지우는 숲의 안쪽으로 계속 들어갔다가, 미로 같은 숲에서 길을 잃어버린다! 어떻게든 왔던 길로 돌아가려고 노력하는 지우와 친구들은 큰 나무 위에서 길을 찾아보기로 한다. 그러나 지우가 찾은 것은 원래 왔던 길이 아닌 나뭇가지에 매달린 거대한 나뭇잎 뭉치! 그 순간 나뭇잎이 흩어지면서 그 안에서 구름체육관 관장 아티가 씩씩하게 등장한다. 그리고 지우와 친구들이 아티의 이야기를 듣고 있는데, 그들 앞에 조금 전의 두르보가…!

구름시티를 향하는 도중, 지우와 친구들의 눈앞에 나타난 것은 새롭게 오픈한 프렌들리숍! 신기해하며 프렌들리숍 안을 구경하는데, 플로어의 안쪽에 사람들이 길게 줄을 서 있다. 그곳에서는 공인 포켓몬소믈리에가 트레이너와 포켓몬의 상성을 진단해 준다고 한다! 흥미가 생긴 지우가 안으로 들어가니, 한 여자아이가 기다리고 있었다. 그녀의 이름은 카베르네. 공인 소믈리에 자격을 가지고 있다고 한다. 그런 카베르네에게 지우는 자신의 포켓몬들을 선보인다. 그 순간! 눈을 가늘게 뜨고, 포켓몬 도감을 들이대던 카베르네의 입에서는 귀를 의심하게 하는 말들이 나오는데…!

알에서 막 부화한 곤율랭과 특별훈련 중인 지우와 피카츄. 한숨 돌리고 점심을 먹으려 하는 순간, 터널 모양의 함정에 떨어져 버린다! 도착한 곳에서 기다리고 있는 것은 일전에 만난 적이 있는 선글라스를 쓴 깜눈크! 피카츄와 시합을 하기 위해, 함정을 파서 유인한 것 같다. 의욕이 넘치는 깜눈크의 도전을 받아들인 지우와 피카츄. 그러나 거기에 한 마리의 “물새포켓몬” 꼬지보리가 나타나, 깜눈크의 선글라스를 훔쳐 달아난다! 사실은 이 꼬지보리, 엉뚱한 장난을 좋아해서 계속해서 지우와 친구들을 당혹스럽게 하는 장난을 걸어오는데…

구름시티와 이어지는 거대한 다리 “스카이애로 브리지”에 도착한 지우와 친구들. 그러나 다리에는 안개가 끼어 바로 앞을 보기도 힘들다. 어떻게든 서둘러 구름시티로 가고 싶은 지우와 친구들은 안개에 굴하지 않고 다리를 건너기 시작한다. 그러자 안갯속에서 “천체포켓몬” 고디모아젤이 나타나, 지우와 친구들을 공격해온다! 할 수 없이 주리비얀으로 응전하지만, 갑자기 주위가 빛으로 둘러싸이고, 정신을 차리니 다시 다리의 기슭으로 돌아와 있다. 그런데 주위를 잘 살펴보니 뭔가 이상하다… 지우와 친구들이 불안해하고 있노라니, 샐리라는 한 명의 소녀가 말을 걸어온다! 그리고 그 샐리의 옆에는 지우와 친구들을 공격했던 고디모아젤이 웃는 얼굴로 서 있는 것이 아닌가!

드디어 도착한 구름시티. 하나지방의 중심이라 불리는 만큼, 거대한 빌딩들이 늘어서 있다. 지우의 목적은 역시 아티와의 체육관 시합이었지만, 우연히 길에서 만난 아티는 무언가 신경이 쓰이는 일이 있어, 체육관 시합을 할 때가 아니라고 한다. 그 이유는 거리에 있는 벌레타입 포켓몬들의 상태가 이상하다는 것. 원인을 찾기 위해 행동을 함께 시작한 지우와 친구들은 지하수도로 가고, 그곳에서 1마리의 “지네포켓몬” 마디네의 모습을 발견! 아티가 말한 대로 무언가 불안한 모습으로 적의를 드러내고 있다! 그리고 이 이변에는 무서운 사실이 숨겨져 있었다!!

구름체육관에 도착한 지우는, 드디어 체육관 관장 아티와의 체육관 시합에 도전한다! 벌레타입의 포켓몬을 사용하는 아티! 녹음이 가득한 체육관에서 지우와 친구들을 맞이한 아티가 처음으로 필드에 내보낸 포켓몬은 돌살이! 그에 지우는 확실한 승리를 위해 뚜꾸리를 내보낸다. 불꽃타입의 기술로 단번에 승리를 차지하려는 지우를 향해, 놀랍도록 빠른 스피드를 보이는 아티의 돌살이는 강력한 암석포로 뚜꾸리를 녹다운 시킨다! 상성으로 유리한 뚜꾸리가 시합 불가능! 이후에도 상승세를 타는 아티를 막지 못하는 지우! 과연 이 시합은 어떻게 될 것인가!?

뇌문시티를 향해, 벨과 함께 여행하는 지우와 친구들 앞에 한 마리의 “하늘다람쥐포켓몬” 에몽가가 나타난다! 터검니가 떨어뜨린 나무열매를 주워준 에몽가의 사랑스러운 행동에 포켓몬들도 모두 마음을 빼앗겨 버리고...! 그런 사랑스러운 에몽가를 보고 몹시 흥분한 벨은, 재빨리 에몽가를 잡기 위해 시합을 한다. 그러나 헤롱헤롱으로 상대를 유혹해버리는 에몽가는 시합을 하려고 하면 도망쳐 버린다. 황급히 쫓아가는 벨! 그리고 자신에게 잘 대해준 에몽가에게 보답하고 싶은지 터검니도 함께 쫓아간다. 그러나 이 에몽가에게는 생각지도 못한 비밀이 있었는데...

에몽가를 잡은 아이리스는 서둘러 특별훈련을 시작한다. 그러나 막상 벨의 치라미와 시합을 하니, 지시도 하지 않은 “볼트체인지”로 다른 포켓몬과 교체해 버린다! 게다가 이 에몽가의 볼트체인지는 조금 특이해서 지우, 덴트의 포켓몬도 끌고 나올 수 있다! 모두가 당황해 하는 모습을 나무 위에서 재밌다는 듯이 바라보는 에몽가. 아무래도 꽤 장난을 좋아하는 성격인 것 같다. 헤롱헤롱을 사용하여, 수컷 포켓몬들을 뜻대로 하거나, 우는 시늉을 해서 미안하게 만드는 등 완전히 자기 멋대로다! 그러나 그런 모습을 유심히 바라보는 포켓몬이 있었으니...

뇌문시티를 향해 여행을 계속하는 지우와 친구들은 갑자기 내리는 비를 피할 장소를 찾고 있다. 가까스로 언덕 위의 저택에 도착한 지우와 친구들은 그곳에서 잠시 쉬기로 한다. 그러나 그때, 선반과 꽃병이 저절로 움직이고, 지우와 친구들을 향해서 습격해 온다! 황급히 도망치면서도, 피카츄의 백만볼트로 어떻게든 뿌리치려 하는 지우와 친구들. 사실 이 모든 건 “양초포켓몬” 불켜미의 소행! 그것을 알아챈 지우와 친구들은 불켜미가 왜 이런 짓을 하는지 조사한다. 그런 모습을 모니터를 통해 지켜보는 그림자가... 지금 이 저택에 숨겨진 비밀이 밝혀진다!

터검니와 곤율랭의 특별훈련 중, 숲의 덤불 속에서 포켓몬의 외침이 들려온다. 그 소리의 정체는 “동굴포켓몬” 크리만! 게다가 갑자기 「기합구슬」로 공격해온다! 당황하며 공격을 피하는 지우와 친구들, 그러자 크리만의 뒤를 쫓듯이 한 트레이너가 나타난다. 그 트레이너는 에이미라고 하는 소녀로, 갑자기 날뛰기 시작한 크리만을 놓치고 말았다고 한다. 아이리스는 드래곤타입의 포켓몬이라는 것에 한층 관심을 보이며 가까이 다가가서 상태를 살펴보니, 크리만의 다리에 굵은 철사가 얽혀 있다. 아무래도 이것이 원인으로 날뛰었던 것 같다. 그런 아이리스의 모습을 지켜본 에이미는 드래곤타입 포켓몬을 키우는 방법에 대해 가르쳐 달라고 부탁하는데...

뇌문시티를 향해 여행을 계속하는 지우와 친구들 앞에 “하전포켓몬” 줄뮤마의 트레이너, 케니언이 시합을 신청해 왔다! 이 시합에 지우가 선보인 것은, 바로 물타입의 수댕이! 장기인 가리비칼로 어떤 공격도 튕겨내는 모습을 보이며 의욕 충만! 시합 초반은 전기타입의 기술을 멋지게 피하는 수댕이였지만, 줄뮤마의 강력한 「두번치기」 공격을 받은 순간, 소중한 가리비칼이 저 멀리 날아가 버린다! 당황하며 찾으러 가는 수댕이와 지우. 그러나 가리비칼은 어디에도 보이지 않는다... 최대의 무기를 잃어버리고 충격을 받은 수댕이. 그런 수댕이를 위해 지우와 친구들은 가리비칼을 대신할 만한 것을 찾기 시작하는데...

언제나처럼 지우와 친구들이 특별훈련을 하고 있는데, 한 마리의 “솜뭉치포켓몬” 소미안이 나타난다. 덴트가 말하기를 이 시기가 되면 소미안은 집단으로 이동하며, 커플이 되어 날아간다고 한다. 그러나 이 소미안은 이유가 있어서 무리에서 떨어진 것 같다. 곤율랭이 풀숲에서 또 한마리의 소미안을 발견하는데, 아마도 처음 만난 소미안은 이 소미안이 좋아서 쫓아온 것 같다. 커플 성립을 위해서는 자신의 강함을 보여줘야만 하는 것 소미안들의 법칙. 그러나 처음 만난 소미안은 시합에서 너무 쉽게 지고 만다. 분하다는 듯이 매달리는 모습을 본 지우와 친구들은, 시합을 위한 특별훈련을 하게 되는데...

뇌문시티를 향한 긴 여행을 대비하여, 잠을 청하고 있는 지우와 친구들의 근처로 갑자기 수수께끼의 비행물체가 굉장한 빛을 내면서 날아온다. 그 움직임은 마치 UFO와 같은데... 아침이 밝자마자 그 수수께끼의 비행물체의 정보를 얻기 위해 마을을 방문한 지우와 친구들은, “삼정”이라는 박사가 변두리의 연구소에 살고 있다는 것을 듣게 된다. 삼정박사에게 물어보기 위해 지우와 친구들은 연구소로 향한다. 그러나 연구소 앞에 거의 다다른 셋은 이상한 현상을 경험한다! 갑자기 머릿속에 본 적도 없는 이미지가 떠오른 것이다! 갑작스런 상황에 불안해하는 지우와 친구들. 그리고 그 모습을 어두운 곳에서 지켜보고 있는 그림자가... 손가락 끝의 라이트를 불규칙적으로 깜박거리는 “브레인포켓몬” 리그레다...!

여행을 계속하는 지우와 친구들. 덴트의 점심준비를 망쳐버린 지우와 아이리스는 “신설포켓몬” 바닐프티로 두까비를 잡으려는 슈티와 우연히 만난다! 그러나 지우 탓에 두까비는 도망가 버린다. 슈티는 어이없어하며 그곳을 떠나려 하지만, 지우가 슈티에게 시합을 신청한다. 슈티는 시합을 거절하려 하지만, 아이리스의 “도망가냐?”라는 비아냥에 이 시합을 받아 들이기로 한다. 3대3 시합을 하게 된 지우는 처음으로 주리비얀을 내보낸다! 한편, 슈티는 주리비얀의 진화형인 샤비를 내는데...! 과연 3번째 라이벌배틀의 승자는 누가 될 것인가!?

슈티와의 시합 중에 수댕이의 생각지도 못한 약점 “물속에서 눈을 뜨지 못한다.”라는 사실을 알게 된 지우. 재빨리 특별훈련을 하기 위해, 큰 연못이 있는 장소로 왔다! 다른 포켓몬들은 아이리스에게 맡기고, 수댕이 곁에 꼬박 붙어서 지우는 특별훈련을 지시하지만, 수댕이는 좀처럼 눈을 뜨지 못한다. 그런 지우와 수댕이, 그리고 덴트를 기다리며 아이리스는 포켓몬들과 놀고 있는데, 곤율랭이 풀 속에 숨어 있던 “버섯포켓몬” 깜놀버슬에게 박치기를 한다! 그러자 화가 난 깜놀버슬이 모두를 향해 독가루를 뿌리고, 그것을 맞은 포켓몬들은 중독되어 버린다. 근처에는 포켓몬센터도 없는 위기의 상황에서 의지할 수 있는 것은 수댕이뿐... 과연 이 위기를 어떻게 극복할 것인가!?

뇌문시티를 향해 여행을 계속하는 지우와 친구들 앞을 갑자기 가로막는 소녀 랭글레이. 목적은 용의 고을 출신의 아이리스! 랭글레이는 “드래곤버스터”라고 불리며 얼음타입의 포켓몬을 사용하는 트레이너로, 아이리스와 시합하기 위해 기다리고 있었다고 한다. 랭글레이의 심한 도발에 화가 난 아이리스는 이 시합을 받아들이기로 한다! 랭글레이가 내보낸 것은 “동결포켓몬”인 툰베어. 그에 아이리스는 당연히 터검니를 선택하여 시합개시! 그러나 상성에서 밀리는 것뿐 아니라, 툰베어의 압도적인 힘 앞에서 터검니는 시합 불가능이 된다. 분한 마음을 금치 못하는 아이리스는 가슴에 품고 있던 이야기를 지우와 덴트에게 말하기 시작한다...

뇌문시티를 향해 여행을 계속하고 있는 지우와 친구들이 어느 숲에서 휴식을 취하고 있다. 그때 한 마리의 “맨틀포켓몬” 단굴이 나타나 답답하다는 듯이 마구 날뛴다! 그 모습을 본 지우는 잡고 싶은 마음이 불타올라 서둘러 수댕이, 뚜꾸리로 시합을 하지만, 생각지도 못한 참패! 치료를 위해 포켓몬센터를 향해 멀어지는 지우와 친구들을 지켜보고 있는 단굴. 마구 날뛰었던 것은 무엇인가 이유가 있는 듯하다… 치료가 끝나고 간호순 누나와 이야기를 나누고 있는데, 한 명의 남성이 나타난다. 이 남성은 갑자기 물이 나오지 않게 된 포켓몬센터의 수리를 위해 왔다고 한다. 그러나 건물에는 이상이 없고, 원인은 동굴의 수원인 듯하다. 그리고 이 수원에는 엄청난 비밀이 숨겨져 있는데…!!

여행을 계속하는 지우와 친구들은 짙은 안개가 자욱한 숲에서 길을 잃어버린다. 그러자 눈앞에는 사람의 그림자가... 길을 묻기 위해 다가서니, 그곳에 있던 것은 “히어링포켓몬” 다부니! 그러나 이상하게도 평소와는 다른 모습으로 지우와 친구들을 무시하고 비틀비틀 걸어가 버린다. 서둘러 뒤를 쫓으려 하자, 여경이 나타나 앞길을 막는다. 게다가 지우와 친구들을 체포하려고 한다! 어떻게 여경의 오해를 풀고, 자세한 이야기를 들어보니 마을 곳곳의 다부니가 갑자기 모습을 감추고 있다고 한다! 이 비상사태에 지우와 친구들도 협력하기로 한다! 그러나 이 사건에는 생각지도 못한 결말이 기다리고 있는데...!!

지우와 친구들은 어느 마을에서 주박사, 주리박사와 재회를 한다. 두 박사는 「날개화석」에서 “최초새포켓몬” 아켄을 부활시키려 하고 있었다. 거대한 장치에 화석을 넣고, 스위치를 누른 다음 몽얌나의 에너지로 그 힘을 높여가니, 장치 속에서 요란한 울음소리와 함께 한 마리의 아켄이 나타난다! 그러나 눈을 뜨고 흥분한 아켄은 「용의숨결」을 여기저기 날리는 등 자기 멋대로다! 그런 아켄을 달랜 것은 지우. 사이가 좋아진 지우와 아켄은 하늘을 나는 특별훈련을 하지만 거기에 로켓단이 나타난다...

여행을 계속하는 지우와 친구들 곁에 또다시 그 소란스러운 사람이... 굉장한 기세로 부딪힌 지우는 언제나와 같이 강 속으로 빠진다. 굽실굽실 머리를 조아리는 소녀는 벨이다! 근처 마을에서 개최되는 낚시대회에 참가하기 위해 서두르고 있다고 한다. 이 이야기를 듣고 눈빛이 바뀐 덴트! 피싱소믈리에라는 별칭을 가질 정도로 낚시를 좋아한다고 한다. 기합이 든 덴트의 기세에 눌려 지우와 아이리스도 벨과 함께 대회에 참가하기로 한다. 강가에 준비된 특설회장에는 기운 좋은 물타입 포켓몬이 많이 있다! 그러나 이 낚시대회에는 비밀이 감춰져 있는데...

지우와 친구들이 들른 영화관에서 놀라운 만남이! “나쁜여우포켓몬” 조로아가 나타난 것이다! 영화의 여주인공으로 둔갑하는 것을 좋아하는 이 조로아를 주연으로 영화를 찍고 있는 트레이너 루크의 권유를 받아들여, 지우와 친구들도 함께 영화를 만들기로 한다! 지우의 역할은 조로아가 연기하는 공주를 구출하기 위해, 해적 덴트와 대결하는 포켓몬나이트! 익숙하지 않은 연기에 고전하면서도, 전설의 드래곤마스터 아이리스에게 수업을 받고, 드디어 덴트와 결전! 이라는 클라이맥스 신을 찍기까지 이르렀다. 그러나 그 순간, 누군가가 갑자기 끼어들어 영화가 엉망이 될 위기에 처하는데...!

영화를 완성시킨 지우와 친구들은 돈 조지가 주최하는 배틀 대회 “돈배틀”에 출전하기 위해 루크와 함께 뇌문마을에 왔다. 그 곳에는 지금까지 여행에서 만났던 많은 트레이너들이 모여 있었다! 이름을 발음하기 어려운 케니언, 포켓몬소믈리에 카베르네, 드래곤버스터 랭글레이, 허둥지둥 아가씨 벨, 그리고 라이벌 슈티! 게다가 덴트, 아이리스, 루크도 참가를 결정해, 지우의 의욕은 최고조! 돈 조지의 개회선언도 듣는 둥, 마는 둥… 1회전의 대진표가 차례차례로 결정되어 간다. 그리고 드디어 지우의 대전상대가 발표되는 순간, 모니터에 나타난 것은…?!

드디어 시작된 뇌문마을에서의 ”돈배틀”. 포켓몬 배틀 클럽의 돈 조지가 주최하는 이 배틀 토너먼트에서 지우는 카베르네와 첫 시합! 두까비의 활약으로 멋지게 1회전을 승리하였다. 그리고 덴트 VS 슈티, 벨 VS 케니언을 시작으로 1회전부터 뜨거운 시합은 계속된다! 랭글레이, 안토니오, 지우에 이어 2회전에 진출한 것은 과연…?! 그리고 발표되는 2회전의 대진표. 밝혀진 지우의 대전상대는 의외의 인물…! 그리고 주리비얀에게 위기가 찾아온다! 강적을 쓰러뜨려 지우는 “돈배틀”의 준결승에 진출할 수 있을까? 그리고 돈배틀에서의 마지막으로 승리하는 것은 누구일까…?!

뇌문마을의 포켓몬 배틀 클럽의 돈 조지가 주최하는 배틀 토너먼트 “돈배틀”. 지우는 2회전에서 드래곤버스터 랭글레이와 격돌하여 절체절명의 위기에 빠진다. 랭그레이의 자망칼이 펼치는 날카로운 공격에 괴로워하는 지우의 주리비얀. 지우는 이 위기를 빠져 나와 준결승에 진출할 수 있을 것인가…? 그리고 계속되는 덴트 VS 루크, 아이리스 VS 케니언의 시합. 덴트의 메더와 루크의 활화르바, 아이리스의 에몽가와 케니언의 타격귀가 불꽃 튀게 격돌한다! 뜨거운 배틀 끝에 준결승에 진출하는 사람은 과연…?!

돈 조지가 주최하는 배틀 토너먼트 “돈배틀”. 순조롭게 승리를 거둔 지우는 결승전에 진출한다. 계속되는 준결승 제2시합은 아이리스 VS 루크. 대회에서의 첫 시합에 임하는 아이리스의 터검니는 루크의 골비람이 펼치는 연속공격에 도망칠 수밖에 없는 위기에 몰린다. 그러나 터검니가 막판에 사용한 새로운 기술로 멋지게 루크의 골비람을 이기고, 아이리스는 결승전 티켓을 손에 넣는다. 그리고 다가온 결승전, 지우와 아이리스의 뜨거운 시합이 시작된다! 지우, 아이리스가 결승전에서 선택할 포켓몬은!? 운명의 시합을 제압하고 돈배틀의 우승자가 되는 것은 과연!?

지우와 친구들은 4번째 배지를 차지하기 위해 다음 체육관이 있는 뇌문시티로 향하는 여행을 계속하고 있었다. 그런데, 만신창이가 되어 쓰러져 있는 로켓단의 나옹과 우연히 만난다. 지우와 친구들의 치료 덕분에 의식을 되찾은 나옹. 나옹은 작전에서 실패하여 본부에서 해고된 뒤, 로이, 로사와 헤어져 몸도 마음도 만신창이가 되어 여기저기를 떠돌아 다녔다고 한다. 그런 나옹을 보고, 함께 여행하자고 제안하는 지우, 아이리스, 덴트. 나옹은 이제 나쁜 짓을 하지 않겠다고 약속하고 함께 여행을 하기로 한다. 그때, 터검니가 곤율거니에게 유괴를 당하고 마는데…!?

묘한 사정으로 함께 여행하게 된 나옹과 여행을 계속하는 지우와 친구들은 한 마리의 쌔비냥과 우연히 만난다. “성악포켓몬” 쌔비냥의 귀여운 모습에 한눈에 반해버린 나옹과 수댕이. 나옹과 수댕이는 어떻게든 쌔비냥의 마음을 끌기 위해 기를 쓰며 어필한다. 쌔비냥은 그런 나옹과 수댕이에게 “자신의 친구가 동굴에 갇혀있다”하며, 도움을 요청해 온다. 예전에 쌔비냥에게 무서운 일을 당했다는 덴트는 쌔비냥이 말하는 것은 믿을 수 없다고 한다. 그러나 지우, 아이리스, 나옹과 수댕이는 쌔비냥을 믿고, 동굴로 쌔비냥을 따라가기로 하는데…!?

나옹 그리고 지우와 친구들은 뇌문시티로 향하고 있었다. 도중에 해가 저물어 일행들은 야영할 준비를 시작하고, 나옹은 장작으로 쓸만한 나뭇가지를 찾기로 한다. 나옹이 좀처럼 장작으로 쓸만한 나뭇가지를 찾지 못하고 있는데, “브레인포켓몬”인 벰크가 나타나 장작 묶음을 건네주었다. “원하는 게 있으면 뭐든 들어주겠다”는 벰크는 요리에 부족한 재료를 만들어주는 등 정성을 다하는데. 그런 벰크에게 덴트는 리조트 호텔의 스위트룸에서 자고 싶다는 소원을 말한다. 벰크를 따라가는 지우와 친구들은 아무것도 없어야 할 숲 속에서 훌륭한 리조트 호텔을 발견한다. 이상하게 생각하면서도 일행은 거기에서 머물기로 하는데!?

뇌문시티를 향해 어느 산을 지나가게 된 지우와 친구들. 폭풍우로 엉망이 된 산길을 가고 있을 때, “빙결포켓몬” 코고미가 쓰러져 있었다. 코고미를 회복시키기 위해 먹을 것을 찾는 지우와 친구들은 겨우 발견한 나무열매를 손에 넣으려는 순간 갑자기 “동결포켓몬”인 툰베어가 나타났다. 그 가운데 나옹은 나고시에이터로서 툰베어의 흥분을 진정시키려고 하지만 툰베어들은 가차 없이 “얼다바람”으로 공격을 해 오는 것이었다. 산의 보안관 클리프의 포켓몬인 “무술포켓몬” 비조푸 덕분에 겨우 위기일발로 위기를 벗어난 일행은 코고미를 어떻게든 원래의 무리로 돌려보내려고 하지만!?

뇌문시티에 도착한 일행들은 지하철로 포켓몬센터에 가게 되었다. 지하철의 운전석을 흥분해서 보고 있던 메트로 소믈리에 덴트. 그런데 열차는 긴급정지하고 만다. 창 밖의 모습을 살펴보니 바로 옆 선로를 한번도 본적이 없던 차량이 지나가는 것이었다. 뇌문시티의 지하철을 관리하는 서브웨이마스터인 상행, 하행과 합류한 일행. 두 사람의 말에 의하면 최근 시간표에 없는 “유령열차”가 나타난다고 한다. 유령열차의 정체가 궁금하면서도 포켓몬센터로 향하는 일행. 이 곳 포켓몬센터에는 다른 곳에는 없는 포켓몬들의 마음과 몸을 쉬게 하는 특별한 서비스가 있다는 이야기를 듣고 지우와 친구들은 모든 포켓몬들을 맡기기로 하는데!?

뇌문시티에 도착한 일행들은 지하철로 포켓몬센터에 가게 되었다. 지하철의 운전석을 흥분해서 보고 있던 메트로 소믈리에 덴트. 그런데 열차는 긴급정지하고 만다. 창 밖의 모습을 살펴보니 바로 옆 선로를 한번도 본적이 없던 차량이 지나가는 것이었다. 뇌문시티의 지하철을 관리하는 서브웨이마스터인 상행, 하행과 합류한 일행. 두 사람의 말에 의하면 최근 시간표에 없는 “유령열차”가 나타난다고 한다. 유령열차의 정체가 궁금하면서도 포켓몬센터로 향하는 일행. 이 곳 포켓몬센터에는 다른 곳에는 없는 포켓몬들의 마음과 몸을 쉬게 하는 특별한 서비스가 있다는 이야기를 듣고 지우와 친구들은 모든 포켓몬들을 맡기기로 하는데!?

4번째 체육관 배지를 차지하기 위해 뇌문체육관에 온 지우와 친구들 그리고 벨. 뇌문체육관은 전기타입 포켓몬을 다루는 인기 모델 카밀레가 체육관 관장을 맡고 있다고 한다. 곧바로 체육관 시합에 도전하려고 하는 벨. 그런데 배틀 필드에는 벨의 아빠가 벨을 집으로 데려 가기 위해 체육관에서 기다리고 계셨다. 벨은 아빠께 어떻게든 여행을 계속하고 싶다고 설득을 시도하지만, 아빠는 그 말을 전혀 들으려고 하지 않는다. 거기서 카밀레는 자신과 벨의 체육관 시합을 벨의 아빠께 보여드리고 벨이 얼마나 성장했는지를 보여드릴 것을 제안한다. 아빠의 말씀대로 카밀레와 체육관 시합을 해서 지면 집으로 돌아간다고 아빠와 약속을 하고만 벨. 그리고 카밀레의 “뇌전포켓몬” 제브라이카와 벨의 “달팽이포켓몬” 쪼마리의 뜨거운 시합이 시작되고...!?

카밀레와의 체육관 시합을 앞두고 대책을 세우는 지우. 카밀레의 강력한 전기타입 포켓몬에 대항하기 위해 카밀레의 포켓몬에 데미지를 주기 어려운 피카츄를 빼고 체육관 시합의 멤버를 정하기로 한다. 의욕이 넘치던 피카츄는 그런 지우에게 불만인 모양이다. 그리고 시작된 체육관 시합. 카밀레의 “뇌전포켓몬” 제브라이카에 지우는 “진동포켓몬”인 두까비로 대항한다. 땅타입을 가지고 있는 두까비에게는 제브라이카의 전기기술은 효과가 없었다. 지우의 작전대로 제브라이카에게 승리한 두까비. 그러나 다음 상대 “하늘다람쥐포켓몬”인 에몽가를 앞에 두고 첫 시합에서 체력을 쓴 두까비는 지쳐있는 것 같은데...!?

체육관 시합을 끝낸 지우와 친구들은 도개교가 복구 될 때까지 뇌문시티에서 하루를 보내고 있었다. 메트로 소믈리에인 덴트는 지하철을 타고 모든 스탬프를 모으면 서브웨이마스터와 시합을 할 수 있다고 하는 서브웨이 스탬프 랠리를 하기로 한다. 한편, 지우와 아이리스는 뇌문시티의 관광을 하기로 하고, 일행은 별도 행동으로 하루를 보내게 되었다. 빅스타디움에서의 관전과 뮤지컬 관람 등 뇌문시티의 관광을 즐기는 지우와 친구들. 그런데 거기에 미아가 된 한 마리의 “이빨포켓몬”인 터검니를 발견하고 트레이너를 찾아주기로 한다. 그리고 서브웨이 스탬프 랠리를 계속하고 있던 덴트는 친한 친구를 잃어버렸다는 소녀를 만나, 친구를 찾는 것을 도와 주게 되었다. 지우와 아이리스, 덴트는 각각 찾고 있는 트레이너와 친구를 찾을 수 있을 것인가!?

물풍경체육관을 향해 뇌문시티를 떠나려고 하는 지우와 친구들은 연기자 스트리트에서 라이벌인 슈티와 다시 만난다. 슈티는 어린시절에 하나리그 챔피언인 노간주와 만나 노간주를 목표로 강한 포켓몬 트레이너가 될 것을 결심했다고 한다. 그 노간주가 최근 이 근처에서 나타났다는 소문을 듣고 슈티는 노간주를 찾고 있었다고 한다. 드디어 노간주와 만난 지우와 슈티는 곧바로 노간주에게 시합을 신청한다. 그리고 시작된 챔피언 노간주와의 시합, 노간주의 “박치기소포켓몬”인 버프론에 대항하기 위해 지우는 최고의 파트너인 피카츄로 시합에 도전하는데 과연...!?

물풍경시티를 향해 여행을 계속하고 있는 지우와 친구들은 어느 마을에서 춤 연습을 하는 “선인장포켓몬”인 마카라치들, “트리오 더 마카라치”와 그 트레이너인 연남과 만난다. 연남과 “트리오 더 마카라치”는 뇌문시티의 포켓몬 뮤지컬 오디션에 합격하기 위해, 시험삼아 이 마을의 포켓몬 퍼포먼스 대회에 참가 한다고 한다. 대회에서 우승하기 위해서 춤의 클라이맥스를 장식할 비장의 기술을 완성시키려고 연습을 계속하고 있는 연남과 포켓몬들. 그러나 좀처럼 클라이맥스를 장식할 기술이 잘 되지 않는 마라카치들을 보고 지우와 친구들은 비장의 기술을 완성할 수 있도록 도와주기로 하는데 어떻게 될 것인가!?

물풍경시티로 향하는 지우와 친구들은 도중에 들른 포켓몬센터에서 포켓몬 전문 카메라맨 “포켓몬 포토그래퍼”인 로버트와 만난다. 로버트는 지우와 친구들에게 역시 포켓몬 포토그래퍼였던 할아버지가 찍은 사진을 보여준다. 그 사진에는 사계절 모두 다른 모습의 "계절포켓몬" 바라철록이 찍혀있었다. 로버트는 할아버지와 같은 장소에 가서, 봄, 여름, 가을, 겨울의 모습이 한 곳에 모인 바라철록의 사진을 찍기로 결심했다고 한다. 그런 결의를 들은 지우와 친구들은 로버트와 함께 사계절의 바라철록이 모두 모이는 장소를 찾으러 가기로 하는데...

물풍경시티를 향하는 여행 도중에 지우와 친구들은 한 마리의 고디탱과 그 트레이너인 소춘과 만난다. 그런데 소춘은 오만방자한 “응시포켓몬”인 고디탱이 하라는 대로 하는 트레이너였다. 고디탱은 지우의 “탈피포켓몬”인 곤율랭을 아주 맘에 들어해, 소춘은 어떻게든 지우에게 곤율랭을 받기 위해 필사적이었다. 소춘은 지우에게 곤율랭과 자신의 파트너 포켓몬을 교환하자고 조른다. 그러나 거부하는 지우, 그런 지우에게 소춘은 시합을 해서 지우가 지면 곤율랭을 달라고 조르는 것이었다. 지우는 소춘의 도발에 넘어가고, 곤율랭을 둘러싼 시합이 시작되었다. 곤율랭의 운명은 과연!?

물풍경시티로 여행을 계속하는 지우와 친구들은 도중에 포켓몬키우미집의 바비와 3마리의 “폭거포켓몬”인 모노두와 만난다. 3마리의 모노두들은 처음으로 키우미집에 맡겨져 트레이너를 찾기 위해 도망쳤다고 한다. 드래곤타입을 돌봐준 경험이 없어 곤란해하고 있는 바비를 위해, 용의 고을 출신인 아이리스는 포켓몬들을 돌보는 일을 도와주는 것을 제안하고, 지우와 친구들도 함께 도와주기로 한다. 곧바로 돌보는 일을 시작한 지우와 친구들. 그런데 그 중 한 마리, 낯가림이 심해 키우미집에 맡겨진 이후, 밥을 먹지 않고 힘이 없는 모노두 때문에 고생을 한다. 아이리스는 이 낯가리는 모노두와 어떻게든 마음을 통하려고 노력하지만...!?

물풍경시티에 도착한 지우와 친구들은 체육관 시합에 도전하기 위해 물풍경체육관을 향했다. 그러나 체육관 관장인 야콘은 아무래도 바쁜 것 같았다. 그래서 체육관이 다시 열리기를 기다리는 동안 물풍경 마켓을 산책하기로 한 일행은 오토바이를 탄 찰스와 그의 파트너 “탈껍질포켓몬”인 어지리더와 만나 안내를 받게 된다. 일행은 마켓을 산책하는 도중에 도둑을 만나지만, 거기에 이 마을의 시골 영웅 “쾌걸 어지☆리더”와 어지리더가 나타나, 범인 체포를 도와 주는 것이었다. “쾌걸 어지☆리더”의 팬이 된 지우. 밤에 항구의 창고 거리에서 어지리더가 나타날지도 모른다는 정보를 찰스에게 듣고 창고 거리로 가기로 하는데...!?

물풍경체육관에서의 야콘과의 체육관 시합을 위해 특훈에 열을 올리는 지우. 그런데 그 앞에 덴트의 형제이자 성신체육관의 체육관 관장 중에 한 명인 팟이 나타났다. 팟은 덴트의 수행의 성과를 알기위해서 포켓몬 시합을 하고 싶다고 갑자기 말을 꺼냈다. 그래서 시작된 형제들의 시합. 팟은 파트너인 “고온포켓몬” 바오프로, 대응하여 덴트는 “풀원숭이포켓몬” 야나프로 승부에 임하는데, 결국 덴트가 멋지게 승리한다. 덴트에게 진 것을 바오프의 탓으로 돌린 것에 모두가 잘못했다고 말하자 그 자리에서 도망치듯 나가버린 팟. 알고보니 팟은 체육관 관장으로서 싸우는 방법에 대해 슬럼프에 빠져 콘과도 싸움을 하고 가출을 한 것이었는데...!?

부활초를 가지고 오면 체육관 시합을 해도 좋다고 하는 야콘의 말에 지우와 친구들 일행은 부활초가 있는 섬, 삼로스섬을 향해 가기로 한다. 삼로스섬에 도착한 지우와 친구들은 청년 웅도를 만난다. 웅도는 파트너 포켓몬인 "꽃장식포켓몬" 드레디어의 도움을 받아 부활초를 찾고 있었다. 웅도의 얘기를 들어보니, 최근 삼로스섬의 토지가 황폐해진 탓인지 풀타입 포켓몬의 기운이 없어지고, 또 부활초까지 시들어버린 상태라고 한다. 웅도, 그리고 지우와 친구들은 삼로스섬의 전설에 따라 풍요의 신 “풍요포켓몬”인 랜드로스에게 기원하는 기우제를 지내기로 하지만, 거기에 바람의 신 “선풍포켓몬” 토네로스가 갑자기 나타나는데...!?

부활초를 얻기 위해 풍요의 신 “풍요포켓몬” 랜드로스에게 기원하는 기우제를 시작한 지우와 친구들. 그러나 거기에 나타난 것은 랜드로스가 아닌, 섬을 큰 소란에 말려들게 만든 바람의 신 “선풍포켓몬” 토네로스와 번개의 신 “뇌격포켓몬” 볼트로스였다! 부적의 역할을 하고 있던 비석의 쐐기가 누군가에 의해 파괴되어 있었던 것이었다! 두 포켓몬의 싸움을 말리려고 어떻게든 랜드로스를 소환한 지우와 친구들이었지만, 그 싸움의 도중에 “이빨포켓몬” 터검니와 “조작포켓몬” 고디보미가 심한 부상을 입고 말았다. 게다가 로켓단이 싸움에 지친 볼트로스•토네로스•랜드로스 3마리의 전설의 포켓몬을 잡을 계획을 꾸미고 있었는데... 과연!?

