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부패와 사이보그 임플란트로 가득한 디스토피아 세상. 재능은 넘치지만 무모한 길거리 소년이 무법의 용병, 엣지러너가 되기 위해 사투를 벌인다.
늦은 밤, 불법 브레인댄스를 스트리밍한 후 현실에서 깨어난 데이비드. 그곳은 과로에 지친 엄마와 고장 난 세탁기가 있는 낡은 아파트였다.
새로운 몸을 장착한 데이비드가 자신을 괴롭히던 주동자에게 복수하려 아카데미로 향한다. 곧 그를 채용하겠다는 미스터리한 여자를 만나는 데이비드.
소란스러운 엣지러너들 속에서 팀에 합류하게 해달라고 부탁하는 데이비드. 한편 사악한 힘의 소유자가 데이비드를 아라사카 아카데미로 다시 끌어들이려 한다.
엣지러너의 기술을 배우고 싶은 데이비드는 메인에게 임무를 더 달라고 조른다. 하지만 메인은 임무 대신 루시에게 데이비드의 트레이닝을 맡긴다.
다음 미션의 전략을 세우는 팀. 데이비드는 영리한 제안을 하지만, 곧 목표물을 과소평가해선 안 된다는 걸 깨닫는다.
메인의 행동이 어딘가 이상하다. 하지만 팀에게는 그보다 먼저 해결해야 할 일이 있었으니. 더 늦기 전에 포로에게서 중요한 정보를 빼내야 한다!
더욱 업그레이드된 몸으로 올스타 엣지러너가 된 데이비드. 팀을 이끌고 새로운 미션에 나선다. 한편 누군가가 데이비드에게 큰 건을 의뢰해 온다.
아라사카와 밀리테크 사이에서 난감해진 패러데이. 루시와 레베카는 데이비드의 행동이 변했다고 지적하지만, 데이비드는 좀처럼 들으려 하지 않는다.
루시의 비밀 미션과 어두운 과거가 밝혀지는 순간. 데이비드와 팀원들은 패러데이의 일을 마무리하러 나가지만, 어딘가 이상한 점을 눈치챈다.
강력하고 치명적인 무기를 출동시키려 하는 아라사카. 사이버 각성 상태를 넘나드는 데이비드는 루시를 구하겠다는 결심으로 나이트 시티로 향한다.
사이버 사이코시스에 빠져드는 전직 엣지러너. 상처로 얼룩진 과거를 지닌 외로운 생존자. 이 두 사람이 나이트 시티 정반대 편에서 자신의 이야기를 시작한다.
절박한 요청을 받은 위크가 반항적인 십 대 아이를 구하기 위해 다시 위험 속으로 뛰어든다. D는 영화를 좋아하는 소년과 가까워지고, 고통스러운 과거의 기억이 그의 복수심에 불을 지핀다.
위크가 위험한 수술에서 탈리아를 구하려 하지만, 대치 중에 참사가 일어난다. D와 로만이 혼란을 일으키는 칩을 발견하고, 이로 인해 아수라장이 펼쳐진다.
D는 아직 자신의 힘을 온전히 이해하지 못한 채, 카프리의 능력을 이용해 아라사카의 연구 시설에 잠입한다. 탈리아와 위크는 서로의 공통점을 발견한다.
충동적인 행동 하나가 탈리아를 끔찍한 혼란 속으로 밀어 넣는다. 복수에 대한 D의 집착이 섬뜩할 정도로 잔인한 수위에 이른다.
기업에 맞서는 자경단원으로 화제를 모으려는 D. 로만에게 자신의 모든 행동을 영상으로 찍어 달라고 부탁한다. 위크는 인간의 영혼을 디지털화해 옮길 수 있다는 소문 속 기술에 관해 조사한다.
카프리가 지켜보는 가운데, 탈리아의 상태에 뜻밖의 변화가 일어난다. D는 옛 친구와 다시 만나고, 위크와 아비다는 기적의 치료법을 찾아 나선다.
D가 카프리콘 프로젝트의 참혹한 과거를 파헤치는 와중에, 거리에서 폭동이 일어난다. 촉박한 시간 속에서 아비다와 위크는 탈리아의 미래를 위해 분투한다.
오미와 D가 자취를 감추고, 키릴은 탈리아를 강제로 붙잡아둔다. 쿄코가 카프리콘 프로젝트를 강행하면서, 끔찍한 결과가 초래된다.
섬뜩한 변화가 도시를 전쟁터로 만들고, 폭격과 충돌 속에서 대혼란이 일어난다.