카운터파트

하워드 실크는 자신이 근무하는 기관의 진실을 알게 됩니다. 교류국(O.I)은 암살자를 찾기 위해 수색에 나섭니다.

하워드는 자신의 '카운터파트(평행세계의 또 다른 자신)'와 협력해야 합니다. 볼드윈은 과거와 마주하게 되고, '다른 세계'의 에밀리는 명령의 의미를 파악하려 애씁니다.

양측은 갈등 해결을 위해 외교에 기대기 시작합니다. 에밀리는 특별 비자를 얻고, 하워드는 용의자를 심문합니다.

두 하워드는 음모의 실체를 더욱 깊이 파헤칩니다. 퀘일은 하워드의 정보원 중 한 명을 만나고, 클레어는 볼드윈과 관련해 결정을 내려야 합니다.

하워드는 에밀리의 또 다른 면을 발견하게 됩니다. 하워드와 에밀리는 수상한 비밀 장소에 대한 단서를 찾아 나서고, 올드리치와 퀘일은 옛 친구로부터 정보를 얻으려 합니다.

올드리치는 사무실 내에서 최근 발생한 의문스러운 죽음을 조사합니다. 에밀리, 하워드, 쇼는 새로운 단서를 추적합니다.

클레어의 과거가 드러납니다. 퀘일은 자신의 생일 파티에서 극심한 스트레스를 겪습니다.

인디고 학교의 실체가 드러난 후 감정적 충격이 퍼집니다. 퀘일은 아내의 정체 변화에 혼란을 겪습니다.

하워드는 '게스트'의 계획을 막으려 하고, 하워드와 에밀리는 카스파를 추격합니다.

교류국(O.I.)에서 발생한 위기로 인해 두 하워드는 서로 다른 세계에 갇히게 됩니다.

하워드의 삶 속에 숨어 있는 하워드 프라임은 집과 교류국(O.I.)에서 정체를 들키지 않도록 조심해야 합니다. 퀘일과 클레어는 새롭고 불편한 동거에 적응하려 애씁니다.

다른 세계에 감금된 하워드는 자신의 충성심을 시험받습니다. 에밀리 프라임은 승진합니다.

하워드는 '에코(Echo)'라는 수상한 감옥으로 이송됩니다. 뜻밖의 방문자는 에밀리에게 과거와의 연결고리를 제공합니다. 에밀리 프라임과 쇼의 조사는 저항에 부딪힙니다.

하워드 프라임, 퀘일, 클레어는 공동의 적에 맞서 힘을 합칩니다. 에밀리 프라임은 조사의 방향을 또 다른 '에밀리'로 돌립니다. 야넥은 하워드의 과거를 파헤칩니다.

새로운 사실이 드러나면서 하워드 프라임과 퀘일은 위험에 처합니다. 에코에서의 일상은 균열을 겪고, 클레어는 자신의 과거와 다시 연결됩니다.

‘크로싱(Crossing)’의 기원이 드러납니다.

봉쇄 조치의 여파로 교류국 내부에 의심이 확산됩니다. 하워드와 에밀리 프라임은 '매니지먼트'의 역사에 대한 단서를 찾아냅니다. 클레어는 자신의 충성심에 의문을 갖기 시작합니다.

하워드 프라임과 에밀리는 협력하여 '인디고'의 계획을 파악하려 합니다. 클레어와 퀘일은 미래를 고민하고, 하워드는 아내에 대한 진실과 마주하게 됩니다.

매니지먼트는 역사적인 결정을 내립니다. 에밀리는 경고를 보냅니다. 퀘일, 클레어, 템플은 마지막 인디고 세포를 추적합니다. 하워드 프라임은 오래된 연락처에 손을 뻗습니다.

미라의 위협이 다가오면서 뜻밖의 동맹들이 형성됩니다. (시즌 피날레)