삼로스섬에서 무사히 부활초를 손에 넣은 지우와 친구들은 물풍경체육관의 체육관 관장인 야콘과 겨우 체육관 시합을 할 수 있게 되었다. 어릴 적부터 포켓몬과 함께 구멍을 파며 광산을 확장해온 야콘은 “땅타입” 포켓몬을 중심으로 한 파워풀한 시합에 자신만만이었다. 그렇게 시작된 체육관 시합. 야콘의 첫번째 포켓몬은 “사막악어포켓몬” 악비르, 이에 대응하는 지우는 “해달포켓몬” 수댕이로 승부를 건다. 수댕이는 아쿠아제트로 과감히 악비르를 공격하지만 악비르가 사용한 모래바람 때문에 눈에 모래가 들어가 버린다. 이후, 기술을 잘 사용할 수 없는 수댕이에게 악비르는 연속적으로 강한 공격을 계속한다. 절체절명이라고 생각한 그 때, 지우는 어떤 작전이 떠오르는데...?

궐수시티를 향해 여행을 계속하는 지우와 친구들. 그런데, 도중에 피카츄가 “들러붙기포켓몬” 파쪼옥에게 전기를 흡수 당하고 말았다. 피카츄를 도와주려고 하는 “트랩포켓몬” 메더와 “하늘다람쥐포켓몬” 에몽가도 같이 전기를 흡수 당해 체력을 다 써 버리고 만다. 3마리를 회복시키기 위해 포켓몬센터로 이동한 일행은 간호순으로부터 원래 이 근처에는 파쪼옥이 없다는 말을 듣는다. 이상하다고 생각하고 있던 그 때, 벨이 급하게 포켓몬센터로 뛰어 들어와서 지우와 부딪치고 만다. 벨은 주박사와 연락을 하기위해 급하게 뛰어 들어온 것이었다. 가까스로 전기돌동굴에 있는 주박사와 연락이 된 벨. 그런데 라이브캐스터의 통신이 갑자기 끊어지고 말았다. 아무래도 주박사가 있는 전기돌동굴 안에서 정전이 일어난 것 같은데....

벨의 “달팽이포켓몬” 쪼마리와 주박사의 “덥석물기포켓몬” 딱정곤을 통신 교환 하는 순간을 지켜보게 된 지우와 친구들. 그러나 벨의 쪼마리는 겁이 많은 성격으로 교환하기 앞서 시합을 시켜도 적극적인 성격의 딱정곤에게 압도되어 시합 진행이 쉽지 않았다. 그러는 중 드디어 통신 교환 개시! 쪼마리는 “탈껍질포켓몬” 어지리더로! 딱정곤은 “기병포켓몬” 슈바르고로 진화! 그런데, 벨에게 온 슈바르고는 쪼마리와는 정반대로 너무 공격적인 성격이라 더 애를 먹는다. 그 때, 주박사의 제안으로 지우, 덴트와 태그배틀을 하게 되는데 과연...!

궐수시티를 향해 여행을 계속하는 지우와 친구들은 전설의 포켓몬 연구자인 주박사의 아버지와 만난다. 그리고 주박사의 아버지로부터 일찍이 전설이라 불리는 포켓몬 제크로무와 영웅이 교신했다는 유적이 가까운 곳에서 발견되어 지금부터 탐색하러 간다는 것을 들은 지우와 친구들은 함께 가기로 한다. 단, 유적에는 고대인의 함정이 많이 설치되어 있어 아주 위험한 장소인 듯한데. 그렇게 탐색을 시작하는데, 갑자기! 유적의 수호신인 “흡사새포켓몬” 심보러에게 습격을 당해 어떻게든 도망치기 위해 넓은 방에 놓여있는 관에 숨은 지우와 친구들. 그런데 그곳에는 “관포켓몬” 데스니칸이... 그리고 아이리스가 미라로 되어버렸다!? 과연 지우와 친구들은 무사히 이 유적에서 탈출할 수 있을까!?

지우와 친구들의 앞에 갑자기 나타난 선글라스를 쓴 악비르. 피카츄를 라이벌로 생각하는 악비르는 지우와 친구들을 계속 쫓아왔던 것이었다! 그러던 중 어느 마을에서 만난 소년 닉에게 피카츄를 빌려달라는 부탁을 받은 지우. 이유를 물으니, 친구인 글렌에게 포켓몬 시합의 도전을 받았지만 아직 트레이너가 아니기 때문에 포켓몬을 가지고 있지 않았던 것이었다. 한편, 글렌은 친구인 셰인에게 아빠의 포켓몬을 빌려오게 했는데, 그 포켓몬들은 “메가지네포켓몬” 펜드라와 “진동포켓몬” 두빅굴 2마리였다. 피카츄를 빌린 닉은 아직 한 마리가 부족했는데... 그 때, 악비르가 시합에 참가하겠다고 한다. 피카츄와 악비르의 더블배틀! 과연 어떻게 될 것인가?

여행 도중에 지나가게 된 숲에서 뚜꾸리와 수댕이가 싸우기 시작했다. 그런데 갑자기 “박치기소포켓몬” 버프론에게 습격을 당한 지우와 친구들. 무사히 도망은 쳤지만 아이리스, 뚜꾸리, 수댕이, 주리비얀, 터검니는 지우, 덴트와 떨어지게 된다. 아이리스와 포켓몬들은 순찰을 하러 온 간호순과 다부니를 만나 버프론의 서식지로 들어온 것을 알게 된다. 버프론은 서식지에 들어온 사람을 적으로 보고 공격하는 습성을 가지고 있다고 한다. 그래서 버프론을 피하기 위해 아프로 가발을 간호순에게 받고 쓰게 된다. 서로의 모습을 보고 웃다가 그 때문에 또 싸우기 시작한 뚜꾸리와 수댕이. 이 싸움에 휘말린 터검니의 가발이 벗겨짐과 동시에 한 마리의 버프론의 머리 속으로 터검니가 날아가 버리는데... 터검니는 과연 어떻게 될 것인가!?

마침내 궐수시티에 도착한 지우와 친구들. 궐수체육관의 체육관 관장 풍란이 있는 곳으로 향했지만, 체육관은 완전 예약제로 에어배틀이라는 시합이 행해지고 있다고 한다. 곧바로, 오후로 예약한 지우는 먼저 오전의 체육관 시합을 보기로 한다. 그런데 에어배틀은 서로의 파트너 포켓몬을 전부 보여주고 어떤 시합이 될지를 풍란이 머리 속으로 시뮬레이션을 하고 실제로는 시합을 하지 않고 승부를 결정하는 시합이었다! 한번에 15명이나 되는 도전자를 처리하는 풍란. 그 모습을 보고 “나도 체육관 관장으로서 그런 시합은 도저히 인정할 수 없어!”라고 분노가 폭발한 덴트는 풍란에게 체육관 시합을 신청한다. “시합은 직접 해보지 않으면 모르는 법이잖아요?!”라고 말하는 덴트의 말에 풍란은 실제로 시합을 시작하는데...!?

시합을 통한 덴트의 설득에도 아랑곳하지 않고 변함없이 에어배틀에 자신만만인 풍란. 똑같이 에어배틀에 의문을 가진 지우가 체육관 시합에 도전한다. 지우의 유토브에 풍란은 진화형인 “프라이드포켓몬” 켄호로우로 대항한다! 스피드 승부의 공중전에서 일진일퇴의 공방이 펼쳐진다. 지쳐 보이는 유토브를 몬스터볼로 되돌리고 피카츄로 대응하지만, 전기타입의 기술이 모조리 봉쇄당하고 만다. 풍란의 에이스 포켓몬 ‘스완나’에 대항하는 것은 이미 지쳐버린 유토브.... 그 때, 유토브의 상태가...!? 비행타입 포켓몬들의 시합의 행방은!? 과연 6번째의 배지 “제트배지”를 차지할 수 있을 것인가!?

설화시티를 향하는 지우와 친구들은 우연히 케니언과 다시 만나게 된다. 거기서 “소원의 종 축제”가 있다는 것을 알게 되어 모두가 참가하기로 한다. 이 축제는 파트너 포켓몬 1마리와 한팀이 되어 여러 가지 경기를 이겨나가는 축제였다. 우승자에게는 “어떤 소원도 이루어 진다”고 전해지는 “소원의 종”을 칠 수 있는 권리가 주어진다고 한다. 우승을 하기 위해 기합을 넣는 지우와 피카츄. 곧바로 도구 빌려오기 경기에서 “천둥의돌”을 찾게 된다. 그런데 피카츄가 "천둥의돌"에 닿게 되면 라이츄로 진화해 버릴텐데..?! 흉내내기 대회에서는 아이리스가 주박사로!? 덴트는 카밀레로 완벽하게 변신하였지만 큰 야유를 받는데!? 여러 가지 어렵고도 별난 관문들을 해결해 나가는 지우와 친구들의 뒤에는 “브레인포켓몬” 리그레를 데리고 온 초능력자 영인이 있었는데...

어느마을에서 개최되는 배틀 대회 ‘돈너마이트’에 참가하기로 한 지우와 친구들. 케니언과 벨, 슈티, 랭글레이 등 친숙한 라이벌들도 속속 시합 참가를 표명하면서 시합에 불꽃이 튀기 시작했다! ‘돈너마이트’의 주최자는 포켓몬 배틀 클럽의 배틀매니저인 돈 조지. ‘돈너마이트’는 격투타입 포켓몬들의 육탄전으로 유명하다고 하여, 지우는 격투타입인 곤율랭을 파트너로 선택한다. 일회전에서 지우는 아키의 가시원숭이포켓몬 야나키와 격돌! 그러나 무릎차기에 실패한 곤율랭은 그 자리에서 움직일 수 없게 되어 절체절명의 위기에 빠지는데...! 야나키의 로킥이 몇 번이고 계속되고, 통렬한 연속 기술을 받은 곤율랭은 배틀필드에서 쓰러지고 만다. 모두들 ‘이제 여기까지인가...’라고 생각한 그 순간, 곤율랭은 지우의 목소리에 힘을 얻어 기합으로 일어서는데...! 바로 그 때!?

포켓몬 배틀 클럽 돈 조지 주최의 배틀 토너먼트 ‘돈너마이트’. 뜨거운 제1회전, 아이리스는 몰드류를 파트너로 선택하고, 포켓몬소믈리에르 카베르네의 쌍검자비를 맞이한다. 물타입인 쌍검자비에 대응하여 땅타입을 가진 몰드류는 상성에서 불리했다. 게다가 카베르네와 쌍검자비의 콤비네이션은 포켓몬소믈리에 덴트의 예상 이상으로 성장해 있었다! 아이리스는 과연 어떻게 할 것인가!? 그리고 계속되는 랭글레이VS그레이스의 시합. 드래곤버스터인 랭글레이는 드래곤타입인 크리만과의 대결에서 불타오른다! 기분나쁜 분위기를 가진 신아는 파트너 포켓몬인 던지미와 함께 출전하여 도문의 비조도와 격돌하는데...!?

열전이 계속되는 육탄전 배틀 토너먼트 대회 ‘돈너마이트’. 일회전 최후의 시합에서는 벨의 염무왕과 슈티의 노보청이 격돌. 최종진화형끼리의 대결이 되었다! 진화를 해서 더욱 파워가 올라간 노보청에게 염무왕은 고전을 면치 못해 위기에 빠지고!! 그 때, 벨은 염무왕에게 터무니없는 지시를 내리는데...!? 그리고 케니언VS덴트는 박력있는 시합을 펼친다! 케니언의 타격귀는 덴트의 야나프의 공격을 계속 받아치면서 혼신의 태권당수를 날린다! 그러나 거기에 질세라 야나프는 물기 공격으로 형세의 역전을 노린다! 돈 조지가 우승 후보라고 말한 신아와 던지미는 여유있는 표정으로 계속해서 시합을 이겨나가는데...!?

점점 더 뜨거워지는 육탄전 배틀 토너먼트 ‘돈너마이트’. 준결승전의 대진표는 벨의 염무왕VS케니언의 타격귀. 파워가 특징인 염무왕에 대항하여 빠른 스피드의 타격귀! 벌크업으로 더욱 공격력을 올린 타격귀는 특기인 태권당수로 염무왕을 공격한다...! 그리고 지우VS신아의 배틀의 막이 열린다. 신아의 파트너 포켓몬 던지미의 기백에 압도된 지우의 곤율랭. 곤율랭은 아직 컨트롤이 완벽하지 않은 ‘기합구슬’로 승부를 건다! 거기에 곤율랭의 특기인 접근전에 들어가 무릎차기로 던지미의 파워에 도전하는데...!? 과연 지우는 어떻게 될 것인가!? 결승전에 진출해 우승을 손에 넣는 사람은 과연 누구일까!

설화시티를 향해 가는 지우와 친구들. 지우의 두르쿤과 아이리스의 에몽가가 시합을 연습하던 중, 두르쿤이 ‘육아포켓몬’ 모아머로 진화를 한다! 모아머는 인사 대신으로 잎사귀 옷을 만드는 습성이 있다. 먼저 피카츄와 다른 포켓몬들에게 잎사귀 옷을 만들어 주고, 잎사귀 옷을 받고 아주 기뻐하는 터검니에게는 잎사귀로 가면을 만들어주었다. 그 후 지우와 친구들은 낮잠을 자는데, 터검니가 아이앤트에게 납치당하고 만다. 아무래도 잎사귀 옷을 입은 터검니를 식량으로 착각한 것 같다! 터검니를 찾기 위해 모아머의 실에 의지하여 미로 같은 굴을 들어가는 지우와 친구들. 그런데, 거기에는 수많은 아이앤트가...! 터검니는 과연 어떻게 될 것인가!?

설화시티로 향하기 위해 태엽산의 동굴을 빠져나오는 도중에 미아가 되어버린 지우와 친구들. 무언가를 치는 소리가 나는 방향으로 걸어간 곳에서 등남과 만난다. 등남은 큰 바위를 들고 흥분한 상태인데. 그 이유는 등남은 아마추어 포켓몬 고고학자로서, 오랫동안 연구를 해온 ‘옛날거북포켓몬’ 프로토가의 화석을 발굴한 것이었다. 아주 오랜 옛날 멸종했다고 전해지는 프로토가. 그러나 등남은 어렸을 적에 살아있는 프로토가와 놀았던 적이 있다고 한다. 태엽산 탐험 중에 갑자기 프로토가가 있는 세계로 타임슬립을 한 이상한 경험을 가지고 있었다. 흥미진진한 이야기에 빠져든 지우와 친구들. 그런데 그 때, 로켓단에게 프로토가의 화석을 빼앗기고 마는데...!?

‘시간의 문’이라 불리는 태엽산에 존재하는 시공의 뒤틀림. 로켓단은 ‘시간의 문’에서 과거의 세계로의 타임슬립을 계획하고 있었다. 멸종하였다는 과거의 포켓몬들을 대량으로 잡아서 전력을 강화해 하나지방의 정복을 꾸미고 있었던 것이었다!! 그런 ‘시간의 문’을 안정시키기 위해서는 ‘옛날거북포켓몬’ 프로토가의 생체 에너지가 필요했다...마침내, 로켓단의 화석복원장치에 의해 프로토가는 현대 세계에 복원되고 말았다. 당황하여 도망가는 프로토가. 지우와 친구들은 프로토가를 보호하여 숲 속으로 도망가지만, 다시 로켓단에게 공격을 당한다! 그런데 갑자기 프로토가가 빛나기 시작하는데...!? 대체 어떻게 될 것일까!?

아스틸베마을의 배틀 클럽에서 잠시 쉬기로 한 지우와 친구들. 거기에서 만난 추룡이라는 소년은 지우의 파트너 뚜꾸리의 이전 트레이너였다! ‘배틀에 재능이 없다’라는 이유로 뚜꾸리를 버린 추룡. 제멋대로인 행동을 비난하는 지우에게 추룡은 ‘얼마나 뚜꾸리가 재능이 없는지, 내가 더블배틀로 증명해 보이겠어!’라고 한다. 한편, 뚜꾸리는 옛날의 추억에 잠겨 시합에 의욕이 나지 않는 상태인데... 뚜꾸리의 활약과 하루하루의 노력을 알고 있는 주리비얀은 자신도 시합에 나가고 싶다고 나선다. 상대는 불꽃타입인 ‘개미핥기포켓몬’ 앤티골과 뚜꾸리의 최종진화형인 ‘큰불돼지포켓몬’ 염무왕이었다. 주리비얀은 불리한 상성에 지지 않으려고 기합을 넣고 시합에 임한다! 그 때, 뚜꾸리가...!?

설화시티 근처 산을 여행하는 지우와 친구들. 위험한 절벽에서 바위가 떨어지는 것을 산기슭에서 수행을 하고 있던 담죽과 ‘동결포켓몬’ 툰베어에게 도움을 받는다. 사실 그들은 유명한 영화 ‘얼음 3부작’에 출연했었던 영화계의 대스타였다. 게다가 담죽과 툰베어의 수행하는 모습도 보게되어 영화 소믈리에인 덴트는 대흥분 상태! 그런데 갑자기 산이 검은 구름으로 덮여가는데... 걱정이 되어 담죽과 지우 일행이 산으로 가보니 포켓몬헌터 윤장이 ‘부유포켓몬’ 탱탱겔 2마리를 이끌고 산의 수호신인 ‘태양포켓몬’ 불카모스를 잡고 있었다! 지우는 악비르로 시합에 임하지만, 악비르도 잡히고 만다! 과연 어떻게 될 것 인가!?

7번째 배지를 차지하기 위해 설화체육관의 문을 두드리는 지우. 눈 앞에는 얼음 경기장이 펼쳐져 있었다! 체육관 관장 담죽은 얼음타입 포켓몬을 다루는 트레이너이다. ‘빙설포켓몬’ 바닐리치에 대항하는 것은 얼음타입과 상성이 나쁜 악비르! 바닐리치는 반격할 틈조차 주지 않고 공격을 계속한다...! 지우는 상당한 데미지를 입은 악비르를 일단 몬스터볼로 되돌린다. 그리고 얼음타입에 상성이 유리한 격투타입인 곤율랭이 체육관 시합에 처음으로 출전하여 대건투! 마지막으로 맞이한 상대는 하얀 얼음의 왕 툰베어! 지우는 ‘절대 지지 않겠다’는 악비르의 마음을 받아 승부를 건다! 툰베어를 라이벌로 생각하는 악비르는 과연 어떻게 될 것인가...!?

나머지 한 개의 배지를 차지하기 위해 쌍용체육관으로 출발 준비를 하고 있던 지우와 친구들. 그런데 덴트를 찾고 있었다는 남자가 나타나 3명은 갑자기 차에 태워진다. 지우와 친구들은 가까운마을의 부자 한거부의 집에 도착. 듣자하니 한거부씨가 사랑하는 딸 도은이 처음으로 포켓몬을 갖게 되어 우수한 A급 포켓몬소믈리에에게 파트너를 선택해 달라는 것이었다. 거기에 또 한 명 초대 된 사람인 피노 누아르는 ‘뿌리포켓몬’ 치릴리가 파트너 포켓몬으로 어울린다고 단언하지만 도은은 시무룩한 표정을 짓고... 덴트는 도은의 향기를 힌트로 음미해 보는데... 거기에 S급 포켓몬소믈리에 타베르네가 난입한다!! 그런데 타베르네를 어디선가 본적이 있는 것 같은데...!?

선착장으로 향하는 지우와 친구들은 우연히 드래곤버스터 랭글레이와 ‘블리자드포켓몬’ 배바닐라를 만난다. 랭글레이는 ‘포켓몬의 능력을 높이는 이끼’를 받기 위해 철시드연구소로 향하는 도중이었다. 흥미를 갖게 된 지우와 친구들도 연구소로 가기로 한다. 이끼는 ‘가시열매포켓몬’ 철시드가 바위와 돌의 성분을 체내로 흡수시켜 만들어내고 있었다. 그런데 갑자기 전기돌로 실험중인 방에서 이끼가 대량 발생! 연구소 전체를 뒤덮어 버리고 말았다!! 서둘러 피난한 지우와 친구들. 그런데 아이리스가 터검니, 수댕이, 싫어하는 얼음타입의 배바닐라와 함께 연구소의 옥상에 남겨지고 만 것이었다! 배바닐라와 점점 다가오는 이끼에 떨고 있는 아이리스...! 과연 어떻게 될 것인가!?

드디어 체육관이 있는 항구도시에 도착한 지우와 친구들. 덴트에 의하면 이 마을에는 옛날부터 영화 촬영소가 있었고 최근에는 영화 놀이공원도 완성되었다고 한다. 거기서 우연히 루크와 “나쁜여우포켓몬” 조로아를 다시 만난다. 영화감독을 목표로 하고 있는 루크는 이 놀이공원의 특별 이벤트에 초대되어 영화제에 참가하기 위해서 이 마을에 온 것이었다. 영화제 참가자들은 이 시설 안에 있는 설비를 똑같이 활용하여, 같은 설정으로 영화를 만들어서 그 솜씨를 경쟁한다고 한다. 루크의 제안으로 영화를 만드는 일에 협력하기로 하는 지우와 친구들. 주인공은 하나방위대 지우, 피카츄, 차오꿀! 주연 여배우인 아이리스는 눈물 연기에 고전을 면치 못하는데...!?

하나리그 출전이 걸린 8번째 배지를 차지하기 위해서 드디어 모란만체육관의 문을 여는 지우. 체육관 관장은 슈퍼펑크밴드 ‘더 또가스’의 보미카! 체육관은 라이브 공연장 겸 경기장이었다! 체육관을 꽉 채우고 있는 시합&라이브를 좋아하는 관객들이 보미카를 응원하는 열띤 분위기에도, 지우는 피카츄의 100만볼트로 더욱 회장의 분위기를 고조시킨다. 게다가 자신만만한 보미카는 지우는 포켓몬 6마리, 자신은 포켓몬 3마리로 시합을 하자고 말도 안 되는 제안을 하는데...! 보미카는 관동에서 잡았다는 “독가스포켓몬” 또가스! 여기에 맞서 지우는 켄호로우로 또가스의 스피드에 대항하지만, ‘오물폭탄’을 맞아 독 상태가 되어 버린다! 이후도 가차없는 독 공격이 계속되는데...! 과연 어떻게 될 것인가!?

하나리그 출전이 걸린 8번째 배지를 차지하기 위해서 드디어 모란만체육관의 문을 여는 지우. 체육관 관장은 슈퍼펑크밴드 ‘더 또가스’의 보미카! 체육관은 라이브 공연장 겸 경기장이었다! 체육관을 꽉 채우고 있는 시합&라이브를 좋아하는 관객들이 보미카를 응원하는 열띤 분위기에도, 지우는 피카츄의 100만볼트로 더욱 회장의 분위기를 고조시킨다. 게다가 자신만만한 보미카는 지우는 포켓몬 6마리, 자신은 포켓몬 3마리로 시합을 하자고 말도 안 되는 제안을 하는데...! 보미카는 관동에서 잡았다는 “독가스포켓몬” 또가스! 여기에 맞서 지우는 켄호로우로 또가스의 스피드에 대항하지만, ‘오물폭탄’을 맞아 독 상태가 되어 버린다! 이후도 가차없는 독 공격이 계속되는데...! 과연 어떻게 될 것인가!?

하나리그가 3개월 후에 개최되는 것을 알게 된 지우와 친구들은 덴트의 제안으로 모란만시티의 명물인 툰베어아이스를 먹으러 간다. 그러자 놀랍게도 그 곳에서 신오지방의 챔피언인 난천과 만나게 되는데. 난천은 보배마을에서 열리는 「포켓몬월드토너먼트 주니어컵」에서 친선경기에 참가한다고 한다. 난천의 시합을 직접 볼 수 있을 뿐만 아니라 그 대회에서 우승하면 하나지방의 챔피언인 노간주와 시합을 할 수 있다는 것을 듣게된 지우와 친구들은 토너먼트에 참가하기로 결정하고 난천과 함께 물결마을로 향한다. 그러던 중 매우 보기 드문 “선율포켓몬” 메로엣타가 지우와 친구들의 앞에 나타난다. 하지만 상처투성이인 메로엣타는 갑자기 쓰러져 버리는데...!?

이스트하나의 물결마을에 도착한 지우와 친구들. 먼저 도착한 손님이 있다고 하는 난천의 별장으로 향하던 중, 갑자기 차 안에서 “선율포켓몬” 메로엣타가 나타난다. 아무래도 메로엣타는 지우가 맘에 들어 따라온 것 같은데... 그리고 난천의 별장에서 기다리고 있던 것은 놀랍게도 빛나와 “펭귄포켓몬” 팽도리였다. 사실 빛나는 포켓몬코디네이터의 실력을 갈고 닦기 위해 하나지방으로 왔던 것이었다. 주니어컵을 위해 함께 합숙하게 된 지우와 친구들. 거기서 덴트는 「포켓몬코디네이터의 포켓몬을 맛보기하고 싶다」고 빛나에게 시합을 신청한다. 그 모습을 로켓단이 감시하고 있었는데...!?

물결마을에 있는 난천의 별장에서 주니어컵을 위해 쉴 틈 없이 훈련을 하고 있는 지우와 친구들. 휴식을 가지고 싶다는 빛나의 제안으로, 신기한 “돌뱀포켓몬” 롱스톤이 있다고 전해지는 무인도로 놀러 가게 된다. 해안가의 동굴을 탐색하던 도중 갑자기 롱스톤에게 습격받게 된다. 겨우 도망은 쳤지만 지우와 친구들은 아이리스, 빛나와 떨어지게 되는데... 일단 해안가로 돌아가기로 결정하고 움직이던 도중에 또다시 거대한 롱스톤에게 습격당한다! 바위・땅 타입의 롱스톤을 상대로 물 타입인 수댕이와 팽도리가 힘을 합쳐 롱스톤을 쫒아내지만, 더욱 많은 롱스톤들이 습격해 온다! 그러자 메로엣타가 노래를 부르기 시작, 그 모습이...!?

물결마을에서 합숙 중인 지우와 친구들은 “빙결포켓몬” 코고미를 찾고 있는 소년 크리스를 만난다. 밀실로 되어 있는 포켓몬하우스에서 코고미가 사라졌다고 하는데... 걱정이 된 지우와 친구들은 다 함께 코고미 찾는 것을 도와주기로 한다. 덴트는 소믈리에탐정의 힘을 발휘하여 숲 속에 있는 수상한 발자국을 발견한다. 분명 이 발자국의 주인이 코고미를 데리고 갔을 것이라고 추리하는 덴트. 터검니가 먹다 남은 과일의 흔적을 발견하면서 범인에 대한 확신을 가진 덴트는 숲 속 깊은 곳까지 들어간다. 그러자, 눈 앞에는 콧물을 흘리면서 과일을 먹고 있는 “동결포켓몬” 툰베어의 모습이! 설마!? 이 툰베어가 바로 크리스의...!? 사건의 진실은 과연!?

난천의 별장에서 아침 준비를 하고 있는 지우와 친구들. 그러자 갑자기 물결마을 전체가 정전이 되어 버린다. 그러고 얼마 안돼 여경이 난천를 찾으러 별장으로 오는데...여경의 말에 의하면 이 마을에서 유명한 난동꾼인 “드래곤포켓몬” 망나뇽 때문에 정전이 되었다고 한다. 하지만 그 얘기를 들은 아이리스는 “드래곤포켓몬 중엔 절대로 그런 나쁜 아이는 없어!” 라고 말하며 변전소를 향해 뛰쳐나간다. 아이리스에 이어 지우와 친구들도 변전소 내부에 들어가니 날개에 상처를 입은 망나뇽이 방 안 깊은 곳에 쓰러져 있었다. 하지만 인간을 경계하는 망나뇽은 난폭하게 날뛰기 시작한다! 천장이 무너지는 순간! 아이리스, 수댕이, 팽도리는 방 안에 갇혀 버리는데...!?

드디어 포켓몬월드토너먼트 주니어컵이 개막. 우승자는 하나지방의 챔피언인 노간주와 시합을 할 수 있다. 대회의 주목거리 중 하나인 친선경기는 신오지방 챔피언인 난천의 “마하포켓몬” 한카리아스 VS 하나지방 사천왕인 카틀레야의 “천체포켓몬” 고디모아젤의 시합이다. 열기에 휩싸인 대회장은 1회전에서부터 분위기가 고조되어 가고 있다. 아이리스의 “드래곤포켓몬” 망나뇽 VS 드래곤버스터 랭그레이의 “동결포켓몬” 툰베어, 거대한 덩치를 가진 두 마리의 박력 넘치는 시합! 망나뇽은 상성이 나쁜 얼음타입 툰베어의 공격을 어째서인지 그대로 맞고 서있다! 곤란해하는 아이리스의 지시를 계속해서 무시하는 망나뇽. 과연 이 시합의 결과는...!?

뜨거운 시합이 계속되는 [포켓몬월드토너먼트 주니어컵]! 아이리스의 망나뇽은 포켓몬코디네이터인 빛나의 “2개송곳니포켓몬” 맘모꾸리와 2회전에서 시합! 1회전에서 망나뇽과의 콤비네이션이 좋지 않았던 아이리스. 초반에는 지시를 들었던 망나뇽이지만 이번 시합에서도 아이리스의 생각처럼 잘 되질 않는데...!? 그와는 반대로 완벽한 콤비네이션의 빛나와 맘모꾸리. 연속해서 기술을 맞춘다! 이 시합, 과연 결과는 어떻게 될 것인가!? 그리고 덴트는 슈티와 돈배틀 이후 2번째 시합.! “로열포켓몬” 샤로다 VS 암팰리스! 체육관 관장으로서의 위엄을 건 맛보기는 과연...!?

드디어 준결승을 맞이한 [포켓몬월드토너먼트 주니어컵] 지우는 악비르로, 아이리스의 망나뇽과 시합. 여기에 와서야 겨우 망나뇽과의 호흡이 맞기 시작한 아이리스는 시합의 감을 잡고 자신감을 얻어 순조로운 공격을 해나간다! 한편 망나뇽과 상성이 좋지 않은 악비르는 망나뇽의 기술을 많이 맞아 위태로워지는데!! 하지만, 그 순간 악비르의 모습이...!? 그리고 지우와 아이리스의 열정적인 시합이 계속되는 사이, 슈티는 누가 이겨서 자기와 붙게 되더라고 단순한 통과점에 불과하다는 듯 여유로운 표정이다. 하나지방 챔피언 노간주에게 이기는 것만이 목적인 슈티...과연 우승은 누가 차지하게 될까!?

[포켓몬월드토너먼트 주니어컵]에서 우승한 슈티는 노간주의 버프론에 대적해 샤로다와 함께 시합을 시작한다! 자신의 강함을 노간주에게 증명하기 위해 버프론의 특성과 약점을 철저하게 연구하여 완벽한 준비를 하여 도전한 슈티. 그에 비에 노간주는 챔피언으로서 당당하게 그 모든 것을 받아들이고 있는 것이었다. 승부는 생각지 못한 결과가 기다리고 있었는데...!? 그리고 대회가 끝난 빛나와 팽도리는 윤진컵에 출전하기 위해 성도지방으로 향한다고 말한다. 지우는 아직 상대해보지 않은 빛나에게 시합 신청을 한다. 피카츄 VS “화산포켓몬” 마그케인. 서로에 대해 너무 잘 알고 있는 두사람의, 모험의 성과라고도 부를 수 있는 시합이 펼쳐지게 되는데...!?

주니어컵 회장에서 만난 소년: 철이의 8개째 배지따기에 동행하기로 한 지우와 친구들. 기하체육관으로 향하던 지우와 친구들은 덴트・아이리스와 흩어지고 만다! 덜렁대는 트레이너에게 쓴웃음을 짓는 “파문포켓몬” 리오르와 피카츄. 더 많은 시련이 기다리고 있는데...!? 그리고, 철이의 특기 덕분에 겨우 체육관에 도착! 그곳에는 물타입 체육관인 듯한, 해안에 만들어진 필드가 펼쳐져 있었다. 체육관 관장 시즈는 “부유포켓몬” 탱탱겔, 이에 맞서는 철이는 “가시열매포켓몬” 너트령으로 시합! 100만볼트로 탱탱겔에게 큰 데미지를 주지만, 그 후 예상하지 못한 사태가...!?

하나리그 참가를 목표로 난천의 별장에서 트레이닝 중인 지우와 친구들. 곤율랭과 기합구슬 연습을 하던 중, 숲 저편에서 비명이 들려왔다! 그곳에는 싸우고 있는 “새끼독수리포켓몬” 수리둥보와 “기저귀포켓몬” 벌차이의 모습이...! 기합구슬을 연습하다 날아간 바위 조각이 머리에 부딪치는 바람에 수리둥보가 착각하여 벌차이 탓으로 돌려버리고 만 것이다! 그러자 그곳에 포켓몬보육원의 신입 보육사가 나타나 2마리의 포켓몬은 항상 이렇게 싸움을 한다며 한탄한다. 보육원에 돌아가서도 변함없이 싸우는 2마리의 포켓몬... 덴트는 포켓몬소믈리에로서 원인을 찾기로 한다! 그러던 중, 레이라선생님에게 주의를 받은 벌차이가 보육원에서 도망치는데...!?

난천의 별장에서 특별훈련 중인 지우와 친구들. 「시합을 하고 싶다」라며 메로엣타가 수댕이에게 도전장을 내밀었다! 그 때 갑자기 지우와 친구들을 악당이라고 착각한 청년 랠리와 “골렘포켓몬” 골루그가 공격을 걸어왔다! 순식간에 메로엣타가 지우를 두둔하여 지우와 친구들은 오해를 풀게 된다. 한편, 랠리와 골루그는 어떻게 해서든 메로엣타를 보호하기 위해 각지를 찾아 다녔다고 한다. 원래 숲 안쪽 깊숙한 곳에 있는 비밀의 장소에 살고 있던 메로엣타는 어떤 자에 의해 습격을 당해, 우연히 지우와 친구들을 만나게 된 것이었다. 그 때! 수상한 감시카메라를 찾아낸 지우와 친구들! 이 장소도 위험하다는 것을 알고, 메로엣타를 지키기 위해 서둘러 별장을 나왔지만 눈 앞에 갑자기 로켓단 보스・비주기가 나타나는데...!?

하나지방 정복계획 「오퍼레이션 템페스트」. 로켓단에 의해 해저신전에 잡히고 만 메로엣타와 지우, 피카츄. 비주기는 토네로스・볼트로스・랜드로스 전설의 3마리를 사용해 하나지방을 정복하려고 꾀하고 있었다... 「비추는거울」의 힘으로 소환 당한 전설의 3마리는 영물폼으로 폼체인지하여 비주기의 지시로 폭주를 시작한다!! 어떻게든 탈출한 지우와 피카츄는 비명을 지르며 괴로워하는 메로엣타를 구출하러 향한다!! 동료 메로엣타를 구하기 위해 피카츄가 사용한 일렉트릭볼은 엄청난 일이 되고...!? 비주기와 그의 곁으로 모이는 로켓단, 지우와 친구들의 하나지방 최대의 배틀이 시작된다!!

하나리그 개최지가 마고자시티로 결정되어, 난천의 별장을 나선 지우와 친구들. 숲 속에서 화원가극단의 마야와 “스카프포켓몬” 치라치노, 서기와 “꽃장식포켓몬” 드레디어, 자울과 “부케포켓몬” 로즈레이드와 최악의 만남을 가지게 된다. 차오꿀과 수댕이의 싸움에 말려든 에몽가는 마야에게 부딪치고 만다. 그러자 마야는 에몽가, 더욱이 주리비얀도 「촌스러!」라고 비난하고, 아이리스는 이에 노발대발!! 자리를 떠난 3명을 기죽게 만들기 위해 지우와 덴트도 드레스업하여, 남자는 출입금지인 그녀들의 기숙사로 향한다. 「시들지 않아야 꽃이지 져서 떨어져버리면 진흙탕 신세」! 라는 터무니없는 배틀이 막을 여는데...!?

하나리그가 열리는 마고자시티를 향해 여행을 지속하는 지우와 친구들. 돌연 “용맹포켓몬” 워글과 “두더지포켓몬” 두더류, 그 트레이너인 천명&지평 형제가 나타나, 지우와 덴트에게 태그배틀을 도전해왔다!! 「드릴윙」, 「홀버드」, 「제비크로우」, 등 누구도 본 적 없는 뛰어난 콤비네이션 합체기술을 사용하는 2마리! 그들에 대적하는 켄호로우와 야나프도 지지 않고 합체기술로 맞대응! 과연 결과는...? 그리고 아직 더 강해지고 싶은 2명에게 덴트가 포켓몬소믈리에로서 맛보기를! 창공과 대지를 제압하는 그들이 물타입 포켓몬을 잡는다면, 육,해,공 삼박자가 모여 세계최강으로...!? 도대체 어떻게 될까!?

