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샌프란시스코에서 고질라의 공격에서 살아남은 케이트는 충격적인 비밀에 크게 동요한다. 무시무시한 위협 가운데 케이트는 가족과 '모나크'라는 비밀 조직의 비밀을 알아내기 위해 세계 곳곳으로 모험을 떠난다.
케이트는 아빠에 대한 궁금증을 풀기 위해 일본으로 떠나고 충격적인 비밀을 알게 된다. 케이코와 리, 빌리는 타이탄들에 관한 이론을 추적한다.
모나크는 한 주요 인물을 찾아내려는 케이트와 켄타로, 메이에게 따라붙는다. 케이코와 리, 빌리는 중요한 발견을 한다.
쇼는 히로시를 찾아 팀을 이끌어 알래스카로 위험한 여정을 떠난다. 케이코와 리, 빌리는 퍼킷 장군에게 그들이 발견한 것을 보여 준다.
아슬아슬하게 탈출한 팀은 얼어붙는 툰드라에 고립된다. 켄타로는 자신의 관계들을 다시 생각해 본다.
켄타로, 메이와 함께 샌프란시스코의 폐허를 헤쳐 나가던 케이트에게 G-데이에 관한 고통스러운 기억이 물밀듯이 되살아난다.
쇼는 모나크 내부에서 예상치 못한 아군을 만나고 무리는 끔찍한 언쟁을 한다. 케이코와 리는 군 무도회에서 가까워진다.
메이는 마침내 자기 과거를 마주한다. 두발과 쇼는 고질라와 히로시의 흔적을 쫓는다.
무리는 쇼와 대면하기 위해 모든 것이 시작된 곳으로 돌아간다. 붕괴 직전에 모나크는 무모한 방법을 택한다.
쇼와 메이는 케이트를 찾고 놀라운 발견을 한다. 켄타로는 상실을 받아들이기 위해 고군분투한다.
무리는 세계의 축에서 나갈 방법을 찾느라 애쓴다. 켄타로와 팀은 예상치 못한 동맹을 맺는다.
사망한 것으로 여겨졌던 케이코가 수십 년 만에 돌아오자 모나크는 충격에 휩싸인다. 한편, 케이트는 쇼를 구하기 위해 명령을 거부하고, 그 과정에서 공포스러운 새로운 타이탄을 세상에 풀어놓게 된다.
리와 케이코는 정체불명의 괴수를 숭배하는 광신도 집단의 비밀스러운 마을을 조사한다. 한편, 케이트는 죽음을 부르는 무단 침입자와 맞닥뜨린다.
타이탄 X를 찾기 위해 쇼와 케이코, 히로시, 켄타로는 독단적인 행동에 나선다. 케이트는 밀려오는 죄책감에 괴로워하고 묻혀 있던 진실이 수면 위로 드러난다.
히로시의 장치를 되찾기 위해 쇼와 팀원들은 에이펙스 사이버네틱스를 상대로 대담한 탈취 작전을 개시한다.
산타 솔레다드에서 타이탄 X는 에이펙스의 표적이 된다. 쇼와 랜다 가족은 적의 은밀한 실험 현장에 잠입하기 위한 작전을 펼친다.
쇼와 스즈키는 고질라를 불러내기 위해 설계된 '타이탄 전화'의 성능을 시험하지만 예상치 못한 사태가 벌어지며 쇼는 자신의 과거를 정면으로 마주한다.
쇼는 있을 수 없는 무선 신호를 받는다. 케이트와 케이코는 타이탄 X와 연결된 고대의 고리를 발견하고 이사벨은 켄타로에게 제안을 한다.
타이탄 X가 호주에 상륙하고 쇼는 고질라를 유인해 숙명의 대결을 성사시킨다. 한편, 이사벨은 혼란을 틈타 자신만의 비밀 작전을 수행한다.
모나크와 팀원들이 스컬 아일랜드로 향한다. 케이트는 켄타로를 설득해 이사벨을 막으려고 애쓰고, 쇼와 케이코는 빌리가 남긴 오래된 균열을 쫓는다.
스컬 아일랜드의 지형마저 뒤바꿀 콩과 타이탄 X의 격돌이 벌어진다. 쇼는 위험천만한 여정을 시작한다.