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영국의 여류 추리작가 앤 클리브스의 소설 「Red Bones」를 원작으로 한 드라마로 스코틀랜드의 셰틀랜드를 무대로 형사 지미 페레즈가 살인사건을 수사 하면서 벌어지는 이야기를 다룬 드라마
레이븐스윅 해변에서 10대 소녀의 시신이 발견된다. 사건을 맡은 페레즈 형사는 주변 인물들을 탐문하기 시작한다. 그러던 중, 한 기자가 이 사건이 19년 전 발생한 어린이 실종 사건과 연관될 가능성이 있다고 주장한다.
캐서린의 죽음을 조사하던 중, 레이븐스윅 언덕에서 19년 전 실종된 캐트리오나의 시신이 발견된다. 온 동네가 연쇄살인 사건이라며 떠들썩한 가운데, 매그너스가 유력한 용의자로 떠오른다. 한편, 페레즈 형사는 캐서린이 살해당한 날 CCTV를 발견하고 그녀의 행적을 좇는다.
페어 아일의 새 연구 센터에서 한 연구원이 살해당한 사건이 발생한다. 페레즈 형사는 사건을 수사하기 위해 고향인 페어 아일로 향하고 유력한 용의자 후보인 동료 연구원들을 심문하기 시작한다.
수사가 시작된 지 24시간도 채 지나지 않아 동료 연구원이 불에 타 사망한다. 수사는 미궁으로 빠지고, 진척이 없는 상황에 의외의 인물이 애나의 살인범을 알고 있다며 페레즈 형사를 찾아온다.
페레즈 형사의 오랜 친구인 기자가 차 사고로 현장에서 사망하는 사건이 발생한다. 한편, 이 마을은 새 가스관 설치를 추진하는 스톤 가스 회사와 이를 반대하는 주민들의 시위로 팽팽한 대립 상태에 놓여 있다. 수사가 진행되면서 페레즈는 친구의 차 사고가 새 가스관 설치 캠페인과 관련이 있을지도 모른다는 의심을 품기 시작한다.
잔인하게 살해된 두 번째 시신이 발견되자, 지미 페레즈 형사는 이 사건의 범인이 에비 와트의 소행일 거라 추측한다. 한편, 조 달하우지의 주장과는 다르게 양식장 수질에는 문제가 없다는 것을 발견한 샌디는 수상함을 느끼고 보험사에 연락을 취한다. 얼마 후, 경찰서에 제리의 노트북을 발견했다는 제보 전화가 온다.
러윅행 페리에서 한 청년이 어느 중년 신사와 말다툼을 한 후에 실종되는 사건이 발생한다. 세인트 니니안 해변에서 약을 주워 먹은 한 꼬마 아이가 갑자기 응급실에 실려 간다. 두 사건이 연관이 있다고 생각한 페레즈 형사와 그의 팀은, 말다툼을 목격한 여성의 진술에 따라 사건의 용의자를 찾아 나선다.
지미 페레즈 형사는 마이클 마과이어가 선적 컨테이너에서 발견된 한 청년의 끔찍한 죽음에 연루되었다고 확신하고 지문을 채취하려 하지만, 법에 정통한 마이클은 갖가지 핑계를 대며 수사를 피해 간다. 알리바이까지 만들어낸 그는 셰틀랜드를 떠날 날만 기다린다.
마이클의 죽음이 그의 과거와 관련이 있다고 생각한 지미 페레즈 형사는 글래스고로 향한다. 수사 도중, 지미는 마이클이 '증인 보호 프로그램' 대상자였으며, 검찰의 내부 공모자가 그의 소재를 유출해 살해당했을 거라는 이야기를 듣게 된다.
마침내 글래스고 경찰의 협력을 얻어낸 지미 페레즈 형사는 '마이클 톰슨 살인 사건' 수사에 박차를 가한다. 그러자 그와 샌디를 향한 보이지 않는 위협이 시작되고, 글래스고에 남아 브라이언 맥데이드를 찾던 토시 경사는 실종되고 만다.