하나리그가 열리는 마고자시티로 향하는 지우와 친구들은 가는 도중에 아이리스의 고향인 용의 고을에 들리기로 한다. 할머님에게 지금까지 여행에 대해 말씀드리고, 아이리스의 소꿉친구인 창포와도 다시 만나 창포가 키우고 있는 “난폭포켓몬” 디헤드 2마리와도 만난다. 이 2마리의 디헤드는 같은 날에 알에서 부화한 형제로, 형 디헤드가 오늘 왠지 기운이 없다고 한다... 지우와 친구들이 창포의 집에서 밥을 먹고 있을 때, 동생 디헤드가 어쩐지 당황한 모습으로 나타난다. 디헤드를 따라가 보니, 형 디헤드가 “난폭포켓몬” 삼삼드래로 진화! 하지만, 삼삼드래는 자신의 진화에 놀라 갑자기 난동을 부리기 시작한다! 아이리스는 「내가 해볼게」라고 말하는데...!?

쌍용시티에 도착한 지우와 친구들. 쌍용체육관의 체육관 관장인 사간과 시합을 하기로 한 아이리스는 의욕이 넘친다. 하지만, 대하기 어려운 사간과의 일을 생각하면 가만히 있을 수 없는데... 아이리스는 마음을 진정시키기 위해 쌍용시티 철탑에 오르는데 그 일로 인해 소동이 일어나고 만다. 그렇지만, 쌍용학원에 다니던 때 기숙사에 계시던 마사 아주머니와 쌍용학원의 포켓몬, “도끼턱포켓몬” 액슨도와의 재회를 통하여 다시 한 번 분발하기로 한다. 처음 사간과 시합을 했을 때, 제멋대로인 아이리스로 인해 몰드류는 마음을 닫아버렸다... 이번에야말로 둘의 콤비네이션으로 이긴다! 는 마음으로 아이리스는 전력으로 사간에게 맞선다! “땅밑포켓몬” 몰드류가 “도끼턱포켓몬” 액스라이즈와 만회의 시합...!! 도대체 어떻게 될까!?

마고자시티 근처의 고개에 온 지우와 친구들은, 바위로 막혀 있는 길을 무리해서 지나가려고 하다 벼랑에서 떨어지고 만다. 그 때, “진화포켓몬” 이브이를 데리고 있는 청년 버질과 “태양포켓몬” 에브이에게 구조된다. 버질은 아버지, 형과 함께 포켓몬 구조대를 구성하여 마을을 지키고 있다고 한다. 버질의 팀 이름은 “이브이팀”. 이브이와 그 진화형 7마리와 함께 구조활동을 하고 있는 것이다. 그러던 중, 댐에서 사건이 발생. 버질의 형・데비가 현장으로 급히 가지만, 싸우기를 좋아하는 “결정포켓몬” 프리지오는 댐 관리실의 문을 얼려 데비를 가둬버린다! 더욱 긴급사태로 치닫고, 버질 그리고 지우와 친구들은 데비를 도우러 간다. 이브이팀의 실력을 발휘할 수 있을까...!?

마침내 하나리그가 열리는 마고자시티에 도착한 지우와 친구들. 벨 그리고 케니언, 슈티, 버질과 다시 만난다. 무사히 대회 엔트리를 등록하고, 각자의 숙소로 돌아가던 중, 숲 속에서 어디선가 본 적이 있는 텐트를 발견한다! 그것은 철이와 리오르가 이번에야말로 지각하지 않기 위해 3일 전부터 대기하고 있던 텐트이다. 하지만, 철이에게 자세히 이야기를 들어보니 아직 대회에 엔트리 등록을 하지 않았다고 한다. 놀란 지우는 접수완료 방송이 나오는 와중에 철이를 데리고 서둘러 엔트리 접수처로 향한다! 과연 시간에 맞출 수 있을까...!? 그리고, 드디어 예선전이 개막! 운명의 대결이 다시 한번 펼쳐진다!? 지우의 상대는 슈티와 샤로다! 이에 맞서 지우가 고른 포켓몬은...!?

격렬한 시합이 계속되는 하나리그 예선전, 지우의 피카츄 VS 슈티의 샤로다의 시합! 슈티와 샤로다의 특기인 필살의 콤비네이션 드래곤테일과 김밥말이의 연속공격이 적중하여 큰 위기에 빠진 피카츄는 100만볼트로 필사적인 대응을 해 보지만, 샤로다에게는 다른 작전이 있었는데...!? 이번에야말로 슈티에게 이기고 싶은 지우와 피카츄는 과연 승리를 할 수 있을까!? 그리고, 라이벌들도 예선전에서 뜨거운 시합을 펼친다! 본선 1회전에서는 철이와 벨의 대전이 결정되었다! 대검귀 VS 슈바르고의 시합에서는 슈바르고가 철벽으로 방어력을 올려, 대검귀의 공격이 잘 통하지 않았다. 곤란해진 철이는 밴드를 잡아 당겨 비책을 짜려고 하는데 과연 그 결과는...!?

하나리그 마고자대회는 어느덧 중반에 돌입하고 지우와 친구들은 잠시 휴식을 취하러 숙소로 돌아가기로 한다. 그런데 터검니가 사라진 것을 피카츄가 눈치챈다!! 터검니는 떠다니는 풍선을 따라가다 깜박하고 지우와 친구들에게서 떨어지고 만 것이다!! 아이리스는 필사적으로 터검니를 찾는다. 작은 골목을 중심으로 터검니를 찾는 피카츄와 친구들. 그러던 중, 수댕이는 박스 가득히 들어 있는 음식을 뒷골목에서 찾아내, 그것을 전부 먹어버린다. 그런데, 그것은 뒷골목에 사는 “쓰레기장포켓몬” 더스트나가 근처의 주민에게 받은 음식이었던 것이다. 음식이 없어져 슬퍼하는 “쓰레기봉투포켓몬” 깨봉이. 그 와중에 피카츄와 친구들은 터검니를 찾아내, 안도의 숨을 돌리는데... 그곳에 분노한 더스트나가 등장한다! 도대체 어떻게 될까!?

뜨거운 시합이 계속되는 하나리그 마고자대회! 2차전을 이긴 지우는 마침내 3차전으로 진출한다. 3차전에서 맞이한 상대는 바로 케니언! 돈배틀이나 소원의 종 배틀, 돈너마이트... 모든 대회에서 함께 싸워 온 케니언과 지우. 서로를 잘 알고 있는 친구이기에 고른 포켓몬과 기술을 서로 예상하고 시합에 도전한다!! 케니언의 제브라이카는 새로운 기술을 배워 예상 외의 전개를 맞이하지만, 지우의 두까비도 지지 않고 맞서 대응한다! 그리고, 케니언의 최강 파트너 “태권도포켓몬” 타격귀에 맞서는 상대는 한번 시합을 해서 체력을 소모해 버린 악비아르였다! 그러나 악타입은 격투타입에 불리한데... 이 상황을 지우는 어떻게 헤쳐나갈까!?

4차전에 진출한 지우는 철이와 시합을 하게 된다! 4차전은 6대 6 풀배틀! 철이가 예고했었던 비밀병기는 바로 “난폭포켓몬” 삼삼드래였다! 이에 맞서는 지우는 “광석포켓몬” 암트르로 승부에 도전한다! 파워가 강한 삼삼드래에게 정확하게 기술을 맞추기 힘든 암트르! 과연...!? 그리고, 철이가 마지막 카드로써 내보낸 좋은 파트너 “파문포켓몬” 리오르다! 이에 맞서는 켄호로우는 스피드로 승부하지만, 리오르는 켄호로우에 올라타서 기술을 사용한다! 리오르의 공격을 피할 수 없는 켄호로우는 큰 데미지를 입고 대 위기를 맞는다...! 언뜻 보기에는 엉망진창으로 보이는 철이의 지시지만, 리오르와의 콤비네이션은 효과가 굉장했다! 그런데 갑자기 리오르의 모습이...!?

격전이 계속되는 하나리그 4차전! 지우와 철이의 시합은 혼전으로 치닫고 있었다! 그런데 철이의 파트너인 리오르가 “파동포켓몬” 루카리오로 진화했다! 루카리오의 기술은 월등히 파워업되고 게다가 신기술을 배워, 지우와 주리비얀을 곤란하게 하는데...!? 게다가 이미 2번의 시합으로 체력을 소모한 피카츄와 루카리오의 시합!! 여기에서 피카츄는 장기전을 피하기 위해 스피드 승부로 루카리오에게 도전한다! 루카리오가 우세한 시합이지만, 지우의 아이디어로 한 번에 역전을 노리는데!! 서로의 공격으로 인해 쓰러진 2마리의 포켓몬. 하나리그에서 우승하겠다는 의지의 대격돌! 과연 승리의 여신은 어느 쪽에 미소를 지을까!?

하나리그를 마친 지우와 친구들은 마름꽃마을에 주박사가 있는 곳으로 향하고 있었다. 그러던 중에 신입 트레이너 노미를 만난다. 뭐든지 신중한 성격인 노미는 돌다리조차 건너지 못하고 길 한가운데서 안절부절못하고 있었다. 지우와 친구들은 노미를 격려해 주고, 다시 주박사의 연구소로 향했다. 주박사와 오박사에게 하나리그에 관해 보고를 한 지우는 관동지방으로 돌아가기로 결정한다. 그런데 노미가 연구소에 온 것이었다! 노미는 한참을 고민한 끝에 첫 파트너 포켓몬을 “불돼지포켓몬” 뚜꾸리로 정하고 지우와 팀을 이뤄 덴트, 아이리스와 태그배틀을 하기로 한다! 시합을 즐기기 시작하게 된 노미. 그런데 갑자기 지우와 친구들 앞으로 기계가 튀어나오는데! 그리고 왠지 어디서 본 적 있는 3인조가! 이들은 도대체 누구일까..!?

마름꽃마을에서 배를 타고 여행을 시작한 지우와 친구들은 전설이라 불리는 포켓몬 레시라무에 얽힌 장소인 「백의 유적」으로 향했다. 부채시티로 향하던 중, 포켓몬의 마음의 목소리가 들린다는 신비한 청년 N과 만난다. 포켓몬을 ‘친구’라고 부르며, 포켓몬과 인간의 관계성은 어떻게 해야 할 것인가. 라고 흥분하며 말하는 N에게 지우와 친구들은 생각지도 못하게 멍 해져버린다. 게다가 N은 포켓몬에게 시합을 시키는 것은 싫다고 단호하게 말하는데... 그러던 중, 갑자기 로켓단이 습격해왔다! 뽀록나의 저리가루를 뒤집어 쓰게 된 피카츄가 위험한 상태에 빠지고...! 재빨리 N이 “돌보기포켓몬” 맘복치를 불러내는데... 그러자...!?

새로운 체육관이 세워진 부채시티에 도착한 지우와 친구들은 체육관 관장 체렌이 있는 곳으로 향했다. 웬일인지 그 곳에는 학교가 있는데... 이 학교는 포켓몬 체육관을 겸한 트레이너스쿨이었다. 그곳에서 선생님을 하고 있는 체렌은 체육관 관장 자격을 딴 지 얼마 되지 않은 상태로 체육관도 준비 중이라고 한다. 한편, 지우와 친구들의 곁을 떠나 방송실 기재에서 놀던 터검니가 학교 안에 큰 소리를 낸 것이 원인이 되어, 포켓몬하우스에 있던 포켓몬들이 놀라 도망쳐 나오고 말았다! 지우와 친구들이 구역을 나누어 찾던 중, 덴트와 야나프 콤비가 꼬지보리의 장난에 휘말려 말도 안 되는 일이 벌어지는데...!? 그리고 지우의 수댕이와 체렌의 “충견포켓몬” 하데리어가 시합을 하게 되는데! 과연 이 승부는 도대체 어떻게 될 것인가!?

플라스마단의 과학자인 아크로마가 포켓몬을 사용한 실험을 하고 있다. “전기거미포켓몬” 전툴라에게 수수께끼의 광선을 쏘아 잠재능력을 끌어내려 하고 있다. 괴로워하는 전툴라... 툰베어나 비조도도 실험 대상으로써 캡슐에 가둬져 있다... 도대체 목적이 무엇일까...!? 산가지마을에 온 지우와 친구들. 갑자기 눈빛이 이상한 “버섯포켓몬” 뽀록나들에게 공격을 당하고 말았다! 아무래도 최근에 들어 산에 사는 포켓몬들이 빈번히 난동을 부린다고 한다. 게다가, 마을 천문대에 수상한 사람들이 있다는 것을 듣고 재빨리 그곳으로 향하는데... 그러나, 가는 도중에 갑자기 피카츄・터검니, 그리고 야생 포켓몬들이 한꺼번에 지우와 친구들을 공격하기 시작한다. 놀란 지우와 친구들을 구한 사람은 등산가였는데 이 등산가의 정체는...!?

산가지목장에 온 지우와 친구들은 소녀 엘리와 “라이트포켓몬” 전룡, “솜털포켓몬” 메리프들과 만난다. 보통 전룡은 메리프 무리를 돌봐주는 일을 하고 있지만, 좀처럼 전룡의 말을 듣지 않는다고 하는데... 「번개펀치」를 배우면 메리프들도 전룡을 인정해줄 거라고 엘리는 전룡의 「번개펀치」 연습에 힘쓰고 있었다. 아이리스는 망나뇽을 전룡의 코치로 임명하고 바로 함께 연습을 시작한다. 그런데, 생각해 보니 메리프 1마리가 사라진 것이었다...! 게다가 또 1마리의 메리프가 사라져 있는 것이었다! 목장주인인 엘리의 할아버지는 「메리프를 잘 돌볼 수 있는 포켓몬을 찾아보자구나」 라고 말하지만, 엘리는 전룡에게 기회를 달라고 하는데... 그리고 수상한 그림자에 3인조가...!?

세계정복을 꾀하는 플라스마단의 작전은 수면 아래에서 점점 진행되고 있었다... 실험의 유기소체로 사용하기 위해 포획한 “용맹포켓몬” 워글을 옮기는 플라스마단 단원들. 하지만, 그곳에 약해진 워글을 꺼내기 위해 트럭에 뛰어든 N의 모습이 보이고...! 플라스마 단원은 “고양이족제비포켓몬” 쟝고와 “송곳뱀포켓몬” 세비퍼로 N에게 공격을 한다! 상처를 입게 된 N은 벼랑 아래로 떨어지고 마는데!! 도대체 N의 목적은...!? 지우와 친구들은 워글을 데리고 간 N과 포켓몬센터에서 재회를 하게 된다. 하지만, 워글에게는 작은 발신기가 붙어 있었고 포켓몬센터는 플라스마단에 의해 정전이 되고 만다!! 그리고 N은 지우와 친구들에게 어떤 제안을 하는데...!?

모란만시티에 도착한 지우와 친구들. 멀리서 연기가 피어오르는 것을 보고 그곳으로 가 보니, 포켓몬 연안구조대의 “수행포켓몬” 쌍검자비, “부유포켓몬” 탱그릴, “경계포켓몬” 보르그, 구조대 대장 전인이 비상사태를 대비하여 훈련을 하고 있었다. 그러던 중, 보르그는 자신도 조금이나마 더 도움이 되고 싶어 감시 이외의 일을 원했는데... 바로 그 때! 모란만콤비나트에서 사고가 발생했다! 연안구조대, 그리고 지우와 친구들이 서둘러 구조하러 갔지만, 전인과 구조대 대원들이 지하실에 갇히고 말았다! ‘포켓몬을 위험한 구조활동에 사용하는 건 좋아하지 않아.’ 라고 말한 N이었지만, 시설 밖에서 감시 일을 하고 있던 보르그에게 「네 힘 좀 빌려주지 않을래?」 라며 협력을 요청하는데...!

관동지방을 소개하는 「관동페어」에 온 지우와 친구들. 특설 스테이지에서는 “도롱뇽포켓몬” 파이리가 기운 넘치게 인사를 하고 있었다. 지우는 자신의 “화염포켓몬” 리자몽을 떠올리는데... 한때 함께 여행을 하며 최강의 파트너로써 큰 활약을 했던 리자몽... 오랜만에 리자몽이 보고 싶어진 지우는 오박사에게 리자몽을 보내달라고 부탁한다. 그리고, 벌써부터 리자몽을 예사롭지 않은 시선으로 바라본 1마리의 포켓몬이 있었는데! 리자몽이 만만치 않은 포켓몬이라 느끼고, 격한 시선을 보내는 아이리스의 망나뇽...! 그 시선에 리자몽도 지지 않고 망나뇽을 째려본다!! 갑자기 시합을 시작하는 것일까!? 과연 이 2마리의 포켓몬은 어떻게 될까!?

어떤 마을을 방문한 지우와 친구들, 그리고 N. 그 마을에는 플라스마단이 과학자 아크로마를 내세워 수상한 기계를 사용해 포켓몬을 조종하는 실험을 하고 있었다. 기계의 광선을 맞은 1마리의 “도끼턱포켓몬” 액스라이즈가 날뛰기 시작하여 마을이 한 순간에 망가지는 큰 소동으로 번진다! 아이리스는 ‘드래곤타입 중에 나쁜 애는 없거든요’ 라고 말하며 무리하게 마을로 잠입하는데... 아이리스의 망나뇽이 액스라이즈를 막으려고 해보지만, 망나뇽까지도 갑자기 날뛰기 시작한다! 게다가, N은 항상 들렸던 「친구」의 목소리가 들리지 않는다고 하는데... 이 이상 난동을 부린다면 2마리 포켓몬의 몸이 망가지고 말 것이라고 걱정한 N은 망나뇽과 액스라이즈의 앞을 막아 선다. 하지만, 2마리의 난동은 더 격해지기만 하고! 과연 이들은 어떻게 될까!?

안개가 걷히고 그곳에는 헬레나와 버베나라는 2명의 여성과 “포용포켓몬” 가디안, “천체포켓몬” 고디모아젤이 나타났다. 헬레나와 버베나가 N을 샘물에 눕히자 그의 몸에 빛이 나며 상처가 치유되었다! 하지만, 그녀들은 지우와 친구들을 경계하는데... 이 장소는 N과 동료들의 은신처로 인간에게 상처받은 포켓몬들을 치유해주는 곳이라고 한다. 그리고 N의 성장 과정을 알게 된 지우와 친구들. N, 플라스마단, 그리고 게치스와의 관계가 서서히 밝혀지는데... 그러자 갑자기 플라스마 단원들이 은신처에 들이닥쳤다! 헬레나와 동료들은 지우와 친구들을 침입자의 한패라고 의심하는데! 몰드류와 피카츄가 몸을 내던져 N과 동료들을 지키지만, 과연 어떻게 될까!?

플라스마단 아지트에서 서로 불쾌한 웃음을 띄며 대치하는 과학자 아크로마와 로켓단의 나옹... 나옹은 아크로마에게 연구자로서 가지고 있는 힘을 로켓단에게 써 보지 않겠냐고 교묘하게 권유하고... 아크로마도 나옹을 유기소체로 삼아 나옹의 잠재능력을 끌어올리고 싶다고 말한다. 로사와 로이는 아크로마와 나옹을 뒤에서 지켜보고 있었는데... 그리고 나옹은 아크로마 실험대에 올라 기계 전파를 맞게 된다. 그러나, 나옹은 컨트롤 당하지 않으려고 훈련을 받았기에 꿈쩍도 하지 않는다. 하지만, 전파가 점점 강해져 갑자기 나옹의 눈빛이 바뀌고...!! 나옹은 하늘을 가르며 마구할퀴기를 사용한다! 아크로마가 나옹에게 공격을 지시한 상대는...!?

지우와 친구들은 백의 유적 근처인 용나선탑 앞까지 도착했다. 그곳에 주박사 아버지의 조수가 지우와 친구들을 마중 나왔다. 박사는 마침내 전설이라 불리는 포켓몬 레시라무가 모습을 바꿨다고 전해지는 「라이트스톤」이 있는 곳을 밝혀냈다고 한다. 백의 유적에 도착한 지우와 친구들은 주박사 아버지와 함께 서둘러 유적의 내부로 향한다... 그리고 박사가 그 봉인을 푼 순간, 라이트스톤은 격한 빛에 둘러싸인다! 그리고 N이 지우와 친구들의 앞에 나타났다. 박사에게 ‘라이트스톤을 어떻게 할 생각이시죠?’ 라고 묻는 N. 박사의 대답을 듣게 된 N은 ‘그럼 드릴 말씀이 없습니다.’ 라며 라이트스톤을 빼앗아 가 버린다! 그곳에 플라스마단의 모습이 나타나는데...! 과연 어떻게 될 것인가!?

포켓몬에 대한 생각이 서로 부딪치는 N과 지우. 그러던 중, N은 백의 유적 밖에서 들렸던 포켓몬의 마음의 소리가 들리지 않게 됐다며 안절부절못한다. 조금이라도 빨리 지상으로 가야 한다! 는 생각으로 지우와 포켓몬들은 힘을 모아 출구를 찾기 위해 파묻힌 흙과 모래를 계속 파낸다. 한편, 지상에서는 아이리스의 망나뇽, 덴트의 암펠리스가 플라스마단의 공격에 맹렬히 맞선다. 하지만, 아크로마의 포켓몬 컨트롤머신이 그들의 공격을 저지한다! 결국 박사, 아이리스, 덴트는 플라스마단에게 붙잡히고 만다. 로켓단은 그 모습을 숨을 죽이며 지켜보는데... 겨우 탈출한 N, 그리고 지우와 포켓몬들. 하지만, 피카츄가 포켓몬 컨트롤머신에 의해 조종당하고 만다! 그리고 마침내 플라스마단의 총지휘관인 게치스가 레시라무 부활의 의식을 시작하는데...!

N을 걱정하여 헬레나와 동료들이 N을 찾아왔다! 고디모아젤과 가디안은 플라스마단의 움직임을 봉쇄하려고 하지만 포켓몬 컨트롤머신의 전파가 두 포켓몬에게 향하는데...!? 그리고 결국 전설이라고 불리는 포켓몬 레시라무는 부활하고 말았다! 분노에 가득 찬 표정의 레시라무. 게치스는 서둘러 아크로마에게 레시라무를 컨트롤 할 수 있게 지시를 내리고, N의 필사적인 외침에도 불구하고 조종당한 레시라무는 마구 크로스플레임을 사용한다! 터검니는 친구들을 구하기 위해 그들의 몸에 묶인 장치를 부순다! 이런 혼란스러운 상황에 다시 피카츄는 아크로마에게 조종당하고 마는데... 그런데 갑자기 피카츄 앞을 막아 서는 로켓단의 나옹! 국제경찰 핸섬과 로켓단의 작전은 과연 무엇일까!? 그리고 포켓몬과 인간의 마음이 하나로 될 때 일어나는 기적은 과연 어떤 것일까!?

플라스마단과의 사투를 끝낸 지우와 친구들은 주박사의 연구소에서 휴식을 갖고, 관동지방의 태초마을로 가기로 한다. 그곳에서 아이리스는 드래곤마스터가 되기 위해, 덴트는 포켓몬소믈리에로서 견문을 넓히기 위해 지우와 함께 관동지방으로 가기로 결정한다! 주박사의 제안으로 여객선을 타고 데코로라제도를 가로질러 관동지방에 가기로 한 지우와 친구들. 기대와는 달리 약간 낡은 배였지만, 포켓몬들의 놀이시설도 마련되어 있어 피카츄와 포켓몬들은 즐거워 보였다. 하지만, 갑자기 방의 문이 열리지 않게 되어 포켓몬들은 깜짝 놀라는데! 그런데 지우와 친구들의 방문도 열리지 않는다고!? 그 와중에 조종실에서는 씨익 웃고 있는 3인조의 모습이...! 파란만장한 모험의 시작인 것인가!?

데코로라제도를 여행 중인 지우와 친구들은 꿀버리섬에 도착했다. “꼬마벌포켓몬” 세꿀버리가 모은 달콤한 꿀 「허니꿀」로 만든 먹거리가 유명한 곳이었다. 지우는 선착장에서 상륙기념 제비뽑기를 하고 특별상인 「허니꿀로 만든 151종류의 과자 맘껏 먹기」에 당첨된다! 관광추진국의 가이드 3명과 함께 서둘러 허니꿀 과자공장으로 향하는데... 이 사람들은 로켓단이었던 것이다! 한편, 또르박쥐들의 공격에 대항하는 피카츄! 그러나! 100만볼트가 엉뚱한 방향으로 향한다! 그러자 대량의 “번데기포켓몬” 딱충이가 “독벌포켓몬” 독침붕으로 진화해서 양손에 독침이 반짝거리고 있었다! 겨우 독침붕을 피한 피카츄는 터검니, 수댕이와 함께 미아가 되어 버리고... 그곳에 나옹이 나타나는데...!?

배에서 펼쳐지는 배틀대회 「마린컵 토너먼트」에 출전한 지우와 친구들. 대회가 끝난 후에 유명한 보석콜렉터인 리플의 수집품들을 보게 된다. 덴트는 리플이 데리고 있는 쌔비냥에 공포에 느낀다! 그런데 쌔비냥은 리플의 소중한 보석 「레파르다스의 눈동자」를 질투하고 있다고 한다. 한편, 자신의 보석은 절대 다른 사람에게는 보여주지 않기로 유명한 보석콜렉터 숄은 리플에게 보석을 양보하지 않겠냐고 끈질기게 부탁하지만 재차 거절당하는데... 그리고 「레파르다스의 눈동자」가 사라지고 말았다!! 보르그가 감시하고 있었는데 도대체 누가 어떻게 가져간 걸까...!? 도와줘! 소믈리에탐정 덴트!!

「가리비칼 킹 결정전」이 열리는 가리비칼킹섬에 도착한 지우와 친구들은 축제가 열리고 있는 회장으로 가고 있었다. 그곳에는 많은 수댕이들과 쌍검자비가 있었다. 가리비칼 킹의 영예에 빛나는 포켓몬은 황금 가리비칼 선물과 여자부문에서 우승한 수댕희와 파트너가 될 수 있다고 한다! 지우의 수댕이는 수댕희에게 한눈에 반하고! 전력을 다해 우승을 노리는 수댕이! 가리비칼 모양과 곡선의 아름다움과 기왓장깨기로 가리비칼의 강도를 경쟁한다...! 하지만, 라이벌 쌍검자비인 「시저」도 지지 않는데! 게다가, 쌍검자옹이라는 강력한 가리비칼을 가진 쌍검자비도 등장!! 어라? 왠지 이 쌍검자비... 누구와 닮았는데...!? 가리비칼킹의 자리를 걸고 남자들이 벌이는 진검승부! 과연 어떻게 될까!?

깊은 안개가 낀 해안지역에 있는 빼어난 본섬으로 향하던 지우와 친구들은 안개 속에서 무언가 거대한 그림자가 가까이 다가오는 말도 안 되는 광경에 놀란다. 그리고, 수십 년 전에 거대 포켓몬이 빼어난 본섬에 있었다고 하는 소문을 단서로 잡아 서둘러 소문의 근원지로 향한다. 숲을 걷다가, 갑자기 누군가의 낌새에 눈치를 챈 피카츄! 그곳에는 큰 “개미핥기포켓몬” 앤티골이 있었다!! 그런데 왜인지 피카츄의 공격이 통하지 않는데! 게다가 앤티골의 공격으로 숲이 불꽃에 휩싸여, 숲의 포켓몬들이 도망쳐 나오는 순간, “버섯포켓몬” 깜놀버슬의 버섯포자 공격이 터검니에게 명중하고 만다! 큰 위기 중에 낡은 포켓몬센터를 발견해 터검니의 치료를 부탁하지만 그곳은 불법의 포켓몬센터였는데...!?

지우와 친구들은 포켓몬 연구에 제1인자인 오박사와 합류하기 위해, “플라스마포켓몬” 로토무가 많이 서식하고 있는 곳으로 유명한 로토무섬으로 향했다. 박사님은 로토무의 폼체인지에 관한 논문을 쓰기 위해 이 섬에 방문한 것이었다. 서둘러 큰 광장으로 가보니, 전선을 타고 3마리의 로토무가 나타났다. 전기를 사용하여 그들을 끌어들이려고 하자 피카츄의 전기를 맛있게 먹고 있는 것이었다. 전기에도 좋고 싫음이 있는 것일까? 라고 생각한 덴트도 메더에게 전기쇼크를 지시하는데! 그 맛은 어떨까...!? 거기에, 아이리스도 에몽가와 함께 로토무를 잡는 것을 도와주려고 하는데! 그러자 로토무들은 폼체인지를 하여 모습을 바꾼다! 알려지지 않은 로토무의 비밀이 드디어 밝혀진다...!? 연구의 성과는 어떻게 될 것인가...!?

데코로라크루즈의 식량창고에서 고급 식료품을 훔치려고 하는 로켓단. 거기에 “큰턱포켓몬” 엘리게이와 “분사포켓몬” 대포무노, “물토끼포켓몬” 마릴리가 와서 식료품을 훔쳐가 버렸다! 배 위를 빠르게 내달리는 포켓몬들! 경보음을 들은 지우와 친구들도 포켓몬들을 멈추게 하려고 했지만, 순식간에 바다에서 대기하고 있던 동료 “물새포켓몬” 꼬지보리의 뗏목으로 도망쳐버린다. 말도 안 되는 나쁜 짓을 저지른 포켓몬 해적단에게 여경도 곤란해 했다. 그들의 아지트를 알아내기 위해 추적하는 리자몽! 주리비얀과 차오꿀은 해적 행동을 그만두라고 설득하는데 과연 주리비얀과 차오꿀의 마음은 전해질 것인가!? 그리고 나옹은 포켓몬 해적단들의 식량에 맺힌 원한을 밝히려고 하는데...!?

도해섬에 도착한 지우와 친구들은 “번데기포켓몬” 단데기의 무리가 “나비포켓몬” 버터플로 진화하는 순간을 목격한다. 이 섬은 스완나 등 바다를 건너는 포켓몬들이 반드시 거치는 기항지라고 한다. 감동하는 지우와 친구들의 눈앞에 한 마리의 “애벌레포켓몬” 캐터피가 나타난다. 이 캐터피는 무리들의 진화에서 쫓아가지 못한 것 같았다. 지우는 예전에 함께 여행했던 자신의 캐터피가 생각나서 진화를 도와 주기로 한다. 그리고 바로 특훈을 시작하지만 바로 잠들어 버리는 캐터피에 지우와 친구들은 쩔쩔 맨다. 그런 중에 “동면포켓몬” 링곰의 구역을 침범하고 마는 위기에 빠지고...! 그런데 캐터피는 작은 몸으로 큰 링곰에 맞서 싸우려고 하는데...!! 과연 어떻게 될까!?

데코로라제도 중에서 가장 큰 커다란섬에 도착한 지우와 친구들은 섬을 횡단하는 외길을 걸어 건너편 강으로 향하고 있는 도중이었다. 그런데 아주 희귀한 “땅뱀포켓몬” 노고치와 우연히 만나 지우는 흥분하고 곧바로 배틀을 신청한다. 놀란 노고치는 싫은소리 공격을 하고 그 순간 지우는 자신의 발에 걸려 넘어지면서 아이리스의 머리에 있는 꽃장식을 밟아 망가뜨리고 만다. 피카츄가 노고치에게 기술을 쓰려고 하는 순간, 귀를 막고 있던 터검니와 부딪치고 만다. 어이없이 노고치를 놓치고 만 것이었다. 노고치를 놓친 것을 터검니의 탓으로 돌리는 지우에게 아이리스는 화를 낸다. 게다가 화해를 하려는 지우의 행동에 더욱 화가 난 아이리스는 ‘절교야!’ 라고 말하고 먼저 가 버린다. 이 모습을 조용히 지켜보고 있는 덴트였는데...!?

커다란섬에서 여행을 계속하는 지우와 친구들은 어느 저녁, 1000년에 7일 동안만 깨어난다고 하는 “희망사항포켓몬” 지라치와 만난다. 피카츄와 포켓몬들이 지라치와 함께 놀고 있는 곳에 지우도 뛰어들어 인간을 보고 지라치가 그 장소에서 사라지고 마는데... 아쉬워하는 지우와 친구들에게 홀리라는 소녀가 다가온다. 홀리는 지라치에게 어떻게든 이뤄달라고 부탁하고 싶은 소원이 있다고 한다. 그 소원은 이 토지에 부족한 물을 되찾는 것이다. 함께 지라치를 찾기로 하지만 좀처럼 찾을 수가 없고... 결국, 필사적인 홀리의 마음이 지라치에게 전해져 지라치가 수로에 모습을 드러낸다! 하지만, 그곳에 로켓단이 나타나고! 지라치는 로켓단과의 싸움에서 체력을 소모해버리는데...!?

포켓몬센터에서 커다란섬의 마지막 밤을 보낸 지우와 친구들. 날이 밝자, 덴트와 아이리스, 터검니까지도 얼굴이 “브레인포켓몬” 벰크로 변해버렸다! 게다가 피카츄까지 벰크의 얼굴로 변해버렸는데! 깜짝 놀란 지우는 간호순과 다부니에게 도움을 요청하러 달려가지만, 간호순과 다부니도 벰크의 얼굴을 하고 있었다! 바깥에서 만난 여경은 물론 마을 사람들까지도 모두 벰크의 얼굴이었다! 지우가 사람들의 눈을 피해 두려워하면서 뒷골목을 걷던 중, 바로 밑에서 누군가 지우의 이름을 부르는 목소리가 들리는데... 그곳에는 로켓단 로사와 로이가 맨홀 뚜껑에 숨어 있던 것이었다. 그 2명은 동료 나옹이를 찾고 있다고 했다. 그리고 밝혀지는 벰크의 무서운 계획은 과연 무엇일까!?

지우와 친구들은 열매섬에 도착하여 길을 걷던 중, 포켓몬 르포 기자인 팬지라고 하는 여성과 만난다. 팬지는 “라이드포켓몬” 고고트, “발전포켓몬” 목도리키텔과 함께 칼로스지방에서 취재를 위해 열매섬으로 왔다고 한다. 열매섬에는 오래된 전설이 있어서 과거의 있었던 큰 싸움이 두 번 다시 일어나지 않도록 하기 위해, 그리고 나무열매 수확을 감사하기 위해 축제를 연다고 한다. 취재를 하려고 발걸음을 옮기는 팬지를 따라 지우와 친구들도 축제 현장으로 가보기로 했다. 메인 이벤트인 포켓몬 씨름의 우승 상품은 「기합의머리띠」와 열매섬의 특산품인 나무열매였다. 지우는 차오꿀, 덴트는 야나프, 아이리스는 망나뇽과 함께 포켓몬 씨름 대회에 참가하기로 하는데! 과연 결과는 어떻게 될까!?

지우와 친구들은 야자나무섬에 도착하여 팬지에게 “포켓몬에 얽힌 전설의 보물”이 근처 무인도에 숨겨져 있다는 이야기를 듣는다. 포켓몬 르포 기자인 팬지가 이전에 해적박물관으로 취재를 갔을 때 발견했던 「숨겨진 보물 암호」에 의지해 지우와 친구들은 무인도에서 수수께끼를 풀면서 보물찾기를 시작한다. 한편, 보물이야기를 엿들은 로켓단도 보물을 노리고 무인도로 향한다. 보물을 찾아가는 지우와 친구들에게 포켓몬들은 잇달아 공격을 해 온다.

지우와 친구들은 동굴에 살고 있는 포켓몬들을 만나기 위해 동굴섬에 내렸다. 그곳에서 우연히 이향과 재회하게 된다. 이향은 이 섬에 「색깔이 다른 크리만」을 잡으러 왔는데 도중에 망나뇽을 잃어버렸다고 한다. 그곳에서 지우와 친구들은 이향과 함께 망나뇽을 찾기로 하는데... 무사히 이향의 망나뇽을 발견했지만, 이향의 망나뇽이 아이리스의 망나뇽과 싸움을 하는 소동이 벌어지고! 그 후, 지우와 친구들은 색깔이 다른 크리만을 찾는 이향과 함께 숲 속의 동굴로 향하는데...!?

지우와 친구들은 데코로라제도의 어느 섬에 도착하여 수십 년에 한 번 볼 수 있다고 전해지는 아름다운 별똥별 “우디트 혜성”을 관측하기 위해 팬지와 함께 산꼭대기에 향하기로 한다. 이 혜성이 나타날 때, 포켓몬들이 산에 모여 신기한 행동을 한다고 한다. 지우와 친구들은 정상에 도착하여 이 섬의 용사라는 칭호를 받은 우디트가 배틀을 펼쳤던 배틀필드의 유적을 발견한다. 어둠컴컴한 곳에 들어서니 피카츄를 노리는 로켓단이 어둠을 틈타 지우와 친구들에게 다가오는데...!?

지우와 친구들은 포켓몬 르포 기자인 팬지와 함께 어느 섬의 포켓몬센터를 방문했다. 취재 기사를 정리하는 팬지를 대신하여 지우와 친구들은 고고트를 봐주기로 한다. 지우는 칼로스지방 포켓몬인 고고트에게 흥미를 보인다. 그러던 중, 이 섬에 살고 있는 토니가 고고트에게 다가왔다. 고고트는 토니에게 장난을 치다가 우연히 고고트 뿔에 토니의 손이 닿는다. 고고트는 뿔이 닿은 사람의 생각을 알 수 있어, 토니의 생각을 읽고 그를 등에 태워 어딘가로 가 버린다. 지우와 친구들은 사라진 고고트를 찾던 중, 아무래도 고고트가 토니 아버지의 근무지인 천문대로 갔을 것이라는 정보를 입수하는데...

