라스트 리조트

평화롭게 항해 중이던 USS 콜로라도함에 비상 통신망을 통해 핵미사일 발사 명령이 들어온다. 채플린 함장과 켄달 부함장은 뭔가 이상함을 느끼고 상부에 정상 통신망을 통해 확실한 명령은 내려 줄 것을 요청하지만 그 대답은 USS 일리노이함으로부터 발사된 미사일이다.

세인트 마리나 섬을 점거한 콜로라도함의 승조원들은 섬 주변을 무인 지대로 선포하고 미국의 반응을 기다린다. 결국 섬 주변으로 병력이 강하하고 승조원들은 어느 나라 병력인지 모른 채 이들과 맞서려 한다.

러시아 부대와의 교전으로 혼란한 상황이 지나간 후 승조원들은 동료들 몇몇이 사라진 사실을 알게 된다. 채플린 함장은 탈영이 아닌 실종으로 판단하고 구금 중이던 갑판장까지 석방하여 이들을 찾아 나선다.

함장을 암살하려던 시도가 저지되면서 국방장관이 함장을 제거하라는 명령을 내린 사실이 밝혀진다. 그 사실을 알고도 채플린 함장은 평소와 똑같은 일정을 소화하며 자신만의 방법으로 문제를 해결하려고 한다.

정부는 섬으로 협상단을 보내 채플린과 극적인 타협을 모색한다. 집으로 돌아갈 기회라고 판단한 채플린과 샘은 다소 들뜬 마음으로 협상을 시작하지만 정부는 한 치의 양보도 할 수 없다며 함장과 부함장을 비롯한 승조원 전원을 감옥에 보내겠다고 선언한다.

의문의 괴한들이 섬의 물에 화학 약물을 풀어 섬의 주민을 비롯한 콜로라도함의 승조원들이 모두 기절한다. 샘은 혼미한 정신으로 잠수함과 동료들을 구하기 위해 고군분투한다. 정신을 차린 제임스는 샘과 힘을 합쳐 섬에 침투한 특수 부대에 맞선다.

정신을 잃은 사이 미사일 발사 열쇠를 빼앗긴 채플린은 잠수함 내에 배신자가 있음을 알게 되고 승조원들의 짐을 뒤지며 배신자 색출에 나선다. 승조원들은 함장의 대우에 불만을 표시하고 샘은 부하들과 함장 사이에서 불만을 줄이기 위해 바쁘게 움직인다.

섬 주민 중 한 여성이 콜로라도함의 앤더스 상사에게 강간을 당했다고 주장하여 주민들은 앤더스 상사를 처벌하려고 하지만 채플린은 군법 재판을 열어 앤더스의 혐의를 조사한다. 앤더스의 변호를 맡은 그레이스는 성폭행을 당했던 과거를 떠올리며 괴로워한다.

콜로라도함 승조원들의 가족은 미국의 허락하에 섬으로 면회를 오게 된다. 하지만 섬 가까이 접근하자마자 파키스탄 해군 함정에게 모두 인질로 잡히고 만다. 파키스탄 해군의 지휘관은 채플린에게 인도군을 향해 핵을 발사하라며 위협한다.

또 다시 미국 정부에게 크리스틴을 빼앗긴 샘은 크리스틴을 되찾겠다며 길을 나서고 제임스도 샘을 도와서 크리스틴을 찾아 나선다. 마닐라에 있는 제임스의 옛 전우를 찾아간 샘은 마닐라의 암흑가 정보를 이용해 크리스틴을 찾으려고 한다.

미국 내에서는 셰퍼드 제독의 지휘하에 정부를 전복하려는 쿠데타 계획이 진행된다. 한편 섬에선 중국 보급선을 기다리는 가운데 미국 정부는 중국 보급선을 저지하기 위해 군함을 보낸다.

미국에선 셰퍼드 제독과 군 참모들이 쿠데타 모의를 마치고 하원 회의만을 기다리고 있다. 셰퍼드 제독의 연락을 받고 성명 발표를 준비 중이던 채플린은 갑판장을 주축으로 한 잠수함 내 반란에 직면하고, 승조원과 장교들은 채플린과 샘 사이에서 갈등을 겪는다.

채플린과 샘은 부하들의 반란으로 잠수함에 갇히고, 반란을 주도한 갑판장마저 부하들에게 배신을 당한다. 잠수함을 탈취한 승조원들은 콜로라도함을 중국에 넘기고 거액의 대가를 받기로 약속한다.