납치 사건에서 살아남은 토시는 지미 페레즈 형사에게 성폭행을 당한 사실을 알린다. 가해자를 찾기 위한 수사가 진행되고, 수사 도중 번스 나이트에 레벨 나인 클럽에서도 유사한 사건이 발생했다는 사실이 밝혀진다. 페레즈와 그의 팀은 클럽의 지분을 소유했던 아서 맥콜과 경찰 조직 사이에 복잡한 관계가 얽혀 있음을 직감한다.
어선의 그물망에 걸려 올라온 시신이 아서 맥콜의 부하이며, 켈리를 성폭행한 가해자가 필리스 검사의 아들이라는 사실이 밝혀지면서 지미 페레즈는 마이클 톰슨 살인 사건을 풀어갈 거대한 실마리를 얻는다. 그리고 로비와 마이클의 죽음에 책임이 있는 사람이 생각보다 가까운 곳에 있다는 것을 깨닫는다.
23년 전 리지 킬뮤어를 살해한 혐의로 유죄를 받은 토머스 말론이 무죄 판결을 받고 석방된다. 페레즈 형사는 1994년에 일어난 리지 킬뮤어 사건의 재수사를 담당한다. 토머스 말론은 계속해서 무죄를 주장하는 가운데, 리지와 비슷하게 살해된 시신이 발견된다.
페레즈 형사는 토머스를 땅에 묻으라고 지시한 사람의 뒤를 쫓는다. 토시는 샐리의 살인범을 찾기 위해 포레스트 에너지라는 회사를 조사한다. 한편, 리지 킬뮤어 사건의 용의자 DNA에서 뜻밖의 결과가 나온다.
지미 페레즈 형사는 알란의 친부 찾기에 돌입하고 안드레아스 헤이건을 찾으러 노르웨이에 간 토시는, 샐리가 뜻밖의 인물을 만났다는 정보를 얻는다. 한편, 몰리는 토머스를 살뜰히 챙기는 엄마 케이트를 못마땅하게 여기고, 결국 다투고 만다.
지미 페레즈와 토시는 안드레아스 헤이건의 아들 마티아스의 거주지를 알아내기 위해 노르웨이 NDA 단체의 본부를 찾아간다. 케이트 킬뮤어는 술김에 토머스와 하룻밤을 보냈지만, 뭔가 꺼림직함을 느끼고 토머스를 밀어낸다. 한편, 조 핼리가 집 주변에 수상한 사람이 나타났다며 또다시 경찰서에 신고한다.
목이 졸려 정신을 잃은 조 핼리는 병원에 입원했지만, 의식이 돌아오지 않는다. 지미 페레즈와 토시는 샐리가 찍힌 CCTV 영상에서 결정적인 단서를 찾는다. 글래스고에서 파견 나온 전문 수사팀은 토머스를 진범으로 만들기 위해 그를 끊임없이 압박한다.
리지의 목을 조른 스카프가 덩컨의 것임을 알고 지미 페레즈는 덩컨을 찾아가 DNA 검사를 진행한다. 한편, 샐리의 USB에서 뜻밖의 단서가 나오면서 수사가 빠르게 풀려가기 시작하고, 토머스는 23년 만에 누명을 벗는다.
셰틀랜드의 해변에서 토막 난 손이 발견된다. 그리고 얼마 후, 인근 다른 해변에서 토막 난 머리가 발견된다. 지미 페레즈와 부하 형사들은 머리가 담겨있던 가방에서 코카인을 발견하고 마약 범죄 집단의 소행이라고 생각한다.
헤이즈 가족이 몰살된 사건에서 유일하게 살아남은 제이미가 의식 불명 상태로 발견된다. 지미 페레즈는 피범벅이 된 올리비아를 범인으로 보고 그녀를 유치장에 구금한다. 한편, 사건이 발생한 밤, 현장 주변에서 밴을 목격했다는 증언을 확보한 페레즈 형사는 밴의 주인을 찾아가 진실을 추궁해서 중요한 단서를 얻는다.