지우와 친구들은 저녁에 출항하는 배를 기다리기 위해 초원에서 느긋하게 피크닉을 즐기고 있었다. 그러던 중, 아이리스의 오해로 에몽가가 단단히 화가 난다. 에몽가는 토라져 활공을 하다 균형을 못잡아 낙하한 곳에는 로켓단이 있었다. 에몽가는 로사와 로이의 포켓몬들과 배틀을 펼치지만, 에몽가는 「헤롱헤롱」 기술 등을 사용하여 한 번에 이긴다. 에몽가의 압승에 로켓단은 에몽가를 로켓단에 들어오라고 권유한다. 로켓단의 권유가 싫지 않은 에몽가는 로켓단과 함께 움직이는데...!?

지우와 친구들은 용안섬에서 덴트의 형제인 팟과 콘을 만나기로 했는데 그들 앞에 눈설왕이 나타난다! 야나프는 덴트와 주웠던 나무열매를 나눠주려고 눈설왕에게 다가갔지만 갑자기 눈설왕에게 공격을 당하고 만다. 마침 그 때, 팟과 콘이 합류하여 이 눈설왕의 트레이너인 드라고가 단지 재미로 자신들이 체육관 관장을 맡고 있는 성신체육관의 간판을 가져가려고 한다는 말을 듣는다. 팟과 콘은 이미 드라고와의 시합에서 지고 말았고, 드라고는 남은 체육관 관장인 덴트를 쓰러트리기 위해 시합을 하러 왔다고 하는데... 성신체육관을 지키기 위해 덴트는 드라고와의 시합을 받아들인다.

지우와 친구들을 태운 배는 관동지방의 항구마을인 갈색시티로 향한다. 배를 타고 떠났던 데코로라제도 여행도 드디어 마지막을 향하고 있었다. 로켓단은 지우와 친구들이 관동지방에 도착하기 전에 어떡해서든 피카츄와 포켓몬들을 빼앗으려 음모를 꾸미고 거대한 풍선으로 바다를 가로지르는 여객선을 공중에 띄워 배 안을 큰 혼란에 휩싸인다. 로켓단은 여느 때처럼 지우와 친구들의 포켓몬을 빼앗으려 하는데 파커까지도 지우와 친구들을 방해한다. 그런데 그곳에는 2명의 파커가 있었는데...!?

관동지방의 갈색시티에 도착함으로써 데코로라제도를 도는 여행은 드디어 끝이 났다. 이것은 아이리스와 덴트와의 이별이기도 했다. 3명은 각자의 꿈을 향해 여행을 떠났다. 지우는 팬지와 함께 태초마을로 돌아왔다. 지우는 제일 먼저 오박사 연구실에 있는 포켓몬들을 만나러 가려고 했지만, 팬지의 충고로 먼저 엄마를 만나러 집으로 향한다. 집에 돌아와서도 안절부절 못하는 지우는 결국 곧장 오박사 연구실로 향한다. 오랜만에 하나지방 포켓몬들과 만난 지우는 하나지방 모험에 대해 돌아보며 자신의 꿈인 「포켓몬마스터」가 되기로 다시 한 번 다짐한다. 그리고 팬지가 온 「칼로스지방」에 대해 상상하던 중, 로켓단이 다시 피카츄와 연구소의 포켓몬들을 노리고 공격해오는데...!?

포켓몬마스터를 목표로 여행을 하고 있는 지우와 파트너인 피카츄는 칼로스지방에 도착했다. 팬지의 여동생이 체육관 관장을 맡고 있는 체육관에 가고 싶다고 지우는 팬지에게 부탁을 해 보지만, 공교롭게도 부재중이라고 했다. 그래서 지우가 한 행동은...?

지우와 친구들은 플라타느 연구소로 향했다. 연구소에 도착한 지우와 친구들은, 플라타느박사의 이야기를 듣게 된다. 플라타느박사의 이야기를 엿들은 로켓단은, 연구소의 한카리아스를 빼앗으려 한카리아스의 목에 링을 채우고, 링 때문에 이성을 잃어 버린 한카리아스는 폭주해 버린다.

포켓몬센터에서 칼로스리그 도전에 등록한 지우는, 첫 번째 체육관을 향하여 출발한다. 체육관으로 향해 가는 도중에 데덴네라는 포켓몬과 만나게 되고, 데덴네가 나무열매를 원하는 것 같아서 건네 주려 하는 순간, 화살꼬빈 이라는 포켓몬에게 뺏기고 만다.

여행을 하고 있는 지우와 친구들은 여행 중에, 이전에 만났던 데덴네를 다시 만나게 된다. 그런데 데덴네는 포켓몬들이 먹고 있던 포켓몬 푸드를 빼앗아 도망 가 버린다. 지우는 데덴네를 잡으려 쫓아가지만...

백단시티에 도착한 지우와 친구들은, 백단체육관으로 향했다. 백단체육관에서는 이전에 함께 여행했던 목도리키텔과 포켓몬 르포 기자인 팬지가 지우를 기다리고 있었다. 팬지는 백단체육관 관장 비올라의 언니였던 것이다. 드디어 지우는 백단체육관 시합에 도전하게 되지만, 비올라의 포켓몬에게 고전을 면치 못하는데...

비올라와의 체육관 시합에서 패한 지우는 재도전을 위해 팬지의 도움을 받아 비올라와의 시합을 위해 특훈을 받게 되고, 지우는 다시 체육관 시합에 도전하게 된다. 고전을 면치 못했던 비비용과의 시합에 다시 도전하는 지우와 피카츄의 전략은?

칼로스지방의 친숙한 스포츠인 뿔카노레이스의 경기장이 있는 스미르마을에 도착한 지우와 친구들은, 여경으로부터 뿔카노레이스에 참가할 수 있는 것을 전해 듣고, 지우도 뿔카노레이스에 참가할 것을 결심하게 된다. 뿔카노레이서인 엄마에게 뿔카노레이스를 배운 세레나는, 지우의 코치를 하게 된다. 뿔카노를 타는 방법을 터득한 지우는 드디어 뿔카노레이스에 도전하지만, 도중에 로켓단이 설치한 함정 때문에 레이스가 엉망이 되어 버린다.

어떤 마을을 지나가던 지우와 친구들은, 세레나의 가이드북에서근처에 카리스마 트리머가 있다는 사실을 알게 된다. 세레나가 카리스마 트리머를 꼭 만나보겠다며 기대에 부풀어 있을 때 우연히 카리스마 트리머의 제자인 제시카와 만나게 되고, 제시카의 트리미앙이 제시카를 인정해주지 않아, 트리밍을 받아주지 않는다는 고민을 듣게 된다. 그러는 가운데, 그곳에 또 한 사람 카리스마 트리머라는 로사리가 나타나, 푸호꼬에게 트리밍을 해주겠다고 하고, 세레나는 푸호꼬를 맡기게 되지만, 로사리 일당의 진짜 정체는...!?

미르시티로 돌아온 지우와 친구들은, 시트론과 유리카의 아버지인 리모네를 만나게 된다, 그곳에서 지우는 시트론이 미르체육관의 체육관 관장이라는 사실을 알게 되고, 동시에 시트론이 발명한 시트로이드에게 미르체육관을 빼앗겼다는 사실을 알게 된다. 지우와 친구들은 시트로이드로부터 체육관을 되찾기 위해 미르체육관에 잠입하여 시트로이드와의 포켓몬 시합에 도전한다.

삼채시티로 향하던 지우와 친구들은, 플라타느 연구소에 들르게 된다. 한편, 플라타느박사와 메가진화에 관한 데이터를 노리고 있던 로켓단은, 플라타느박사를 납치하고, 플라타느박사를 구하려고 했던 유리카와 세레나도 함께 끌려가게 된다. 기지를 발휘한 세레나는 끌려가는 도중에 마카롱을 떨어뜨리고 그 마카롱을 발견한 먹보 도치마론과 지우와 친구들은 마카롱을 따라 로켓단이 있는 곳으로 가게 된다.

여행을 하고 있는 지우와 친구들이 점심식사를 하려고 하는 도중, 그 모습을 보고 있던 두 마리의 판짱이라는 포켓몬이 나타나 지우와 친구들의 식사를 전부 먹어 치운다. 그러는 사이에, 로켓단이 나타나 지우와 친구들의 포켓몬을 한꺼번에 잡아 도망가 버리게 된다. 이번이야말로 훌륭하게 작전에 성공한 로켓단이었지만, 사소한 싸움을 하는 바람에 기구가 폭발하고, 피카츄와 포켓몬들은 모두 뿔뿔이 흩어지게 된다. 어떻게든 피카츄와 포켓몬들은 한곳에 모이게 되지만, 나옹은 기구에서 떨어지면서 부란다라는 포켓몬에게 충돌하여 부란다를 화나게 만드는데...

여행을 하고 있는 지우와 친구들은 여행도중, 포켓몬 바이어인 데이즈가 여경으로부터 도망가는 장면을 목격하게 된다. 포켓몬 바이어인 데이즈는, 주로 비비용을 팔아서 돈을 벌어들이는 악랄한 악당이다. 지우와 친구들은 데이즈를 쫓아가는 여경을 도우려고 그 뒤를 따라가게 되고, 그 도중에 데이즈가 떨어트린 포켓몬, 분이벌레를 발견하게 된다.

지우는 여행을 하는 도중에 포켓몬 트레이너인, 프르미에와 포켓몬 시합을 하게 된다. 프르미에는 님피아로, 지우는 개구마르로 승부를 걸게 되는데. 프르미에는 “내가 이기면 사귀는 거다”라며 의미심장한 발언을 하고, 결과적으로 개구마르는 님피아의 헤롱헤롱 공격에 지게 된다. 지우는 약속대로 프르미에와 사귀기로 하고, 프르미에를 따라가게 되는데, 그곳은 프르미에가 일하는 유치원이었다. 프르미에는 다양한 포켓몬을 유치원에 데리고 와서 유치원 아이들에게 포켓몬과 만남의 기회를 마련하고자 하는 것이었다. 피카츄와 포켓몬들을 만난 유치원 아이들은 크게 기뻐했다. 하지만 그중에, 포켓몬에게 가까이 가려고 하지 않는 한 아이가 있는데 그 아이의 이름은 랜디. 랜디가 포켓몬을 무서워하는 이유는...?

여행을 하고 있는 지우와 친구들은 비를 피하려고 한 저택 안으로 들어가게 된다. 그 무렵에, 로켓단도 비를 피하려고 같은 저택 안으로 들어가게 된다. 그 저택은 인기척은 없지만, 갑자기 불이 켜지거나 문이 저절로 닫혀버리는 이상한 현상이 일어나는 곳이었다. 이 기이한 현상에 무서워하면서도 각각 그 저택 안으로 들어가보는 지우와 친구들, 그리고 로켓단. 그런데 거기에는 이상한 그림자가 나타나는데...

먹보인 도치마론은 세레나가 만든 마카롱을 전부 먹어 버린다. 그런 과식으로 인해 도치마론은 배가 퉁퉁해져 버린다. 지우와 친구들은 식후의 운동을 겸하여 포켓몬 시합을 하게 되는데, 배가 무거워진 도치마론은 움직임이 둔해져서, 개구마르에게뿐만 아니라 데덴네에게까지도 지게 된다. 체육관 관장으로서 위기감을 느낀 시트론은 도치마론을 위해 엑서사이즈 기어를 발명하여 도치마론에게 운동을 시키려고 하는데, 어느샌가 도치마론이 사라져 버린다. 도치마론은 도대체 어디로 가버린 걸까...?

포켓몬센터에서 휴식을 취하고 있었던 지우와 친구들. 마침 그 자리에 있던 여자아이와 유리카의 가방이 바뀌고 만다. 두 사람은 가방에 각각 유리카는 데덴네, 여자아이는 피츄를 넣어 두었다. 지우와 친구들은 여자아이가 머리에 빨간색의 큰 리본을 달고 있었다는 정보만 가지고, 데덴네와 피츄의 트레이너를 찾아 보기로 한다. 과연 유리카는 데덴네를 찾을 수 있을까!?

여행 도중, 특훈을 하고 있었던 지우와 개구마르는 그 곳에서 닌자 트레이너 삼평과 개구마르의 진화형인 포켓몬 개굴반장을 만나게 된다. 지우는 삼평과 포켓몬 시합을 하게 되지만 도리어 지고 만다. 하지만 이 시합에서 상대한 개굴반장의 '전광석화'를 개구마르에게 배우게 하고 싶다며, 삼평에게 '기술의 비법'을 배우기로 한다. 이렇게 해서 지우와 개구마르는 삼평, 개굴반장과 함께 혹독한 수행을 시작하게 된다. 개구마르는 '전광석화'를 배울 수 있을까!?

고목내마을에 들른 지우와 친구들은 코를 심하게 골며 자고 있는 잠만보를 발견한다. 이 잠만보를 깨울 방법은 단 한 가지, 침울한 왕이 부는 '포켓몬피리'가 필요한 듯 하다. 하지만 그 피리는 파르팽 궁전의 제멋대로인 성격의 공주에게 빼앗겨 버렸다고 한다. 지우와 친구들은 그 피리를 되찾기 위해, 파르팽 궁전의 공주가 있는 곳으로 향한다. 피리를 돌려 달라고 부탁하자, 공주가 피리를 돌려주기 위해 제시한 놀라운 조건은 과연...?

피카츄 포획 작전을 짜던 로켓단 앞에 나타난 수수께끼의 인물 마담X와 칼라마네로. 갑자기 칼라마네로에게서 뿜어져 나온 빛 때문에 로사와 로이가 세뇌 당해 버린다. 간신히 도망친 나옹은 지우와 친구들에게 도움을 요청한다. 그러던 중 칼라마네로가 다시 나타나고 피카츄 마저 세뇌를 시켜 버린다. 계속해서 세뇌되어 가는 친구들. 과연 지우는 이 위기를 극복할 수 있을까!? 그리고 마담X와 칼라마네로의 목적은 과연 무엇일까!?

지우와 친구들은 포켓몬 시합의 사교장이기도 한 ‘배틀샤토’에서 백단체육관의 체육관 관장인 비올라를 다시 만난다. 그 곳에는 또 한 사람, 지우의 다음 목적지 삼채체육관의 체육관 관장 자크로도 있었다. 배틀샤토에서 함께 승점을 쌓아 온 비올라와 자크로. 이 두 사람이 드디어 격돌한다! 체육관 관장 사이의 시합. 과연 승부의 결말은!?

포켓몬과 트레이너의 매력을 어필하는 동영상을 만들어 사이트에 올릴 수 있는 포켓비전! 포켓몬센터에서 본 영상에서는 칼로스 최고의 아이돌 엘르와 푸호꼬의 모습이 나오고 있었다! 서둘러 세레나도 포켓비전 만들기에 매달리게 되는데...

가라마을에 다다른 지우와 친구들은 여러 지방의 물타입 포켓몬이 모여 있는 가라 수족관에 가기로 한다. 그리고 그 곳에서 수족관 관장 루단과 파트너 포켓몬인 완철포를 만난다. “황금의 잉어킹”을 낚고 싶다는 루단의 꿈을 도와주기 위해 함께 낚시를 하게 된 지우와 친구들. 이윽고 시트론은 황금의 잉어킹을 낚기 위한 멋진 아이템을 발명한다. 과연 지우와 친구들은 황금의 잉어킹을 낚을 수 있을까!?

가라마을에서 특훈을 하고 있던 지우와 친구들은 화석 연구소에 취재를 하러 온 팬지를 다시 만난다. 오랜 옛날에 살았던 포켓몬에 깊은 흥미를 가지고 있었던 지우와 친구들은 팬지를 따라 가보기로 한다. 연구원의 안내를 받아 가게 된 큰 냉동고에는 화석에서 재생된 고대의 포켓몬 아마루스와 아마루르가가 있었다. 지우와 친구들은 아마루스와 함께 눈싸움을 즐기던 도중에 몸이 차가워져서 일단 밖에 나가 체온을 높이기로 한다. 그런데 그 틈을 타 아마루스에게 로켓단이 몰래 다가 가는데...

삼채시티에 도착하여 드디어 삼채체육관에서 자크로와의 체육관 시합에 도전하는 지우. 자크로의 롱스톤에 대항해 지우는 개구마르로 맞선다. 배틀샤토에서 본 롱스톤의 ‘암석봉인’에 맞서기 위한 대책을 마련하기 위해 힘을 쏟아온 지우와 개구마르. 과연 둘의 작전은 자크로에게 통할 것인가!? 그리고 피카츄 대 티고라스의 승부!! 지우는 체육관 배지를 얻을 수 있을까!?

여행 도중, 세레나는 푸호꼬와 피카츄 들에게 손수 포켓몬용 과자 ‘포플레’를 대접했다. 그런데 갑자기 그 곳에 “휩포켓몬” 나루림과 나루림의 트레이너 밀피유가 나타나서는 처음 만나는 세레나에게 손수 만든 포플레를 두고 별로라며 얕보기 시작한다. 당연히 두 사람 사이에서는 뜨거운 불꽃이 튀게 되고 그 결판을 이 마을에서 열리는 ‘포플레콘테스트’에서 짓기로 하는데...

여행을 하는 도중, 세레나가 유리카의 머리에 예쁜 꽃 모양의 장식을 달아 주자, 그 곳에 플라베베라는 포켓몬이 자신의 꽃이라고 착각해 매달려 왔다. 이 플라베베는 무언가 사정이 있어서 자신의 꽃을 잃어버린 듯 했다. 지우와 친구들은 이 플라베베가 가지고 있던 ‘요정의 꽃’을 찾아 보기로 했다. 하지만 꽃이 피는 계절은 점점 끝나가고 있었다. 과연 ‘요정의 꽃’을 무사히 찾을 수 있을까!?

어느 도시를 방문한 지우와 친구들은 이 도시에서 열리는 포켓몬 시합의 엑시비션 매치에 칼로스지방 최강의 포켓몬 트레이너인 챔피언 카르네가 등장한다는 사실을 알게 된다. 그런데 시합장에서 카르네에게 시합을 신청하려 하자, 만날 수 없다는 소리를 듣는다. 그 때, 우연히도 카르네에게 메가진화의 연구협력을 부탁하러 온 플라타느박사의 주선으로 카르네를 만나게 된 지우. 그리고 바라던 대로 지우 VS 카르네의 포켓몬 시합이 실현된다! 과연 승부의 결과는 어떻게 될까!? 그리고 카르네의 가디안은 메가진화 하는 걸까!?

어느 마을에 다다른 지우와 친구들은 갑자기 여경에게 연행되어 버린다. 여경에 따르면, 지우, 세레나, 유리카의 이름을 도용하는 3인조가 피카츄, 데덴네를 데리고 무전취식을 하는 사건이 여러 번 발생하고 있다는데. 그에 관해 전혀 몰랐던 지우와 친구들은 범인을 찾아보기로 한다. 과연 가짜 지우 일행을 잡아낼 수 있을까!?

지우와 친구들은 여행 도중 갑작스레 코르니라는 여자아이와 코르니의 파트너 루카리오에게 포켓몬 시합 신청을 받는다. 도전을 받아들인 지우는 피카츄로 시합에 나가지만, 압도적으로 강력한 루카리오 때문에 매우 고전하고 만다. 게다가 코르니는 다음으로 향할 목적지인 사라체육관의 체육관 관장이었다! 그런 코르니가 몸에 착용하고 있었던 글로브에는 키스톤이 달려 있었다. 그 말은, 이 루카리오는 메가진화를 한다는 이야기가 되는데...?

루카리오의 메가스톤인 '루카리오나이트'를 손에 넣기 위해 옥유마을에 찾아간 코르니와 지우 일행. 산속의 동굴에 메가스톤이 있다는 정보를 입수하고 서둘러 가 봤더니, 먼저 동굴을 찾아온 로켓단이 별안간 누군가에게 격퇴당해 쫓겨나고 마는 모습을 본다! 바로 이 동굴 안에는 번치코가 기다리고 있었던 것이었다! 과연 루카리오는 번치코와의 시합에서 이기고 루카리오나이트를 손에 넣을 수 있을까!?

루카리오나이트를 손에 넣고 보란 듯이 메가진화를 해낸 코르니의 루카리오. 그 힘을 확인하기 위해 서둘러 피카츄와 시합을 해 보기로 한다. 메가진화로 인해 압도적인 파워를 보여주는 메가루카리오였지만, 강력한 파동을 제어하지 못 하고 점점 흉포한 모습을 보이기 시작한다. 피카츄에게 비열한 공격을 해 버릴 만큼 폭주상태에 빠진 메가루카리오를 과연 멈출 수 있을까!?

메가진화를 하면서 강력한 파동을 통제할 수 없다는 과제에 부딪힌 코르니와 루카리오는 메가진화 아저씨로부터 새로운 시련을 부여 받고, 지우와 친구들과 함께 머스토산으로 향한다. 그런데 지름길로 들어간 동굴에는 로켓단이 함정을 설치해 놓았다. 하지만 그것이 원인이 되어 동굴의 음뱃들이 큰 소란을 피웠고 동굴은 큰 혼란에 빠지고 만다! 지우와 친구들은 어떻게든 그 장소에서 도망쳤지만, 결국은 모두 뿔뿔이 흩어져 버리고 마는데...

머스토산에 도착한 지우와 코르니 일행. 그 곳에서 만난 메이플이라는 할머니와 메가진화 시합을 하지만 또 다시 메가루카리오가 폭주하고 만다. 그리고 메가루카리오는 메가입치트에게 압도당해 버리는데... 그런 코르니 일행에게 메이플이 지시한 수행, 그것은 바로 ‘꽃꽂이’였다. 메가진화와는 전혀 상관없어 보이는 이 수행. 과연 코르니 일행은 꽃꽂이로 메가진화를 이뤄낼 수 있을까!?

여행을 하던 도중, 다른 포켓몬들을 괴롭히고 있는 링곰을 저지하려 했던 지우와 친구들. 그 때, 그곳에 “레슬링포켓몬” 루차불이 나타났다. 멋지게 기술을 쓰는 것이 ‘싸움의 미학’인 루차불의 모습에 지우는 감동을 받는다. 루차불의 트레이드 마크 ‘플라잉프레스’를 함께 완성 시키기 위해 지우와 루차불은 특별 훈련을 실시하지만 그곳에 흉악포켓몬들이 슬그머니 다가오는데...!

여행을 하던 도중, 칼로스캐니언을 방문한 지우와 친구들. 그 곳에서 지우는 하늘을 날며 포켓몬 시합을 하는 ‘스카이배틀’을 펼치는 스카이 트레이너 나미와 파이어로를 만나게 되고, 루차불과 함께 스카이배틀에 도전하게 된다. 나미는 루차불이 파이어로를 이긴다면, 화살꼬빈도 파이어로에게 스카이배틀 도전을 할 수 있다고 말한다. 과연 스카이배틀의 승부는 어떻게 될까!?

여행 도중 ‘비춤의 동굴’에 들른 지우와 친구들은, 거울처럼 자신들의 모습을 비추는 이 동굴에서 기묘한 사건에 휘말린다. 바로 거울에 비친 또 한 명의 지우가 피카츄를 빼앗아 가 버린 것! 지우는 피카츄를 되찾기 위해 무심코 거울 벽으로 뛰어 들어가고, 설마 했던 다른 차원의 세계로 가게 되는데!? 그 곳에는 지기 싫어하는 성격의 세레나, 발이 빠른 시트론, 조신한 성격의 유리카 등 평소와는 전혀 다른 모습의 동료들이 있었다. 과연 지우는 피카츄를 되찾을 수 있을까? 그리고 원래 세계로 되돌아올 수 있을까!?

코르니와의 체육관 시합을 앞두고 시트론을 상대로 더블배틀에 도전하는 개구마르와 루차불. 하지만 둘은 호흡이 전혀 맞지 않고, 시합 도중에 싸움까지 하고 만다. 지켜보던 지우는 둘의 유대관계를 높이기 위하여 ‘슈퍼플라잉풀베기’라는 합체 기술의 특별 훈련을 제안한다. 당연히 순조롭게 진행될 리가 없었지만, 지우는 둘을 격려하면서 특별훈련에 열을 쏟는다. 그 때 무언가가 갑자기 지우를 숲 속으로 끌고 가 버리는데! 개구마르와 루차불은 힘을 모아 지우를 구해낼 수 있을까!?

플라타느박사가 주최하는 ‘포켓몬 서머캠프’에 참가하게 된 지우와 친구들. 이 캠프에서는 팀 대항전으로 주어진 프로그램을 서로 겨뤄서, 가장 포인트가 높은 팀이 전당 등록 트레이너로 인정받는다. 거기서 지우와 친구들은 이상해씨, 꼬부기, 파이리를 파트너로 데리고 있는 사나, 티에르노, 트로바 3총사를 만난다. 시합도 있고! 웃음도 있고! 눈물도 있는! 서머캠프의 막이 지금 열린다!!

서머캠프 3일차의 프로그램은 ‘포켓비전 제작’! 포켓비전에 관심이 많은 세레나는 포켓몬들을 주인공으로 하여 그 매력을 어필하기 위한 의욕에 가득 차 있었다! 세레나는 자신이 상상한 아이디어를 바탕으로 포플레 만들기나 트리밍을 하며 완벽히 준비하는데! 하지만 열중해서 촬영 장소를 찾던 세레나는 실수로 그만 언덕 아래로 미끄러져 떨어지고 만다! 게다가 지우도 급히 세레나를 구하려고 팔을 뻗다가 함께 떨어져 버리는데. 과연 두 사람은 무사한 걸까!? 그리고 포켓비전 제작의 결말은!?

치열해지는 서머캠프. 지금까지 지우와 티에르노의 팀이 같은 포인트를 얻으며 선두를 다투고 있다. 다음으로 참여 할 프로그램은 각 코스마다 만들어져 있는 체크 포인트의 스탬프를 모아, 가장 먼저 골에 도착해야 하는 ‘포켓엔티어링’. 동료들과 힘을 모아 순조롭게 체크 포인트를 통과하는 지우 팀과 티에르노 팀. 하지만 안개가 자욱한 길에서 유리카가 일행으로부터 멀어지고 만다. 과연 지우 팀은 무사히 유리카를 찾아낼 수 있을까!? 그리고 일행과 멀어진 유리카가 숲 속에서 본 것은 무엇일까...!?

포켓몬 서머캠프 마지막 날은 팀배틀! 지금까지 같은 포인트로 선두를 달리고 있는 지우 팀과 티에르노 팀이 결승전에서 마무리를 짓기로 한다! 결승전을 하기에 앞서 포켓몬들을 치료하려고 티에르노 팀은 간호순을 찾아간다. 하지만 그 앞에 나타난 것은 요리사로 변장하고 서머캠프에 잠입해 있었던 로켓단이었다! 로켓단은 티에르노 팀의 포켓몬들을 데리고 가 버리는데... 과연 이들은 무사히 꼬부기와 포켓몬들을 되찾을 수 있을까!? 그리고 팀배틀 결승전에 승리하고 서머캠프 “전당 등록”을 해내는 것은 어떤 팀일까!?

사라시티에 도착하여 코르니, 루카리오와 오랜만에 다시 만난 지우와 친구들. 포켓몬 서머캠프에서 티에르노에게 배운 ‘리듬전법’이 아직 완성되지도 않은 채로 체육관 시합에 도전하려 하는 지우를 모두가 걱정하는 가운데, 일행은 사라체육관이 있는 마스터타워로 향한다. 그런데 코르니와의 체육관 시합을 하루 앞두고 있는 밤, 로켓단이 마스터타워에 보관되어 있던 메가진화의 비전서를 훔쳐가 버린다! 결전 전야의 대소동! 과연 지우와 친구들은 로켓단으로부터 비전서를 되찾을 수 있을까!?

설레는 마음을 주체하지 못 하던 지우는 코르니와의 시합에 대비하여 ‘리듬전법’의 연습도 어느 정도 되었으니 사라체육관 시합을 하게 되었다! 격투타입에 일가견이 있는 코르니에 맞서 지우는 루차불, 불화살빈, 피카츄로 승부에 임한다. 이제까지 한 번도 루카리오를 이긴 적이 없었던 피카츄는, 과연 파동을 제어할 수 있게 된 메가루카리오를 이길 수 있을까!?

여행 도중 지우와 친구들은 냐오닉스를 파트너로 데리고 있는 용아와 일남이라는 형제를 만난다. 두 사람은 각각 여행을 하고 있었고, 오랜만에 집에 돌아가는 도중이었다. 그런데 오랜만에 다시 만났음에도 불구하고, 두 사람 사이에는 험악한 분위기가 감돈다. 집에 돌아간 두 사람은 아버지로부터 후계자를 정하기 위한 시련을 부여 받게 되고, 그 후계자 쟁탈전에 지우와 친구들도 가세하게 된다!

여행 중 들른 포켓몬센터에서 지우와 친구들은 실수를 연발하는 푸크린을 만난다. 한 편 마을에서 난동을 부리던 보만다의 소행으로 상처를 입은 포켓몬들이 계속해서 실려오고, 푸크린은 패닉에 빠진다! 그런 푸크린을 다정하게 지원해 주던 간호순이 보만다에게 습격 당해 큰 위기에 빠지고! 간호순을 지키기 위해 푸크린이 보만다에게 맞선다!

칼로스퀸 엘르의 퍼포먼스를 보고 자극을 받은 세레나. 다음 순서였던 루키클래스를 연기하던 중, 제멋대로 무대에서 퍼포먼스를 시작한 판짱이 공연장을 엉망진창으로 만들어 버린다. 판짱의 장난에 모두들 화가 나 있는 가운데, 세레나는 퍼포먼스에 대한 판짱의 생각을 알게 되고, 함께 퍼포먼스를 하고 싶다고 생각한다.

시트론의 모교에서 지우와 친구들은 야생 럭시오를 만난다. 이 럭시오는 예전에 시트론과 함께 연구를 하며 우정을 쌓은 포켓몬이었다. 하지만 약간의 오해로 둘은 멀어져 버렸다. 겨우 다시 만난 둘 사이에는 채울 수 없는 골이 생겨 버렸는데... 과연 시트론의 마음은 럭시오에게 전해져서 우정을 되찾을 수 있을까!?

숲 속에서 지우와 친구들은 라프라스 방위대를 자처하는 유리카 정도 나이의 3인조를 만난다. 세 사람은 상처 입은 라프라스를 보살피고 있었다. 가끔 구슬프게 우는 라프라스를 바다로 돌아가게 해 주려 하지만, 로켓단에게 방해 받아 큰 위기에 빠지고 만다! 포켓몬을 가지고 있지 않은 유리카와 라프라스 방위대는 과연 라프라스를 지킬 수 있을까!?

판짱과 도치마론의 싸움을 계기로 내내라는 트레이너와 만난 지우와 친구들. 내내도 세레나와 마찬가지로 트라이포카론 출전을 목표로 삼고 있었다. 그런데 서로의 퍼포먼스를 보고 있는 와중에, 로켓단이 나타나 포켓몬들을 빼앗아 가 버렸다! 싸움 중이던 판짱과 도치마론은 트레이너와 떨어지는 위기에 맞닥뜨리고 마는데!?

지우와 친구들은 블루를 위협하는 색이 다른 루차불을 발견한다. 지우는 블루를 도와주려 했지만, 사실 그것은 연극 연습이었다. 연습을 방해한 것도 모자라, 그만 주인공인 엘레이드에게 상처를 입혀 버리게 되자, 대타로 지우의 루차불이 무대에 올라가게 되었다. 이윽고 다가온 실제 무대에서는 소란을 틈타 로켓단이 쳐들어 오는데...

지우와 친구들은 시합의 특별 훈련을 하던 중, 상처를 입은 삼평과 개굴닌자를 다시 만난다. 삼평과 개굴닌자는 비밀 두루마리를 어느 저택까지 전해줘야 하는 임무를 수행하던 도중에, 수수께끼의 「가면을 쓴 닌자」에게 습격당했다고 한다. 지우와 친구들은 삼평을 도와주고자, 함께 그 저택을 찾아가 보기로 한다. 그런데 또 다시 가면을 쓴 닌자가 나타나 시합을 하게 되고... 어라? 지우의 개구마르의 모습이?

어느 목장에 들른 지우와 친구들은, 세레나의 어머니를 다시 만난다. 최고의 뿔카노레이서로 키우고 싶다는 어머니의 바람을 알면서도, 세레나는 결의에 차 “포켓몬 퍼포머가 되고 싶다”는 마음을 전한다. 하지만 인정해 주지 않는 어머니를 향해 세레나는 “메이클 레이스에서 이길 수 있다면 꿈을 인정해 달라”며 승부를 제안한다.

지우와 친구들은 여행 도중 발전소를 점령하고 있던 칼라마네로와 다시 만난다! 그리고 허를 찔린 지우와 친구들, 로켓단은 포로가 되고 만다. 가까스로 위기에서 벗어난 시트론과 로이는 어떻게든 해서 모두를 구하려고 하는데...!?

비익시티로 향하던 도중, 지우와 친구들은 가장 약한 드래곤타입 미끄메라를 만난다. 그런데 약해져 있는 미끄메라를 도와주던 지우와 친구들이 방심한 틈을 타 피카츄와 미끄메라가 로켓단에게 잡혀 버린다. 피카츄와 미끄메라는 힘을 합쳐 도망치려 하는데...?

여행 도중 연못을 발견한 지우와 친구들은 포켓몬들에게 물놀이를 시키기로 한다. 하지만 그 연못은 로켓단이 만든 함정이었다. 뿔뿔이 흩어져 버린 지우와 친구들, 어떻게든 한 데 모이지만 미끄메라가 사라져 버린다. 데덴네가 미끄메라를 뒤쫓아가 찾아내지만, 미끄메라는 그만 로켓단에게 붙잡혀 버렸다!

비익시티에 도착한 지우와 친구들. 비익시티의 포켓몬센터에서 혼자가 되어 헤매고 있던 바닐프티를 보호하고 있다는 이야기를 듣고, 서둘러 바닐프티를 만나러 가기로 한다. 하지만 바닐프티는 로켓단에게 유괴되어 버린다. 그렇게 바닐프티의 뒤를 쫓고 있었더니 갑자기 큰 눈이 내리기 시작하는데!?

드디어 맞이한 비익체육관 시합에서 지우는 비익시티의 체육관 관장이자 풀타입을 사용하는 후쿠지에게 도전한다. 다양한 기술로 지우를 압박하는 후쿠지에게, 지우는 굳이 상성이 나쁜 물타입의 개굴반장으로 맞선다. 과연 지우의 작전은 무엇일까? 그리고 무사히 체육관 배지를 손에 넣을 수 있을까!?

오늘은 1년에 한 번 있는 비익시티의 축제날. 이 날 가장 큰 맹세의 나무 아래에서 포켓몬에게 선물을 주면 서로의 유대관계가 깊어진다고 들은 지우와 세레나는, 둘이서 포켓몬들에게 줄 선물을 사러 나간다. 처음으로 피카츄도, 다른 포켓몬도 없이 단 둘이 쇼핑을 하게 되는 지우와 세레나... 어? 이건 설마 데이트!?

오늘은 드디어 세레나가 처음 트라이포카론에 도전하는 날. 세레나는 긴장한 기색이었지만, 사나와 합류해 결의를 새롭게 다지며 준비는 O.K.! 과연 세레나는 사나, 로사 등 라이벌들을 제치고 데뷔전을 승리로 장식할 수 있을까? 드디어 트라이포카론, 비익대회의 막이 열린다...!

지우와 친구들은 여행 도중 만난 황야에서 상처 입은 피그점프를 도와준다. 피그점프는 황야에 있는 오아시스에서 평화롭게 살고 있었지만 홀연히 나타난 피그킹에게 괴롭힘을 당해 도망쳤다고 한다. 지우와 친구들은 피그점프를 도와주려고 하지만 배후에 있던 로켓단의 덫에 걸려들어 곤경을 겪게 되고, 한 편 위기에서 빠져 나온 데덴네와 미끄메라는 피그킹에게 맞서게 된다! 그 때, 미끄메라의 모습이!?

여행 도중, 칼로스발전소 근처를 지나가던 일행은 발전소에 들러 보기로 한다. 하지만 발전소에 다가가자 포켓몬들에게 이변이 일어나는데! 실은 로켓단이 발전소를 점령하고 전기타입 포켓몬들을 조종하고 있었던 것이다! 과연 지우와 친구들은 포켓몬들을 구해낼 수 있을까? 한편 시트론은 무언가로 고민하고 있는 것 같은데...?

지우와 친구들과 시합을 하다가 로이, 나옹과 떨어져 버린 로사와 마자용. 강에 빠져 휩쓸려온 그들을 의사인 화이트가 도와준다. 그 때, 로사는 그만 화이트에게 한 눈에 반해 버리고 만다! 한 편 로사의 마자용도 화이트의 파트너 포켓몬인 마자용과 좋은 분위기가 감돌고... 사랑과 어둠 사이에서 고민하는 로사... 과연 로켓단의 미래는!?

다음 트라이포카론을 향해 연습중인 세레나. 하지만 연습이 잘 안 풀려 세레나는 문뜩 포켓몬들을 심하게 대해 버린다. 세레나는 마음을 정리하려고 잠깐 혼자서 행동하기로 하는데. 그 때 에레나라는 이름을 가진 수수께끼의 언니가 말을 걸어 와서 함께 쇼핑을 하게 되고... 어라? 이 언니의 얼굴 어딘가에서 본 것 같은데?

미르시티를 향해 가고 있는 지우와 친구들은 숲에서 티에르노와 다시 만난다. 지우는 체육관 시합을 앞두고 티에르노와의 특훈 배틀 중에 로켓단의 메카가 나타나 티에르노의 어니부기와 라이츄, 그리고 지우의 미끄네일을 납치해 갔다. 지우와 친구들은 어떻게든 로켓단을 쫓아가지만 배틀의 여파로 화제가 발생해 큰 위기를 맞는다. 이 때 바로 이 포켓몬이 나서는데!!

미르시티에 돌아온 지우와 친구들은 약속했던 시트론과의 체육관 시합에 도전하려고 하고 있었다. 그런데 갑자기 여경님이 나타나 시트로이드를 체포해 가고 말았다. 아무래도 시트로이드와 똑같이 생긴 로보트가 미르시티에서 여러 가지 나쁜 짓을 하고 있는 것 같았다. 과연 지우와 친구들은 시트로이드의 무죄를 증명할 수 있을까?

드디어 맞이한 미르체육관 시합. 남자 대 남자의 약속을 지킬 때가 왔다! 지금까지 함께 여행을 계속해온 지우와 시트론. 파트너 포켓몬이나 잘 사용하는 기술 등 서로의 특징을 잘 알고 있는 두 사람은 역시 지금까지 본 적 없는 격렬한 시합을 펼친다. 전력을 다해 싸우는 시합 끝에, 마지막 열쇠를 쥐고 있는 포켓몬은?

플라타느 연구소에 들른 지우와 친구들. 플라타느박사가 발견한 메가스톤이 한카리아스나이트로 밝혀져서 한껏 들떠있었는데... 그런데 갑자기 로켓단이 나타나 키스톤, 메가스톤, 그리고 한카리아스를 빼앗아 간다! 로켓단의 뒤를 쫓는 지우와 친구들. 그런데 로켓단은 한카리아스를 메가진화 시켜 공격하려고 하는데!?

여행 도중 어느 습지대에 들른 지우와 친구들. 그런데 이 습지대는 미끄래곤의 고향이었다!! 미끄래곤은 고향 친구들과 다시 만나 기뻐하지만, 어딘가가 조금 이상한데... 그곳에 습지대의 지배자 플라제스가 이끄는 군단이 공격해온 것이다!? 친구들을 지키기 위해, 고향의 평화를 지키기 위해, 미끄래곤이 나선다!!

미끄래곤의 고향인 습지대에 머무는 지우와 친구들. 지우와 친구들은 습지대에 사는 포켓몬 친구들 간의 싸움에 속상해하면서도, 인간이 포켓몬끼리의 관계에 끼어드는 것에 대해 고민한다. 그날 밤 갑자기 플라제스가 이끄는 군단이 피카츄와 포켓몬들을 납치해 간다! 구출에 나선 지우와 친구들. 혼란 속에 꿈틀거리는 수상한 그림자의 정체는...?

로켓단과의 배틀 도중, 갑자기 부란다에게 습격을 받은 지우와 친구들. 혼란 속에서 친구들과 떨어진 유리카가 정신을 차리고 보니, 옆에 있는 건 무려 로켓단의 나옹?! 게다가 서로의 몸에는 덩굴이 감겨있어서 떨어질 수 없게 되고, 싫어도 함께 행동을 해야 하는 상황이 되었다. 닥쳐오는 많은 트러블. 과연 유리카와 나옹은 무사히 친구들이 있는 곳 까지 갈 수 있을까?!

숲에서 미아가 되어버린 지우와 친구들. 겨우 다다른 곳은 유령이 나온다는 소문이 있는 “무서운 집”이었다!? 갈팡질팡하는 친구들 앞에 집 주인이라고 하는 노인 코르가 나타나 집에 들리지 않겠냐고 제안해왔다. 때마침 비가 오기 시작해서 코르의 호의를 받아들이기로 한 지우와 친구들. 연발하는 괴기현상. 사라지는 친구들. 무서운 집의 진실은!?

후늬시티에 도착한 지우와 친구들은 서둘러 체육관 시합에 도전하려 했지만, 오늘은 체육관 관장인 마슈가 디자인한 드레스의 패션쇼가 열리기 때문에 체육관 시합을 할 수 없다고 한다. 실망한 지우였지만 때마침 알게 된 승태라는 트레이너와 배틀하게 된다. ...응? 세레나와 유리카가 없어?!

드디어 기다리고 기다리던 후늬체육관 시합의 날을 맞이한 지우! 설레는 마음을 진정시킬 수 없던 지우였지만 대전 상대인 체육관 관장 마슈는 기발한 전법을 잘 쓰는 강적이었다! 오늘 지우는 특별한 작전을 생각하지 않은 것 같은데... 정말 괜찮을까?!

지우와 마슈의 체육관 시합을 관전하고 상당한 자극을 받은 승태. 승태는 흥분한 나머지 항상 소중히 여기던 배틀메모를 잃어버린다. 지우와 친구들은 승태를 걱정하며 분담해서 메모를 찾아보지만 쉽게 찾지 못한다. 사실은 승태의 메모를 주운 건 로켓단이었다!

여행 도중 어떤 숲에서 루차불이 알을 주워왔다! 모두가 따뜻하게 해주자 알에서 나온 건 음뱃이었다! 기뻐하는 지우와 친구들. 음뱃도 지우와 피카츄를 매우 잘 따르는 것 같다. 그러나 이 음뱃은 날 수 없는 것으로 판명되었다!! 모두 음뱃이 날 수 있도록 도우려고 하는데...?

여행 도중에 들린 마을에서 수많은 비행타입 포켓몬과 트레이너가 모여있는 걸 보게 된다. 지금 이 마을에서는 하늘을 나는 포켓몬들에 의해 비행 레이스, 포켓몬 스카이릴레이가 개최 중이라고 한다! 지우는 불화살빈, 루차불 그리고 음뱃으로 도전하기로 했지만 음뱃은 아직 잘 날지 못하는 것 같은데...

지우의 피카츄가 영화에 출연!? 피카츄를 좋아하는 대부호의 열혈한 오퍼로 피카츄가 대거 등장하는 영화에 주연으로 등장! 하지만 이 영화, 스탭도 부족하고 시나리오는 없는 등 문제 투성. 이를 보다 못한 지우와 친구들이 영화제작을 도와주게 되었다. 과연 영화는 무사히 완성될 수 있을 것인가?!

몬스터볼 공장 견학을 간 지우와 친구들. 그러나 이 공장 견학은 로켓단의 함정이었다! 몬스터 볼의 수리 체크라는 거짓말에 그대로 속아서 몬스터 볼째로 포켓몬을 빼앗겨버린다. 유일하게 볼에 들어가지 않았던 피카츄가 포켓몬들을 되찾기 위해 나옹과 대격돌!!

오늘은 드디어 세레나의 2번째 트라이포카론 도전!! 밀피유도 등장해서 세레나는 퍼포먼스에도, 사랑에도 기합이 잔뜩 들어갔다! 이번 테마 퍼포먼스는 포플레 만들기! 자신 있는 분야를 훌륭하게 통과한 세레나였지만 프리 퍼포먼스로 향하는 무대 뒤에서 설마했던 트러블이... 세레나는 어떻게 될까?! 프린세스 열쇠는 누구 손에 들어갈까?!

한 호텔에 틀린 지우와 친구들. 그런데 이 호텔, 너무 황폐하고 상태가 이상해?! 마음을 가다듬고 지하의 배틀 필드를 보러 가자 포켓몬을 내기의 대상으로 한 맨틀이라는 남자와 만나게 된다. 지우도 도박 배틀에 말려들 뻔 하지만, 거기에 나타난 로토무가 구해준다. 로토무는 호텔이 황폐해진 이유를 알고 있는 것 같은데...?

지우와 친구들은 여행 도중에 들린 마을에서 포켓몬으로 가장하는 축제인 펌킨인 페스티벌에 참가하기로 한다. 그러자 수수께기 노인이 펌킨인 집단을 끌고 습격해왔다! 당황하는 일행. 그리고 피카츄로 가장한 도치마론을 빼앗겨 버린다. 이 소동의 뒤에는 로켓단의 모습이.... 응!? 로사의 호바귀가 결혼을?!

향전시티로 계속 여행을 가고 있는 지우와 친구들. 빨리 기가 위해 맘모꾸리를 빌려 설산을 넘기로 했다. 그러자 산 속에서 병에 걸린 눈쓰개와 눈쓰개를 지키는 눈설왕과 조우하게 된다. 눈쓰개를 구하기 위해 지우 일행은 분담해서 약 재료를 찾기로 한다. 그러나 로켓단도 뒤를 따라와 맘모꾸리와 눈쓰개를 붙잡아버렸다!!

여행 도중, 비가 와서 포켓몬 센터에서 쉬기로 한 일행. 그러나 비가 새서 기계가 고장 나고 정전이 되어버린다. 시트론은 수리해보려고 힘을 다해 노력해보지만, 부품이 부족해서 고칠 수 없다!! 그래서 도치마론과 파르빗이 사오기로 되었는데...? 과연 도치마론은 무사히 첫 번째 심부름을 달성할 수 있을까!?

향전시티를 향해 여행을 계속하는 지우 일행. 세레나는 다음 트라이포카론을 위해 연습에 열중한다. 그런데 그 때, 연습중에 사고로 테르나의 가지가 부러진다. 모두가 힘을 합쳐 대신할 가지를 찾지만 테르나는부러진 가지에 대해 강한 집착을 보인다. 테르나 가지에 숨겨진 비밀은...?

여행 중 트로바와 재회하는 지우와 친구들. 포켓몬 포토 컬렉터가 꿈인 트로바는 근처 화산에 전설의 포켓몬 파이어가 있다는 소문을 듣고 찾아왔다고 한다. 지우 일행은 전설의 포켓몬을 만날 수 있을지도 모른다는 기대에 크게 흥분한다. 하지만 로켓단의 방해로 큰 위기에 처하게 된다. 그 때! 수상한 울음소리가 울려 퍼지는데...!?

어느날 밤, 잠이 깬 유리카는 미아가 된 티고라스를 도와주게 된다. 유리카가 돌보게 된 이 티고라스, 덩치는 큰데 어리광쟁이! 돌보기가 만만치 않다. 그때, 티고라스를 노리는 로켓단이 나타났다! 티고라스를 도우려 했던 유리카의 위기!? 그런데 그때 티고라스에게 변화가...!?

어느 숲에서 로켓단의 습격을 받아 함정에 빠지게 된 지우와 친구들. 로켓단은 물리쳤지만, 배틀 후 지면에 구멍이 생겨 지하로 떨어지게 된다. 그런데 유리카는 전에도 이런 일이 있었다고 한다. 아마도 시트론이 파르빗과 만나게 된 일이었던 듯 한데...?

다음 트라이포카론을 위해 퍼포먼스 연습에 열심인 세레나. 어느날 꽃밭에서 즐겁게 춤을 추고 있는 이브이를 발견한다. 이브이의 아름다운 댄스에 감동한 세레나는 어떻게든 이브이와 함께 트라이포카론에 나가고 싶다고 생각하는데... 세레나의 바람은 이브이에게 전해질 수 있을까!?

7번째 배지를 차지하고 트라이포카론 도전을 위해 향전시티로 향하던 중, 트라이포카론 향전대회에 출전하는 사나와 응원하는 티에르노와 합류하여 점점 열의에 차는 세레나. 그런데 세레나에게 고민이 있는 듯하다. 최근에 잡은 그 포켓몬 때문인 듯한데...?

향전시티에 도착한 지우와 친구들. 세레나가 먼저 트라이포카론 향전대회에 도전한다! 이번에는 사나, 로사비, 네네 어려운 라이벌들이 집결하게 되고 세레나는 초조한 모습을 보인다. 무사히 테마 퍼포먼스를 통과하였는데 프리 퍼포먼스를 돌파 직전에 이 포켓몬이 길을 잃어버린다!

세레나의 트라이포카론 도전을 무사히 마치고 드디어 지우의 향전체육관 도전이다! 체육관을 향하던 중, 향전시티의 상징인 해시계 근처를 지나가던 일행은 수수께끼 여성에게 습격을 받는 플라타느 박사와 조수들을 목격한다. 도와주던 지우와 친구들에게 수수께끼의 여성은 칼로스를 위해서다, 라고 돌연 배틀을 걸어온다!

드디어 향전체육관 배틀! 이번 체육관 도전은 2대 2 더블배틀! 호흡이 잘 맞는 2마리의 냐오닉스를 사용하는 체육관관장 고지카를 상대로 지우는 개굴반장과 파이어로 2마리로 맞선다! 냐오닉스의 "미래예지"때문에 고전하는 개굴반장과 파이어로. 지우가 세운 작전은?!

마침내 대망의 새로운 시리즈 스타트! 칼로스리그 도전을 위해 마지막 체육관이 있는 이설시티로 향하는 지우와 친구들. 그런 그들 앞에 포켓몬 도감에는 나와 있지 않은 의문의 말랑말랑한 포켓몬이 나타났다?! 혹시 신종 포켓몬 일지도 모른다는 생각에 크게 흥분 하는 지우와 친구들! 그런데 그 때, 갑자기 의문의 단체로부터 습격을 받게 되는데...

말랑이와 친구가 되어 이설체육관을 향해 여행을 계속해가는 지우와 친구들! 트라이포카론을 연습하고 있던 세레나 앞에, 갑자기 야생의 도치보구가 나타났다!! 그런데 이 도치보구는 이브이에게 첫눈에 반한 것 같은데.. 적극적으로 어필하는 도치보구이지만, 내성적인 성격의 이브이에게는 역효과인 것 같은데...?

여행을 계속 하고 있는 지우와 친구들. 근처의 포켓몬센터를 향해 숲을 걷던 중, 돌 사이에 끼인이상한 차림의 간호순과 만나게 된다. 그런데 이 간호순은 플라타느박사를 동경하여 메가진화의 연구를 하고 있다고 한다. 간호순에게 안내를 받아 포켓몬센터에 도착하게 되는데... 어? 포켓몬센터에 들어갈 수 없다고!?

칼로스리그에 도전하기 위해 마지막 체육관이 있는 이설시티로 여행을 계속하고 있는 지우와 친구들. 그러던 어느 날, 한 마리의 레오꼬가 화염레오 무리들로부터 벗어나 독립하는 모습을 보게 된다. 작지만 훌륭한 화염레오가 되기 위해 열심히 노력하는 레오꼬의 모습을 보고 감동하는 지우와 친구들. 그런데, 그런 레오꼬를 바라보는 어두운 그림자가 있었는데...

여행을 계속하고 있는 지우와 친구들은 어느 숲 속에서 야영을 하게 되었다. 한 밤중에 피카츄와 나옹이 잠에서 깨어보니 그 곳에는 진화한 포켓몬과 진화 전의 지우 일행의 포켓몬이 있었다! 심지어 나옹과 같이 사람의 언어로 이야기 하고 있었다! 영문을 모른 채 어리둥절해 하는 피카츄와 나옹. 그런데 그 때,말랑이가 나타나 도와주겠다며 말을 하는데...

이설시티를 향해 여행을 계속하고 있는 지우와 침구들은 삼평과 개굴닌자를 다시 만났다.삼평은 닌자마을에서 열리는 축제에 초대한다고 했다. 처음으로 방문하는 닌자마을에서 삼평의 형인 일평과 이평, 그리고 닌자마을 사람들을 만난 지우 일행. 그런데 갑자기, 의문의 닌자군단이 닌자마을을 습격하여 닌자마을의 두령이 납치 당하는데...

납치된 두령을 구하기 위해 의문의 닌자군단을 쫓는 지우와 삼평 일행. 적의 보스인 영우는 삼평의 형인 일평과 일대일 승부를 하고자 지우 일행 앞에 자객을 보내온다. 치열한 배틀을 하던 중, 지우의 개굴반장에게 변화가... 그리고 지우의 몸에도 신기한 현상이...!!

세레나가 또다시 트라이포카론에 도전한다! 이번 무대부터는 이브이도 참가하여, 연기실력도 늘었는데! 하지만 정작 주인공인 이브이는 첫 무대를 앞두고 조금은 긴장한 듯한 모습. 세레나는 테르나, 판짱과 함께 이브이를 격려해주어, 팀원들의 결속력은 한 층 더 단단해지는데... 그리고 무대에 오르는 날, 이브이는 과연 첫 무대에서 첫 승리를 할 수 있을까!?

이설시티로 향하는 도중, 끝의 동굴에 들르게 된 지우와 친구들. 동굴로 들어가서보니 말랑이가 어디론가 사라져버렸다! 당황하여 말랑이를 찾는 지우와 친구들. 동굴 내부에서 말랑이를 찾아다녔지만, 말랑이를 아예 잃어버린 것 같다!! 그때 갑자기, 플레어단이 나타나 말랑이가 사라진 주변을 공격하기 시작하는데...

플레어단의 습격을 겨우 물리친 지우와 친구들. 유리카는 배틀 도중에 행방불명이 된 “아이”에 대한 걱정으로 안절부절인 듯한데... 다 함께 끝의 동굴 주변을 찾아보지만, 실수로 독개굴을 화나게 하여, 파르빗이 부상을 당했다! 게다가 파르빗의 부상을 자신의 잘못이라 생각한 유리카가 보여준 행동은!?

지우와 친구들이 한 숲 근처에서 휴식을 취하는 가운데, 그곳에 음뱃의 비명이!? 하늘을 날고 있던 음뱃이 야생의 버섯모와 부딪혀, 버섯모를 화나게 만든 것 같다. 버섯모에게 독 공격을 받은 음뱃, 그런 음뱃을 구한 것은 지나가던 플라엣테였다. 하지만 어쩐지 플라엣테의 행동이 버섯모를 더 화나게 만든 것 같은데?

3번째 프린세스 키를 얻기 위해, 열심히 연습하는 세레나. 그때, 포켓몬 퍼포머를 대상으로 한 댄스파티의 초대장이 도착한다. 퍼포머, 포켓몬과 함께 남녀가 한 팀이 되어 참가하는 이 파티에, 세레나와 이브이, 시트론, 파르빗이 참가하기로 한다. 그때 지우와 한 팀을 이루려는 밀피유가 등장하는데!?

여행 도중, 승태와 다시 만나 배틀하게 되는데. 승태와의 배틀이 한창인 가운데, 또다시 지우의 개굴닌자 모습이 변했다! 이 현상은 도대체 무엇일까? 무엇이 원인인지 궁금한 지우와 친구들. 이튿날 아침, 포켓몬센터에서 휴식을 취하는 지우와 친구들을 로켓단이 습격한다! 위기에 빠진 피카츄를 구한 것은 바로...!?

지우와 친구들을 노리는 로켓단. 우연히 로켓단은 칼로스지방에서 비밀리에 활동하던 플레어단과 마주치게 된다. 로켓단이 플레어단의 정보를 수집하는 도중 말랑이와 똑같이 생긴 기이한 생명체와 만나게 된다. 곧바로 포획하여 보스인 비주기에게 보내기 위해 계획을 짜지만, 그때 플레어단이 습격한다. 그곳에 누군가가 나타나는데. 갑자기 등장한 의외의 인물은!?

여행 도중, 황야에서 식물을 기르기 위해 움직이는 로봇을 발견한 지우와 친구들. 사실 이 땅은 먼 옛날 녹음이 가득한 땅이었지만, 언젠가부터 물부족으로 인해, 더 이상 식물이 자라지 않게 되었다고 한다. 로봇을 도와주기 위해 시트론의 발명품과 포켓몬들의 능력을 사용하여 황야에 녹지를 되찾기 위해 노력하지만 과연...?

세레나는 마지막 하나의 프린세스 키를 얻기 위해, 지우와 친구들과 함께 루키클래스가 열리는 플레이시티에 도착한다. 그러나 이 대회에는, 플레이시티의 명문가 출신 유력 퍼포머, 아멜리아도 참가한다. 강력한 라이벌의 등장에 불안한 듯한 세레나. 그리고 대회장에는, 전 칼로스퀸의 유명 프로듀서, 아젤리아가 나타나는데...?

여행 도중, 전설의 포켓몬, 썬더를 기리는 축제가 열리는 우레마을을 방문하기로 한 지우와 친구들. 그러나 갑자기 큰 천둥이 울린다! 허둥지둥 근처 동굴로 몸을 피한 지우와 친구들은 그곳에서 부상 당한 구급대원과 만난다. 부상을 입은 구급대원을 대신하여, 마을 병원의 아이들에게 약을 전달하기로 한 지우. 그러나 동굴을 빠져나오니 화가 난 썬더의 모습이!?

여행 도중 들른 마을에서, 세계 보석전이 개최 중인 것을 알게 된 지우와 친구들. 곧바로 그곳을 향하려는데, 갑자기 경보가 울린다! 보석전에 도둑 괴도너클이 나타난 것이다! 하지만 너클은 정작 보석은 훔치지 않은 채 그대로 사라지는데. 너클의 목적을 알 수 없어 수상히 여기는 지우와 친구들. 거기에 갑자기 유리카를 습격해오는 의문의 그림자는!?

드디어 마스터클래스 당일을 맞이한 세레나! 사나, 밀피유, 내내, 그리고 로사비까지! 선의의 경쟁을 펼쳤던 라이벌들이 모두 모였다! 결승에서는 세레나가 줄곧 동경해 온 칼로스퀸, 엘르가 기다리고 있는데... 엘르에게 도전할 수 있는 건 마지막까지 살아 남은 단 한 사람뿐! 세레나는 그동안 갈고 닦은 기술, 마음, 그 모든 것을 가슴에 품고, 드디어 꿈꿔 온 무대의 문을 연다...!!

불꽃튀는 경쟁을 뚫고 드디어 트라이포카론 마스터클래스 준결승에 진출권을 따낸 세레나, 상대는 로사비, 그리고 세레나의 친구 사나. 각인각색의 각자의 최선을 다해 퍼포먼스에 임해 일진일퇴, 작은 실수도 허락하지 않은 긴박한 스테이지가 전개된다. 그런데, 퍼포먼스의 마지막에서 착지를 하려고 하는 세레나의 몸에 무슨 일이??

지우와 친구들은 여행 도중에 이어롤을 파트너 포켓몬으로 가지고 있는 여자아이를 만나게 된다. 그런데 이 여자아이는 유리카의 실부플레가 당황스럽지 않은 모습이었다!? 이 여자아이는 세계적으로 유명한 로봇 회사의 사장의 외동딸이인데 미래에 파트너를 찾고 있다고 했다! 시트론이 만든 메카에도 흥미진진해하는데... 둘은 왠지 아주 좋은 느낌인데... 그런데 유리카는 그 모습이 좋지만은 않은 것 같다??

지우가 감기에 걸리고 말았다. 세레나가 간병을 하고 시트론과 유리카가 약을 사러 가기로 한다. 그런데 세레나 앞에 한 명의 트레이너가 나타난다. 이 트레이너는 피카츄를 아주 좋아하여 최강의 피카츄 트레이너를 목표로 여행을 하고 있다고 한다. 아픈 지우에게 부담을 주지 않기 위해서 세레나는 과연 어떤 행동을!?

지우와 개굴닌자에게 일어난 이상한 현상을 밝히기 위해 포켓몬센터에서 배틀을 하면서 시트론의 메카로 분석을 하기로 한다. 그런데 거기에 다시 알랭과 만나게 된다! 강적과의 재회에 두근거리는 지우는 그 자리에서 알랭에게 배틀을 제안한다. 개굴닌자와 리자몽의 작렬하는 배틀이 계속되는 가운데, 지우의 몸에 이상한 변화가 일어나는데!?

하늘에서 포켓몬이 떨어졌다!? 지우와 친구들 앞에 하늘에서 하얀 나목령이 떨어진 것이다. 아무래도 이 나목령은 길을 잃은 것 같은데... 지우와 친구들은 이 나목령을 친구들이 있는 곳으로 데려다주기로 한다. 그런데 이 나목령은 사는 곳에서 밖으로 한 번도 나와 본 적이 없는 것 같았다. 보는 것, 만나는 포켓몬들 모두에 이상하게 크게 놀라는 것이었다. 무사히 친구들과 합류할 수 있을 거라고 생각했는데...?

마지막 배지를 얻기위해, 이설시티로 향하는 지우와 친구들. 그런 지우와 친구들 앞에 나타난 한 대의 헬리콥터! 안에서 내린 것은 다름아닌 칼로스지방의 챔피언 카르네! 가까운미래 칼로스지방에 위기가 다가온다는 예언을 들은 카르네는 사건의 열쇠가 된다는 지우와 친구들을 만나러 왔다고 하는데...

마지막의 체육관배지를 얻기위해, 이설시티로 향하는 지우와 친구들은 포켓몬센터에서 승태하고 재회한다. 지우를 존경하는 승태는 지우를 쫓아가는 마음으로 노력하여, 이미 모든 배지를 모았다고 한다. 지우는 승태의 성장을 확인하기 위해, 3대3 포켓몬대결을 하게 되는데...

드디어 이설시티에 도착한 지우와 친구들. 지우는 칼로스리그 출장을 걸고 마지막의 체육관으로 향한다. 상대는 얼음타입의 체육관 관장, 우르프! 강력한 파워와 높은 테크닉을 구사한 대결을 유리하게 이끄는 우르프 앞에 지우는 대고전! 승리의 열쇠를 가지고 있는 것은... 바로 이 포켓몬!!

밤에 혼자 숲으로 모습을 감춘 지우. 그러나 아침이 되어도 지우는 돌아오지 않고 걱정하는 지우의 친구들. 거기에 갑자기 큰 돌풍이 불어왔다! 걱정하는 세레나들은 다같이 지우를 찾기로 한다. 한편, 숲에서 미아가 된 지우의 앞에 같이 모습을 감춘 그 포켓몬이 나타났다... 숲의 안에서 지우가 찾은 해답은!?

숲에서 포켓몬들하고 교류를 하고, 더욱 성장한 지우. 방황이 없어진 지우는 다시 한번 이설체육관에 도전한다! 지금까지 축적한 지식, 경험, 그리고 포켓몬들과 하나로 된 마음으로 전력승부하는 지우. 그런 지우의 앞에 나타난 것은 최대의 강적, 메가눈설왕이었다. 과연 배틀의 행방은...?

미르시티로 향하는 도중, 미끄래곤이 사는 습지대에 들르게 된 지우와 친구들. 재회에 기뻐하는 지우와 친구들... 하지만 그 곳에 갑작스런 사건이! 한마리의 멜리시가 습지대에서 날뛰고 있었던 것이다! 바로 지우와 친구들은 미끄래곤과 습지대의 포켓몬들하고 같이 멜리시를 말리려고 하지만, 그곳에 로켓단이 나타나고...

지우와 친구는 여행도중에, 기계장치 페스티벌에 들르기로 한다. 그 곳은 칼로스지방의 기계장치명인들이 제작한 기계장치를 체험할 수 있는 이벤트라 한다. 안으로 들어가자마자 바로 작동하는 기계장치, 그러나 지우일행과 피카츄들은 떨어지고 말았다! 과연 지우들은 무사히 피카츄하고 합류할 수 있을 것인가!?

드디어 맞이한 칼로스리그의 개막! 리그에 출장하는 사람들은 배지를 8개 모은 강자들뿐. 그 중에는 승태와 티에르노, 트로바같은 익숙한 트레이너도 있었다. 지우의 기분도 서서히 올라가는 도중, 지우에게 배틀을 도전한 트레이너가!

뜨거운 시합이 계속되는 칼로스리그, 준결승진출을 걸고 승태와 티에르노가 격돌! 댄스로 포켓몬하고 호흡을 맞추면서 싸우는 리듬전법을 특기로 하는 티에르노에 대해서, 승태는 특유의 분석을 구사하여 대응한다. 서로 우열을 가리기 힘든 상황! 거기에서 지우와 친구들이 본 것은!?

칼로스리그도 드디어 대단원으로. 준결승부터는 6대6의 풀배틀! 지우의 상대는 바로 승태! 앞 전의 대결에서 승태에게 패배한 지우였지만, 그 때보다 강해졌지만, 가벼운 마음으로 대한다. 한편, 승태도 존경의 대상인 지우와 최고의 무대에서 대결하는 기쁨을 느끼고 있었다. 지우와 승태의 대결은 초반부터 전력승부!!

일진일퇴의 공방이 계속되는 지우와 승태의 준결승. 지금까지 몇번 싸운 상대이기 때문에 수준높은 배틀이 전개된다. 시합을 통해서, 지우와 승태는 서로 지금까지의 노력을 생각해낸다. 드디어 맞이한 마지막배틀, 전력승부하는 지우와 승태 드디어 결착!

칼로스리그로 인해 분위기가 뜨거워진 미르시티. 그러한 도중 사고가 발생! 시트론의 도치마론이 미아가 되어버렸다! 망연자실한 도치마론 앞에 나타난 것은...? 칼로스리그 결승이 시작되기 전 각각의 마음이 교착되어 새로운 만남이 다음의 이야기를 만들어낸다...

드디어 맞이한 칼로스리그 결승전. 지우의 상대는 지금까지 한번도 이길 수 없었던 알랭. 더구나, 알랭은 리자몽과 메타그로스만으로 결승전까지 진출했다! 전력으로 승부하는 지우와 알랭. 일진일퇴의 공방이 계속되는 가운데, 알랭이 꺼낸 3번째 포켓몬이란!?

격투가 계속되는 지우와 알랭의 칼로스리그 결승전!! 일진일퇴의 배틀은 경기장 전체를 뜨겁게 하고 있다. 그리고, 드디어 결착의 순간, 과연 칼로스리그 우승이라는 영광을 손에 넣는 것은 지우인가? 알랭인가? 한편, 결승전의 뒷편에서는 플레어단이..?

갑자기 나타난 거대한 식물의 습격으로 인하여, 미르시티는 괴멸상태로 되어버린다. 지우와 친구들은 사건의 진상을 알기 위해 프리즘타워로 향하지만, 플레어단의 기습으로 인해, 지우가 잡혀간다! 그리고, 플라드리는 전세계를 향해 자신의 야망을 선언한다!

플레어단의 계획을 막기 위해, 시트론들은 개별행동으로 나선다. 한편, 50%폼이 되어 폭주하는 Z2와 대치중인 말랑이를 쫓는 유리카. 하지만, 그곳에도 플레어단의 마수가! Z2에 이어서 말랑이도 플레어단에 의해서 조종되려 하고 있었다. 또한, 플라드리는 지우와 개굴닌자에게 관심을 보이고...?

플레어단 사건으로 인해 피해가 확대되어 간다. 마농과 같이 또치를 구출하기 위해 플라드리 래버러토리로 향한 세레나 앞에 나타난, 강력한 도우미는!? 그리고, 미르체육관의 탈환을 목표로 하는 시트론은 시트로이드와 같이 프리즘타워에 잠입을 성공하고, 과학자로서의 포부를 걸고 크세로시키에 도전한다!

시트론과 유리카의 활약으로 인해서, 폭주를 멈춘 지가르데. 그리고 지우는 드디어 플라드리를 격파한다. 이것으로 사건해결...이라고 생각한 직후, 플라드리 래버러토리에 있던 거석에 이변이! 거석이 변형하여 움직이기 시작한 것이다. 과연 거석이 향하는 곳은? 대위기이던 피카츄들 앞에 나타난 인물은!?

또치를 구하기 위해, 이 세계를 구하기 위해, 지우와 친구들은 압도적인 힘을 자랑하는 거석에 도전한다. 지우의 친구들이 길을 열어주고 지우와 알랭은 거석으로 침입, 또치를 구출한다. 남은 것은 거석을 멈추는 것! 하지만 멈출 기세가 보이지않고... 이 상태로는 칼로스, 이 세계가 위험하다!! 절체절명의 위기에 전설의 포켓몬이 움직인다!

플레어단 사건도 일단락되고, 조금씩 복구되기 시작한 칼로스지방. 시트론도 체육관의 복구와 시트로이드의 수리에 매우 바쁘다. 드디어 미르체육관이 다시 문을 열기 하루 전날, 한 소년이 체육관으로 찾아온다. 그는 이전에 시트로이드와의 배틀에 도전했지만 패하고, 재도전을 위해 찾아 온 것. 그의 도전을 받아들일지 망설이는 시트론인데...

차근차근 복구가 진행되는 미르시티. 세레나는 플레어단 사건으로 지친 사람들의 마음을 달래주기 위해 트라이포카론의 스페셜 이벤트를 계획한다. 앞으로의 여행에 대해 고민하고 있던 세레나는 자신의 퍼포먼스를 보고 웃음짓는 사람들을 보고, 지우와 포켓몬 배틀을 하게 되면서 결단을 내리게 되는데...

미끄래곤과 헤어지기 위해 습지대로 향하는 지우와 친구들. 습지대에서 돌아오는 길, 플레어단 사건으로 맹위를 떨친 폭주하는 덩굴과 만난다. 놀란 지우는 지우개굴닌자의 도움으로 그들을 물리치지만 난데없이 그곳에 크세로시키가 나타난다! 그리고 허를 찔린 시트론이 마인드컨트롤을 당하는데...!?

드디어 찾아온 작별의 날, 지우와 친구들은 공항에서 언젠가 반드시 재회할 것을 맹세한다. 그러던중 비행기 탑승시간이 다가오고, 데덴네가 도망치고 만다. 아직 어린 데덴네는 모두와 헤어지는 것이 싫은 듯한데... 그런 데덴네에게 유리카가 해준 말은?

제르네아스, 이벨타르 그리고 지가르데... 칼로스지방 전설의 포켓몬. 이번에는 칼로스 신화로 전해지는 시대, 전설의 포켓몬의 수수께끼에 다가가는 특별편. 플라타느와 팬지는 칼로스지방에서 최근에 발견된 유적을 방문한다. 유적에서 발견된 석상은 전설의 포켓몬과 얽힌 신화의 수수께끼를 풀 열쇠가 될지도 모른다고 하는데...

미르시티에서 열린 낚시 대회에 참가한 시트론과 유리카는 그곳에서 포켓몬소믈리에 여행자 덴트와 만난다. 프리즘타워에 가고 싶어하는 덴트를 안내하게 된 시트론과 친구들은 덴트의 희망으로 지하철로 이동한다. 그런데 그곳에서 사건이 발생! 무인 시험차량이 유리카를 태운 채로 달려버린다! 시트론&덴트는 과연 어떻게 할지!?

엄마와 함께 알로라섬에 놀러 온 지우. 즐거운 시간을 보내던 지우는 오박사의 심부름으로 포켓몬스쿨에 가게 되고, 그곳에서 만난 친구의 안내로 포켓몬스쿨을 둘러본다. 그리고 섬의 수호신 카푸꼬꼬꼭과 몇 번의 신비한 만남을 가지며 Z링까지 받는다. 결국 점점 알로라섬에 흥미를 느낀 지우는 그곳에서 새로운 생활을 하기로 결심하는데…

알로라섬에서 포켓몬스쿨에 다니기 시작한 지우! 그러던 어느 날, 마오를 비롯한 포켓몬스쿨 친구들이 지우를 위해 준비한 서프라이즈 환영식이 다 끝나갈 무렵 카푸꼬꼬꼭이 나타나 지우에게 배틀을 제안한다. 그리고 그 배틀을 계기로 Z기술을 제대로 사용하겠다고 결심한 지우는 섬 순례라는 새로운 목표에 도전하기로 하는데…

쿠쿠이박사로부터 로토무도감을 선물 받은 지우! 잠시 뒤 지우와 친구들은 로토무도감과 함께 야생 포켓몬을 잡기 위해 숲으로 출발하고, 곧 따라큐를 만나 배틀을 시작한다. 그런데 그때 알로라지방에로 온 로켓단이 그들을 방해하기 시작하고, 불현듯 따라큐가 로켓단을 돕겠다고 나서는데…

로토무도감과 함께 알로라의 야생 포켓몬을 잡기 시작한 지우는 우연히 나몰빼미를 만나고, 더욱 더 의욕에 불타오른다. 그러던 중 따라큐를 앞세운 로켓단이 나몰빼미의 친구들을 습격하는 사건이 발생하지만, 나몰빼미의 활약으로 무사히 해결한다. 그리고 나몰빼미는 지우와 함께 가기로 결심하는데…

포켓몬스쿨의 야외수업으로 바다포켓몬 낚시에 나선 지우와 친구들. 그들은 일일 선생님인 수련의 지시에 따라 서툴지만 열심히 낚시를 하기 시작한다. 그러던 중 포켓몬을 노리는 로켓단의 습격을 받지만, 수련과 누리공의 활약으로 무사히 로켓단을 물리치는데...

손에 익지 않은 집안일을 하며 배고픔에 지친 지우는 식료품을 사러 쇼핑몰로 향한다. 그런데 그곳에서 로켓단이 저지른 실수에 휘말리게 되고, 우연히 만난 마마네, 토게데마루와 함께 문제를 해결하기 위해 나선다. 그러던 중 로켓단을 맞닥뜨리게 되고, 피카츄와 토게데마루의 멋진 콤비 플레이가 펼쳐지는데…

학교 가는 길에 떠돌이 냐오불에게 샌드위치 한 조각을 빼앗긴 지우는 냐오불을 잡기로 결심한다. 그러다 우연히 데미지를 입은 냐오불을 돕게 되고, 그동안 쇠약한 바랜드를 먹이기 위해서 음식에 집착하며 동분서주했다는 사실을 알게 되는데...