칼럼 던우디가 끝내 사망하고, 샌디는 모락 던우디에게 고소당할 위기에 처한다. 글래스고에서 샘 보이드의 도움을 받아 에런 맥과이어의 행적을 쫓던 지미 페레즈 형사는 예상치 못한 협박 문자를 받는다. 한편, 토시에게 꾸준히 관심을 표현했던 도니는 드디어 토시와 데이트를 하게 된다.
지미 페레즈 형사는 에런 맥과이어가 여자애들을 납치하고, 그레임 벤슨이 인신매매 범죄를 총괄한다고 믿고 두 사람의 행적을 좇는다. 한편, 의문의 여성이 모락 던우디에게 지속적으로 협박 전화를 걸어온다. 러윅 집으로 돌아온 캐시는 지미와 앨리스 사이에 미묘한 감정이 흐르고 있음을 눈치챈다.
올리비아는 제이미를 납치해 절벽에서 함께 떨어져 죽자며, 제지의 행방을 말하라고 협박한다. 페레즈 경감은 제지와 니키가 감금되어 있던 건물의 소유주가 덩컨이라는 사실을 알게 된다. 지미와 언쟁을 벌인 후 해변에서 정신을 차린 덩컨은 믿기 힘든 광경을 목격한다.
맥과이어를 덮치려던 작전은 실패로 돌아가고 제지의 행방은 또다시 미궁으로 빠진다. 지미 페레즈는 정보 유출을 의심하고, 의심의 화살이 앨리스에게로 향한다. 한편, 회사에서 해고당하고 짐을 정리하던 도니가 뜻밖의 정보를 알아낸다.
지미 페레즈 형사의 어머니가 세상을 떠나 장례식을 치른다. 동시에 셰틀랜드의 변호사 알렉스 갈브레이스가 총격으로 살해되는 사건이 발생한다. 피해자의 딸 메런이 사건 당시 아버지와 통화 중 총소리를 듣게 되어 충격에 빠진다. 지미는 사건 수사를 맡아 살해 동기와 용의자를 찾기 시작한다.
살인 사건의 유력 증인이었던 에이먼 골디가 잠수 중 사고로 사망한다. 경찰은 사고가 살인과 연관되었다고 의심한다. 또한, 과거 살인범 도나 킬릭이 건강 문제로 석방되어 섬으로 돌아오자 주민들의 분노가 커진다. 페레즈는 마약과 조직범죄와의 연관성 등을 중심으로 수사를 이어간다.
린다 모튼은 마약 운반에 연루되어 공포에 떨며 경찰의 보호를 요청한다. 경찰은 마약 조직원 커티스 갈트를 추적하여 체포한다. 하지만 사건 배후에 더 큰 인물이 있음을 직감한다. 한편, 주요 용의자 로건 크레건과 페레즈 형사 간 긴장이 고조되면서 수사는 점점 복잡해진다.
로건 크레건의 아들 프레이저가 총에 맞아 숨지면서 사건은 더욱 긴박해진다. 크레건은 아들의 죽음에 분노해 무장한 채 용의자들을 위협하며 진실을 밝히려 한다. 페레즈는 추가 피해를 막기 위해 분투하고, 정치적 야심을 가진 니벤 거스리가 수사 과정에서 영향력을 행사하며 페레즈와 대립한다.
지미 페레즈는 알렉스 갈브레이스의 죽음이 과거 발생한 소녀의 실종 사건과 연관이 있음을 알게 된다. 한편, 도나 킬릭의 건강이 악화되어 결국 사망에 이른다. 또한, 사건의 또 다른 열쇠를 쥔 수녀 캐롤린이 공격을 당하며 상황이 위태로워진다. 용의자들은 과거 사건을 은폐하려고 시도하고 있음이 드러난다.
페레즈 형사는 드디어 알렉스 갈브레이스 사건이 과거 마리 앤 로스라는 소녀의 사망과 연결되었음을 확증한다. 마리 앤은 21년 전 약물 과다로 사망했으며, 사건 당시 알렉스, 니벤, 대런 등이 연루된 사실이 밝혀진다. 페레즈는 긴 수사 끝에 진실을 밝혀내지만, 이 과정에서 도나 킬릭의 죽음에 관한 진실도 마주하게 되어 심적 갈등을 겪는다.