특별수업의 일환으로 포켓몬 알을 받은 지우와 친구들. 그들은 릴리에에게 알을 집으로 가져가 돌볼 것을 제안하고, 릴리에는 용기를 내서 받아들인다. 그런데 릴리에의 집에 야도뇽이 나타나서 알을 노리는 소동이 벌어지고, 어느새 릴리에는 알을 지키겠다는 일념으로 꼭 끌어안는데…

Z크리스탈을 손에 넣기 위해 섬 순례를 하기로 결심한 지우. 멜레멜레섬의 섬의 왕인 할라는 지우에게 시련을 받을 수 있는 자격이 있는지 시험하기 위해 질문을 한다. 고민하던 지우는 무사히 시험을 통과하고, 주인 포켓몬인 형사구스에게 첫 번째 시련 포켓몬 배틀을 도전해서 멋지게 돌파하는데…

멜레멜레섬 섬의 왕인 할라와 큰 시련 배틀을 하게 된 지우. 두 사람은 각각 포켓몬 2마리로 치열한 배틀을 펼치기 시작하고, 결국 피카츄와 함께 Z기술을 멋지게 성공시킨 지우의 승리로 막을 내린다. 그 덕분에 지우는 두 번째 Z크리스탈을 손에 넣게 되는데…

Z기술을 연습하던 중에 우연히 키아웨를 만나서 키아웨네 목장을 방문하게 된 지우. 지우는 목장의 포켓몬들을 돌보고 키아웨에게 Z링에 얽힌 이야기를 듣는 등 보람찬 하루를 보낸다. 그런데 다음날 키아웨와 함께 밀크를 배달하러 가던 도중 스컬단의 습격을 받고, Z기술을 사용해서 그들을 무사히 물리치는데...

바닷가에서 야외 수업을 하게 된 지우와 친구들은 물놀이와 수영 등을 하며 즐거운 시간을 보낸다. 잠시 뒤 지우는 수업의 일환으로 포켓몬을 관찰하던 중 로켓단을 습격을 받게 되고, 즉석에서 배틀을 하지만 불리한 상황에 놓이게 된다. 그런데 그때 이븐곰이 나타나서 로켓단을 데리고 가버리는데…

포켓몬 팬케이크 레이스에 출전하기로 결심한 지우. 지우는 작년 챔피언인 노아를 만나서 레이스에 대한 조언을 들으며 함께 연습한다. 드디어 대회가 시작되고, 지우와 피카츄는 우승을 목표로 최선을 다해 경기에 임한다. 그러던 중, 꼼수를 써서 대회에 참가한 나옹이 경기를 방해하기 시작하는데…

릴리에는 자신이 돌보던 알에서 알로라 식스테일이 태어나자, 지우와 친구들의 권유를 받아들여 파트너로 삼는다. 하지만 포켓몬을 만질 수 없는 릴리에는 알로라 식스테일과 친해지기 위해 함께 시간을 보내기로 결심한다. 그때 로켓단이 습격하고, 릴리에는 로켓단과 배틀을 하면서 자연스럽게 알로라 식스테일을 만지게 되는데...

어느 날 밖에서 상처를 잔뜩 입고 돌아온 암멍이. 이를 이상하게 여긴 지우와 쿠쿠이 박사는 암멍이의 뒤를 밟기 시작하고, 포켓몬들의 단련 장소인 발톱자국언덕에서 특훈을 하다가 다쳤다는 사실을 알게 된다. 지우는 암멍이에게 마그마를 이길 수 있도록 특훈을 하자고 제안하는데...

실수로 인해 벌룬을 타고 날아가 로켓단의 안테나를 부수고 허둥지둥 도망친 나몰빼미와 누리공은 잠시 뒤 그들을 쫓아온 나옹과 맞닥뜨린다. 그런데 그때 냐오불이 나타나 그들을 위험에서 구해주고, 집에 데려다주기로 한다. 하지만 집으로 향하던 도중 다시 로켓단의 습격이 시작되고, 세 마리 모두 꼼짝없이 잡히고 마는데…

카푸꼬꼬꼭에게 받은 Z크리스탈을 잃어버린 지우. 그러자 탐정 드라마에 푹 빠져있던 로토무는, 스스로 탐정이 되어 Z크리스탈을 찾기 위해 동분서주하기 시작한다. 잠시 뒤, 방송국의 비디오카메라 영상을 통해 단서를 입수하게 되고, 드디어 Z크리스탈 사건의 범인이 밝혀지는데...

아이나식당에서 열린 마오의 신메뉴 시식회에 참석한 지우와 친구들. 곧 ‘환상의 알로라스튜’가 나오고, 다들 기대에 차서 요리를 입에 넣지만 이내 얼굴을 찌푸리고 만다. 진노랑꿀이 빠져서 맛이 이상하다는 사실을 알게 된 지우는 마오와 함께 진노랑꿀을 찾기로 하고, 우여곡절 끝에 성공을 눈앞에 둔다. 그런데 그때, 진노랑꿀을 노리고 로켓단이 공격하기 시작하는데…

카푸꼬꼬꼭과의 재배틀을 원하는 지우. 지우는 전기 타입에 대해 공부하기 위해 마마네의 집에 가지만, 곧 머리 아픈 이론은 포기하고 몸을 움직이는 특훈에 매진한다. 잠시 후 카푸꼬꼬꼭은 전기를 이용해서 피카츄를 불러내고, 지우와 피카츄는 특훈의 성과를 보이며 배틀에 열중하는데...

알로라 선라이즈에 갔다가 보물섬으로 탐험을 떠나게 된 지우와 피카츄. 보물섬에서 즐거운 시간을 보내던 지우와 피카츄는 우연히 바위에 갇힌 꼬시레를 구해주고, 그 와중에 지우는 손에 상처를 입는다. 그때 카푸나비나가 나타나서 지우의 상처를 치료해주는데…

오랜만에 시장에서 냐오불을 만난 지우. 곧장 냐오불을 쫓아간 지우는 바랜드와 함께 기술을 연습하는 모습을 목격한다. 그런데 얼마 후, 쇠약해진 바랜드는 결국 세상을 떠나고 냐오불은 깊은 슬픔에 빠진다. 지우는 냐오불에게 동료가 될 것을 청하지만, 냐오불은 배틀을 통해 지우의 실력을 확인하려 하는데...

냐오불의 특훈을 위해 바닷가를 찾은 지우 일행. 잠시 뒤, 의도치 않게 모래꿍의 삽이 바다에 빠지게 되자, 지우는 삽 대신 로토무를 머리에 꽂아준다. 그러자 화가 난 모래꿍은 모래성이당으로 진화해서 지우와 냐오불을 삼켜버리고, 나머지 일행들은 그들을 구하기 위해 대책을 강구하는데…

쿠쿠이박사와 함께 라이브 공연에 간 지우와 친구들. 닥트리오와 DJ레오의 유닛, 일명 ′다그레오′의 퍼포먼스를 보기 위해서다. 우연히 DJ레오와 알게 된 지우 일행은 그곳에서 닥트리오를 동경하는 디그다를 만난다. 그런데 어느 날 닥트리오가 해산한다는 충격적인 뉴스가 나오는데?!

어느 휴일, 고민에 빠진 지우. 이제 곧 포켓몬스쿨에서 학부모와 마을 사람들을 초대하는 ′오픈스쿨′이 열리는데, 그곳에서 발표를 하게 된 것이다! 게다가 생각지도 못한 방문객, 지우의 엄마가 관동지방에서 발표를 보기 위해 왔다! 지우의 발표는 과연?!

지우와 피카츄를 끈질기게 노리는 로켓단. 어느 날 포켓몬스쿨의 수업을 엿보다 Z기술을 보고 충격을 받는다. 곧바로 Z기술 연습을 하기 위해 Z크리스탈을 찾으러 나선다. 그런데 그곳에 알로라지방에서 난동을 부리고 다니는 스컬단이 나타나고…로켓단과 스컬단, 악과 악이 맞붙는다!!

지우의 반 친구인 마마네는 우연히 부모님이 이사에 대해 이야기하는 것을 듣게 된다. 포켓몬스쿨의 친구들과 이별해야 한다는 사실이 슬프지만, 강하게 마음을 먹는 마마네. 그러나 수업에도 적극 참여하지 못하고 왠지 힘이 빠져 있다. 그런 마마네의 모습을 보고 걱정이 된 지우와 친구들은 계획을 세우는데...

포켓몬스쿨의 쉬는 시간, 지우는 강력한 루가루암과 의문의 트레이너에 대한 소문을 듣게 된다. 꼭 그 트레이너와 배틀하고 싶다고 생각한 지우. 길을 걷던 중, 소문의 루가루암과 트레이너가 나타난다! 바로 배틀을 하려고 말을 거는 지우, 그런데 그때 갑자기 릴리에가 나서는데...?

알로라지방의 최고 인기 스포츠, 포켓베이스를 TV에서 본 지우와 피카츄는 무척 흥분한다! 다음 날, 포켓몬스쿨 수업에서 쿠쿠이박사는 서프라이즈 발표를 한다. 바로 오늘 수업은 포켓베이스를 한다는 것. 게다가 강사는 프로 포켓베이스 선수로 유명한 올루올루 선수다! 격렬한 시합이 펼쳐지고, 과연 승자는 누가 될 것인가?!

휴일을 이용해 숲으로 캠핑을 떠난 지우와 친구들. 요리를 하고, 강에서 놀며 캠핑을 만끽한다. 그런데 어느 순간 친구들이 한 명씩 쓰러져 버린다. 알고 보니 이 숲에는 정체불명의 존재가 있어, 습격을 당하면 기억과 에너지를 흡수해 버린다는데...

어느 날, 포켓몬스쿨 수업에서 쿠쿠이박사가 깜짝 발표를 한다. 바로 서로의 파트너 포켓몬을 교환하라는 것. 이것은 사실 수업의 일환으로, 자신의 파트너 이외의 포켓몬에 대해서도 잘 알도록 하기 위해서라고 한다. 피카츄는 릴리에 집에서 지내게 되지만, 릴리에는 피카츄를 만질 수 없는데…

평소와 달리 설레는 모습으로 등교하는 지우. 오늘부터 아칼라섬으로 야외수업을 떠나기 때문이다. 이번 수업의 특별강사이자, ′섬의 여왕′ 라이치와 함께 아칼라섬으로 향한 지우 일행. 도중에 곤경에 처한 고래왕자를 만나게 되고, 라이치는 멋지게 고래왕자를 구하는데...

야외수업으로 아칼라섬에 온 지우와 친구들. 오늘은 바랜드와 함께하는 보물찾기에 도전한다. 바다와 산을 돌아다니며 각자 다양한 보물을 발견하는 지우와 친구들. 그러나 수련은 좀처럼 바랜드와 친해지지 못하는데…

아칼라섬에서 자유시간을 갖게 된 지우 일행. 지우는 수련과 함께 낚시를 하러 연못으로 향하고, 나머지는 키아웨의 목장을 방문한다. 연못에 도착한 수련은 지우의 도움을 받으며 물가의 주인과 뜨거운 낚시 배틀을 펼치게 되는데…

아칼라섬의 벨라불꽃축제에 참석한 지우 일행. 그런데 포켓몬에게 벨라의 관을 씌워주는 행사에 난입한 텅구리가 관을 가지고 도망가 버리는 일이 발생한다. 키아웨는 관을 되찾으려 텅구리를 찾아가 배틀을 하지만 뜻하지 않은 패배를 맛보게 된다.

오늘의 야외수업은 아칼라카레 만들기. 마오와 한 팀을 이룬 지우는 카레에 필요한 식재료를 찾아 나선다. 우여곡절 끝에 식재료를 전부 찾은 지우는 생각지도 못한 풀타입 Z크리스탈까지 얻게 되어 기뻐하는데…

라이치와 큰 시련 배틀을 하게 된 지우. 이번 큰 시련은 더블배틀로, 지우는 암멍이와 나몰빼미를 배틀에 내보낸다. 루가루암과 대코파스를 내세운 라이치의 공격에 밀려 고전하던 지우는, 심기일전해서 치열한 배틀을 이어간다.

진화를 앞두고 이상한 행동을 보이는 암멍이. 급기야 한밤중에 집을 나가는 일이 발생하고, 지우는 그런 암멍이를 찾아 나선다. 한참 뒤, 상처투성이가 되어 생명의 유적에서 발견된 암멍이는 아칼라섬 수호신인 카푸나비나의 도움으로 몸을 회복하고, 마침내 멋진 모습으로 진화하는데…

오늘도 지우에게 배틀을 신청한 로켓단. 평소처럼 배틀에서 지고 하늘로 날아가는데 그만 로사와 따라큐가 일행과 떨어지고 만다. 심지어 따라큐의 탈도 찢어져 로사는 크게 당황하는데…

아이나식당의 맛집 촬영이 예정된 날. 마오는 포켓몬스쿨을 조퇴하며 가게를 돕기 위해 달려간다. 잠시 뒤 리포터가 와서 촬영이 시작되고, 방송에 정신이 팔린 마오의 아빠는 모든 요리를 마오에게 떠맡긴다. 그러자 화가 난 마오는 가출을 해서 숲으로 들어가고, 우연히 하랑우탄을 만나 상처를 치료 받는데…

계속된 연습에도 Z기술에 실패한 수련과 누리공. 그러다 우연히 거리에서 공연을 하는 이아가 Z기술을 사용하는 걸 본 수련은 이아의 제자가 되어 특훈을 시작한다. 그러던 중, 침몰선에서 보물을 찾기 위해 카노아와 함께 바다로 나간 지우 일행은 오해로 인해 화가 난 타타륜과 맞닥뜨리게 되는데…

포켓몬스쿨에서 마마네로부터 ′전지충이 레이스′에 대해 듣게 된 지우. 마마네, 키아웨와 함께 팀을 이뤄 대회에 참가하기로 한다. 셋은 각자 역할을 나누고 서둘러 연습을 시작하지만, 좀처럼 진척이 없는데…

지우 일행은 포켓몬스쿨 개교 20주년을 맞아 관동지방으로 특별 야외 수업을 하러 간다. 기대감을 안고 관동지방에 도착한 그들은 오 박사의 연구실로 가서 다양한 관동 포켓몬들을 보며 즐거운 시간을 보낸다. 그런데 그때 로켓단이 나타나는데…

블루체육관에서 체육관 시합을 하기로 한 지우 일행. 그들은 이슬, 웅과 함께 Z기술과 메가진화 등을 사용하며 최선을 다해 배틀에 임한다. 지우 일행은 포켓몬 배틀을 끝으로 관동지방의 야외수업을 마치고, 다시 알로라지방으로 돌아가는데…

등굣길에 이름 모를 포켓몬을 발견한 지우. 지우는 꿈에서 그 포켓몬을 봤던 사실을 기억해내고, 친구들과 함께 별구름이라는 이름을 지어준다. 그런데 잠시 뒤, 에테르재단 사람들이 찾아와서 별구름을 자신들이 맡겠다고 제안하는데...

길에서 우연히 만난 신비한 포켓몬을 ′별구름′이라고 부르며 돌보기로 한 지우와 친구들. 그런데 어느 날 수업에서 별구름이 순간이동을 할 수 있다는 사실을 알게 된다. 지우도 별구름과 함께 엉뚱한 곳으로 순간이동을 하는데...

루자미네의 초대로 에테르파라다이스를 방문한 지우 일행. 그들은 야생 포켓몬의 보호구역을 견학하며 즐거운 시간을 보낸 뒤 메타몽의 예방접종을 하는 버넷을 돕기로 한다. 그런데 주사를 무서워는 메타몽이 도망치는 사건이 발생하고, 메타몽을 잡기 위해 고군분투하는데...

어느 날 우연히 별구름에 의해 텐캐럿힐로 순간이동을 하게 된 지우. 그곳에서 글라디오를 만나 울트라비스트에 관한 대화를 나눈다. 그러던 중 지우는 글라디오에게 배틀을 하자고 제안하고, 두 사람은 배틀을 통해 서로를 더 이해하게 되는데...

쿠쿠이박사의 집에 모여서 파자마 파티를 하기로 한 지우와 친구들. 그들은 별구름의 검진을 위해 쿠쿠이박사의 집을 방문한 버넷박사와 함께 게임을 하고 저녁을 먹으며 즐거운 시간을 보내는데…

실버디를 만나 다시 포켓몬을 만질 수 없게 된 릴리에. 릴리에는 잃어버린 기억을 되찾기 위해 글라디오가 있는 곳으로 향한다. 한편, 에테르재단의 자우보는 릴리에의 기억이 돌아오면 감춰진 과거의 실수가 드러나게 될까봐 두려워 하는데…

과거의 기억이 모두 돌아온 릴리에는 포켓몬들과 함께 즐거운 시간을 보낸다. 한편, 자신의 실수가 드러나 곤란해진 자우보는 별구름을 유혹해 그 힘으로 울트라비스트를 불러내려고 하는데…

에테르파라다이스의 사건 이후 움직이지 않는 별구름. 지우와 친구들은 이런 별구름이 걱정스러운 한편, 릴리에가 글라디오와 함께 집을 나갔다는 소식을 듣게 된다. 결국 지우는 섬의 왕 할라를 찾아가 도움을 청하는데…

전설의 포켓몬 솔가레오를 만나기 위해 포니섬에 있는 일륜의 제단으로 향한 지우 일행. 하지만 좀처럼 솔가레오의 모습은 보이지 않고, 대신 카푸꼬꼬꼭을 비롯해 알로라 지방의 수호신이라 불리는 포켓몬들이 나타나는데…

솔가레오의 힘으로 울트라홀을 건너 울트라비스트의 세계에 도착한 지우와 친구들. 신비로운 광경에 감탄한 것도 잠시, 울트라비스트가 조종하는 포켓몬들이 그들을 막아서는데…

루자미네를 구하기 위해 배틀을 계속하던 지우 일행. 겨우 루자미네를 쫓아가는데 성공하지만, 울트라비스트에게 완전히 사로 잡힌 루자미네가 저항을 멈추지 않는다. 지우와 친구들은 과연 어떻게 위기를 극복할지?!

전설의 포켓몬 솔가레오와 힘을 합쳐 울트라비스트 사건을 해결한 지우와 친구들. 알로라지방에도 다시 평화가 찾아왔다. 그러던 어느 날, 지우는 쿠쿠이박사로부터 굉장한 이야기를 듣게 되는데...

어느 날, 포켓몬스쿨에서 배틀 연습을 하고 있는 지우와 친구들에게 자말라가 찾아온다. 트레이너인 오 교장으로부터 자말라와의 만남에 대한 이야기를 듣던 중, 이번엔 푸린이 찾아온다. 그런데 우연히 자말라가 푸린을 화나게 하고, 지우와 친구들은 둘을 화해시키려 하는데…

오늘은 포켓몬스쿨이 쉬는 날. 쿠쿠이박사와 버넷, 지우는 모두 외출을 하고 로토무 도감 혼자 집을 보게 된다. 그러던 중 우연한 사고로 로토무 도감은 워시로토무로 폼체인지를 하게 되고, 계속해서 스핀로토무, 히트로토무로 체인지를 멈추지 않는데... 과연 로토무는 무사히 원래 모습으로 돌아갈 수 있을까?!

어느 날 로켓단 앞에 나타난 시마사리의 첫사랑 선배. 로이는 시마사리의 행복을 위해 선배와 같이 지내라며 억지로 등을 떠민다. 하지만 시마사리는 거부하고 서럽게 울기 시작하고, 그 모습을 본 선배는 로이에게 결투를 신청하는데…

어느 날 숲에서 길을 잃은 호와 수. 집에 돌아와 커다란 포켓몬이 도와줬다는 이야기를 한다. 그 얘기를 듣고 수련은 어린시절 마오와 ′숲의 할아버지′라고 부르던 포켓몬에게 도움을 받았던 기억을 떠올린다. 지금이라도 고맙다는 인사를 전하고 싶은 두 사람은 지우와 함께 포켓몬을 찾아 나서는데…

눈 덮인 라나키라마운틴을 찾은 지우와 친구들. 그곳에서 유명한 포켓썰매점프 선수를 만나게 되고, 대회에 참가해 보라는 권유를 받는다. 과연 우승은 누가하게 될지?!

멜레멜레 화원에 갑자기 나타난 울트라비스트! 루자미네의 지시로 지우와 친구들은 ′울트라 가디언즈′가 되어 출동한다. 목적은 울트라비스트를 포획해 그들의 세계로 돌려보내는 것. 과연 지우와 친구들은 임무에 성공할 수 있을까?!

어느 날, 자신이 아껴둔 아이스크림을 로사가 먹자 화가 나 비밀기지를 뛰쳐나온 나옹. 그러다 우연히 알로라 나옹을 만나 함께 비밀기지로 가게 된다. 눈치가 빠른 알로라 나옹은 금방 로사와 로이의 마음을 사로잡지만, 나옹은 왠지 그런 녀석이 마음에 들지 않는데…

4마리의 포켓몬이 동시에 배틀하는 알로라 전통의 ′배틀로열′을 TV에서 본 지우. 배틀에 직접 참가하기 위해 친구들과 함께 경기장을 찾는다. 그곳에서 우연히 냐오불과 함께 ′로열마스크′에게 도전하는데…

장을 보러 시장에 온 지우와 피카츄. 우연히 서로 싸우고 있는 내던숭이들을 만난다. 아칼라섬과 멜레멜레섬 중 보스를 정하기 위해서라고 싸우고 있다고. 그 얘기를 듣고 지우는 멜레멜레섬의 내던숭이들을 도와주려고 하는데…

어느 날, 포켓몬스쿨에서 배틀 연습을 하고 있는 지우와 친구들 앞에 졸업생인 일리마가 나타난다. 마오와 마마네에 따르면 일리마는 포켓몬스쿨 개교 이래 최고의 수재로, 수많은 전설의 보유하고 있다고 한다. 그러자 지우는 그 전설이 뭔지 확인하기 위해 바로 일리마를 만나러 가는데...

오늘은 포켓몬스쿨에선 트레이너와 포켓몬이 함께 탁구를 치는 ′포켓핑퐁′을 배우는 날. 특별강사로 졸업생 일리마가 초대되고, 지우와 친구들은 포켓핑퐁에 도전한다! 그 후 지우와 친구들은 일리마가 참가하는 포켓핑퐁 대회를 직접 보러 가는데...

어느 날, 피카츄 앞에 베베놈이 나타난다. 베베놈은 피카츄가 신경쓰이는 눈치다. 베베놈을 따라가다 길을 잃어버린 피카츄. 피카츄를 찾으러 간 지우와 친구들은 우연히 로켓단과 베베놈을 두고 배틀을 시작하게 되는데…

오늘은 포켓몬타운에 직업체험을 하러 온 지우와 친구들. 그런데 간호순이 감기에 걸리는 바람에 지우와 친구들이 남아 포켓몬센터를 운영하게 되는데…

부모님과 캠핑을 온 마마네. 혼자 대나무숲을 산책하다 땅속에 묻혀있는 죽순처럼 생긴 물체를 발견한다. 그 물체가 옛날 이야기에 나오는 ‘화구야’라고 생각한 마마네는 지우 일행을 데리고 와서 파내기 시작한다. 그런데 루자미네에 의해 200여 년 전에 지구로 넘어온 울트라비스트였다는 사실이 밝혀지는데…

어느 날 키아웨네 목장에 리조트 회사 사장 부르갱이 찾아와 목장을 팔라고 하지만 부모님은 이를 거절한다. 그러자 부르갱은 치사한 방법을 동원해 목장 일을 방해하기 시작하고, 보다 못한 키아웨가 부르갱에게 목장 매매가 걸린 배틀을 신청한다. 하지만 키아웨가 배틀에서 이겼음에도 부르갱은 악행을 멈추지 않는데…

원래 살던 둥지를 떠나 새로 살 곳을 찾아다니던 물거미는 벌룬을 쓴 수련을 보고 동료로 착각해서 한눈에 반한다. 물거미는 수련을 따라 포켓몬스쿨에 오고, 지우 일행은 물거미를 따라다니며 관찰한다. 그리고 우여곡절 끝에 자신의 영역을 찾은 물거미를 보고 진심으로 축하해주는데…

요리를 배우기 위해 수행을 하러 갔던 마오의 오빠 우루. 어느 날 갑자기 돌아와, 허리를 삐끗한 마오의 아빠를 대신해 알로라빵 페스티벌에 나가기로 한다. 페스티벌 당일, 준비했던 재료를 모두 잃는 사고가 발생하지만, 마오의 기지로 무사히 빵을 완성하고 우승까지 거머쥔다. 하지만 우루는 자신의 부족함을 깨닫고 다시 수행을 떠나는데…

로켓단은 본부와 연락을 하던 중, 비주기로부터 울라울라섬에 가서 Z링을 손에 넣으라는 지시를 받는다. 그런데 울라울라섬에 도착한 로켓단 앞에 욕심쟁이 팬텀이 나타나 악Z를 갖고 달아나고, 팬텀을 쫓던 로켓단은 우연히 아세로라를 도와주게 된다. 그러자 그에 대한 보답으로 섬의 왕 나누는 로켓단에게 Z링을 주는데..

섬 순례를 하기 위해 울라울라섬으로 떠난 지우와 포켓몬들. 지우는 그곳에서 아세로라의 도움으로 섬의 왕인 나누를 만나고, 예비 시련을 통해 시련에 도전할 만한 실력이 있는지 시험대에 오른다. 하지만 루가루암과 같이 포켓몬 배틀에 나선 지우는 나누에게 패배하게 되고, 특훈을 하기로 결심하는데...

나누와의 배틀에서 진 지우는 특훈을 하기 위해, 아세로라의 안내를 받아 카푸브루루를 찾아간다. 카푸브루루는 처음에 그들에게 관심을 보이지 않지만 지우가 루가루암을 진심으로 대하는 모습을 보고 특훈을 해준다. 그 덕분에 루가루암은 자신의 약점을 극복하고 한층 더 성장하는데…

따라큐가 Z기술을 쓸 수 있게 되자 로켓단은 피카츄를 잡기 위해 지우를 찾아 나선다. 한편 지우는 시련에 도전하기 위해 나누를 찾았다가 로켓단과 포켓몬 배틀을 하게 된다. 지우는 강력한 Z기술을 앞세운 따라큐에게 밀리는 듯했으나, 피카츄가 새로운 Z기술을 쓰면서 승리를 거머쥐고 큰 시련에 도전할 수 있게 되는데…

울라울라섬의 섬의 왕 나누와 큰 시련 배틀을 하게 된 지우. 루가루암 1마리로 나누의 포켓몬 3마리를 상대하는 1 대 3 배틀이 시작되고, 지우는 나누의 도발에 맞서며 우여곡절 끝에 큰 시련을 클리어한다. 그리고 아세로라와 다음에 만날 날을 기약하며 울라울라섬을 떠나는데…

불꽃놀이를 즐기고 온 지우 일행은 다음날 울트라비스트가 나타났다는 연락을 받고 울트라 가디언즈로 변신해 출동한다. 그런데 2마리의 울트라비스트가 서로 화려한 퍼포먼스를 펼치는 바람에 울트라겟을 할 수 없는 상황에 놓인다. 그러자 지우 일행은 기지를 발휘해 울트라비스트의 관심을 돌리며 무사히 임무를 마치는데…

호쿠라니천문대로 야외학습을 떠난 쿠쿠이와 지우 일행. 그들은 호쿠라니천문대에서 일하는 멀레인과 메테노들을 구경하던 중, 껍데기에서 나오지 못해 우주로 돌아가지 못한 메테노를 발견한다. 다음날 무사히 껍데기에서 나온 메테노는 짧은 시간 동안 베베놈과 가까워진다. 그런데 멀레인이 메테노의 비밀을 차마 말하지 못하는 사이, 마마네는 잊고 있던 메테노와의 추억을 기억해내는데…

멜레멜레섬으로 돌아가기 위해 정기선 선착장으로 향하던 지우와 친구들. 그들은 지름길인 동굴 안으로 들어갔다가 예상치 못한 해프닝으로 뿔뿔이 흩어지게 된다. 그런데 잠시 뒤 위험에 처한 모래두지들을 발견한 릴리에는 하양이와 같이 더블배틀로 도와준 뒤, 보답으로 얼음Z를 받게 되는데…

로열마스크의 시합을 보러 간 지우 일행. 시합 도중에 리벤저스의 반칙으로 어흥염이 수세에 몰리자 냐오히트가 뛰어나가 도움을 준다. 그 일을 계기로 지우는 로열마스크와 함께 더블로열이라는 태그 팀을 이뤄 리벤저스를 상대로 태그배틀을 하게 된다. 그리고 리벤저스의 반칙에 맞서며 우승을 거머쥐는데..

포켓몬스쿨에서 포켓댄스 발표회를 하게 된 지우 일행이 각자 안무를 생각하느라 여념이 없는 가운데, 마오와 달무리나는 모아니에게 힌트를 얻어 알로라 훌라를 연습한다. 그런데 발표회 당일 포켓몬을 노린 로켓단의 습격이 시작되고, 지우 일행을 구하려 고군분투하던 달무리나가 달코퀸으로 진화하는데…

특별강사 자격으로 포켓몬스쿨을 방문한 자우보. 자우보가 직접 발명한 뭐든지 작아지게 만드는 머신으로 시범을 보이는 와중에, 지우와 마마네, 릴리에가 작아져버린다. 잠시 뒤 본의 아니게 모험을 떠나게 된 세 사람이 위험에 처하자, 울트라 가디언즈로 변신한 마오 일행이 나타나 구해주는데…

우연히 말리화를 만나게 된 지우 일행. 베베놈이 그림 그리는 걸 살펴보던 말리화는, 그 그림을 보고 베베놈이 현재 즐거운 기분이라는 걸 알려준다. 그런데 다음날 베베놈의 그림에 슬픔이 표출되고 사명을 짊어지고 있기 때문이라는 사실이 밝혀진다. 게다가 베베놈이 빛나는 그분까지 그리기 시작하자, 지우의 의아함이 더 깊어지는데…

포켓몬 스쿨에서 뜀틀을 하는 지우 일행. 서로 더 높이 뛰려고 경쟁하던 그들은 쿠쿠이에게 높은 뜀틀을 준비해달라고 한다. 그런데 쿠쿠이가 준비한 줄 알았던 뜀틀이 울트라비스트 차곡차곡이라는 게 밝혀지고, 지우 일행은 부르갱의 손에 들어간 차곡차곡을 잡아서 무사히 원래 있던 세계로 돌려보내주는데…

지친 포켓몬들의 휴식을 위해 포켓몬 파라다이스 리조트를 찾은 지우 일행. 그런데 즐거운 시간을 보내던 그들 앞에 리조트 직원으로 변장한 로켓단이 나타나 포켓몬들을 잡아간다. 하지만 라이드포켓몬들의 도움으로 포켓몬들은 무사히 구출되고, 지우 일행은 다시 온천을 즐기기 시작하는데…

개기일식 날에 열리는 마나로축제를 앞둔 가운데, 쿠쿠이 박사를 포함한 어른들이 의욕 없이 나른한 모습을 보인다. 그때 울트라 가디언즈의 출동명령이 내려지고, 지우 일행은 일륜의 제단으로 향한다. 그런데 울트라홀에서 갑자기 루나아라가 나타나고, 그 뒤를 이어 정체를 알 수 없는 울트라비스트가 나타나는데…

UB:BLACK은 루나아라와 치열한 전투를 벌이던 중 루나아라를 흡수한다. 그런데 그때 솔가레오가 나타나 루나아라를 구해내지만, UB:BLACK이 솔가레오를 흡수한 채 끌고 가버린다. 한편 데미지를 입은 루나아라는 지우와 친구들이 비밀기지로 데려가 치료를 해준 덕분에 다시 기운을 차리는데…

솔가레오를 구하기 위해 루나아라와 같이 울트라홀 너머로 가기로 결심한 지우 일행은 황폐해진 베베놈들이 사는 세계에 도착한다. 그들은 거기서 UB:BLACK인 네크로즈마가 부활하지 않으면 그 세계를 구할 수 없다는 사실을 알게 된다. 그래서 Z파워를 이용해 네크로즈마를 부활시키기로 결심하는데…

Z파워를 이용해 네크로즈마를 부활시키는 데 실패한 지우 일행. 그들은 곧 루자미네를 통해 알로라의 모든 사람 및 포켓몬의 힘이 필요하다는 사실을 알게 되고, 수호신 포켓몬을 따라 네크로즈마에게 힘을 보내기 시작한다. 그리고 마침내 네크로즈마인 빛나는 그분을 원래 모습으로 되돌리는데…

피카츄들이 모여 있는 골짜기를 찾아간 지우 일행은 그곳에서 피카츄를 좋아하는 피카라를 만난다. 피카라는 그들을 피카츄처럼 꾸며준 뒤 피카어를 사용할 것을 당부한다. 지우 일행이 피카츄에 대해 새로운 사실을 알아가며 즐거운 시간을 보내던 중, 지우의 피카츄를 노리는 로켓단이 골짜기를 습격하는데…

로열마스크가 악수회를 위해 멜레멜레섬에 온다는 소식을 들은 지우와 버넷은 쿠쿠이에게 같이 가자고 청한다. 쿠쿠이는 고민 끝에 멀레인을 잠시 로열마스크의 대역으로 내세운 뒤 자신은 버넷 옆에 있기로 한다. 그런데 악수회 당일, 로이와 자우보는 멀레인이 로열마스크의 마스크를 훔쳤다고 오해한 나머지 그를 밧줄로 묶어버리는데…

포켓몬스쿨에서 연극 공연을 하게 된 지우 일행. 가족들이 참관하는 가운데 모두 무대에 올라 각자 맡은 역할을 연기하기 시작한다. 그런데 그때 연기에 대한 열정이 넘치는 로사가 무대에 난입하면서, 로토무는 어쩔 수 없이 대본을 수정해서 연극을 이어가는데…

귀신의 집에 가고 싶어 하는 호와 수. 하지만 멜레멜레섬에 귀신의 집이 없다는 사실을 아는 수련은 고민하기 시작하고, 마침 포켓몬스쿨을 방문한 아세로라가 귀신의 집을 직접 만들 것을 제안한다. 그런데 호와 수가 귀신의 집 체험을 하며 즐거워하는 사이, 고스트포켓몬들이 몰려들기 시작하는데…

루자미네의 호출을 받은 울트라 가디언즈는 자기 이상 원인에 대해 조사해달라는 부탁을 받고 벨라화산으로 출동한다. 잠시 뒤 센서에 자기 이상이 감지되고 데구리 일행이 모여 있는 광경을 보게 된다. 그리고 곧 그들이 암석 헌터들에게 쫓겨나 먹이인 스파크스톤을 찾아 지상으로 나왔다는 사실이 밝혀지는데…

심부름을 할 겸 에테르파라다이스를 찾은 지우. 지우는 오랜만에 보호구역에 있는 포켓몬들을 보며 즐거운 시간을 보낸다. 같은 시각 에테르파라다이스에 잠입한 로켓단은 포곰곰이 따라오는 바람에 도둑으로 몰리게 된다. 그러자 지우는 포곰곰을 돌려받기 위해 배틀을 시작하고, 그 순간 이븐곰이 나타나는데…

우연히 할라의 손자인 하우와 빼미스로우가 특훈을 보게 된 지우. 지우는 자극을 받고 나몰빼미와 함께 배틀을 청하지만, 결국 Z기술을 쓰지 못하는 바람에 패배하고 만다. 뒤늦게 의지를 불태우는 나몰빼미와 지우는 새로운 기술을 익히기 위해 둘이 처음 만났던 곳으로 향하는데…

인기 드라마 ‘알로라 탐정 라키’의 촬영을 구경하던 지우와 로토무. 그러던 중 로토무는 새로운 캐릭터를 찾고 있던 프로듀서의 눈에 띄어서 출연 제의를 받게 된다. 그러자 로토무는 물론 지우도 들뜬 마음을 감추지 못한다. 그런데 해외 촬영을 위해 지우와 로토무는 이별을 해야 할 상황에 처하게 되는데…

혼자 있는 것에 외로움을 느낀 물결. 물결은 피카츄 일행을 찾아 나섰다가 알로라페르시온에게 위협을 받고 전력을 다해 도망치기 시작한다. 그 모습을 본 누리공은 물결을 돕기 위해 나섰다가 같이 도망치게 된다. 한편 지우와 친구들은 갑자기 없어진 누리공을 찾아 나서는데…

포켓몬스쿨에 가는 도중에 카푸꼬꼬꼭을 만난 지우. 지우는 기뻐하며 배틀을 청하고, 카푸꼬꼬꼭을 따라 숲으로 들어가 배틀을 한다. 그런데 잠시 정신을 잃었다 눈을 뜬 순간, 피카츄와 함께 악식킹에게 쫓기기 시작한다. 그때 디아와 제라오라가 나타나 그들을 구해주는데…

디아의 설명으로 평행세계에 왔다는 사실을 알게 된 지우. 지우는 악식킹을 원래 세계로 돌려보내고 폐허가 된 마을을 예전 모습으로 되돌리려는 디아를 돕기로 결심한다. 지우와 디아는 결국 악식킹을 울트라홀에 집어넣는 데 성공하고, 지우는 원래의 세계로 무사히 돌아오게 되는데…

연휴를 앞둔 지우와 친구들. 설레는 마음으로 계획을 세우고 있을 때, 웅과 이슬이 포켓몬스쿨에 나타낸다. 오랜만에 만난 두 사람과 반가운 인사를 나눈 지우 일행은, 알로라의 이곳저곳을 안내하며 즐거운 시간을 보내는데…

라이치를 만날 생각에 들뜬 웅은 지우 일행과 함께 아칼라섬으로 향한다. 우여곡절 끝에 라이치를 만난 웅은 감격에 겨워 기뻐하고, 라이치는 웅이 체육관 관장이었다는 말을 듣고 배틀을 청한다. 잠시 후 웅과 라이치가 배틀을 하던 도중에 로켓단이 습격하자, 둘은 힘을 합쳐서 물리치는데…

자유 연구를 하기 위해 포니섬을 찾아온 지우 일행. 지우는 큰 시련에 도전하기 위해 카푸느지느를 찾아 나섰다가 밭에서 일하고 있는 골루그를 보고 다가간다. 그러자 하푸우는 포니무를 훔치러 온 도둑으로 오해하고 공격하기 시작하는데…

각자 포니섬의 자유 연구를 위해 열심히 노력하는 지우 일행. 지우는 하푸우를 찾아가 자신과 배틀을 해달라고 청해보지만 거절당한다. 그러던 중 포니섬에 와있던 글라디오를 만나게 되고, 글라디오는 루가루암끼리 배틀을 하자고 제안하는데…

전지충이를 진화시키기 위해 포니의 협곡을 찾은 마마네. 마마네는 그곳에서 전지충이 레이스에서 만난 신철을 만나 진화가 걸린 승부를 하게 되고, 우여곡절 끝에 전지충이의 진화에 성공한다. 한편 긴 여행을 떠나는 이아에게 최고의 기술을 선보이고자 수련과 같이 노력하던 누리공도 진화의 순간을 맞이하는데…

지우는 자신과 마찬가지로 카푸느지느와 배틀을 하고 싶어 하는 키아웨와 함께 피안의 유적으로 카푸느지느를 찾아 나선다. 그곳에 도착한 두 사람은 카푸느지느를 불러내기 위해 배틀을 시작하고, 잠시 뒤 분노한 카푸느지느가 모습을 드러내는데…

죽은 사람을 만나게 해주는 신비한 힘을 가진 카푸느지느. 지우 일행은 하푸우의 집에 놀러가서 밭일을 돕던 중에 자욱한 안개에 휩싸인다. 그 안갯속에서 마오와 냐오히트, 하푸우는 각자 그리워하던 상대를 만나 귀중한 체험을 하게 된다. 그런데 이상하게 릴리에의 아버지는 모습을 드러내지 않는데…

카푸느지느의 인정을 받아 포니섬의 섬의 여왕이 된 하푸우. 그 모습을 지켜본 지우는 진심으로 축하한 뒤 곧바로 큰 시련에 도전하겠다고 한다. 그리고 그날 밤, 바닷물이 빠지며 나타난 배틀필드에서 지우는 피카츄와 함께 하푸우의 만마드를 상대로 큰 시련 배틀을 시작하는데…

최근 연패 중으로 인해 슬럼프에 빠진 포켓골프 선수 카일리. 고향인 알로라를 찾은 카일리는 기자들을 피해 달아나다 우연히 포켓몬스쿨의 지우 일행을 만난다. 그러자 그들은 카일리를 반기며 함께 포켓골프를 치자고 청하는데…

포니섬에서 지우 일행의 배를 타고 멜레멜레섬에 도착한 멜탄들. 잠시 뒤 그들은 하수구에 빠지는 바람에 두 그룹으로 나뉘어 한 그룹은 로켓단의 기지로 가고, 다른 그룹은 포켓몬스쿨로 오게 된다. 지우 일행은 공구함에 들어있는 멜탄들을 보고 신종 포켓몬을 발견했다며 흥분하는데…

무리에서 떨어진 멜탄과 같이 있게 된 나몰빼미. 나몰빼미는 이런저런 우여곡절 끝에 멜탄을 지켜주기 위해 노력하고, 멜탄도 위험한 순간에 나몰빼미를 구해준다. 그러는 동안 둘 사이에는 끈끈한 유대감이 생기고, 멜탄은 자신의 동료들이 아닌 나몰빼미의 곁에 남고 싶어 하는데…

퀴즈 프로그램에 출연한 마마네를 응원하기 위해 방송국을 찾은 지우와 친구들. 그들은 그곳에서 우연히 조지님을 만나 잉어냐의 촬영 현장을 구경한다. 그러던 중 새로운 드라마에 출연하기로 했던 여배우들이 못 오게 됐다는 연락을 받은 조지는 마오와 수련, 릴리에에게 대신 출연해줄 것을 부탁하는데…

Z크리스탈을 노리는 울트라비스트 페로코체를 잡기 위해 출동한 울트라 가디언즈. 하지만 놀랍도록 빠른 스피드를 자랑하는 페로코체를 놓치고 많다. 한편 나옹은 로켓단의 Z크리스탈을 빼앗기 위해 접근한 페로코체를 보고 한눈에 반하게 되는데…

기자회견장에서 알로라 포켓몬리그 개최를 선언한 쿠쿠이. 지우 일행을 비롯해 그 소식을 들은 모든 사람들이 기뻐하는 가운데 스컬단의 보스 구즈마만이 불편한 심기를 드러낸다. 구즈마는 곧장 포켓몬리그 개최를 막기 위해 쿠쿠이를 찾아가지만, 지우가 앞으로 나서며 배틀을 하자고 제안하는데…

루자미네가 처음으로 보여준 아버지의 방에서 Z링과 마기아나를 발견한 릴리에. 릴리에는 할라 앞에서 완벽하지 않은 Z기술을 선보였음에도 불구하고 임시로 Z링을 쓸 수 있도록 허락받는다. 그리고 잠시 뒤 다시 찾은 아버지의 방에서 마기아나에 관한 연구 내용이 담긴 노트를 발견하는데…

관광을 하기 위해 울라울라섬의 말리에시티를 찾은 지우 일행. 그들은 동양적인 정취가 가득 느껴지는 곳에서 즐거운 시간을 보내던 중에 쉐이미와 멜탄, 물결이 사라졌다는 사실을 알고 서둘러 찾아 나선다. 한편 그 모습을 지켜보던 로켓단은 자신들이 중간에서 포켓몬들을 가로채려 하는데…

대롱의 안내를 받으며 체육관오브관동을 방문한 지우 일행. 그들은 체육관 시합을 하기 위해 건물의 각 층을 지키고 있는 닌자들이 제시하는 게임을 하기 시작하고, 우여곡절 끝에 지우와 키아웨만이 최상층에 다다른다. 그리고 잠시 뒤에 닌자들의 두목인 용규가 모습을 드러내는데…

지우 일행의 응원을 받으며 투구뿌논 레이스에 출전한 마마네. 마마네는 어두운 동굴 코스에서 패닉 상태에 빠지지만 자신을 위해 애쓰는 투구뿌논의 모습을 보고 공포를 극복한다. 그런 와중에 로켓단의 습격을 받은 투구뿌논들이 위기에 처하자, 마마네는 그들을 무사히 구해내는데…

바다에서 낚시를 하던 지우와 수련 앞에 나타난 가이오가. 지우와 수련은 가이오가가 포켓몬헌터들에게 쫓기고 있다는 사실을 알게 되고, 그들을 물리쳐 가이오가를 위험한 상황에서 구해준다. 하지만 분노가 가라앉지 않은 가이오가는 폭주하기 시작하는데…

아버지 심부름으로 하랑우탄의 카페에 간 마오. 마오는 카페 안이 포켓몬 손님들로 북적이기 시작하자 팔을 걷어붙이고 돕기 시작한다. 그러던 중, 카푸꼬꼬꼭이 카페를 찾아오고 마오는 정성스레 요리를 만들어 대접한다. 잠시 뒤 카푸꼬꼬꼭은 마오의 요리를 인정하고 풀Z를 주는데…

이븐곰을 잡았다고 거짓 보고를 했던 로켓단 로이, 로사, 나옹에게 이븐곰을 본부로 보내라는 명령이 떨어진다. 잠시 뒤 당황하는 그들 앞에 마트리가 찾아오지만, 그들은 포켓몬을 잡기 위해 이븐곰의 힘이 필요하다며 상황을 모면한다. 그러자 마트리는 그 포켓몬을 잡을 때까지 로켓단을 감시하겠다고 선언하는데…

마마네는 Z기술을 마스터하기 위해 키아웨의 집 근처에서 합숙을 하며 특훈을 시작한다. 그리고 키아웨와 지우의 강행군에 지쳐 포기하려고도 하지만, 의욕적인 투구뿌논의 모습을 보며 마음을 다잡는다. 그러던 중, 가재장군의 습격을 받고 전력을 다해 배틀에 임하기 시작하는데…

지우 일행은 자신들도 모르게 주변에 있는 물건들이 베어진 것을 보고 의아함을 느낀다. 잠시 후, 울트라비스트인 종이신도의 소행이었다는 게 밝혀지고, 루자미네는 종이신도를 막으라는 지시를 내린다. 그런데 지우 일행이 종이신도를 잡기 위해 고군분투하는 사이에 운석이 떨어지기 시작하는데…

포켓몬리그에 대비해 특훈을 하고 있던 지우는 세레비의 시간이동에 휘말려서 과거의 세계로 가게된다. 그곳에서 꼬마 쿠쿠이를 만난 지우. 지우는 포켓몬에 대한 열정이 가득한 꼬마 쿠쿠이와 시간을 보내면서, 포켓몬마스터가 되겠다는 자신의 꿈을 밝히는데…

특훈을 하던 중에 세레비의 시간이동에 휘말려 과거로 가게 된 지우와 냐오히트. 그러자 피카츄 일행은 온갖 고난을 겪으며 지우와 냐오히트를 찾아 헤매기 시작한다. 무사히 현재의 세계로 돌아온 지우는 피카츄 일행을 만나 재회의 기쁨을 나누던 것도 잠시, 엉망이 된 모습을 보며 의아하게 생각하는데…

릴리에는 자신의 집에 온 지우와 친구들에게 마기아나를 소개하고, Z기술을 습득하기 위해 특훈에 열중한다. 한편, 하푸우의 큰 시련을 클리어한 글라디오는 조로아크를 찾아내, 함께 힘을 합쳐서 아버지를 찾아보자고 하는데…

포켓몬리그가 열리는 마나로 스타디움에 도착한 지우 일행. 그들은 리그가 시작되기 전에 전의를 다지고 주변을 둘러보기로 한다. 리그 참가자들이 속속 모여드는 가운데 스컬단이 나타나 리그를 망치기 위해 방해하기 시작하는데…

마나로 스타디움에 151팀의 트레이너와 포켓몬들이 모여서 포켓몬리그의 예선 배틀로열이 치러진다. 알로라 각지에서 모여든 참가자들과 함께 격렬한 배틀을 펼친 지우 일행은 무사히 결승 토너먼트에 진출하게 되는데...

지우와 자우보의 배틀을 시작으로 결승 토너먼트가 차례로 치러지고, 드디어 마오와 수련의 배틀이 시작된다. 그런데 힘들어하는 달코퀸을 위해 마오가 배틀을 도중에 포기하려고 한다. 그러자 이를 눈치 챈 수련이 말리고 나서는데…

어느덧 중반을 넘어선 결승 토너먼트의 1회전 시합. 다섯 번째 시합인 마마네와 말리화의 배틀이 시작되고, 각자 투구뿌논과 에리본을 내세운 치열한 공중전 끝에 마마네가 승리를 거둔다. 그 뒤로 펼쳐진 로사와 로이의 배틀에서, 로이는 일부러 져주기로 했던 약속을 어기고 진지하게 배틀에 임하기 시작하는데…

지우는 하우와의 배틀을 앞두고 나몰빼미, 피카츄와 함께 특훈에 열중한다. 한편 2회전의 첫 번째 시합에 나선 글라디오와 로이. 두 사람의 치열한 배틀은 글라디오의 승리로 막을 내린다. 잠시 뒤 특훈을 마치고 아슬아슬하게 경기장에 도착한 지우의 2회전 배틀이 시작되는데...

지우 대 하우의 2회전 두 번째 배틀. 나몰빼미와 모크나이퍼는 공중에서 대결을 펼치기 시작하고, 고전을 면치 못하던 지우는 하우에게 승리를 내준다. 그러나 할라의 이의 제기로 인해 다시 배틀이 시작되고, 결국 지우가 승리를 차지하며 준결승 진출을 확정 짓는데…

키아웨와 마마네의 2회전 세 번째 시합. 리자몽과 투구뿌논(F)을 내세워 전력을 다해 치열한 공방을 펼치던 가운데 결국 키아웨가 승리를 거머쥔다. 이어진 2회전 마지막 시합에서는 수련 역시 전력을 다해 배틀에 임하지만, 실력 차이로 인해 구즈마에게 패배하고 마는데…

드디어 시작된 알로라 포켓몬리그의 준결승. 키아웨와 글라디오가 첫 번째 시합을 앞둔 가운데, 키아웨를 응원하기 위해 오하이가 마나로 스타디움을 찾는다. 그리고 잠시 뒤 오하이와 릴리에의 열렬한 응원을 받으며 키아웨와 글라디오의 치열한 배틀이 시작되는데…

키아웨는 치열한 배틀을 벌인 끝에 글라디오에게 결승행 티켓을 내주지만, 지우 외에 또 다른 라이벌이 생겼다는 사실을 순순히 받아들인다. 그리고 이어진 지우와 구즈마의 준결승 두 번째 시합. 구즈마는 갑주무사로 인해 핫삼이 시합 불가능 상태에 빠지자 불같이 화를 내기 시작하는데…

후반전에 접어든 지우와 구즈마의 준결승. 치열한 배틀이 펼쳐지는 가운데, 불리한 상황에 처하게 된 구즈마는 평소처럼 도망쳐버리고 싶은 마음이 들기 시작한다. 하지만 물러서지 않는 갑주무사를 보며 끝까지 맞서 싸우기로 결심하는데…

알로라 포켓몬리그의 결승을 앞둔 지우는 멜탄이 진화하는 장면을 목격한다. 다음날 드디어 지우와 글라디오의 배틀이 시작되고, 두 사람은 각각 멜탄의 진화형인 멜메탈과 실버디를 첫 번째로 내세워 치열한 대결을 펼치는데…

알로라 포켓몬리그의 결승전에서 맞붙은 지우와 글라디오. 두 사람은 멜메탈과 피카츄, 실버디와 조로아크에 이어 각자의 루가루암을 내새워 대결을 펼친다. 잠시 후 치열한 접전 끝에 결국 지우가 초대 챔피언이 되는 영광을 차지하는데…

알로라 포켓몬리그에서 우승을 차지한 지우가 모두의 축하를 받는 사이에, 울트라홀에서 나온 악식킹 3마리가 난동을 부리기 시작한다. 지우 일행은 관중들을 안전하게 대피시킨 후, Z기술을 이용해 악식킹들을 울트라홀로 무사히 돌려보내는데…

로열마스크가 쿠쿠이였다는 사실에 놀란 것도 잠시, 지우는 이벤트 배틀에 대비하기 위해 연습에 열중한다. 드디어 막이 오른 지우와 쿠쿠이의 이벤트 배틀. 두 사람은 각각 냐오히트와 어흥염을 내세워 첫 번째 대결을 펼치기 시작하는데…

이벤트 배틀에서 풀배틀을 펼치는 지우와 쿠쿠이. 두 사람은 상황에 따라 포켓몬을 교대해가며 엎치락뒤치락 대결을 이어간다. 그러던 중 쿠쿠이가 루카리오를 내보내자, 그게 맞서 지우는 아고용을 내보내는데…

치열한 공방전을 벌이던 아고용과 루카리오의 대결은 결국 아고용의 승리로 막을 내린다. 곧이어 시작된 냐오히트와 어흥염의 대결. 파워업한 냐오히트는 어흥염을 쓰러뜨리며 다운시킨 뒤, 어흥염으로 진화하기 시작하는데…

이벤트 배틀에 나타난 카푸꼬꼬꼭은 지우와 배틀을 하고 싶다고 어필한다. 쿠쿠이와 팀을 이룬 카푸꼬꼬꼭을 상대로 지우는 아고용과 피카츄를 차례로 내보낸다. 치열한 배틀을 치른 결과, 지우는 알로라 포켓몬리그에 이어 이벤트 배틀에서도 승리를 거머쥐는데…

알로라 포켓몬리그를 마친 지우는 여유로운 나날을 보내고 있다. 그러던 중 쿠쿠이가 지우와 친구들에게 곧 방학을 한다는 사실을 알리며, 뭘 하고 지낼지 생각해 보라고 한다. 저마다 확실한 계획을 세운 친구들과 달리, 지우는 뭘 해야 할지 고민하는데…

마기아나의 눈을 뜨게 하는 데 성공한 릴리에는 아버지를 찾아 여행을 떠나겠다고 선언한다. 나머지 친구들은 릴리에를 위해 서프라이즈 파티를 준비하지만, 뒤늦게 온 지우가 태초 마을로 돌아가겠다는 결심을 밝히자 놀라움을 감추지 못 하는데…

관동 지방의 어느 숲속에는 외톨이 피츄가 있었다. 아직 어린 피츄는 우연히 캥카 모자를 만나 즐거운 나날을 보낸다. 어느덧 시간이 지나 어미캥카가 힘들어하는 모습을 보고 피츄는 캥카 모자 곁을 떠나려고 하는데, 그 순간 피카츄로 진화한다. 한편 지우는 오박사의 포켓몬캠프에 참가하려고 하지만 늦잠을 자는데…

채박사 연구소 오픈 기념행사에 참석하게 된 지우와 피카츄. 그곳에서 지우는 전설의 포켓몬인 루기아를 만나게 된다. 루기아의 등에 올라탄 지우는 가까스로 매달려 있던 고우와 함께 루기아를 타고 하늘과 바닷속을 탐험하면서 즐거운 시간을 보내는데…

관동지방에 있는 채박사 연구소의 조사 연구원이 된 지우와 고우. 첫 번째 일은 마을에 잔뜩 모여든 이상해풀을 조사하는 것. 바로 거리에 나가보니 이상해풀 무리는 어떤 장소를 향해 가고 있었다. 그리고 지우와 고우는 이상해씨, 이상해풀, 이상해꽃의 새로운 생태를 보게 되는데…

포켓몬 거대화 현상이 일어나는 가라르지방에 대해 알게 된 고우와 지우. 채박사의 허락을 받고 가라르지방으로 출발한다. 와일드에리어로 가는 열차를 기다리는 그들의 앞에 나타난 염버니와 훔처우들이 지우의 배낭을 들고 도망치면서 추격전이 벌어지는데…

포켓몬 거대화 현상을 조사하기 위해 가라르지방에 와있는 지우와 고우. 조용하고 평온한 초원이 펼쳐진 와일드에리어에서 커다란 잠만보를 만나고, 슛시티에서 만났던 염버니가 고우를 따라서 와일드에리어에 오는데…

지우와 고우는 스마트로토무에 도감 기능이 있다는 사실을 알게 된다. 고우는 도감을 채우겠다며 새로운 포켓몬이 보이는 족족 몬스터볼을 던진다. 도감이 채워질 때마다 기뻐하는 고우와 염버니. 그러던 중, 콘팡과 대결을 하던 염버니가 독가루에 맞고 괴로워하는데…

호연지방에서 열리는 ‘배틀프런티어 비드로컵’에 참가한 지우와 고우. 포켓몬 배틀이 처음인 고우의 상대는 용암마을에서 온 봉준이다. 그라에나를 내보낸 봉준을 상대로 고우는 상성이 좋은 스라크로 도전한다. 그런데 순식간에 패배하며 실의에 빠진다. 한편, 지우는 배틀에서 계속 이기며 결승에 진출하는데…

바다에서 포켓몬을 잡고 있던 지우와 고우. 바닷속에서 무엇인가가 그들을 향해 빠른 속도로 헤엄쳐 온다. 그들의 앞에 나타난 건 수척하고 핼쑥한 모습의 팽도리였다. 팽도리의 주인이 선단시티에 사는 세희라는 사실을 알게 된 지우와 고우는 팽도리를 데려다주러 갔다가 그곳에서 유빙 레이스에 참가하게 되는데…

성도지방 인주시티에서 전설의 포켓몬, 칠색조를 보았다는 이야기를 들은 지우와 고우. 두 사람은 인주시티에 도착하자마자 칠색조로 보이는 포켓몬을 발견한다! 하지만 그건 규호가 꾸민 가짜 칠색조였고, 규호는 할아버지에게 꼭 칠색조를 보여드리고 싶다고 말한다.

채박사로부터 망나뇽만 사는 섬에 대해 들은 지우와 고우. 그들은 망나뇽을 만나기 위해 바다로 나갔다가 조난되고 만다. 망나뇽의 도움으로 망나뇽의 섬에 도착한 두 사람은 그곳에서 날지 못하는 신뇽을 도와주기로 하는데…

채박사님의 딸인 하루는 포켓몬에게 별로 관심이 없지만, 멍파치는 하루를 좋아하고 잘 따른다. 한편 하루는 ‘포켓몬 박사의 딸이니까 포켓몬을 좋아하는 게 당연하지!’라는 주위의 시선이 신경 쓰인다. 그러던 중 채박사 연구소에 모두를 당황하게 한 팬텀이 나타나는데…

채박사로부터 포켓몬 월드 챔피언십 결승전 티켓을 받은 지우와 고우는 기대를 안고 가라르지방으로 향한다. 긴장감과 환호 속에서 관동지방 챔피언인 목호와 가라르지방 챔피언인 단델의 대결이 시작된다. 팽팽하게 맞서던 두 사람은 포켓몬을 거대하게 만드는 다이맥스를 이용해 배틀을 시작하는데…

경기장에서 날뛰는 거다이맥스 갈가부기. 지우와 고우가 갈가부기를 상대하는 도중에 피카츄가 거다이맥스를 한다. 단델의 도움으로 갈가부기를 이긴 지우는 단델에게 배틀을 하고 싶다고 말한다. 단델은 지우를 테스트하기 위해 배틀에 응하는데…

하나지방, 리조트데저트에서 발견된 거신의 유적. 지우과 고우는 그 수수께끼를 풀기 위해 조사하러 간다. 뜨거운 사막을 너머 도착한 유적에서 그들을 기다리는 것은 수많은 함정이었다. 지우가 함정에 빠진 순간, 사막을 건너기 전에 만났던 키일라가 구해준다. 모험을 좋아하는 키일라는 하나씩 수수께끼를 풀어나가는데…

연구소의 시스템 고장으로 집으로 가게 된 지우와 고우. 집에 도착한 고우는 부모님이 늦게 온다는 전화를 받는다. 그리고 부모님께 스튜를 갖다 주기 위해 공원을 지나가다 망키에게 괴롭힘을 당하는 탕구리를 발견한다. 망키가 탕구리의 뼈다귀를 빼앗아가자 되찾아주겠다며 나서지만 감쪽같이 숨어버린 망키를 찾기란 쉽지 않은데…

요즘 들어 채박사 연구소에서 물건이 부서지고, 방이 어질러지는 이상한 현상이 일어나고 있다. 범인은 예전에 연구소에 나타났었던 팬텀이었다. 지우와 고우는 이번에야말로 팬텀을 잡겠다며 의욕을 불태운다. 그러던 와중에 지우에게 계속 안 좋은 일이 일어나고, 고우는 팬텀의 저주에 걸린 게 아니냐며 겁을 주는데…

채박사 파크에서 배틀 연습을 하던 지우와 고우. 갑자기 나타난 불비달마가 염버니를 자극한다. 자존심이 상한 염버니는 어떻게든 불꽃 기술을 익히려고 안간힘을 쓰지만, 좀처럼 나아지지 않는다. 그로 인해 염버니와 고우의 사이는 조금씩 삐걱거리기 시작하는데…

포켓몬 월드 챔피언십에 도전하는 지우. 단숨에 순위를 높이기 위해서는, 랭킹의 상위에 있는 사람을 꺾어야 한다. 지우는 랭킹 상위에 있는 비스케스를 꺾기 위해 갈색체육관을 찾아간다. 두 사람은 한 치의 양보도 없이 치열한 배틀을 이어가는데…

영화 촬영장에 간 지우와 고우. 그곳에는 제대로 변신하지 못해 감독에게 혼나는, 슬럼프에 빠진 메타몽이 있었다. 촬영장에서 도망친 메타몽은 근처에 있던 로사의 가방에 숨어 로켓단의 아지트까지 간다. 로사는 여배우로서 메타몽을 단련시켜주겠다고 선언하고, 지우와 고우는 사라진 메타몽을 찾아 나서는데…

채박사 연구소에서 개최하는 포켓몬오리엔티어링에서 리더 역을 맡은 지우와 고우. 참가한 아이들과 함께 포켓몬 배틀과 포켓몬을 잡는 즐거움에 흠뻑 빠진 두 사람은 다시 한번 각자가 이루고 싶은 꿈을 확인한다. 그러던 그때 로켓단이 나타나서 포켓몬을 빼앗아가려고 하는데…

아직 밝혀지지 않은 비밀이 많은 포켓몬 알. 아직 알을 본 적이 없는 고우는 흥미진진해 하며 지우와 포켓몬 알을 찾으러 나선다. 하지만 알은 그렇게 쉽게 발견되지 않고, 두 사람은 포켓몬센터에서 오랫동안 부화되지 않은 신기한 알을 만나게 된다. 지우는 간호순의 부탁으로 그 알을 맡게 되는데...

지우와 고우는 뷰티플라이의 대이동을 관찰하기 위해 미로마을로 향한다. 뷰티플라이를 관찰하기 위해 애를 쓰는 가운데, 무심한 래비풋의 행동에 점점 지쳐가는 고우. 그러던 중 밤마다 어디론가 향하는 래비풋을 몰래 쫓아간 고우는 뜻밖의 광경을 목격하는데...

채박사 파크가 소란스럽다. 포켓몬들에게 나눠준 포켓몬 푸드가 사라지면서 포켓몬들이 싸우기 시작한 것이다. 지우와 고우는 범인을 찾기 위해 채박사 파크에서 밤새 지켜보기로 한다. 포켓몬들의 싸움은 점점 심해지고, 그런 와중에 카스쿤들이 진화할 징조를 보인다. 그때 골루그의 봉인이 벗겨지고 폭주하기 시작하면서 채박사 파크는 혼란에 빠지는데...

연못에 주인 포켓몬이 있다는 말을 듣고 신오지방 리조트에리어로 향하는 지우와 고우. 연못에서 낚시하고 있을 때, 호텔 쪽에서 시끄러운 소리가 들려온다. 호텔에 있는 포켓몬을 모조리 잡아들이는 비주기의 비서인 마트리와 싸우던 도중, 피카츄를 빼앗기고 마는데…

칼로스지방에서 열리는 배틀 페스티벌에 참가한 지우. 포켓몬 월드 챔피언십의 참가자가 많이 모이는 이 대회는 순위를 올릴 수 있는 절호의 기회다. 순조롭게 배틀에서 이기던 지우는, 예전에 칼로스지방에서 배틀했던 체육관 관장 코르니와 수퍼클래스 달성을 놓고 다시 배틀하게 되는데...

잉어킹 하이점프 대회에 나가기 위해 잉어킹과 훈련을 시작한 고우. 피나는 노력으로 대회에 나가 결승전에 오르지만, 뜻밖의 상황이 벌어진다. 한편, 야돈의 섬에 가게 된 지우와 고우. 컵라면을 먹는 지우의 앞에 야도킹이 나타난다. 지우의 컵라면을 먹은 야도킹은 감격하며 셀러를 벗어버리고, 그 셀러를 뒤집어쓴 지우가 이상한 말을 하기 시작하는데…

포켓몬 월드 챔피언십 공식 시합을 보기 위해 가라르지방에 간 지우와 고우. 두 사람은 최강의 제왕 단델과 가라르지방 드래곤타입의 체육관 관장인 금랑의 배틀에 가슴이 설렌다. 시합이 끝난 뒤, 두 사람은 우연히 만난 소니아에게 가라르지방의 영웅전설을 듣게 된다. 그리고 다리 위에서 트레이너들에게 배틀을 신청하는 가라르지방 모습을 한 파오리와 만나게 되는데...

가라르지방에서 아침 식사를 하던 지우와 고우는 겁쟁이에 울보인 울머기를 만나게 된다. 고우는 모습을 감추고 도망친 울머기를 우연히 잡지만, 울머기는 무리한 배틀을 두려워하며 또 도망친다. 울머기를 찾아 헤매던 지우와 고우는 로켓단에게 납치된 울머기를 발견하는데...

한가로운 휴일, 멍파치가 채박사 집의 창문에 부딪혀서 다친 콩둘기를 데려온다. 하루 엄마와 하루, 두루는 콩둘기의 귀여움에 푹 빠져 콩둘기가 날 수 있을 때까지 돌봐주기로 한다. 그런데 하루마저 콩둘기를 예뻐하자 멍파치의 질투심이 폭발한다. 그러자 채박사는 어렸을 때 하루가 멍파치를 질투했고, 그러다 둘이 친해진 계기에 대해 이야기 해주는데...

포켓몬 월드 챔피언십의 랭킹을 올리기 위해 한창 컨디션이 좋은 리오르와 특훈에 정신이 없는 지우. 리오르만 챙기는 지우에게 화난 피카츄는 집을 뛰쳐나가고, 마임맨은 피카츄를 데려오기 위해 따라간다. 하지만 마임맨이 아무리 설득해도 피카츄는 고집을 꺾지 않는데...

지우와 친구들은 친구들이 자신의 포켓몬을 무시해서 고민에 빠진 두루의 친구, 나미를 만난다. 나미의 포켓몬은 세상에서 제일 볼품없다고 알려진 빈티나였다. 워터페스티벌 콘테스트에 나가서 우승하면 친구들도 인정해 줄 거라며 나미와 빈티나의 특훈을 돕는 지우와 친구들. 그런데 콘테스트 당일, 로켓단이 나타나서 방해하는데…

성도지방 고동마을로 가족 여행을 가게 된 고우. 하지만 왠지 마음이 내키지 않는 표정이다. 그는 잠든 부모님을 두고 숲으로 갔다가 옛날 기억에 젖는다. 3년 전, 고우는 숲에서 만난 시웅과 함께 세레비를 만나기 위해 숲속을 돌아다닌다. 다음날 또 만나기로 했지만 시웅은 나타나지 않았는데…

갈색시티 포켓몬센터에서 포켓몬 교환 이벤트를 한다는 얘기를 들은 지우와 고우는 즉시 이벤트에 참가한다. 그들은 그곳에서 또미를 만나는데, 또미는 자신의 헤라크로스와 고우의 쁘사이저를 교환하고 싶어 한다. 고우는 고민 끝에 포켓몬을 교환하지 않고, 또미가 쁘사이저 잡는 걸 도와주기로 하는데…

지우와 고우는 포켓몬 월드 챔피언십 다음 대전상대를 찾아 관동지방의 노랑시티로 간다. 격투도장에서 포켓몬을 받을 고민에 빠진 고우. 한편, 태권도 대왕이 배틀하고 있다는 말에 구경하러 간 지우는 그곳에서 태권도 대왕의 패배를 보게 되고, 승자인 채두에게 배틀을 신청하게 되는데…

지우와 피카츄를 보며 고우도 피카츄를 잡고 싶어한다. 채박사에게 피카츄가 많이 있다는 보고를 받았으니 조사해달라는 말을 듣고, 바로 피카츄가 있는 곳을 찾아간 지우와 고우. 그곳에 있는 피카츄는 천둥의돌을 캐내 라이츄로 진화하고 있었다. 그때 로켓단이 나타나 피카츄를 전부 잡아가는데…

배틀에서 연패한 지우는 절망에 빠진다. 그런 와중에 호연지방의 보라시티에서 모래 폭풍으로 사람들이 들어가는 기묘한 일이 발생하고, 지우와 고우는 조사하기 위해 보라시티에 도착한다. 그들은 모래 폭풍으로 들어가 강력한 포켓몬인 플라이곤과 배틀을 하게 되고, 플라이곤의 스피드에 맥을 못 추는 지우에 이어, 고우는 색다른 배틀을 시작하는데…

지우와 고우는 알로라나시를 잡으러 알로라지방의 멜레멜레섬으로 간다. 지우는 쿠쿠이박사, 버넷박사와 포켓몬스쿨 친구들을 다시 만나 기뻐하고, 고우는 모두 처음 만나는 사람들이라 약간 긴장한다. 포켓몬스쿨에서 친구들과 환영파티를 하던 중, 키아웨는 고우가 지우의 라이벌에 어울리는지 확인하겠다며 고우에게 포켓몬 배틀을 신청하는데…

화석에서 복원된 방패톱스를 보기 위해 회색시티 과학박물관으로 향하는 지우와 고우, 그리고 하루. 그런데 화석포켓몬을 보느라 방패톱스 전시관 관람을 놓치게 된다. 아쉬워하던 그들은 화석 발굴 체험을 하고, 그곳에서 고우는 신기한 호박을 발견한다. 호박을 복원할 때를 기다리던 중 과학박물관에서 굉음이 들리면서 고우의 포켓몬이 사라지는데…

지우는 채두와 재대결하기 위해, 채두가 수련 중인 성도지방 진청체육관을 방문한다. 채두는 지우의 도전을 받아들이고, 고우와 진청체육관 관장인 사도가 지켜보는 가운데 배틀이 시작된다. 지난번 패배를 설욕하기 위해 지우와 리오르는 문어굳히기를 공략할 방법을 시도하는데…

갑자기 몰려온 번개구름에서 강력한 생체 에너지가 감지됐다는 말을 들은 지우와 고우. 전설의 포켓몬 썬더와 만날 수 있다는 기대감을 안고 달려가지만, 번개구름이 사라진다. 정전이 일어났다는 하루의 말에 지우와 고우는 무인발전소로 달려가, 전설의 포켓몬 썬더를 발견한다. 그들은 강력한 썬더에 맞서기 위해 그곳에서 만난 로켓단과 손을 잡고 레이드배틀을 하는데…

<피카츄 더빙 대작전!> 나옹이 감기에 걸려 자리에 눕게 되자, 로사와 로이는 이번 기회에 나옹에게만 의지하지 않고, 지우의 피카츄가 무슨 말을 하는지 이해하기 위해 더빙을 시작한다. <반쪽이 된 늪짱이> 지우와 고우는 비가 갠 숲에서 땅에 묻혀 꼼짝도 못하는 늪짱이를 발견한다. 어떻게든 구해주려는 두 사람 앞에 로파파가 나타나는데…

다이맥스의 비밀을 풀기 위해 가라르지방으로 향하는 지우와 고우는 짙은 안개로 기차가 잠시 멈추자 파르빗을 쫓아 꾸벅졸음숲으로 들어간다. 그곳에서 신종 포켓몬을 만난 지우와 고우는 대결 도중 안개에 휩싸여 잠든다. 잠에서 깨어난 지우는 하늘에서 떨어지는 빛을 쫓아 마을로 향하고, 그곳에서 거다이맥스 다태우지네와 대결하게 되는데…

지우와 단델은 광산에서 거다이맥스해서 날뛰는 석탄산을 제압하고, 시찰하러 온 로즈 사장을 만난다. 한편 고우는 우연히 가라르지방 영웅전설의 비밀을 파헤치는 소니아를 만나서 브래시마을에 있는 매그놀리아박사에게 가는데…

괴한과 싸우던 중에 영웅 전설의 비밀을 알게 된 소니아와 고우는 갖은 방해를 뚫고 너클시티로 향한다. 한편 지우와 단델은 로즈를 통해 포켓몬을 다이맥스하게 만드는 무한다이노에 대해 알게 된다. 단델은 위기에 빠진 가라르지방을 구하기 위해 무한다이노를 봉인하기로 결심하고, 지우는 로즈와 배틀을 시작하게 된다.