직무 정지에서 복귀한 페레즈 경감은 젊은 그래픽 노블 작가 코너 케언스의 실종 사건을 맡는다. 코너의 아버지인 전직 경찰 대니의 과거에 앙심을 품은 이들이 용의선상에 오르지만, 뚜렷한 증거는 찾기 어렵다. 그러던 중 코너를 찾기 위한 수색 중, 해안에서 시신이 발견된다.
페레즈는 코너의 실종과 신원미상 시신 사건을 동시에 수사하며 두 사건의 연관성을 찾는다. 코너의 아버지 대니는 독자적으로 아들의 행방을 쫓아 글래스고로 향하고, 페레즈는 그를 뒤쫓지만 그곳에서 무엇을 마주하게 될지는 알 수 없다. 한편, 셰틀랜드에서는 토시와 샌디가 코너 주변 인물을 조사하던 중 예상치 못한 의혹을 발견한다.
코너의 여자친구 브리드 플레밍이 이전 시신과 유사한 방식으로 살해된 채 발견되면서 연쇄 살인의 가능성이 커진다. 브리드의 차 안에서 코너의 반지가 발견되자, 코너는 브리드 살인 사건의 유력한 용의자로 떠오른다. 한편, 수사팀은 첫 번째 시신의 신원이 미국인 윌리엄 로저스임을 밝혀낸다.
브리드 살인 용의자로 지목된 코너가 임대한 캐러밴에서 폭발물이 발견되자, 그는 테러 관련 혐의까지 받으며 공식 수배된다. 페레즈는 코너가 환경 운동과 관련되었을 가능성을 추적하며 그의 행적을 뒤쫓는다. 하지만 코너를 둘러싼 위협의 실체는 아직 베일에 싸여 있으며, 시간은 점점 촉박해진다.
페레즈는 사망한 로저스와 연관된 로이드 앤더슨을 체포하여 심문하지만, 그는 미국에서의 살인 누명을 쓰고 도망쳤다고 주장한다. 한편 농자재 창고에서 비료가 도난당하는 사건이 발생하면서 폭탄 제조 가능성에 대한 긴장감이 높아진다. 수사팀은 코너와 브리드가 사망한 로저스와 함께 급진적인 환경 운동에 연루되었을 가능성에 무게를 둔다.
페레즈와 토시는 로저스와 연관된 환경 단체 조직원들을 심문하며 테러 계획의 전모를 파악하려 한다. 심문 과정에서 테러 계획의 배후 인물이 특정되고, 그의 목표가 정유 시설임이 드러난다. 수사팀은 폭발물을 실은 트럭을 확보하고 도주하는 범인을 추격하며 임박한 테러를 막기 위해 필사적으로 움직인다.
런던 경찰청 소속 형사 루스 칼더는 살인 사건을 목격한 엘렌 퀸을 찾아 고향 셰틀랜드로 돌아온다. 토시는 잠시 동물 연쇄 살해 사건 조사를 중단하고, 루스를 돕는다. 둘은 너무 늦기 전에 엘렌을 찾아야만 한다.
피해자도 두 명, 무장한 살인범도 두 명인 상황. 하웰은 노박이 죽기 전에 섬에서 벗어나려고 한다. 루스의 사생활이 사건의 일부가 된다.
루스는 셰틀랜드에 조금 더 남기로 한다. 토시는 살인 사건과 동물 연쇄 살해 사건의 연결고리를 조사한다. 그러다 누구도 예상하지 못한 이상한 일이 발생한다.
용의자는 체포되었지만, 의문은 풀리지 않는다. 토시는 수사팀한테 범행 증거를 찾으라고 지시한다. 루스는 진한테 들은 얘기 때문에 고뇌한다.
끔찍한 사건 때문에 루스는 셰틀랜드를 떠나지 못한다. 루스는 샌디를 데리고 진상을 파헤치기 시작한다. 해리와 도니는 토시를 걱정하지만 토시는 꿋꿋이 수사를 계속한다.
토시와 루스는 베인 가족을 조사하기 시작한다. 살인범을 찾아내려면 엘렌이 셰틀랜드를 떠난 이유를 알아내야만 한다. 결국 생각지도 못한 진실이 드러난다.
토시 부부의 친구인 타라의 생일 파티가 끝나갈 때 토시는 친구 애니와 그의 남편 이안이 이혼한 사실을 그들의 아들 노아를 통해 알게된다. 이후 애니는 토시에게 할말이 있다며 내일 만나자는 약속을 하고 약속 시간이 되어 토시는 애니를 찾아갔지만 애니는 사라진 이후였다. 죽을 위기를 넘긴 루스와 함께 애니와 애니의 9살짜리 아들을 찾아 나선다.
애니가 변사체로 발견되고 같은 건물에서 의문의 남자의 변사체도 발견된다. 모두가 용의자로 지목된 이안을 찾기 위해 노력한다. 루스와 토시는 베르겐에 대해 조사한다. 애니의 숨겨진 면이 밝혀지기 시작한다.
애니의 과거가 밝혀지자, 수사는 새로운 국면을 맞이한다. 시설을 감시하던 앵거스가 사라진다. 노아는 드디어 토시와 루스에게 사건 당일 얘기를 들려준다.
수색 영장이 나오자, 토시와 루스는 연구소를 조사한다. 결국 연구소의 진짜 목적이 밝혀진다. 그리고 아스트리드가 갑자기 사라진다.
토시와 루스는 애니가 총에 맞게 된 이유와 유언의 현재 목적을 알게 된다. 유언이 애니의 살인범한테 복수하기 전에 그를 찾아야만 한다. 이안은 트라우마가 생긴 노아를 보살피는 걸 힘들어한다.
리사는 사건에 관련됐다는 사실을 부인하지만, 토시가 끔찍한 진실을 알아차린다. 이안은 트라우마로 힘들어하는 노아 때문에 최후의 수단을 쓰게 되고 토시와 루스는 범인을 찾기 위해 노력한다.
토시, 루스와 샌디는 라우덴이라는 남자의 정보를 믿고 낚싯배를 급습하지만 마약은 찾지 못하고, 라우덴은 사라진다. 직후에 셋은 러니스윅이라는 작은 마을에서 이디라는 노인 교살 사건을 조사하기 시작한다. 이디와 아는 사이였던 빌리는 크게 충격받는다. 글래스고 감옥에 갔다가 최근에 돌아온 젊은 남자 데이비드가 유력 용의자로 부상한다.
토시와 루스는 이디의 집에 불을 낸 라나를 조사한다. 모래그는 토시한테 이디가 담당했던 아이가 자라서 현재 사회복지국을 고소한 상태라고 알려준다. 크리스는 헤일리의 비밀을 알게 된다.
뭔가를 목격한 콜린은 크리스와 헤일리를 수상하게 여긴다. 토시와 루스는 스티비를 취조하고, 모래그는 그들에게 스티비에 관한 정보를 제공해준다.
루스는 라우덴한테 캘러헌 조직의 부하가 누군지 알아내줄 것을 부탁한다. 토시와 루스는 다시 스티비를 취조한다. 토시는 로버트에 관해 알아내기 위해 지나를 찾아간다. 한편, 제스가 이디와 접촉했다는 사실이 밝혀진다.
토시는 빌리를 추궁한다. 라우덴 일 때문에 죄책감을 느끼는 루스는 미첼을 조사하기 시작한다. 신원 미상의 지문이 누구 것인지 밝혀지고 에드는 루스한테 같이 술을 마시자고 제안한다.
에드 털록이 취조당한다. 제스는 에단과 집을 떠나지만 진통이 시작된다. 루스는 이디의 인터뷰 영상이 사건 해결의 열쇠라는 사실을 깨닫는다.