전설의 포켓몬, 무한다이노를 앞에 두고 지우는 로즈 사장과, 고우는 올리브와 배틀을 한다. 그러던 중, 지우의 리오르와 고우의 래비풋이 진화하고, 단델과 대치하던 무한다이노는 최종 형태로 변한다. 그리고 지우와 고우가 위기에 빠진 순간 두 포켓몬이 나타나는데…

뮤가 내보내는 것으로 보이는 사이코 에너지가 세로아일랜드에서 포착된다. 뮤를 만나기 위해 세로아일랜드를 돌아다니던 지우와 고우는 갸라도스의 공격으로 폭포 밑으로 떨어진다. 낯선 곳에서 깨어난 두 사람은 뮤츠를 만나고, 뮤츠와 배틀을 펼치는데…

갈색시티의 포켓몬 많이 먹기 대회에 출전하기로 한 고우와 탐리스. 지난 대회 우승 포켓몬을 비롯한 엄청난 강자가 모였지만, 고우는 기발한 작전으로 우승을 노린다. 하지만 스태프로 위장한 로켓단이 나쁜 짓을 꾸미는데…

포켓몬 많이 먹기 대회에서 우승한 지우와 고우는 맛집 여행을 위해 하나지방에 도착한다. 그런데 두 사람이 구름아이스에 정신이 팔린 틈을 타서 로켓단이 ′거의피카츄′와 피카츄를 바꿔치기해서 도망친다. 그걸 본 에이스번과 루카리오는 로켓단을 쫓아가지만, 서로 손이 묶인 채 로켓단과 맞서게 되는데…

갈색시티에 있는 이브이 진화 연구소는 이브이와 그 진화형을 연구하는 기관이다. 그곳의 특별한 이브이는 우연히 멍파치를 만나 연구소를 빠져나오게 되고, 하루가 다니는 학교에 도착한다. 학교에서는 로켓단이 포켓몬들을 강제로 기계에 빨아들이고 있었는데…

과학박물관 관장으로부터 가라르지방의 화석에 대해 조사해달라는 부탁을 받은 지우와 고우. 그들은 하루와 함께 희귀한 화석이 나온다는 가라르지방으로 향하고, 그곳에서 만난 마칸다와 모젤란을 도와 화석을 복원한다. 그런데 복원을 마친 포켓몬들이 갑자기 난동을 부리기 시작하는데…

특훈하던 지우와 파오리는 꼬마돌이 잔뜩 모여 있다는 소식을 듣고 고우와 함께 돌산터널로 향한다. 그리고 그곳에서 우연히 만난 사람과 그의 파트너인 토쇠골을 상대로 포켓몬 월드 챔피언십 공식 배틀을 하게 된다. 그리고 힘겹게 이긴 지우의 파오리 앞에 정체를 알 수 없는 트레이너인 린트가 나타나는데…

채박사의 제자인 완두는 채소를 재배하는 농부다. 그런데 완두팜에 디그다들이 나타나서 채소를 엉망으로 만들자 지우와 고우, 하루는 그 문제를 해결해주기 위해 완두팜으로 향한다. 닥트리오와 디그다를 힘들게 잡은 뒤, 그들이 살았던 언덕에 올라가자 그곳에선 로켓단들이 채소를 재배하고 있었는데....

전 세계를 돌아다니며 더러운 물을 깨끗하게 해준다는 전설의 포켓몬 스이쿤. 스이쿤이 어떤 호숫가에 머물고 있다는 소식을 들은 지우와 고우는 호수로 향한다. 두 사람은 그곳에서 스이쿤을 잡으려는 포켓몬헌터들과, 그들 때문에 다친 스이쿤을 만나게 되는데…

영화 촬영을 구경하러 간 지우와 고우. 그때 로켓단이 나타나서 인텔리레온을 데려가겠다며 난동을 부리지만, 인텔리레온은 로켓단을 멋지게 물리친다. 그 모습을 본 울머기는 인텔리레온을 동경하여 특훈을 시작한다. 특훈을 마치고 내려가던 지우와 고우는 로켓단이 고디탱을 납치했다는 이야기를 듣고 동굴로 향한다. 그런데 함정에 빠지는 바람에 울머기 혼자 로켓단을 상대하게 되는데…

채박사 연구소에서 ‘당신과 루미너스메이즈숲의 이야기’란 책을 발견한 하루. 그 책에는 가라르지방의 포니타와 날쌩마가 그려져 있었다. 호기심이 생긴 하루는 지우, 고우와 함께 가라르지방의 루미너스메이스숲으로 간다. 그리고 숲속을 탐색하던 중, 하루 앞에 포니타가 나타나는데…

파오리의 특훈을 위해 칼로스지방에 도착한 지우와 고우. 기사도 저택에서 사천왕 중 한 명인 간피를 만나 그들은 세 가지 수련을 하게 된다. 첫 번째 수련을 끝내고 두 번째 수련을 시작한 그들은 각자 곳곳에 설치된 함정과 맞닥뜨리지만, 두 번째 수련도 무사히 끝내고, 마지막 수련을 시작하려 하는데…

숙희의 집에서 하룻밤 자게 된 하루는 어떤 청년과 머플러를 한 고라파덕, 숙희가 함께 찍힌 사진을 발견한다. 숙희에게 과거 이야기를 들은 하루는 숙희가 사진 속 청년을 만나고 싶어 한다고 생각한다. 다음 날, 지우와 고우가 그 청년과 같이 있었다는 걸 알게 된 하루는 두 사람과 함께 청년을 찾아 나서는데…

<패닉! 꼴깍몬 공!!> 로켓단 아지트에서 나온 꼴깍몬이 지우와 고우에게 달라붙는다. 채박사 연구소로 돌아가던 그들은 꼴깍몬들에게 둘러싸이고, 여기저기 굴러다니게 되는데... <컴 온, 깨물부기 거북레이스!> 로켓단 아지트에서 나온 깨물부기가 밖으로 나가고 나옹과 마자용이 뒤쫓아간다. 공원에 도착한 깨물부기는 그곳에서 만난 모부기와 격렬한 거북레이스를 펼치는데…

고릴타가 된 부모님이 동생인 흥나숭을 돌봐달라는 꿈을 꾸다가 잠에서 깬 고우. 꿈인 줄 알았는데 고우의 팔에 흥나숭이 매달린 채 자고 있었다. 지우와 고우는 흥나숭을 파트너에게 데려다주기 위해 멍파치의 후각을 이용해 흥나숭의 자취를 쫓아가는데…

특훈을 하다 지친 핫삼과 파오리를 데리고 포켓몬센터로 향하는 지우와 고우. 그곳에서 지우는 우연히 린트를 만나 공식 배틀을 하게 된다. 지우와 파오리는 지난번의 설욕전을 하려고 하지만 린트와 엘레이드는 절대 만만하지 않았다. 그런 와중에 엘레이드의 공격으로 파오리의 파가 두 동강이 나는데…

채박사 연구소의 수도꼭지를 고치러 온 ‘플러시 마이농 심부름센터’의 디바이와 멀티플 남매. 남매는 마스코트 포켓몬인 플러시와 마이농의 응원을 받으며 무사히 수리를 마쳤지만 멀티플 때문에 디바이가 다치고 만다. 지우와 고우는 디바이 대신 심부름센터 일을 도와주기로 하는데…

인텔리레온을 동경해서 치고 빠지기 특훈을 하는 고우의 울머기. 그러다가 아무도 모르게 뚜벅쵸를 구해주고 누겔레온으로 진화한다. 누겔레온은 자신이 인텔리레온으로 진화했다고 생각했지만, 수면에 비친 자신의 모습이 누겔레온이라 크게 실망한다. 누겔레온은 동굴에 틀어박혀 고우하고도 서먹해지는데...

바다를 무대로 펼쳐지는 포켓몬들의 장애물 레이스 ‘포켓몬 마린 애슬레틱 레이스’ 중계를 보는 지우와 고우. 레이스에서 우승한 샤미드의 파트너인 카이리는 숙희의 친구였다. 샤미드를 보며 좋아하는 이브이를 보고, 하루는 샤미드를 만나고 싶어 하는데…

호연지방의 봉준이 지우와 고우에게 조사의뢰를 한다. 용암마을에 온천수가 나오지 않자 마을 사람들은 재앙을 부르는 앱솔 때문이라며 앱솔을 해치우겠다고 나선다. 그러자 봉준은 진짜 원인을 찾기 위해 지우와 고우에게 조사를 의뢰한 것이다. 지우와 고우는 온천수가 나오지 않게 된 원인을 알아내기 위해 원천이 있는 굴뚝산으로 향하는데…

지우에게 온 한 통의 편지, 그건 아이리스가 배틀을 청하는 내용이었다. 지우와 고우는 곧바로 하나지방의 쌍용시티로 출발하고, 그곳에서 쌍용체육관 관장인 사간과 하나지방 챔피언이 된 아이리스를 만난다. 지우와 아이리스는 하이퍼클래스가 걸린 포켓몬 월드 챔피언십 배틀을 시작하는데…

어느 날, 고우의 플라베베들이 한 번에 플라엣테로 진화한다. 그러나, 고우는 5마리 중에 하얀 플라베베가 없다는 걸 알아차린다. 하얀 플라베베는 타고 있는 꽃의 꽃잎이 하나 떨어져서 제대로 날지 못한 것이다. 고우와 지우는 새로운 꽃을 찾기 위해 플라베베를 잡은 칼로스지방으로 가게 되는데…

여경과 허수고 형사가 채박사 연구소에 찾아온다. 갈색시티의 주택가에서 전기를 도난당하는 일이 계속 생기는 바람에, 범인을 찾기 위해 채박사 파크에 있는 전기 타입 포켓몬을 보러 온 것이다. 전기 타입 포켓몬들을 확인하던 허수고 형사는 갑자기 지우의 피카츄를 체포하겠다고 하는데…

오랜만에 오박사 연구소에 들른 지우와 고우. 고우는 오박사에게 본격적으로 뮤를 탐색하는 팀, 프로젝트 뮤에서 멤버를 모집하고 있단 얘기를 듣는다. 한편, 지우는 오박사 연구소에 맡긴 초염몽이 최근에 모습이 보이질 않는다는 말을 듣고 고우와 같이 찾으러 나선다. 그러던 중에 지우의 친구이자 라이벌인 바람을 만나는데…

포켓몬센터에 온 지우, 고우, 하루. 장난꾸러기인 흥나숭과 이브이 때문에 세 사람은 조마조마하다. 이브이와 흥나숭은 원래 착한 아이라고 말하는 하루과 고우에게 지우는 이브이와 흥나숭에게 심부름을 시켜보자고 제안한다. 그렇게 흥나숭과 이브이는 처음으로 심부름을 하게 되는데…

로켓단의 아지트에 자리 잡고 사는 모르페코. 엄청난 먹보인 모르페코는 로사의 케이크, 나옹의 과자, 로이가 금고에 숨겨둔 식량까지 다 먹어 치운다. 이대로는 사명을 완수할 수 없다고 생각한 로켓단은 모르페코를 야생으로 돌려보낼 계획을 세운다.

고우는 ‘프로젝트 뮤’로부터 신오지방의 천관산 기슭에 있는 연구소로 와달라는 메일을 받는다. 그리고 드디어 연구소에 도착해, 천관산 북쪽에 펼쳐진 빙하지대에서 알로라나인테일을 잡는 첫 미션을 받게 되는데…

기어르의 새로운 진화형이 발견됐다는 정보를 얻고 하나지방 물풍경시티에 도착한 지우와 고우 그리고 하루. 그곳에서 땅속 깊이 이어진 구덩이를 발견한 흥나숭과 이브이는 뒤도 돌아보지 않고 뛰어든다. 지우와 친구들은 흥나숭과 이브이를 쫓아가고, 하나지방에 와있던 로켓단도 지우 일행을 뒤따라 구덩이로 뛰어드는데…

대여르를 조사하러 가라르지방에 간 지우와 고우. 두 사람은 그곳에서 호흡이 잘 맞지 않는 대여르를 만나게 된다. 피카츄의 공격으로 대여르는 뿔뿔이 흩어지고 고우는 리더를, 지우는 나머지 대여르 멤버들을 구하기로 한다. 고우는 제대로 지휘를 못 해서 풀죽은 리더를 도와주기로 하는데…

사람들이 악몽에 시달리는 사건을 조사하러 신오지방으로 간 지우와 고우. 두 사람은 악몽을 꾸게 하는 원인이 다크라이라고 생각한다. 한편 혼자서 신오지방으로 여행을 떠난 하루는 지우의 친구인 빛나를 만나게 되는데…

하루와 빛나는 숲에서 온몸에 상처를 입은 크레세리아를 만난다. 크레세리아를 치료해주고 잠든 두 사람은 다크라이와 크레세리아가 만나는 이상한 꿈을 꾼다. 잠에서 깬 두 사람 앞에 다크라이와 로켓단이 나타나고, 다크라이를 쫓던 지우와 고우도 숲속으로 들어가게 된다.

지우와 고우는 포켓몬 잡기 어드벤처 레이스에 참가하기 위해 알로라의 무인도로 향한다. 치열하게 레이스를 펼치던 중 피카츄를 노리는 로켓단의 습격을 받아 위험에 처하지만, 전수와 역수의 도움으로 로켓단을 물리치게 되는데…

지우는 신오지방 물가시티 체육관 관장인 전진과 첫 번째 하이퍼클래스 배틀을 하게 된다. 초반에는 전기타입 포켓몬들을 내세운 전진에게 고전을 면치 못하지만, 특유의 끈기와 열정으로 전기기술을 이용해 마침내 승리를 거머쥐게 되는데…

채박사 연구소에서 지우와 고우가 열심히 모은 포켓몬 데이터가 삭제되는 사건이 발생한다. 누구의 소행인지 밝혀내기 위해 한밤중에 연구소를 둘러보던 고우는 하지가 켈리몬을 앞세워 데이터를 삭제했다는 사실을 알게 되는데…

지우와 고우, 하루는 성도지방에서 열리는 일식 축제를 구경하기 위해 일식성으로 향한다. 하루는 그곳에서 자신과 꼭 닮은 일식성의 차기 성주인 해루를 만나 신기해한다. 그런데 성주 자리를 노리는 달호가 하루를 해루로 착각해 납치하는 사건이 발생하는데…

고우와 지우는 첫 번째 트라이얼 미션인 불카모스 황금의 인분을 채취하기 위해 하나지방의 리조트데저트로 향한다. 그곳에서 거신의 유적에 있는 벽화를 통해 불카모스가 화산 지대에 있을지도 모른다는 사실을 알아내는데…

칼로스지방에서 여행을 온 파랑포켓몬마니아 아벨. 그는 우연히 거리에서 만난 지우 일행에게 같이 파랑 활동을 하자고 제안한다. 그런데 아벨은 계획했던 장소를 방문할 때마다 같은 마니아인 블루터스와 사사건건 부딪치기 시작하는데…

지우 일행은 체육관 관장 포플러의 초대를 받아, 대회에 참가하기 위해 아라베스크마을로 향한다. 단델과의 배틀을 기대하며 대회장에 들어선 지우는 배틀 대회가 아닌 케이크 데코레이션 대회가 열린다는 말에 실망을 감추지 못하는데...

성도지방의 작은 마을에서 밤이 계속되고 있다는 소식은 들은 지우와 고우는 원인을 조사하기 위해 그곳으로 향한다. 마을에 도착한 두 사람은 하늘로 돌아간 삐를 그리워하며 하늘의 별을 보고 있는 소녀를 우연히 만나게 된다. 그리고 이번 일이 안농과 관계가 있다는 걸 알게 되는데...

루카리오를 메가진화시키기 위해 칼로스지방의 코르니를 찾아간 지우는 코르니로부터 키스톤을 받는다. 하지만 메가진화를 하려면 루카리오의 메가스톤인 루카리오나이트가 필요하다는 말을 듣고 코르니의 안내를 받으며 메가섬으로 향하는데...

지우는 하이퍼클래스의 두 번째 대전 상대인 채두와 배틀을 하기 위해 가라르지방으로 향한다. 과거 채두와의 배틀에서 1무 1패를 기록했던 지우는 세 번째로 맞붙는 이번 배틀에선 반드시 이기겠다고 다짐하며 임하는데...

한 치의 양보도 없이 치열한 배틀이 계속되는 가운데, 어느새 지우와 채두에겐 루카리오와 괴력몬 한 마리씩만 남게 됐다. 더구나 두 포켓몬 모두 상당한 데미지를 입은 상황이다. 지우와 채두는 결국 메가진화와 거다이맥스를 이용해 마지막 대결을 펼치는데...

고우와 하루가 다니는 학교로 전학을 온 레지나. 레지나에 대해 궁금한 게 많은 같은 반 친구들은 질문을 퍼부으며 우르르 몰려든다. 그런데 그때 레지나의 글레이시아가 나타나 모여든 학생들을 경계하기 시작하는데...

두 번째 트라이얼 미션에서 야생 킹드라 잡기를 선택한 고우는 시드라가 있는 곳에는 진화형인 킹드라도 있지 않을까 해서 지우와 함께 호연 지방으로 향한다. 바다에서 잠수하며 탐색하던 두 사람은 우연히 호연지방의 사천왕인 권수를 만나게 된다.

숲에서 콘테스트 연습을 하려던 빛나는 자신과 똑같이 생긴 소녀가 팽도리를 데리고 가버리자 지우에게 도움을 청한다. 사건을 해결하기 위해 신오지방에 도착한 지우와 친구들은 원래 세계와 똑같은 또 다른 세계가 있다는 것을 알게 되는데…

지우 일행은 디아루가와 펄기아를 이용해 포켓몬들을 자신의 부하로 만들어 세계를 정복하려는 다른 세계의 로켓단을 막기 위해 고군분투 하지만, 포켓몬들이 알로 변하는 희귀한 현상에 마주하게 된다. 과연 지우 일행은 이 위기를 극복할 수 있을 것인가?!

래터럴마을행 열차를 타려던 지우는 우연히 어니언이 떨어뜨린 기차표를 줍고, 그것을 돌려주려고 하다가 고스트 열차를 타게 된다. 그런데 그곳에서 화강돌을 만나고, 지우 안으로 나쁜 영혼이 들어간다. 화강돌은 지우 안으로 들어간 나쁜 영혼을 되찾기 위해서 공격을 시도하는데...

팬텀이 거다이맥스를 할 수 있게 래터럴마을의 고스트체육관을 찾아간 지우와 고우. 그런데 고스트체육관 관장은 고스트 열차에서 만난 어니언이었다. 그의 말에 따르면 팬텀이 거다이맥스를 하기 위해서는 다이버섯으로 만든 다이수프를 먹어야 한다고 한다. 지우와 고우는 어니언의 안내를 받으며 다이버섯을 찾아 나서는데...

렌지의 포켓몬인 프랑수아즈는 고집도 세고 옛날 전자제품의 전기만 먹는 특이한 식성을 가진 코일이다. 렌지가 지우와 고우에게 프랑수아즈와의 첫 만남에 관해 이야기해주려는 순간 채박사 연구소가 정전되고, 갈색시티의 코일들이 일제히 난폭한 행동을 하기 시작했다는 소식이 들어오게 된다.

평소 꽃에 관심이 많은 헤라크로스가 채박사 파크에 새로 들어온 드레디어에게 호감을 보이자 헤라크로스를 좋아하는 쁘사이저는 우울감에 빠진다. 그 모습을 본 고우는 쁘사이저의 사랑을 응원하기 위해 포켓몬 꽃꽂이교실이 열리는 무지개체육관에 가서, 쁘사이저와 함께 포켓몬 꽃꽂이교실에 참가하게 된다.

활동자금을 마련하기 위한 아르바이트와 과중한 임무, 설교에 지쳐가던 로켓단은 피카츄를 잡으려다 실패한다. 그러자 로켓캡슐에서 강한 포켓몬이 나오지 않은 탓에 실패했다고 생각하며, 본부의 로켓캡슐 담당자를 만나기 위해 패리퍼를 쫓아가기 시작하는데...

이끼 우주센터에서 전룡과 함께 소행성 탐사기 파이어로2 귀환 프로젝트에 참가 중인 마마네는 지우와 고우를 그곳으로 초대한다. 그런데 전룡이 파이어로2의 귀환을 유도하기 위해 꼬리에서 빛을 내려다 실패한 뒤, 그 충격으로 인해 자신감을 잃고 만다.

야돈들이 사는 야돈의 섬을 다시 찾은 지우와 고우. 그런데 가라르 야돈들이 사는 작은 섬과 야돈의 섬이 충돌하면서 가라르 야도킹이 이끄는 가라르 야돈들이 야돈의 섬에 들어가게 된다. 그리고 지우와 고우는 야돈들과 친해지고 싶어 하는 가라르 야돈들을 도와주기로 하는데...

추첨을 통해 포켓몬 서커스에 참가하게 된 지우와 고우는 서커스장에 도착한 뒤, 서커스단 단장에게 불꽃타입을 좋아하는 화미와 전기타입을 선호하는 빌리를 소개받는다. 그런데 화미와 빌리가 진화의돌을 이용해 각자의 이브이를 진화시키려던 중 돌이 바뀌는 사고가 발생하게 된다.

포켓몬 월드 챔피언십에서 마리와 대결을 펼치게 된 지우. 그런데 옐단이 마리의 부전승을 위해 지우에게 대회장을 틀리게 알려주고, 지우와 고우는 스파이크마을로 향하게 된다. 그리고 그곳에서 마리의 오빠이자 스파이크체육관 관장인 두송을 만나는데...

고우와 함께 가라르지방 포켓몬을 잡으러 가려던 지우는 늦잠을 자는 바람에 뒤늦게 고우를 따라가려 한다. 그러나 단델의 배틀이 펼쳐지고 있다는 이야기를 듣고 그쪽으로 발길을 돌린 지우는 배틀이 끝나고 만난 단델에게 특별훈련을 제안받게 된다.

포켓몬을 잡기 위해 와일드에리어에 온 지우와 고우는 그곳에서 흥나숭의 진화형인 채키몽을 만난다. 채키몽의 모습은 어딘지 모르게 상처를 받은 것 같은데, 스틱을 하나 잃어버렸기 때문이었다. 지우와 고우는 그런 채키몽을 도와주게 되는데…

프로젝트 뮤의 멤버가 되고 싶어 하는 고우의 다음 미션은 프리져와의 레이드배틀! 프리져가 있다는 쌍둥이섬으로 향하는 도중, 고우의 친구이자 세레비를 목표로 하는 시웅을 만나고, 지우의 어릴 적 친구인 바람도 만나게 된다. 이 둘과 함께 고우는 프리져와의 레이드배틀에 도전하게 되는데…

포켓몬 월드 챔피언십의 다음 상대가 칼로스 사천왕인 드라세나로 정해지고, 지우는 오랜만에 시트론을 찾아가서 창파나이트와 훈련하기로 한다. 시트론은 특별히 개발한 포켓모션캡처를 이용해 창파나이트의 문제점을 찾아내고, 지우는 어래곤과 창파나이트의 상성을 보고 함께 훈련시키기로 결심하는데…

포켓몬 월드 챔피언십! 지우의 다음 상대는 칼로스 사천왕 드라세나다. 지우는 드라세나의 음번과 파비코리에 맞서서 어래곤과 창파나이트를 내보낸다. 하지만 드라세나는 다정해 보이는 외모와 달리 실력이 굉장했고, 파비코리의 메가진화로 지우는 더욱 곤경에 빠지게 되는데…

하루와 이브이는 해안시티에서 열리는 포켓몬 콘테스트에 님피아가 참가했다는 소식을 듣고 해안시티로 향하고, 뜻밖의 기회로 하루는 콘테스트에 참가하게 된다. 한편 지우와 고우는 하루와 합류하기 위해 콘테스트가 열리는 곳으로 가던 중, 체육관 관장 윤진을 만나게 된다.

비주기로부터 로켓단 단원을 늘리라는 명령을 받은 로사, 로이, 나옹. 그들은 단원을 늘리기 위해 전 세계를 향해 인터넷 라디오 방송을 시작한다. 그런데 단원 신청서가 들어오지 않자, 새로운 코너를 만드는 등 이런저런 기획을 시도하는데…

하루는 포켓몬 사진을 찍기 위해 멍파치의 안내를 받으며 채박사 파크를 돌아다닌다. 멍파치는 안내를 하며 흥나숭의 스틱을 찾아주고 포켓몬의 고민을 해결하는 등, 채박사파크 포켓몬들의 형님 노릇을 톡톡히 한다. 그런 와중에 강물이 오염된 것을 알게 되고 문제를 해결하려 하는데…

마스터즈 에이트를 앞두고 루카리오는 의지를 불태운다. 루카리오의 파동에서 개굴닌자가 배틀할 때와 비슷한 느낌을 받은 지우는 둘을 만나게 해주기 위해 칼로스지방으로 향한다. 그리고 루카리오와 개굴닌자는 배틀을 시작하게 되는데…

드디어 마스터즈 에이트를 걸고 지우와 금랑의 배틀이 시작된다. 지우는 망나뇽, 팬텀, 루카리오를 내보내고, 금랑은 플라이곤, 미끄래곤, 두랄루돈을 내보낸다. 챔피언 단델을 향한 각자의 의지는 어느 한쪽도 물러설 수 없는 상황. 과연 이 격렬한 배틀의 향방은…?!

프로젝트 뮤”의 트라이얼 미션을 위해 씨보라를 찾은 고우와 지우. 오늘의 미션은 시설 내에서 다른 도전들과 배틀을 하여 마지막까지 승리하는 도전자가 미션을 클리어하는 것. 미션 수행 중, 고우는 시웅을 만나게 되고, 이 둘은 팀을 이뤄서 함께 배틀을 하게 되는데…

지우 일행은 신기한 포켓몬이 나타났다는 왕관설원으로 향한다. 한편 아버지 몬을 찾기 위해 여행을 하고 있던 릴리에 가족은 왕관설원에서 몬을 발견하지만, 몬은 그들을 기억하지 못한 채 텅비드를 릴리에라 생각하며 살고 있었다.

지우 일행은 왕관설원에서 만난 릴리에의 가족과 함께 알로라에 도착한다. 알로라에서는 몬의 무사 귀환을 축하하는 잔치가 열리고, 하루는 수련에게 이브이에 대해 이것저것 물어본다. 그리고 알로라리그 초대 챔피언인 지우를 위해 배틀로열이 개최되는데…

고우에게 주어진 마지막 트라이얼 미션은 ‘결정의 유적’에 가서 레지에레키와 레지드래고를 잡는 것이다. 고우는 이번에 혼자 힘으로 해내기로 결심하고 ‘결정의 유적’으로 향하지만, 그곳에는 이미 바람이 기다리고 있었다. 과연 두 사람의 운명은?!

마스터즈 토너먼트에 앞서, 지우는 기운을 얻기 위해 오박사 연구소에 있는 자신의 포켓몬들을 만나기로 한다. 오박사 연구소에서 지내는 지우의 포켓몬들과 마스터즈 토너먼트에 참가할 포켓몬이 훈련하고 있을 때, 갑자기 진철이 나타나 지우와 3 대 3 배틀을 하게 되는데…

마침내 마스터즈 토너먼트의 막이 오르고, 1회전에서 맞붙는 선수는 단델과 알랭, 목호와 카르네, 난천과 아이리스, 성호와 지우로 정해졌다. 지우는 스타디움 앞에서 우연히 만난 단델의 동생 호브와 함께 관중석에서 첫 번째 시합 단델과 알랭의 배틀을 지켜본다.

포켓몬 월드 챔피언십, 마스터즈 토너먼트 1회전 두 번째 시합의 상대는 카르네와 목호. 카르네는 아마루르가로, 목호는 망나뇽으로 대결을 시작한다. 일진일퇴의 격렬한 배틀은 흥미롭게 전개되고, 한 치도 물러설 수 없는 두 번째 시합을 제압하는 것은 과연 누가 될 것인가...?!

포켓몬 월드 챔피언십, 마스터즈 토너먼트 1회전 세 번째 시합은 난천 대 아이리스! 난천에게 지도를 받은 적도 있는 아이리스는 이번 대결에서 반드시 난천을 이겨서 넘어서고 싶어 한다. 하지만 난천의 밀로틱에게 몰드류와 망나뇽이 잇달아 패배하게 되는데... 과연 세미파이널 진출의 향방은?!

포켓몬 월드 챔피언십, 마스터즈 토너먼트의 네 번째 시합은 지우 대 성호의 대결이다. 지우는 어래곤과 팬텀, 피카츄로, 성호는 메타그로스, 보스로라, 릴리요로 배틀에 나서고, 성호가 쏟아내는 강력한 공격에 지우는 위기에 몰리게 된다. 과연 지우는 성호를 꺾고 1회전 돌파에 성공할 수 있을 것인가?!

하루는 이브이의 진화에 대해서 여러모로 생각이 많다. 그 모습을 보고 채박사는 숲으로 캠핑하러 가자고 제안하고 캠핑장에서 하루에게 어린 시절에 삐삐를 만났던 이야기를 해준다. 그 순간 둥근 보름달 아래 어디선가 삐삐의 소리가 들리게 되는데…

이번에는 포켓몬 월드 챔피언십 뉴스와 지금까지 활약한 지우의 모습을 전한다. 8명의 선수가 치열한 격전을 벌인 1회전 배틀 상황을 전함과 동시에, 여기까지 오게 된 지우의 배틀 방식과 가장 충격적인 배틀을 보여준 피카츄, 창파나이트, 루카리오에 대해서 소개한다.

지우와 난천이 세미파이널을 앞두고 포켓몬의 컨디션을 점검하고 있는 곳에 빅과 토리아라는 남매가 나타난다. 그런데 토리아가 갑자기 사라지고, 토리아를 찾기 위해 동분서주하는 동안 단델과 카르네의 세미파이널이 시작하게 되는데...

드디어 난천과 지우의 세미파이널이 시작된다. 난천은 이번 대회를 끝으로, 은퇴하겠다는 각오로 경기에 임하면서, 초반부터 교묘한 전략으로 지우를 위기에 빠뜨린다. 지우는 어떻게든 나쁜 흐름을 바꾸려 하지만, 난천의 강력한 포켓몬들 앞에서 번번이 가로막힌다.

세미파이널 2번째 시합, 지우 VS 난천의 경기에서 피카츄가 다운되면서 지우는 난천의 경험과 전략 앞에 서서히 몰리게 된다. 그런 상황에 지우는 어래곤과 창파나이트를 내보내며 돌파구를 찾으려 하는데...

세미파이널의 지우와 난천의 대결! 난천은 토게키스와 한카리아스, 지우는 루카리오만 남겨두고 있다. 난천은 토게키스를 다이맥스시키고, 지우는 루카리오를 메가진화시키지며, 격렬한 배틀을 이어가고 있는데... 과연 파이널 진출자는 누가 될 것인가?!

고우와 에이스번은 우연히 서로 처음 만났던 가라르지방의 스콘 가게를 지나게 된다. 거기서 에이스번이 염버니 시절 함께 지내던 훔처우들이 거리의 평화를 지키고 있다는 걸 알게 되는 순간, 나이킹, 가라르 나옹, 로켓단의 어두운 그림자가 드리우게 되는데…

마스터즈 토너먼트 파이널을 앞두고 배틀 평론가인 불대대문자를 초대해서 지금까지 있었던 배틀을 돌아본다. 또한 결승전에서 맞붙을 지우와 단델의 포켓몬들을 살펴보고, 두 사람의 과거 비공식 배틀도 보면서 이번 배틀의 의미를 되새겨 보자.

마스터즈 토너먼트 파이널! 마침내 지우와 단델이 배틀 필드에 등장한다. 파이널은 6 대 6의 풀배틀! 원래 다이맥스, Z기술, 메가진화 중 하나만 사용하기로 되어 있지만, 단델의 요청으로 더 멋진 경기를 위해 모두 사용하기로 규정을 바꾼다. 지우는 미리 결심했던 대로 피카츄를 내보내고, 단델은 에이스번으로 배틀을 시작하는데...

지우는 팬텀을, 단델은 인텔리레온을 잃은 가운데 파이널 배틀은 계속되고 있다. 초반부터 일진일퇴의 공방을 거듭하고, 지우는 포켓몬을 교체하며 단델에게 물고 늘어지지만, 지우의 포켓몬들은 점점 지쳐가는데… 그것이 단델이 노렸던 작전?!

지우는 네 마리, 단델은 세 마리의 포켓몬을 남겨둔 가운데, 배틀은 계속 이어진다. 고릴타의 막강한 공격에 지우의 망나뇽과 창파나이트는 잇달아 다운되지만, 어래곤이 고릴타의 승기를 막아선다. 거다이맥스한 단델의 리자몽과 Z기술을 사용한 지우의 피카츄가 격돌하는 순간, 가라르지방에는 전에 없던 기운이 느껴지는데…

슛스타디움에 갑자기 나타난 무한다이노의 목적은 대체…!? 그리고 지우와 단델의 배틀도 클라이맥스로 향하고, 단델의 에이스 리자몽에게 지우와 피카츄는 마지막 힘을 다해 맞선다. 지금까지의 만남을, 배틀을, 모험의 모든 것을! 최고의 파트너와 함께 지우는 정상의 자리에 오를 수 있을 것인가!?

프로젝트 뮤의 호출을 받고 달려간 고우. 무학 박사는 ‘머나먼 고도’의 테이블마운틴에서 강한 사이코 에너지가 감지된다고 하면서, 고우를 포함한 체이서들에게 그곳에 상륙해 뮤를 탐색하라는 지시를 내린다. 테이블마운틴에 도착한 순간, 무학 박사와의 통신이 끊어지고, 체이서들은 두 팀으로 나누어지게 되는데…

테이블마운틴에서 포켓몬들이 갑자기 날뛰며 어딘가로 향하자, 고우를 비롯한 체이서 일행은 포켓몬들을 쫓아간다. 그곳에는 뮤가 있었고, 체이서들은 뮤를 진정시키기 위해 배틀에 나서게 되는데... 과연 고우는 뮤에 다가가 원하던 꿈을 이룰 수 있을 것인가?!

하루는 예전에 아빠와 같이 갔던 숲으로 지우, 고우와 함께 캠핑을 하게 된다. 그들은 그곳에서 어릴 적 포켓몬에 대한 추억 이야기로 즐거운 시간을 보내지만... 고우는 지우 앞에서 계속 머뭇거린다. 고우는 어떤 고민이 있는 걸까?

약간의 오해로 어색해진 지우와 고우 앞에 나타난 전설의 포켓몬 루기아! 지금까지 함께 모험하며 성장해온 두 사람이 처음 만났던 날의 루기아와 재회하며, 레이드배틀에 도전하게 되는데…

챔피언이 된 지우는 마음 내키는 대로 여기저기 모험을 다닌다. 하지만 로켓단이 나타나 또 피카츄를 잡아가려 하고, 지우는 다시 피카츄를 구해낸다. 그 과정에서 지우는 연못으로 떨어진 라티아스를 발견하게 되는데…

오랜만에 바닷가에 온 지우와 피카츄. 바다에서 신나게 놀던 중 야생 완철포를 만나게 되고, 지우가 잡으려는 순간 이슬이 나타나 제동을 건다. 완철포를 잡기 위한 이슬 VS 지우의 배틀이 시작되는데…

여행을 함께하게 된 이슬. 지우와 이슬은 점심을 먹으러 간 식당에서 웅과 재회한다. 식당의 누나를 흠모하고 있던 웅이는 곧바로 실연당하고 우울함에 빠진다. 그러자 우울한 기운을 좋아하는 브리무음은 웅이의 기운을 받기 위해 숲으로 유인하고, 지우와 이슬, 덴트까지 웅이를 되찾으러 숲으로 가게 되는데…

잉어킹의 폭포오르기를 보기 위해 어느 산에 도착한 지우 일행. 하지만 힘을 컨트롤하지 못하는 툰베어에 의해 폭포의 물은 꽁꽁 얼어 있었다. 지우는 수댕이와 함께 툰베어가 힘을 자유자재로 다룰 수 있도록 특훈을 시켜주게 되는데…

지우와 함께 여행했던 꼬부기가 이끄는 꼬부기 소방대를 만난 지우 일행. 로켓단의 방해로 지우는 꼬부기를 만나지 못하게 되고, 그런 꼬부기는 지우가 자신을 외면했다고 오해하여 이상해씨와 리자몽에게도 차갑게 대하며 서로의 갈등이 깊어지는데...

오늘도 역시 피카츄를 잡기 위해 로켓단이 나타나고, 배틀 끝에 가까스로 격퇴했지만 로켓단과 함께 피카츄까지 날아가 버린다. 지우는 피카츄를, 피카츄는 지우를 찾지만 길이 엇갈리게 되고... 떨어져 있어도 마음은 하나, 최고의 파트너인 두 사람은 과연 재회할 수 있을까?

지우 일행은 예전에 함께 여행했던 라프라스를 만나게 되고, 무언가 도움을 청하는 라프라스의 모습에 어느 섬으로 따라가자 동굴 구멍에 끼어 괴로워하는 고래왕자가 있었다. 지우 일행은 과연 고래왕자를 구출할 수 있을까?

지우 일행은 사람들의 물건이 없어지는 이상한 현상이 일어나는 마을에 다다른다. 그리고 여러 가지 물건을 훔쳐 나오던 다크펫을 발견하는데... 도대체 물건을 훔치는 다크펫의 목적은?!

로사, 로이, 나옹, 마자용은 로켓단 본부의 딜리버드가 가져다준 예전 동료 포켓몬들과 재회하고, 피카츄를 잡기 위해 새로운 계획을 세운다. 지금까지의 모든 것을 건 일생일대의 작전. 과연 성공할 수 있을까?

라티아스는 지우 일행 앞에 다시 나타나 꿈그리기를 통해 위험에 처해있는 라티오스의 상황을 알려 준다. 포켓몬헌터로부터 부상당한 라티오스를 구출하기 위해 고군분투하는 지우 일행. 과연 지우는 포켓몬헌터를 물리치고 라티오스를 무사히 구해낼 수 있을까?

태초마을로 돌아온 지우는 포켓몬마스터에 얼마나 가까이 다가간 걸까?라는 바람이의 말에 자신을 돌아보게 된다. 처음 여행을 떠날 때부터 계속 목표로 해 온 포켓몬마스터란 꿈. 그 대답을 과연 지우는 찾을 수 있을까?